; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0015988 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0015988
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationLG08:1007800..1008684
RNA-Seq ExpressionTan0015988
SyntenyTan0015988
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAB5395720.1 unnamed protein product [Rhizophagus irregularis]2.5e-1143.84Show/hide
Query:  LVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFR---SASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPD-SLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPFGLGFELQIG
        L L L  G RLG R G GL     LG R          + +   +   LG  L  G    LG   GLG    L LG  F GL L   GL  GLG  L +G
Subjt:  LVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFR---SASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPD-SLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPFGLGFELQIG

Query:  PQLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGLYRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHIGLVFGF
          L L LGL   LGL L   LG  L L LGL  L L LG  L L LG  L LG  L L LGL   L LGL L LG     GLGL  GLGL   +GL  G 
Subjt:  PQLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGLYRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHIGLVFGF

Query:  GSG
        G G
Subjt:  GSG

PVD20299.1 hypothetical protein C0Q70_18453 [Pomacea canaliculata]3.4e-1346Show/hide
Query:  GPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPFGLGFELQIGP
        G GL LGL  G  LG   G GL     LG         V VR RV  RLG  L  G   LG   GLG    L LG    GL L   GL  GLG  L +G 
Subjt:  GPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPFGLGFELQIGP

Query:  QLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGLYRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHIGLVFGFG
         L L LGL   LGL L   LG  L L LG   L L LG  L L LG  L LG  L L LGL   L LGL L LG     GLGL  GLGL   +GL  G G
Subjt:  QLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGLYRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHIGLVFGFG

RMB95088.1 hypothetical protein DUI87_28459 [Hirundo rustica rustica]7.7e-1343.54Show/hide
Query:  GPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPFGLGFELQIGP
        GPGL LGL  G  LG   G G      LG         + +       LGP L  GP   G   GLGP   L LG          PGL  G G  L +GP
Subjt:  GPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPFGLGFELQIGP

Query:  QLTLRLGLPSRLGL----DLPSRLGPELPLRLGL-YRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGP--ELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHI
         L L LGL   LGL     L   LGP L L LGL     L LGP L L LGP L LGP   L L LGL   L LGL L LGP    GLGL  GLGL   +
Subjt:  QLTLRLGLPSRLGL----DLPSRLGPELPLRLGL-YRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGP--ELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHI

Query:  GLVFGFGSG
        G   G G G
Subjt:  GLVFGFGSG

RMC10348.1 hypothetical protein DUI87_13151 [Hirundo rustica rustica]1.7e-1243.54Show/hide
Query:  ASHGPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFS---GLVLARPGLPFGLGF
        A  G GL LGL  G  LG   G GL     LG         + +   +   LGP L  G   LG   GLG    L+LG       GL L   GL  GLG 
Subjt:  ASHGPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFS---GLVLARPGLPFGLGF

Query:  ELQIGPQLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGL-YRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHI
         L +G  L L LGL   LGL L   LG  L L LGL   L+L LG  L L LG  L LG EL L LGL   L LGL L LG     GLGL  GLGL   +
Subjt:  ELQIGPQLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGL-YRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHI

Query:  GLVFGFGSG
        GL  G G G
Subjt:  GLVFGFGSG

WP_199731279.1 hypothetical protein [Paraburkholderia sp. RAU2J]2.0e-1344.34Show/hide
Query:  LVWAWEWASHGPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPF
        L WAW WA  G GL LGL  G  LG   G GL     LG         + +   +   LG  L  G   LG   GLG    L LG    GL L   GL  
Subjt:  LVWAWEWASHGPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPF

Query:  GLGFELQIGPQLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGLYRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLS
        GLG  L +G  L L LGL   LGL L   LG  L L LGL  L L LG  L L LG  L LG  L L LGL   L LGL L LG     GLGL  GLGL 
Subjt:  GLGFELQIGPQLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGLYRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLS

Query:  FHIGLVFGFGSG
          +GL  G G G
Subjt:  FHIGLVFGFGSG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2T7NGK4 Uncharacterized protein1.7e-1346Show/hide
Query:  GPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPFGLGFELQIGP
        G GL LGL  G  LG   G GL     LG         V VR RV  RLG  L  G   LG   GLG    L LG    GL L   GL  GLG  L +G 
Subjt:  GPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPFGLGFELQIGP

Query:  QLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGLYRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHIGLVFGFG
         L L LGL   LGL L   LG  L L LG   L L LG  L L LG  L LG  L L LGL   L LGL L LG     GLGL  GLGL   +GL  G G
Subjt:  QLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGLYRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHIGLVFGFG

A0A3M0J2I3 Uncharacterized protein3.7e-1343.54Show/hide
Query:  GPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPFGLGFELQIGP
        GPGL LGL  G  LG   G G      LG         + +       LGP L  GP   G   GLGP   L LG          PGL  G G  L +GP
Subjt:  GPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPFGLGFELQIGP

Query:  QLTLRLGLPSRLGL----DLPSRLGPELPLRLGL-YRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGP--ELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHI
         L L LGL   LGL     L   LGP L L LGL     L LGP L L LGP L LGP   L L LGL   L LGL L LGP    GLGL  GLGL   +
Subjt:  QLTLRLGLPSRLGL----DLPSRLGPELPLRLGL-YRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGP--ELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHI

Query:  GLVFGFGSG
        G   G G G
Subjt:  GLVFGFGSG

A0A3M0KB37 Uncharacterized protein8.3e-1343.54Show/hide
Query:  ASHGPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFS---GLVLARPGLPFGLGF
        A  G GL LGL  G  LG   G GL     LG         + +   +   LGP L  G   LG   GLG    L+LG       GL L   GL  GLG 
Subjt:  ASHGPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFS---GLVLARPGLPFGLGF

Query:  ELQIGPQLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGL-YRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHI
         L +G  L L LGL   LGL L   LG  L L LGL   L+L LG  L L LG  L LG EL L LGL   L LGL L LG     GLGL  GLGL   +
Subjt:  ELQIGPQLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGL-YRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHI

Query:  GLVFGFGSG
        GL  G G G
Subjt:  GLVFGFGSG

A0A5S6PCZ6 Uncharacterized protein5.4e-1244.71Show/hide
Query:  GPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPFGLGFELQIGP
        G GL LGL  G  LG   G GL     LG         + +R R+  RLG  L  G   LG   GLG    L LG    GL L   GL  GLG  L +G 
Subjt:  GPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPFGLGFELQIGP

Query:  QLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGL-----YRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGLKHL-LRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHIG
         L L LGL   LGL L  RL   L LRL L      RL L LG  L L LG  LRL   L L L L+ L L LGL L LG     GLGL  GLGLS  +G
Subjt:  QLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGL-----YRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGLKHL-LRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHIG

Query:  LVFGFGSG
        L  G G G
Subjt:  LVFGFGSG

A0A674N4X4 Uncharacterized protein8.3e-1342.61Show/hide
Query:  VNLLIRAGARAFTLVWAWEWASHGPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQ
        V   +RA  RA   V A        GL LGL  G  LG   G GL     LG         + +R  +   LG  L  G   LG   GLG    L LG  
Subjt:  VNLLIRAGARAFTLVWAWEWASHGPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRARVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQ

Query:  FSGLVLARP-GLPFGLGFELQIGPQLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGL---YRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGL-KHLLRLGLQLW
         SGL L    GL  GLG  L +G  L L LGL   LGL L   LG  L LRLGL     L L LG  L LWLG  L LG  L L LGL     RLGL L 
Subjt:  FSGLVLARP-GLPFGLGFELQIGPQLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGL---YRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGPELSLPLGL-KHLLRLGLQLW

Query:  LGPDFFFGLGLKFGLGLSFHIGLVFGFGSG
        LG     GLGL  GLGL   +GL  G G G
Subjt:  LGPDFFFGLGLKFGLGLSFHIGLVFGFGSG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATTCGCCGGCGAAATACTTGGCAGAATCTAGACTCTCAAATTTCCACTACTCTCCGCCAGTCGGATCCCCACCAAAACGGAGACCGGGTACGGTCACCCATGGTAG
GGACGAGTTTAAGAAAAGGACGGTAAATTTGCTGATTCGGGCAGGGGCTCGGGCTTTCACTTTAGTTTGGGCTTGGGAGTGGGCTTCGCATGGGCCTGGCTTGGTTTTGG
GCTTAACATTCGGCTGGCGCTTGGGCTTCCGTTTTGGGTCAGGCCTGAGCTTTCACTCCGACTTGGGCTTTCGTTCTGCTTCAGCTTGGGCTTCAGTTTCGGTTCGGGCT
AGGGTTTCCTTTCGGCTTGGGCCTCAGCTTTGGTTCGGGCCTGACTCTTTGGGCTTCCGTTCAGGCCTGGGCCCGACCTTTTTCTTAGACTTGGGCTTTCAGTTTTCCGG
CTTGGTTTTGGCTCGTCCTGGGCTTCCTTTCGGCTTGGGCTTTGAGTTACAGATCGGGCCTCAGCTTACGCTCCGGCTTGGGCTTCCATCACGGCTCGGGCTTGACCTTC
CATCACGGCTCGGGCCTGAGCTTCCTCTTCGGCTTGGGCTTTATCGGCTTCAATTACAGCTTGGGCCGAAGCTGATACTTTGGCTTGGGCCTAAGCTTAGGCTCGGGCCT
GAGCTATCTCTCCCGCTTGGGCTTAAGCATCTGCTTCGGCTTGGGCTTCAGTTATGGCTCGGGCCTGATTTCTTCTTTGGCTTGGGCCTCAAATTCGGCTTGGGCCTGAG
CTTCCACATCGGCTTGGTCTTCGGATTCGGCTCGGGCTCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATTCGCCGGCGAAATACTTGGCAGAATCTAGACTCTCAAATTTCCACTACTCTCCGCCAGTCGGATCCCCACCAAAACGGAGACCGGGTACGGTCACCCATGGTAG
GGACGAGTTTAAGAAAAGGACGGTAAATTTGCTGATTCGGGCAGGGGCTCGGGCTTTCACTTTAGTTTGGGCTTGGGAGTGGGCTTCGCATGGGCCTGGCTTGGTTTTGG
GCTTAACATTCGGCTGGCGCTTGGGCTTCCGTTTTGGGTCAGGCCTGAGCTTTCACTCCGACTTGGGCTTTCGTTCTGCTTCAGCTTGGGCTTCAGTTTCGGTTCGGGCT
AGGGTTTCCTTTCGGCTTGGGCCTCAGCTTTGGTTCGGGCCTGACTCTTTGGGCTTCCGTTCAGGCCTGGGCCCGACCTTTTTCTTAGACTTGGGCTTTCAGTTTTCCGG
CTTGGTTTTGGCTCGTCCTGGGCTTCCTTTCGGCTTGGGCTTTGAGTTACAGATCGGGCCTCAGCTTACGCTCCGGCTTGGGCTTCCATCACGGCTCGGGCTTGACCTTC
CATCACGGCTCGGGCCTGAGCTTCCTCTTCGGCTTGGGCTTTATCGGCTTCAATTACAGCTTGGGCCGAAGCTGATACTTTGGCTTGGGCCTAAGCTTAGGCTCGGGCCT
GAGCTATCTCTCCCGCTTGGGCTTAAGCATCTGCTTCGGCTTGGGCTTCAGTTATGGCTCGGGCCTGATTTCTTCTTTGGCTTGGGCCTCAAATTCGGCTTGGGCCTGAG
CTTCCACATCGGCTTGGTCTTCGGATTCGGCTCGGGCTCGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNSPAKYLAESRLSNFHYSPPVGSPPKRRPGTVTHGRDEFKKRTVNLLIRAGARAFTLVWAWEWASHGPGLVLGLTFGWRLGFRFGSGLSFHSDLGFRSASAWASVSVRA
RVSFRLGPQLWFGPDSLGFRSGLGPTFFLDLGFQFSGLVLARPGLPFGLGFELQIGPQLTLRLGLPSRLGLDLPSRLGPELPLRLGLYRLQLQLGPKLILWLGPKLRLGP
ELSLPLGLKHLLRLGLQLWLGPDFFFGLGLKFGLGLSFHIGLVFGFGSGS