; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0015677 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0015677
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionTubulin beta chain
Genome locationLG08:72757292..72759308
RNA-Seq ExpressionTan0015677
SyntenyTan0015677
Gene Ontology termsGO:0000278 - mitotic cell cycle (biological process)
GO:0000226 - microtubule cytoskeleton organization (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0005874 - microtubule (cellular component)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
GO:0005200 - structural constituent of cytoskeleton (molecular function)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR037103 - Tubulin/FtsZ-like, C-terminal domain
IPR036525 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily
IPR023123 - Tubulin, C-terminal
IPR018316 - Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain
IPR017975 - Tubulin, conserved site
IPR013838 - Beta tubulin, autoregulation binding site
IPR008280 - Tubulin/FtsZ, C-terminal
IPR003008 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain
IPR002453 - Beta tubulin
IPR000217 - Tubulin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
QFZ79247.1 tubulin beta chain-like protein [Luffa aegyptiaca]1.5e-26099.1Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P37392 Tubulin beta-1 chain5.0e-25495.92Show/hide
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P45960 Tubulin beta-4 chain2.5e-25394.62Show/hide
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Q56YW9 Tubulin beta-2 chain5.0e-25494.84Show/hide
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Q8H7U1 Tubulin beta-2 chain1.7e-25495.91Show/hide
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AT5G23860.2 tubulin beta 83.0e-25494.85Show/hide
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AT5G62700.1 tubulin beta chain 33.5e-25594.84Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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