; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0014772 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0014772
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionU-box domain-containing protein 1-like
Genome locationLG01:101555408..101556370
RNA-Seq ExpressionTan0014772
SyntenyTan0014772
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
InterPro domainsIPR011989 - Armadillo-like helical
IPR016024 - Armadillo-type fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6608146.1 U-box domain-containing protein 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.7e-15794.69Show/hide
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KAG7031783.1 U-box domain-containing protein 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.3e-15795Show/hide
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XP_022940416.1 U-box domain-containing protein 1-like [Cucurbita moschata]1.1e-15694.38Show/hide
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XP_022982428.1 U-box domain-containing protein 1-like [Cucurbita maxima]6.7e-15794.69Show/hide
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XP_023524300.1 U-box domain-containing protein 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.4e-15694.38Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGP7 Uncharacterized protein2.6e-14688.71Show/hide
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        SGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIK DRIV SMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCL DA +LPEFFGV+ADLSVRGS KARERA+LLMNK
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        IMNSD D YSN+DSVYS W
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A0A1S3CR56 U-box domain-containing protein 8-like3.8e-14289.29Show/hide
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        MRSMSV TAHK IT+C+A ARSDAH++QEKALQNLV +TQVSPL+RNLL QVDGSI ILI LSKSS STVQSLSLSILFNLSLN+DMKKLLASME IYHL
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        NTLISLGSPET+KLS+SLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRAL VP++PAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAI VLIGVVES SGEDLAGTALV
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        VLGLLARFEEGLRALIK DRIV SMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESE CL DAL+LPEFFGVVADLSVRGS KARERA+LLMNKIMNSD D YSN
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        ADSVYS W
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A0A6J1CG09 U-box domain-containing protein 1-like4.5e-14386.88Show/hide
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        MSVASFHS+SSMRSM+V TAHK IT+CVADARSD  ++QEKALQNLV+ITQVSPLYRNLLAQVDG+IPILIALSKSSSS++QSLSLSILFNLSLN+DMK+
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        LLASMETIYHLN LISLGSPET+KLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTI+LLVRAL+VPSV  AHH+LCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAI VLI VVEST
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          EDLAGTAL VLGLLARFEEGLRAL+K D IVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDES+ CLRDAL +PEF GVVADLSVRGS KARERA LLMNK
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        +MNSD+D YSNA SVYS WY
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A0A6J1FIE4 U-box domain-containing protein 1-like5.5e-15794.38Show/hide
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        IMN+DL++YSNADSVYSPWY
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A0A6J1J4T3 U-box domain-containing protein 1-like3.2e-15794.69Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22193 U-box domain-containing protein 41.8e-1127.57Show/hide
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        + S  S  + R +S       + + V + +S + D Q +A   L  + + +   R ++    G+I +L+ L  S+ S  Q  +++ L NLS+N++ KK +
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        A    I  L  ++  GS E  + S++ + SL+++++NK K G +G I  LV  L   +         +L  L     N  + V+SGA+  LI +++  +G
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          +   A+ VL  LA   EG R  I  +  +  +V V++      KE A   LL+L   S       L+      +VA LS  G+ +ARE+A  L++   
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Query:  N
        N
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Q681N2 U-box domain-containing protein 155.5e-1325.93Show/hide
Query:  QEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETIKLSSSLICSLAMLDK
        Q ++++ +  + + +P  R L+A   G+IP+L+ L     S +Q  +++ L NLS++   KKL+++   I ++  ++  G+ E  + S++ + SL+MLD+
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Query:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVNSMVN
        NK   G++  I  LV  L   ++      L +L  L     N   A+ +G +  L+ +++      +   AL +L LLA   EG +A+ ++   + ++V 
Subjt:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVNSMVN

Query:  VLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFFGV---VADLSVRGSTKARERATLLMNKIMNSD
         ++     +KE AT +LL L   +   +  AL+    FGV   + +++  G+ +A+ +A  L+  I  S+
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Q8GUG9 U-box domain-containing protein 116.1e-1224.91Show/hide
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        +  A+  + ++++ S   R L+A+  G+IP+L+ L  S     Q  +++ + NLS+  + K+L+     +  +  ++  G+ E  + +++ + SL++ D+
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Query:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVNSMVN
        NK   G +G I  LV  L   +         +L  L  +HGN   AVR+G ++ L+ ++  ++   +   AL +L +LA  ++   A++K + +  +++ 
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Query:  VLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--FGVVA---DLSVRGSTKARERATLLM
        +L+     ++E A  ILL L      C RD  +L      G V    DLS  G+ + + +A  L+
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Q9C9A6 U-box domain-containing protein 104.7e-1226.48Show/hide
Query:  ITQCVADARSDAHDIQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSST-VQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPET
        I   V    S + + +  A+  + ++++ S   R L+A+  G+IP+L+ L  S   T  Q  +++ + NLS+    K+L+     +  +  ++  GS E 
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Query:  IKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEG
         + +++ + SL++ D+NK   G +G I  LV  L   SV        +L  L  + GN   AVR+G +  L+ ++  +S E +A  AL +L +LA  +  
Subjt:  IKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEG

Query:  LRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--FGVVA---DLSVRGSTKARERATLLMNKIMNS
          A+++ + I   +++ L+     ++E A  ILL L      C RD  +L      G V    +LS  G+ +A+ +A  L+  +  S
Subjt:  LRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--FGVVA---DLSVRGSTKARERATLLMNKIMNS

Q9SNC6 U-box domain-containing protein 131.6e-1226.55Show/hide
Query:  DARSDAHDIQ---EKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETIKLS
        D RS A +I+   ++   N VAI +             G+IP+L+ L  +  S +Q  S++ L NLS+  + K  + S   I  +  ++  GS E  + +
Subjt:  DARSDAHDIQ---EKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETIKLS

Query:  SSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRAL
        ++ + SL+++D+NK   G  G I  LV  L   +         +L  L  + GN   A+R+G I  L  ++ +  G  +   AL +L +L+   EG +A+
Subjt:  SSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRAL

Query:  IKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFFGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKI
        I     V S+V  ++     ++E A  +L+ L       L +A +L    G + DL+  G+ + + +A  L+ +I
Subjt:  IKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFFGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23030.1 ARM repeat superfamily protein4.4e-1324.91Show/hide
Query:  QEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETIKLSSSLICSLAMLDK
        +  A+  + ++++ S   R L+A+  G+IP+L+ L  S     Q  +++ + NLS+  + K+L+     +  +  ++  G+ E  + +++ + SL++ D+
Subjt:  QEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETIKLSSSLICSLAMLDK

Query:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVNSMVN
        NK   G +G I  LV  L   +         +L  L  +HGN   AVR+G ++ L+ ++  ++   +   AL +L +LA  ++   A++K + +  +++ 
Subjt:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVNSMVN

Query:  VLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--FGVVA---DLSVRGSTKARERATLLM
        +L+     ++E A  ILL L      C RD  +L      G V    DLS  G+ + + +A  L+
Subjt:  VLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--FGVVA---DLSVRGSTKARERATLLM

AT1G71020.1 ARM repeat superfamily protein3.3e-1326.48Show/hide
Query:  ITQCVADARSDAHDIQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSST-VQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPET
        I   V    S + + +  A+  + ++++ S   R L+A+  G+IP+L+ L  S   T  Q  +++ + NLS+    K+L+     +  +  ++  GS E 
Subjt:  ITQCVADARSDAHDIQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSST-VQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPET

Query:  IKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEG
         + +++ + SL++ D+NK   G +G I  LV  L   SV        +L  L  + GN   AVR+G +  L+ ++  +S E +A  AL +L +LA  +  
Subjt:  IKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEG

Query:  LRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--FGVVA---DLSVRGSTKARERATLLMNKIMNS
          A+++ + I   +++ L+     ++E A  ILL L      C RD  +L      G V    +LS  G+ +A+ +A  L+  +  S
Subjt:  LRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--FGVVA---DLSVRGSTKARERATLLMNKIMNS

AT1G71020.2 ARM repeat superfamily protein3.3e-1326.48Show/hide
Query:  ITQCVADARSDAHDIQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSST-VQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPET
        I   V    S + + +  A+  + ++++ S   R L+A+  G+IP+L+ L  S   T  Q  +++ + NLS+    K+L+     +  +  ++  GS E 
Subjt:  ITQCVADARSDAHDIQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSST-VQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPET

Query:  IKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEG
         + +++ + SL++ D+NK   G +G I  LV  L   SV        +L  L  + GN   AVR+G +  L+ ++  +S E +A  AL +L +LA  +  
Subjt:  IKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEG

Query:  LRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--FGVVA---DLSVRGSTKARERATLLMNKIMNS
          A+++ + I   +++ L+     ++E A  ILL L      C RD  +L      G V    +LS  G+ +A+ +A  L+  +  S
Subjt:  LRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--FGVVA---DLSVRGSTKARERATLLMNKIMNS

AT3G46510.1 plant U-box 131.1e-1326.55Show/hide
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        D RS A +I+   ++   N VAI +             G+IP+L+ L  +  S +Q  S++ L NLS+  + K  + S   I  +  ++  GS E  + +
Subjt:  DARSDAHDIQ---EKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETIKLS

Query:  SSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRAL
        ++ + SL+++D+NK   G  G I  LV  L   +         +L  L  + GN   A+R+G I  L  ++ +  G  +   AL +L +L+   EG +A+
Subjt:  SSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRAL

Query:  IKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFFGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKI
        I     V S+V  ++     ++E A  +L+ L       L +A +L    G + DL+  G+ + + +A  L+ +I
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AT5G42340.1 Plant U-Box 153.9e-1425.93Show/hide
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        Q ++++ +  + + +P  R L+A   G+IP+L+ L     S +Q  +++ L NLS++   KKL+++   I ++  ++  G+ E  + S++ + SL+MLD+
Subjt:  QEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETIKLSSSLICSLAMLDK

Query:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVNSMVN
        NK   G++  I  LV  L   ++      L +L  L     N   A+ +G +  L+ +++      +   AL +L LLA   EG +A+ ++   + ++V 
Subjt:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVNSMVN

Query:  VLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFFGV---VADLSVRGSTKARERATLLMNKIMNSD
         ++     +KE AT +LL L   +   +  AL+    FGV   + +++  G+ +A+ +A  L+  I  S+
Subjt:  VLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFFGV---VADLSVRGSTKARERATLLMNKIMNSD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTGTTGCATCTTTCCATTCAGCATCTTCCATGAGGTCCATGAGTGTTACAACTGCACATAAGAATATAACACAGTGTGTTGCTGATGCTCGGTCTGACGCTCACGA
TATCCAGGAAAAGGCTCTTCAAAACTTGGTTGCCATCACCCAGGTTAGTCCCCTGTACAGGAACTTGCTTGCACAAGTAGATGGATCAATTCCAATTCTTATTGCTCTCT
CCAAATCATCTTCCTCTACCGTCCAATCTCTTTCATTGTCTATTCTCTTCAATCTGTCTCTGAACAATGACATGAAAAAGCTTCTTGCATCGATGGAAACCATCTACCAT
CTCAATACGCTCATATCCTTGGGCTCGCCTGAAACCATCAAGTTGTCTTCCTCGTTGATTTGCAGCCTTGCAATGCTAGACAAGAACAAGGCTAAGTTTGGGGTAGCAGG
GACCATACAGTTATTGGTTAGAGCACTTACAGTCCCTAGTGTTCCTGCTGCCCATCACCTTCTCTGTTCTTTAGCTGAGCTAGGCCAGTTTCATGGCAACTGCACTGTGG
CTGTTCGATCGGGAGCCATCTCAGTTCTTATCGGTGTAGTGGAGAGTACAAGCGGTGAGGATCTTGCGGGCACTGCTCTTGTTGTTCTCGGTCTATTGGCTAGATTTGAG
GAGGGTTTGAGGGCTCTGATAAAAATCGATCGAATCGTTAACTCGATGGTTAATGTGTTGAAAGGGAGGTGTATGTTGAGTAAAGAAGGTGCAACTGAGATTCTTTTGCG
ATTGTTCGATGAAAGTGAAGGTTGTTTGAGAGATGCTTTGAGGTTGCCAGAGTTTTTTGGTGTTGTTGCTGATCTTTCTGTGAGAGGATCTACAAAAGCTAGAGAAAGAG
CTACTCTACTTATGAATAAGATCATGAATAGTGACTTGGATATATATTCAAATGCTGATTCAGTGTATTCACCATGGTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTGTTGCATCTTTCCATTCAGCATCTTCCATGAGGTCCATGAGTGTTACAACTGCACATAAGAATATAACACAGTGTGTTGCTGATGCTCGGTCTGACGCTCACGA
TATCCAGGAAAAGGCTCTTCAAAACTTGGTTGCCATCACCCAGGTTAGTCCCCTGTACAGGAACTTGCTTGCACAAGTAGATGGATCAATTCCAATTCTTATTGCTCTCT
CCAAATCATCTTCCTCTACCGTCCAATCTCTTTCATTGTCTATTCTCTTCAATCTGTCTCTGAACAATGACATGAAAAAGCTTCTTGCATCGATGGAAACCATCTACCAT
CTCAATACGCTCATATCCTTGGGCTCGCCTGAAACCATCAAGTTGTCTTCCTCGTTGATTTGCAGCCTTGCAATGCTAGACAAGAACAAGGCTAAGTTTGGGGTAGCAGG
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CTACTCTACTTATGAATAAGATCATGAATAGTGACTTGGATATATATTCAAATGCTGATTCAGTGTATTCACCATGGTATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVASFHSASSMRSMSVTTAHKNITQCVADARSDAHDIQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYH
LNTLISLGSPETIKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFE
EGLRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFFGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIMNSDLDIYSNADSVYSPWY