; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0015965 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0015965
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionDUF688 domain-containing protein
Genome locationLG07:8680447..8682866
RNA-Seq ExpressionTan0015965
SyntenyTan0015965
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0042546.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold44G00400 [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-4263.69Show/hide
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        R G  GSKRWGSFRMC+              + GGGSGRFRR R+  SLS+SSY   SHFL+ IYESFKQVL WR R R
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KAG6605789.1 hypothetical protein SDJN03_03106, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.7e-6780.81Show/hide
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        SKRWGSFRMCKE VGGGNDSL   VDG GGGSGRF +K TPSLSVSSYGRSHFL+KIYE FK+V   R R R
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XP_022958693.1 uncharacterized protein LOC111459844 [Cucurbita moschata]8.2e-6981.4Show/hide
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        SKRWGSFRMCKE VGGGNDSL   VD GGGGSGRF +K TPSLSVSSYGRSHFL+KIYE FK+V  WR R R
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XP_022995989.1 uncharacterized protein At4g00950-like [Cucurbita maxima]2.4e-6881.4Show/hide
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        SKRWGSFRMCKE V GGNDSL  GVD GGGGSGRF +K TPSLSVSSYGRSHFL+KIYE FK+V   R R R
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XP_038875428.1 uncharacterized protein LOC120067888 [Benincasa hispida]2.3e-5877.56Show/hide
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        M SEP HT  ++S  TL LSWLPP+PP MPTPPRLTLASVPFLWEEAPGKPR SA S++ WP PALG+LPPPP+L NEAKQSTL SPTT+LDGPERAGD 
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        SKRWGSFRM K+FVGG   GNDSL AG D GGGSG FRRKRT S SVSSY RSHFL
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AU39 uncharacterized protein LOC1034829697.1e-4263.13Show/hide
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        M SEP HT    +ST TL LSWLP    P MPTPPRLTL SVPFLWEEAPGKPRPS  S++ W  P + G LPPPPRLL NE KQS  L SPTTVLDG E
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        R G  GSKRWGSFRMC+              + GGGSGRFRR R+  SLS+SSY  S  FL+ IYESFKQVL WR R R
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A0A5A7TKS5 Uncharacterized protein6.4e-4363.69Show/hide
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        M SEP HT    +ST TL LSWLP    P MPTPPRLTL SVPFLWEEAPGKPRPS  S++ W  P + G LPPPPRLL NE KQS  L SPTTVLDG E
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        R G  GSKRWGSFRMC+              + GGGSGRFRR R+  SLS+SSY   SHFL+ IYESFKQVL WR R R
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A0A6J1DV06 uncharacterized protein At4g00950-like2.3e-4059.55Show/hide
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        MWSEP H  E SST TL+LS L P+PP MPTPPRLTLAS+PFLWEEAPGKPR  AGS+   PSP L      L  PPRL     Q+ L SPTTVLDGPE 
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Query:  --RAGDGSKRWGSFRMCKEFVGGGNDSLVAGVDGGGGSGRFRRKRTPSLSVSSYGRSHFLIKIYESFKQVLS--WRGR
            G  SKRWGSFR CKE               GGG GR RRKR   LSVSSY +SHFL+ IYE FKQV++  WR R
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A0A6J1H3S6 uncharacterized protein LOC1114598444.0e-6981.4Show/hide
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        SKRWGSFRMCKE VGGGNDSL   VD GGGGSGRF +K TPSLSVSSYGRSHFL+KIYE FK+V  WR R R
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A0A6J1K7H0 uncharacterized protein At4g00950-like1.2e-6881.4Show/hide
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Query:  SKRWGSFRMCKEFVGGGNDSLVAGVD-GGGGSGRFRRKRTPSLSVSSYGRSHFLIKIYESFKQVLSWRGRPR
        SKRWGSFRMCKE V GGNDSL  GVD GGGGSGRF +K TPSLSVSSYGRSHFL+KIYE FK+V   R R R
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G27810.1 unknown protein1.2e-1238.15Show/hide
Query:  PSMPTPPRLTLASVPFLWEEAPGKPR------PSAGSEITWPSPALG---DLPPPPRLLNEAKQSTLLSPTTVLDGP--------------ERAGDGS--
        P + TPP     SVPFLWEEAPGKPR      P A  +        G    L  PPRL   A      SPTTVLDGP              ERA +G   
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Query:  -KRWGSFRMCKEFVGGGNDSLVAGVDGGGGS----GRFRRKRTPSLSVSSYGRSHFLIKIYESFKQVLSWRGR
          R  + R C               DGGGG+     R RRK   SL   S+ +S FL ++Y+ FKQV+ WR R
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AT5G51680.1 hydroxyproline-rich glycoprotein family protein5.8e-0446.15Show/hide
Query:  PPQPPSMPTPPRLTLASVPFLWEEAPGKPRPSAGSE-ITWPSPALGDLPPPP
        PP PP +P P +L + SVPF WEE PGKP P++ ++    P P L    P P
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AT5G53030.1 unknown protein4.0e-1333.5Show/hide
Query:  PSMPTPPRLTLASVPFLWEEAPGKPRPSAGSEITWPSPALGDLPPPPRLLNEAKQSTL--LSPTTVLDGP------------------------------
        P + TPP     SVPFLWEEAPGKPR             +  L  PPRL+   + +T+   SPTTVLDGP                              
Subjt:  PSMPTPPRLTLASVPFLWEEAPGKPRPSAGSEITWPSPALGDLPPPPRLLNEAKQSTL--LSPTTVLDGP------------------------------

Query:  -ERAGDGSKRWGSFRMCKEFVGG-------GNDSLVAGVD--GGGGSGRFRR----------KRTPSLSVSSYGRSHFLIK----IYESFKQVLSWR
         ER   GS RWGSF  CKE   G        +D      D  GGGG G F            K+    ++S   +S F +K    +YE FKQV+ W+
Subjt:  -ERAGDGSKRWGSFRMCKEFVGG-------GNDSLVAGVD--GGGGSGRFRR----------KRTPSLSVSSYGRSHFLIK----IYESFKQVLSWR

AT5G53030.2 unknown protein2.4e-1032.26Show/hide
Query:  PSMPTPPRLTLASVPFLWEEAPGKPRPSAGSEITWPSPALGDLPPPPRLLNEAKQSTL--LSPTTVLDGP------------------------------
        P + TPP     SVPFLWEEAPGKPR             +  L  PPRL+   + +T+   SPTTVLDGP                              
Subjt:  PSMPTPPRLTLASVPFLWEEAPGKPRPSAGSEITWPSPALGDLPPPPRLLNEAKQSTL--LSPTTVLDGP------------------------------

Query:  -ERAGDGSKRWGSFRMCKEFVGG-------GNDSLVAGVD--GGGGSGRFRR----------KRTPSLSVSSYGRSHFLIKIYESF
         ER   GS RWGSF  CKE   G        +D      D  GGGG G F            K+    ++S   +S F +  Y+ F
Subjt:  -ERAGDGSKRWGSFRMCKEFVGG-------GNDSLVAGVD--GGGGSGRFRR----------KRTPSLSVSSYGRSHFLIKIYESF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGTCGGAGCCGTCCCACACGGCGGAGCAGAGCTCTACTCTGACTCTTGCTCTGTCTTGGCTTCCGCCGCAGCCTCCCTCGATGCCCACGCCGCCTCGTTTAACATT
GGCCTCCGTTCCCTTTTTGTGGGAGGAGGCGCCGGGGAAGCCCCGGCCATCCGCTGGATCGGAAATTACGTGGCCGTCGCCGGCGCTGGGGGACCTGCCTCCGCCTCCCC
GGCTGTTGAACGAAGCCAAACAGAGCACTCTGCTCTCGCCCACGACGGTGCTCGACGGGCCGGAAAGGGCTGGCGACGGATCGAAGAGATGGGGTAGTTTCAGGATGTGT
AAGGAGTTCGTCGGCGGCGGCAACGACTCTTTGGTCGCCGGTGTTGACGGCGGCGGTGGAAGCGGGAGGTTTAGAAGGAAAAGGACTCCGTCATTGTCGGTTTCTTCTTA
TGGAAGATCACACTTCTTGATCAAGATCTATGAGAGCTTTAAACAAGTTCTTTCGTGGAGAGGAAGACCAAGATATAATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCTAAAATTCAATAATCTCTATTCAACTCTCAACCACCCCACTCACAAACTCACTCTCTTCTTTCTTCTTCTTTACCCATGTGGTCGGAGCCGTCCCACACGGCGGAGC
AGAGCTCTACTCTGACTCTTGCTCTGTCTTGGCTTCCGCCGCAGCCTCCCTCGATGCCCACGCCGCCTCGTTTAACATTGGCCTCCGTTCCCTTTTTGTGGGAGGAGGCG
CCGGGGAAGCCCCGGCCATCCGCTGGATCGGAAATTACGTGGCCGTCGCCGGCGCTGGGGGACCTGCCTCCGCCTCCCCGGCTGTTGAACGAAGCCAAACAGAGCACTCT
GCTCTCGCCCACGACGGTGCTCGACGGGCCGGAAAGGGCTGGCGACGGATCGAAGAGATGGGGTAGTTTCAGGATGTGTAAGGAGTTCGTCGGCGGCGGCAACGACTCTT
TGGTCGCCGGTGTTGACGGCGGCGGTGGAAGCGGGAGGTTTAGAAGGAAAAGGACTCCGTCATTGTCGGTTTCTTCTTATGGAAGATCACACTTCTTGATCAAGATCTAT
GAGAGCTTTAAACAAGTTCTTTCGTGGAGAGGAAGACCAAGATATAATTAACTTCAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MWSEPSHTAEQSSTLTLALSWLPPQPPSMPTPPRLTLASVPFLWEEAPGKPRPSAGSEITWPSPALGDLPPPPRLLNEAKQSTLLSPTTVLDGPERAGDGSKRWGSFRMC
KEFVGGGNDSLVAGVDGGGGSGRFRRKRTPSLSVSSYGRSHFLIKIYESFKQVLSWRGRPRYN