; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0015318 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0015318
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationLG08:6141192..6142164
RNA-Seq ExpressionTan0015318
SyntenyTan0015318
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586247.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.2e-5995.8Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
        MAGFNS TFFLICAAVFVV SCSSTAVH GLGI HSL WIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP

Query:  GAQANPYSRGCSAITRCRS
        GAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  GAQANPYSRGCSAITRCRS

KAG7021083.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.3e-5794.92Show/hide
Query:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        M MAGFNS TFFLICAAVFVV SCSSTAVH GLGI HSL WIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITR
        QPGAQANPYSRGCSAITR
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITR

XP_022937540.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]2.4e-5995.04Show/hide
Query:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        M MAGFNS TFFLICAAVFVV SCSSTAVH GLGI HSL WIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_022966015.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]2.9e-6095.87Show/hide
Query:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        M MAGFNS TFFLICAAVFVV SCSSTAVH GLGIHHSL WIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_038889183.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]3.4e-6195.87Show/hide
Query:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        M MAGFNSPTFFLICAAVFV+ SCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFW9 Uncharacterized protein7.6e-5991.74Show/hide
Query:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        M MAGFNSPTFFLICAAVF++ SCSST VHAGLGI HSLAWIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGC+AITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A5A7TYI2 Rapid ALkalinization Factor4.2e-5790.08Show/hide
Query:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        M MAGFNSPTFFLI AAVF++ SCSSTAVHAG+GI +SLAWIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGC+AITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1DA82 protein RALF-like 331.2e-5690.91Show/hide
Query:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        M MAGF+SPT FLICAAVFVV +CSSTAVH GLGIHHSLAWIP+QS+CKG+IAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGAL+RNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPY RGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1FH12 protein RALF-like 331.2e-5995.04Show/hide
Query:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        M MAGFNS TFFLICAAVFVV SCSSTAVH GLGI HSL WIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1HQE4 protein RALF-like 331.4e-6095.87Show/hide
Query:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        M MAGFNS TFFLICAAVFVV SCSSTAVH GLGIHHSL WIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 335.0e-3178.31Show/hide
Query:  WIPNQSTCKGTIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        ++P +S C GTIAEC      EEFE DSEI+RRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  WIPNQSTCKGTIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor7.9e-2980Show/hide
Query:  CKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        CKG+I EC    EEFE DSE +RRILAT +YISYGAL++N+VPCSRRGASYYNC+PGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  CKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 232.7e-2968.42Show/hide
Query:  PNQSTCKGTIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        P ++ C+GTIAEC             +G    GEEFE DSEI+RRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  PNQSTCKGTIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 226.7e-2860.91Show/hide
Query:  AVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQST-----CKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYS
        AV  +L+   +AV +      SL ++   S+     C G+IAEC    EE EFDS+ISRRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYS
Subjt:  AVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQST-----CKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYS

Query:  RGCSAITRCR
        RGCS ITRCR
Subjt:  RGCSAITRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 11.6e-2962.07Show/hide
Query:  TFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ
        T FL    + VV   SS  V AG       +AW     N S C G+IAEC G EE E DSEI+RRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQ
Subjt:  TFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ

Query:  ANPYSRGCSAITRCRS
        ANPYSRGCS I RCRS
Subjt:  ANPYSRGCSAITRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.1e-3062.07Show/hide
Query:  TFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ
        T FL    + VV   SS  V AG       +AW     N S C G+IAEC G EE E DSEI+RRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQ
Subjt:  TFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ

Query:  ANPYSRGCSAITRCRS
        ANPYSRGCS I RCRS
Subjt:  ANPYSRGCSAITRCRS

AT2G33775.1 ralf-like 191.0e-1560.94Show/hide
Query:  GGEEFEFDSEISRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRC
        G  ++  DSE +RR LA  + YISYGALR+N VPCSRRG SYY+C+   +ANPY RGCS IT C
Subjt:  GGEEFEFDSEISRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRC

AT3G05490.1 ralf-like 224.8e-2960.91Show/hide
Query:  AVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQST-----CKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYS
        AV  +L+   +AV +      SL ++   S+     C G+IAEC    EE EFDS+ISRRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYS
Subjt:  AVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQST-----CKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYS

Query:  RGCSAITRCR
        RGCS ITRCR
Subjt:  RGCSAITRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.9e-3068.42Show/hide
Query:  PNQSTCKGTIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        P ++ C+GTIAEC             +G    GEEFE DSEI+RRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  PNQSTCKGTIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

AT4G15800.1 ralf-like 333.5e-3278.31Show/hide
Query:  WIPNQSTCKGTIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        ++P +S C GTIAEC      EEFE DSEI+RRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  WIPNQSTCKGTIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCTTGATCTGCGCCGCCGTGTTTGTGGTCCTCAGCTGCTCCTCAACCGCCGTCCACGCCGGCCTCGGGATCCACCA
CAGTCTCGCATGGATTCCTAACCAATCGACCTGCAAGGGCACCATAGCGGAGTGTTTCGGCGGAGAGGAGTTCGAATTTGATTCGGAAATCAGCCGCCGCATCTTGGCCA
CCAGCCAGTACATCAGCTACGGCGCTCTGCGAAGGAACACCGTGCCGTGCTCGAGACGCGGTGCTTCCTATTACAATTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCTTACAGC
CGTGGATGCAGCGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTTCACATCACTGCTCGCTTTTTCTGTGCTAAAAAAAAAAAAAAGGAAGAAGAAGAACCCACCGACGAATTGCCGGAGCGATTGCCGGAGCTGAAGAAACCGTCAATTC
CGAGGAGAAGAGAGCGGAGAGAAAGAGATAGAGCTTGTTCTTGCATGGAAATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCTTGATCTGCGCCGCCGTGTTTGTGGTCCTC
AGCTGCTCCTCAACCGCCGTCCACGCCGGCCTCGGGATCCACCACAGTCTCGCATGGATTCCTAACCAATCGACCTGCAAGGGCACCATAGCGGAGTGTTTCGGCGGAGA
GGAGTTCGAATTTGATTCGGAAATCAGCCGCCGCATCTTGGCCACCAGCCAGTACATCAGCTACGGCGCTCTGCGAAGGAACACCGTGCCGTGCTCGAGACGCGGTGCTT
CCTATTACAATTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCTTACAGCCGTGGATGCAGCGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGAGTAATTTGTTTGTACTCTCTGTTTAATAAT
CTCTCTCTCTCCATTTCAATGTTTATTGATCTTTTTTTTTTTCCCTTCTTTCTTCTTTGAGATGGCTTTGATTGTTATACAAATTGAAAAGGGGAGATTGATTATATAGT
GTCGTCTCTGTCGTCGTTGTAAGTGATGAAAATTGTTGTGGTTAATTAATTATTTATCTCTGCTCAATAATGTGATAGTCTTTAGTGGCTTGGATTTTCGTTCCTCTTCC
TTTTCCTTCTTCGATTGAAGGGAAAAGAGATTCTGCAAAGAAATGAAGGAAGAAGAATTGCTTTAATAAGTTGGAATTGGGGAGAATTATGGATCCCACCATGAGATAAG
AGTGAGAACAAATTGATTATTGTTCTAAGTATATTTCTCTTCTTGAAAATGTCAAAGATTGTGTTTCTGGTGTTGTTTTTGGGTTTAGATAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEMAGFNSPTFFLICAAVFVVLSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYS
RGCSAITRCRS