| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0048153.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 1.5e-20 | 48.23 | Show/hide |
Query: NAHLWHLRSGH---INLNRIERLVNDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKD
NA+ LR + N + +DV+ + LHVP+G IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ ++GVKM EKL L+D
Subjt: NAHLWHLRSGH---INLNRIERLVNDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKD
Query: GTEDKKS---VQKMFDIVGRHPLADSLEVLIKKMSQDNKEK
GT ++K + FD+ HPL L +I+K S + EK
Subjt: GTEDKKS---VQKMFDIVGRHPLADSLEVLIKKMSQDNKEK
|
|
| KAA0063387.1 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.6e-19 | 57.28 | Show/hide |
Query: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKS---VQKMFDIVGRHPLA
+DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFT+H+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ ++GVKMA EKL L+D TE++K + FD+ HPL
Subjt: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKS---VQKMFDIVGRHPLA
Query: DSL
L
Subjt: DSL
|
|
| KAA0067206.1 hypothetical protein E6C27_scaffold418G00080 [Cucumis melo var. makuwa] | 9.4e-20 | 64.37 | Show/hide |
Query: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKSVQKM
+DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ E K FEPK LYNVS+ SQ ++ +KMA EKL +L+DGT D+KSVQ +
Subjt: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKSVQKM
|
|
| TYK02449.1 F15O4.13 [Cucumis melo var. makuwa] | 4.2e-20 | 65.52 | Show/hide |
Query: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKSVQKM
+DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ ++GVKMA EKL L+DGT ++KSVQ +
Subjt: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKSVQKM
|
|
| TYK08102.1 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.7e-21 | 55.56 | Show/hide |
Query: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKS---VQKMFDIVGRHPLA
+DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ ++GVKMA EKL L+DGT ++K + FD+ HPL
Subjt: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKS---VQKMFDIVGRHPLA
Query: DSLEVLIKKMSQDNKEK
L +I+K S + EK
Subjt: DSLEVLIKKMSQDNKEK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TX19 Reverse transcriptase | 7.0e-21 | 48.23 | Show/hide |
Query: NAHLWHLRSGH---INLNRIERLVNDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKD
NA+ LR + N + +DV+ + LHVP+G IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ ++GVKM EKL L+D
Subjt: NAHLWHLRSGH---INLNRIERLVNDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKD
Query: GTEDKKS---VQKMFDIVGRHPLADSLEVLIKKMSQDNKEK
GT ++K + FD+ HPL L +I+K S + EK
Subjt: GTEDKKS---VQKMFDIVGRHPLADSLEVLIKKMSQDNKEK
|
|
| A0A5A7V8R2 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 7.8e-20 | 57.28 | Show/hide |
Query: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKS---VQKMFDIVGRHPLA
+DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFT+H+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ ++GVKMA EKL L+D TE++K + FD+ HPL
Subjt: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKS---VQKMFDIVGRHPLA
Query: DSL
L
Subjt: DSL
|
|
| A0A5A7VL78 RT_RNaseH_2 domain-containing protein | 4.6e-20 | 64.37 | Show/hide |
Query: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKSVQKM
+DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ E K FEPK LYNVS+ SQ ++ +KMA EKL +L+DGT D+KSVQ +
Subjt: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKSVQKM
|
|
| A0A5D3BWE8 F15O4.13 | 2.0e-20 | 65.52 | Show/hide |
Query: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKSVQKM
+DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ ++GVKMA EKL L+DGT ++KSVQ +
Subjt: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKSVQKM
|
|
| A0A5D3C9X5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 8.3e-22 | 55.56 | Show/hide |
Query: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKS---VQKMFDIVGRHPLA
+DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ ++GVKMA EKL L+DGT ++K + FD+ HPL
Subjt: NDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQYKNGVKMALEKLSTLKDGTEDKKS---VQKMFDIVGRHPLA
Query: DSLEVLIKKMSQDNKEK
L +I+K S + EK
Subjt: DSLEVLIKKMSQDNKEK
|
|
