; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0015561 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0015561
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionras-related protein RABC1-like
Genome locationLG01:90148569..90153404
RNA-Seq ExpressionTan0015561
SyntenyTan0015561
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607690.1 Ras-related protein RABC1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.4e-11597.18Show/hide
Query:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSS+PSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE+LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PEVNASTGGCCSY
        P+ NAS GGCCSY
Subjt:  PEVNASTGGCCSY

XP_011657438.1 ras-related protein RABC1 isoform X1 [Cucumis sativus]1.2e-11497.18Show/hide
Query:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSS+PSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PEVNASTGGCCSY
        PE   S GGCCSY
Subjt:  PEVNASTGGCCSY

XP_022153719.1 ras-related protein RABC1-like [Momordica charantia]4.2e-11597.18Show/hide
Query:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSS+PSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEID+YSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PEVNASTGGCCSY
        P+ NAS GGCCSY
Subjt:  PEVNASTGGCCSY

XP_022926286.1 ras-related protein RABC1-like [Cucurbita moschata]9.4e-11597.18Show/hide
Query:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSS+PSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE+LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PEVNASTGGCCSY
        P+ NAS GGCCSY
Subjt:  PEVNASTGGCCSY

XP_023525903.1 ras-related protein RABC1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-11497.18Show/hide
Query:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSS+PSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE+LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PEVNASTGGCCSY
        P+ NAS GGCCSY
Subjt:  PEVNASTGGCCSY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KH59 Uncharacterized protein5.9e-11597.18Show/hide
Query:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSS+PSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PEVNASTGGCCSY
        PE   S GGCCSY
Subjt:  PEVNASTGGCCSY

A0A5A7V1Q4 Ras-related protein RABC1 isoform X11.3e-11496.71Show/hide
Query:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSS+PSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PEVNASTGGCCSY
        PE   + GGCCSY
Subjt:  PEVNASTGGCCSY

A0A6J1DJX3 ras-related protein RABC1-like2.0e-11597.18Show/hide
Query:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSS+PSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEID+YSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PEVNASTGGCCSY
        P+ NAS GGCCSY
Subjt:  PEVNASTGGCCSY

A0A6J1EEF0 ras-related protein RABC1-like4.5e-11597.18Show/hide
Query:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSS+PSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE+LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PEVNASTGGCCSY
        P+ NAS GGCCSY
Subjt:  PEVNASTGGCCSY

A0A6J1IUG0 ras-related protein RABC1-like4.5e-11597.18Show/hide
Query:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSS+PSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE+LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PEVNASTGGCCSY
        P+ NAS GGCCSY
Subjt:  PEVNASTGGCCSY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23657 Ras-related protein RABC16.8e-10085.1Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS QPEFDYLFK+LLIGDSGVGKS+LLL FTS++F+DLSPTIGVDFK+K++T+G KKLKLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGIIMVYDVTRR+TFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-VN
        SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCF+ELVLKIL+TPSL A+GS+G KKNIFK+ P +  +
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-VN

Query:  ASTGGCCS
         S+  CCS
Subjt:  ASTGGCCS

O49841 Ras-related protein RABC2a8.0e-8571.01Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS Q  +D  FK+LLIGDSGVGKS+LL+ F S S EDL+PTIGVDFKIK +TVGGK+LKL IWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGII+VYDVTRRETFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPEVNA
         D+W KEI+LYSTNQ+C++MLVGNKVD+ESER VS++EGI  A+E  C+FLECSA+TR NVEQCF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+NI K+KP     
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPEVNA

Query:  STGGCCS
        +  GCCS
Subjt:  STGGCCS

P36862 GTP-binding protein yptV39.0e-6063.13Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFED-LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWAK
        DY FK+LL+GDSGVGKS +L RFTS  FE+  + TIGVDFK+K++T  GK+ KL IWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGII VYDVTRR+TF +L   W +
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFED-LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWAK

Query:  EIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTG
        E D+YST +  IKM+V NKVD  ++R VS +EG DFAR +GCLF+E SA+  + V Q F+EL+LKILDTP LL   + G
Subjt:  EIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTG

Q5ZLG1 Ras-related protein Rab-181.0e-5556.35Show/hide
Query:  KLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE-DLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWAKEIDL
        K+L+IG+SGVGKS+LLLRFT D+F+ +L+ TIGVDFK+K ++V G K KLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQG+I+VYDVTRR+TF  L D W  E++ 
Subjt:  KLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE-DLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWAKEIDL

Query:  YSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPEVNASTGGCCS
        Y T  D +KMLVGNK+DKE+ R V + EG+ FAR++  LF+E SAKT   V+  F+ELV KI+ TP L    S      +  ++      + GG CS
Subjt:  YSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPEVNASTGGCCS

Q9SF92 Ras-related protein RABC2b6.8e-7666.67Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS Q  +D  FK+LLIGDSGVGKS+LLL F S S EDL+PTIGVDFKIK + V GK+LKL IWDTAGQE+FRTLT SY+RG+QGII+VYDVT+RETF NL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPEVNA
        +DIWAKEI+LYSTN DCIKMLVGNKVD+ESER VS++EG+  A++  CLF ECSA+TR NV  CF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+       P+  A
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPEVNA

Query:  STGGCCS
          G CCS
Subjt:  STGGCCS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43890.1 RAB GTPASE HOMOLOG B184.8e-10185.1Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS QPEFDYLFK+LLIGDSGVGKS+LLL FTS++F+DLSPTIGVDFK+K++T+G KKLKLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGIIMVYDVTRR+TFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-VN
        SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCF+ELVLKIL+TPSL A+GS+G KKNIFK+ P +  +
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-VN

Query:  ASTGGCCS
         S+  CCS
Subjt:  ASTGGCCS

AT1G43890.2 RAB GTPASE HOMOLOG B184.8e-10185.1Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS QPEFDYLFK+LLIGDSGVGKS+LLL FTS++F+DLSPTIGVDFK+K++T+G KKLKLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGIIMVYDVTRR+TFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-VN
        SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCF+ELVLKIL+TPSL A+GS+G KKNIFK+ P +  +
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-VN

Query:  ASTGGCCS
         S+  CCS
Subjt:  ASTGGCCS

AT1G43890.3 RAB GTPASE HOMOLOG B184.8e-10185.1Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS QPEFDYLFK+LLIGDSGVGKS+LLL FTS++F+DLSPTIGVDFK+K++T+G KKLKLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGIIMVYDVTRR+TFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-VN
        SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCF+ELVLKIL+TPSL A+GS+G KKNIFK+ P +  +
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-VN

Query:  ASTGGCCS
         S+  CCS
Subjt:  ASTGGCCS

AT3G09910.1 RAB GTPase homolog C2B4.8e-7766.67Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS Q  +D  FK+LLIGDSGVGKS+LLL F S S EDL+PTIGVDFKIK + V GK+LKL IWDTAGQE+FRTLT SY+RG+QGII+VYDVT+RETF NL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPEVNA
        +DIWAKEI+LYSTN DCIKMLVGNKVD+ESER VS++EG+  A++  CLF ECSA+TR NV  CF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+       P+  A
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPEVNA

Query:  STGGCCS
          G CCS
Subjt:  STGGCCS

AT5G03530.1 RAB GTPase homolog C2A5.7e-8671.01Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS Q  +D  FK+LLIGDSGVGKS+LL+ F S S EDL+PTIGVDFKIK +TVGGK+LKL IWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGII+VYDVTRRETFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPEVNA
         D+W KEI+LYSTNQ+C++MLVGNKVD+ESER VS++EGI  A+E  C+FLECSA+TR NVEQCF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+NI K+KP     
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPEVNA

Query:  STGGCCS
        +  GCCS
Subjt:  STGGCCS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGTCGTCACCGTCTTCGAGTCAACCGGAGTTTGATTACTTGTTTAAATTGCTGTTGATTGGGGACTCTGGAGTTGGGAAGAGTACGCTTCTTTTGCGATTCACTTC
CGATTCCTTTGAGGATCTTTCTCCAACTATTGGTGTGGATTTCAAGATTAAGCATGTTACAGTTGGGGGAAAGAAGTTGAAGCTTGCAATATGGGACACAGCTGGACAAG
AGAGGTTTCGAACATTAACAGGTTCATACTACAGAGGAGCTCAAGGAATCATTATGGTGTATGATGTGACTCGGCGTGAGACATTCACAAATCTGTCTGACATATGGGCT
AAAGAAATTGACCTGTACTCAACAAATCAGGATTGCATCAAGATGCTTGTTGGAAACAAAGTGGATAAGGAAAGTGAAAGGGCAGTCAGTAAAAAAGAGGGAATTGACTT
CGCTCGAGAATATGGATGCCTATTTCTCGAATGCAGTGCGAAAACTCGAGTCAATGTGGAGCAGTGCTTTGATGAGCTTGTGTTGAAGATTTTGGACACGCCGAGTCTTT
TGGCTGATGGCTCAACAGGTTTGAAAAAGAACATCTTCAAAGAGAAACCTCCCGAAGTGAATGCATCAACCGGTGGCTGCTGCTCGTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGCACATTTTTCAAAAAAAAAAGAATTGAGGAAGAAGGAATCGGTGGGAAGCAGGAAAGTTTTCAATTCAGTCTGAAGAATAATTTCAAAGCATTTTCCATCCCTCTCTA
CTCAGTGAGTTTCTTACTTTCCCTTCTTCTGAAGGTGTTTGTTGTGTTTCTGATGTCGTCGTCACCGTCTTCGAGTCAACCGGAGTTTGATTACTTGTTTAAATTGCTGT
TGATTGGGGACTCTGGAGTTGGGAAGAGTACGCTTCTTTTGCGATTCACTTCCGATTCCTTTGAGGATCTTTCTCCAACTATTGGTGTGGATTTCAAGATTAAGCATGTT
ACAGTTGGGGGAAAGAAGTTGAAGCTTGCAATATGGGACACAGCTGGACAAGAGAGGTTTCGAACATTAACAGGTTCATACTACAGAGGAGCTCAAGGAATCATTATGGT
GTATGATGTGACTCGGCGTGAGACATTCACAAATCTGTCTGACATATGGGCTAAAGAAATTGACCTGTACTCAACAAATCAGGATTGCATCAAGATGCTTGTTGGAAACA
AAGTGGATAAGGAAAGTGAAAGGGCAGTCAGTAAAAAAGAGGGAATTGACTTCGCTCGAGAATATGGATGCCTATTTCTCGAATGCAGTGCGAAAACTCGAGTCAATGTG
GAGCAGTGCTTTGATGAGCTTGTGTTGAAGATTTTGGACACGCCGAGTCTTTTGGCTGATGGCTCAACAGGTTTGAAAAAGAACATCTTCAAAGAGAAACCTCCCGAAGT
GAATGCATCAACCGGTGGCTGCTGCTCGTATTGATTTTATGCTAAGAATTCGAGGAGCATCCTCATTTTGTTTTGGGCTACTCAGTTCCACAGTTCCATTTCAGCACACC
CTGAAGTCAAAAGGTTCATGTTCTTTCAATGAGAATGTCTACCAGAGTGATTTCTTTGTATTCTTTTAGTCTTTGTTTCTAGGTTGACGATTAATTGATTTATTCTGGTG
TGAGTTTGATTCACCTTGAACTTATAACTTCACAGATGGAAACGGATCCGAAACCTTAGGACTCCTATCAATACTCTGGTTTCTAAGAACAATTCTCTTAACTGCTTAGA
CGTCTTTCATTTGCCCTATCTAGCTATATGTGGCCGTTAGGGGCTTATCTATGTGATTTGCAACGCTTGCTTGCATCTATCGACAGATTGATCGATTTCATTGCTGGTCT
AGTTACCATAACTTTTTTGATAGTATCAAATGCTATTCTTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSSPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWA
KEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERAVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPEVNASTGGCCSY