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Tan0015256 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0015256
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Genome locationLG01:65541892..65544784
RNA-Seq ExpressionTan0015256
SyntenyTan0015256
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585871.1 hypothetical protein SDJN03_18604, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-4184.4Show/hide
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XP_022951707.1 uncharacterized protein LOC111454452 [Cucurbita moschata]2.6e-4184.4Show/hide
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XP_022973308.1 uncharacterized protein LOC111471866 [Cucurbita maxima]9.0e-4285.32Show/hide
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XP_023536952.1 uncharacterized protein LOC111798179 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.6e-4184.4Show/hide
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XP_038899595.1 uncharacterized protein LOC120086852 isoform X1 [Benincasa hispida]3.4e-4182.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E3K1 uncharacterized protein LOC103500457 isoform X21.7e-3879.82Show/hide
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A0A1S4E493 uncharacterized protein LOC103500457 isoform X11.7e-3879.82Show/hide
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A0A6J1DPW9 uncharacterized protein LOC1110232263.5e-3981.65Show/hide
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A0A6J1GIF1 uncharacterized protein LOC1114544521.3e-4184.4Show/hide
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A0A6J1ICN5 uncharacterized protein LOC1114718664.4e-4285.32Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGGGTCTGTTTGGGAACAATAACGAGCAGTTACCAGAAAGAAGAGACATTGCTTCTGGATTTTTTAAATCCTCTGGCAAAACAGAACATGGAAGTAGGGCTATTCG
TCGAGGAAGGAGGCTTGGTCGAACTATCAGAATAAAATTCTCATGTTTGTTTTTGACGCTTACAACTTCCTTCTTGTTGTATTTGGCGATCTTTGGCTTAAAAGTGAACT
TTCATGATAAAATTGGAGATAGCATATCAGTGACAAAAGTACAAGGAGAACATTTGGCATCCAGAGACCAGAAACCACCAACTAGCAGCAAGCATCGCCGTAAGCAACGT
AAGTATTCTTGGCTTGTACCCTTGCATTTTCACGCGTGCATCCTTATTGAAGGTAAAGTAGATGTAAATCTTCTCCTTAAACTTAGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTTCTATTCTCTTCATTTTTTTTTCTCACCATACTCTTCTCTTCGTCTCTTACGAATTTGTTTGCATCTTCATCCTTTTTTGGTCGCCAGATCTTCGTCGAGGTAATGC
TTCAGATGATCTTCTTCATTTGGTTTCACAAACATTGTTCGGAGATCTTTATAGCGACGCTTTCAATCTGAGTTAGACATGCCTTATTCTAGTTCTCTGCATTTGCATTT
TAAGCATGCGCTCCACCGATGAGCTTTGTTTTGCGGATATGAACCGAGATTTGGAGGCAATGTCATGATGGGTCTGTTTGGGAACAATAACGAGCAGTTACCAGAAAGAA
GAGACATTGCTTCTGGATTTTTTAAATCCTCTGGCAAAACAGAACATGGAAGTAGGGCTATTCGTCGAGGAAGGAGGCTTGGTCGAACTATCAGAATAAAATTCTCATGT
TTGTTTTTGACGCTTACAACTTCCTTCTTGTTGTATTTGGCGATCTTTGGCTTAAAAGTGAACTTTCATGATAAAATTGGAGATAGCATATCAGTGACAAAAGTACAAGG
AGAACATTTGGCATCCAGAGACCAGAAACCACCAACTAGCAGCAAGCATCGCCGTAAGCAACGTAAGTATTCTTGGCTTGTACCCTTGCATTTTCACGCGTGCATCCTTA
TTGAAGGTAAAGTAGATGTAAATCTTCTCCTTAAACTTAGGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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