CuGenDBv2

Gene ID	Tan0014406
Organism	Trichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description	Unknown protein
Genome location	LG05:2730055..2731926
RNA-Seq Expression	Tan0014406
Synteny	Tan0014406
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6605469.1 hypothetical protein SDJN03_02786, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

7.3e-135

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XP_022947973.1 uncharacterized protein LOC111451693 [Cucurbita moschata]

2.3e-133

80.43

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XP_023007066.1 uncharacterized protein LOC111499670 isoform X1 [Cucurbita maxima]

2.8e-134

81.31

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XP_023532268.1 uncharacterized protein LOC111794467 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

6.6e-136

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XP_038902956.1 uncharacterized protein LOC120089527 [Benincasa hispida]

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        SSSSSQVLPLAS
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KEA0 Uncharacterized protein

3.9e-118

77.36

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         YSSSSSQVLPLASSP S
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A0A6J1D323 uncharacterized protein LOC111017117

1.5e-130

78.55

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        ESST+L+LNRLLSSPPPKFRFLREAEEKLYRRL+EE+QKKA +  N GS QNSE +AIS P  A +EE             E+G C T+EKEPQNH++SQ
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A0A6J1G835 uncharacterized protein LOC111451693

1.1e-133

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           SSSSSQVLPLASSPPS G RF+ V
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A0A6J1KXJ9 uncharacterized protein LOC111499670 isoform X2

1.3e-129

81.49

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Query:  DLDLNRLLSSPPPKFRFLREAEEKLYRRLLEESQKKACKNGGSVQNSENQAISIPTAAVKEEKEEEEEEEERRRREDGICCTKEKEPQNHYVSQYSSSSS
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Query:  QVLPLASS
        Q+L  +SS
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A0A6J1KZH4 uncharacterized protein LOC111499670 isoform X1

1.3e-134

81.31

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Query:  MASFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWKKRSFTSEVEDEFTNYAKEFFHLICWKRGSSTTTTSSSSSLQANNSLRNPEVRNQESDIEIGSSKDLL
        M SFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWKKRSF SEVEDEFT+YAKEFFHLICW+R S     SSSSS+QANNSLRNPE+RNQE DIEIGSSKDLL
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Query:  LKSSGGEDGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESEDRSRKGSRTRSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLKATSPLNPLSSFKHHGFNINPLFESST
        LKSSGGEDGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESEDRSRKGSRTRSLSDLIL +DTPFLTPLPSPP    +P +P SSFKHHGFNINPLFESST
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Query:  DLDLNRLLSSPPPKFRFLREAEEKLYRRLLEESQKKACKNGGSVQNSENQAISIPTAAVKEEKEEEEEEEERRRREDGICCTKEKEPQNHYVSQYSSSSS
        D DLNRL+SSPPPKFRFLREAEEKLYRRL+EESQKKACKNGGS+QN E  AIS P AA ++E+++E             CC KEKE QNHYVSQYSSSSS
Subjt:  DLDLNRLLSSPPPKFRFLREAEEKLYRRLLEESQKKACKNGGSVQNSENQAISIPTAAVKEEKEEEEEEEERRRREDGICCTKEKEPQNHYVSQYSSSSS

Query:  QVLPLASSPPSAGHRFNDVSL
        Q+LPLASSPPS G R + VS+
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G39560.1 Putative membrane lipoprotein

7.5e-29

39.15

Show/hide

Query:  MASFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWKKRSFTSEVE---DEFTNYAKEFFHLICWKRGSSTTTTSSSSSLQANNSLRNPEVRNQESDIEIGSSK
        M S S +G+ LS+VFGCLL AL+AELYYLLW KKRS T   +   D  T   +E   + C      +++T+ SSS  +++S  NP+  + +    + +  
Subjt:  MASFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWKKRSFTSEVE---DEFTNYAKEFFHLICWKRGSSTTTTSSSSSLQANNSLRNPEVRNQESDIEIGSSK

Query:  DLLLKSSGGEDGVELELMRLHNLAGP---PRFLFTIKEETKEDLESED-RSRKGSRTRSLSDLILTVDT-----PFLTPLPSPPLKATSPLNPL--SSFK
                             N+ GP   PRFLFTI EET E++ESED  S KG   +SL+DL L +++     P+LTP  SP L  T PL PL   S  
Subjt:  DLLLKSSGGEDGVELELMRLHNLAGP---PRFLFTIKEETKEDLESED-RSRKGSRTRSLSDLILTVDT-----PFLTPLPSPPLKATSPLNPL--SSFK

Query:  HHGFNINPLFESSTDLDLNRLL------------SSPPPKFRFLREAEEKLYRRLLEE
             I+ LFESS+D + NRL+            SSP  +F+FLR+AEEKLY++ + E
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AT5G59350.1 unknown protein

2.9e-41

46.23

Show/hide

Query:  MASFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLL---WWKKRSFTSEVEDE------FTNYAKEFFHLICWKRGSSTTTTSSSSSLQANNSLRNPEVRNQES--
        M + SGLGIGLSL+FG LL ALV E+YYLL     KKR  + E E+E         YAKE   L C+K+           SLQ NN  R  EV   E   
Subjt:  MASFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLL---WWKKRSFTSEVEDE------FTNYAKEFFHLICWKRGSSTTTTSSSSSLQANNSLRNPEVRNQES--

Query:  -DIEIGSSKDLLLKSSGGEDGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESED--RSRKGSRT--RSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLKATSPLNPLSS
         D+E+G  K L    +GG+ G E ELM+LHN     RFLFTI EETK DLESED  +SR GSR+  RSLSD+    +TP  TPL SP  K +S  +PL S
Subjt:  -DIEIGSSKDLLLKSSGGEDGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESED--RSRKGSRT--RSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLKATSPLNPLSS

Query:  FKHHGFNINPLFESSTDLDLNRLL---SSPPPKFRFLREAEEKLYRRLLEESQKK--ACKNGGSVQNSENQAISIPTAAVKEEKEEEEEEEE
        + HHGF  NPLFES  +L+ N+     SSPPPKF+F+R+AEEKL +RL+EE++++  +    GS     N A++      +E+K+  +E +E
Subjt:  FKHHGFNINPLFESSTDLDLNRLL---SSPPPKFRFLREAEEKLYRRLLEESQKK--ACKNGGSVQNSENQAISIPTAAVKEEKEEEEEEEE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTTCTTTCAGTGGATTGGGAATTGGGTTGAGCTTGGTTTTTGGATGCCTTCTGTTTGCTCTTGTTGCTGAGCTTTACTATTTGTTATGGTGGAAGAAGAGAAGCTT
TACTTCAGAGGTTGAAGATGAATTCACCAATTATGCTAAGGAATTCTTCCATCTCATTTGTTGGAAAAGGGGTTCTTCTACTACTACTACTTCTTCTTCCTCTTCTCTGC
AAGCCAACAATTCTCTAAGGAATCCAGAGGTTAGAAATCAAGAATCTGACATTGAAATTGGTTCTAGCAAGGATTTGTTGTTGAAATCATCTGGTGGAGAAGATGGAGTT
GAGTTAGAGCTGATGAGGCTGCATAATCTTGCAGGCCCACCAAGGTTTCTCTTCACCATTAAAGAGGAAACCAAGGAAGATTTAGAGTCTGAAGATAGAAGCAGAAAGGG
ATCAAGAACAAGAAGCTTAAGTGATCTTATTTTAACTGTTGACACTCCATTTCTCACTCCTTTGCCTTCTCCTCCATTGAAGGCAACCTCTCCCTTAAACCCCTTGAGTT
CTTTCAAACACCATGGATTCAATATAAACCCTCTCTTTGAATCATCTACTGATTTAGATTTGAACAGGCTCTTGTCTTCTCCTCCCCCAAAATTTAGGTTCCTAAGGGAG
GCAGAAGAGAAACTGTACAGAAGATTGTTGGAAGAATCTCAGAAAAAGGCCTGTAAAAATGGTGGGTCAGTTCAGAATTCTGAAAATCAAGCCATTTCCATCCCCACAGC
TGCAGTTAAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGAAGAAGAAGAGAAGATGGGATTTGTTGTACAAAAGAGAAAGAGCCTCAAAATCATTATGTTTCAC
AGTATTCTTCAAGTTCTTCACAGGTTCTTCCTTTAGCTTCTTCTCCTCCTTCAGCAGGGCATAGATTTAATGATGTTTCATTAGATAGGTCTTTGTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CAAAGGGAATCAATCAACCAATGAAAAAAATAAAATAAAATACAATAAACAAAAAAGGCAAAATTTTCCTTTCACTGCAAATTCCACACGCTTTTGCCTAACTCACCCAT
GTGAGTGAGCTGCCATCCAAGCAACTCAAATTCATGTATAAATTTGCTTCTTCTTTCCCTTCCATTCTCTTATTTTAATCTCTCTGGTTTTGGTTTCTTCTTCATCTTTT
GTATGCTTTCTTTCTGAAATTAATATAAATTGGATTTTTGTTCGCATCTGTTGATTGTGGCTACTCCAGCATTCTTTTTGCTTTTTAAAGGTAACTTCCTTTTCCCTACG
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AG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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Tan0014406 (gene) of Snake gourd v1 genome