; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0014416 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0014416
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionProtein yippee-like
Genome locationLG01:108661908..108665875
RNA-Seq ExpressionTan0014416
SyntenyTan0014416
Gene Ontology termsGO:0000151 - ubiquitin ligase complex (cellular component)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR004910 - Yippee/Mis18/Cereblon
IPR034751 - Yippee domain
IPR039058 - Yippee family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004146051.1 protein yippee-like At5g53940 [Cucumis sativus]2.3e-6391.47Show/hide
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XP_022139779.1 protein yippee-like At5g53940 [Momordica charantia]2.3e-6392.25Show/hide
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XP_023536603.1 protein yippee-like At5g53940 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.6e-6392.25Show/hide
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XP_038899427.1 protein yippee-like At5g53940 [Benincasa hispida]4.1e-6594.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L050 Protein yippee-like1.1e-6391.47Show/hide
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A0A1S4E4C9 Protein yippee-like7.6e-6593.02Show/hide
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A0A6J1CDY9 Protein yippee-like1.1e-6392.25Show/hide
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A0A6J1F692 Protein yippee-like1.6e-6291.47Show/hide
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A0A6J1IP05 Protein yippee-like3.2e-6392.25Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P59234 Protein yippee-like1.7e-3763.81Show/hide
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Q9C777 Protein yippee-like At3g112304.3e-3359.05Show/hide
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Q9FN32 Protein yippee-like At5g539405.3e-5576.74Show/hide
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Q9LY56 Protein yippee-like At3g558904.3e-3353.12Show/hide
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Q9SR97 Protein yippee-like At3g089909.3e-3649.22Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G40110.1 Yippee family putative zinc-binding protein9.2e-3965.71Show/hide
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AT2G40110.2 Yippee family putative zinc-binding protein2.7e-3866.67Show/hide
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AT3G08990.1 Yippee family putative zinc-binding protein6.6e-3749.22Show/hide
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AT3G08990.2 Yippee family putative zinc-binding protein6.6e-3749.22Show/hide
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AT5G53940.1 Yippee family putative zinc-binding protein3.7e-5676.74Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGACGGATTTTTGTTGTGGAAAGGGAAGGGAGGTCGTACAGATGCAAGTTCTGCAATACGCAGTTAGCTCTCGCCGACGACCTTGCATCTCGGGCCTTTCATTGCCG
CCGTGGAAAAGCTTACCTTTTCAATAATGCGATAAACATTTCTTTTGGAGCATTGGAAGAGAGGATGATGCTCTCAGGAGTGCATACTGTAGCAGACATATTTTGTTGCA
CATGTGGACAAATTGTCGGGTGGAAATATGAGACAGCACATGAGAAGAGCCAGAAATATAAGGAGGGAAAGTTTGTTCTTGAAAGGGGGAGGATTGTCGATGACATTGAA
TTCTCGACTGGCTTCTACATAGACTCTCGGTCTAGTATCAGTGATAGCGAAGATAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCGGAACGACATCGATGTCCAATGGGCCAAAATCTTGCAGCTTCTTCTCACGTCAACAATGGCAGTGCTCGTGTCCTTTGCCTACTGGAAGATGGACGAATTTAGGGGA
AAAACATTTTTCCCAGATTACATCCTCTCAATTCAAGCTTACTTCTACTGTTTACCACAGATTACCAGTATTTCTAGGGCATGTGTCGCTTCCAGACGGCGGCGTAATCC
TTTCCCCGTAGAAGCTGAGCCGGAAGACGGGAGCTAAGGAGCGTGGACTGGCGGAGGAGAGCGATGGGACGGATTTTTGTTGTGGAAAGGGAAGGGAGGTCGTACAGATG
CAAGTTCTGCAATACGCAGTTAGCTCTCGCCGACGACCTTGCATCTCGGGCCTTTCATTGCCGCCGTGGAAAAGCTTACCTTTTCAATAATGCGATAAACATTTCTTTTG
GAGCATTGGAAGAGAGGATGATGCTCTCAGGAGTGCATACTGTAGCAGACATATTTTGTTGCACATGTGGACAAATTGTCGGGTGGAAATATGAGACAGCACATGAGAAG
AGCCAGAAATATAAGGAGGGAAAGTTTGTTCTTGAAAGGGGGAGGATTGTCGATGACATTGAATTCTCGACTGGCTTCTACATAGACTCTCGGTCTAGTATCAGTGATAG
CGAAGATAATTAGGGTGTGATATTATCATGTTATTGTATACTCTGAATCATAATAATAACGAAATGACAGTGTTCAGGTTTTGTGTATAGTCTAATAATGTTTGGACTAT
GTAAATGTAGAGTTTATCTAGATGGGGATACCTTTTTTCTCTTAATTCTTCTACCCTTCTAGTTCATCACTTCATTTGTTATTTATTTTCAATGTGAGTTGCAGTTTCAC
TAGCATTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRIFVVEREGRSYRCKFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGVHTVADIFCCTCGQIVGWKYETAHEKSQKYKEGKFVLERGRIVDDIE
FSTGFYIDSRSSISDSEDN