; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0016109 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0016109
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionbasic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
Genome locationLG09:68878886..68881751
RNA-Seq ExpressionTan0016109
SyntenyTan0016109
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058209.1 transcription factor bHLH35 [Cucumis melo var. makuwa]6.1e-8983.33Show/hide
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XP_004146337.1 transcription factor bHLH35 [Cucumis sativus]2.3e-8883.96Show/hide
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XP_008453552.1 PREDICTED: transcription factor bHLH35 [Cucumis melo]4.7e-8984.43Show/hide
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XP_022135507.1 transcription factor bHLH35-like [Momordica charantia]1.3e-9186.51Show/hide
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XP_038878729.1 transcription factor bHLH35-like isoform X2 [Benincasa hispida]2.6e-8781.14Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LU95 BHLH domain-containing protein1.1e-8883.96Show/hide
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A0A1S3BWL7 transcription factor bHLH352.3e-8984.43Show/hide
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A0A5A7UXG0 Transcription factor bHLH353.0e-8983.33Show/hide
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A0A6J1C2W6 transcription factor bHLH35-like6.4e-9286.51Show/hide
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A0A6J1E262 transcription factor bHLH35-like2.1e-8782.65Show/hide
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        MDS G D M Y G+ +FI  +E+DSWGFDEPVSGYYDSSSPEGV     A+KNI SERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAIDYIQDLHEQ
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        ERR+Q EI ELESGK  KITG EFDQELP LLR KRKKTE+ FSY SPASRTSPIEV DLSVTYMG+RT+ VS+TCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITA
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        NI+AVSGRLLKTVFIE  K
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0JEB7 Transcription factor BHLH65.9e-3442.59Show/hide
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        G A+KNI+ ER+RRRKLNE+L+ALRSVVPNITKMDKASIIKDAI+YIQ L  +E+++  E+  LES           N   G      +E+    P    
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         + KK ++  S  S        A+   P+E+ +L V+ +G+R +VVS+TC KR D+M ++C   E L+L++ITANIT+V+G L+ T+F+EV  + S+ + 
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             + +E   S LV
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Q0V7X4 Transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR1.6e-1529.49Show/hide
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        ++ E + ++ G+S+    E D   +++       +++ +G        S+ ++SER RR ++ ++L+ALRS+VPNITKMDKASI+ DA+ Y+Q+L  Q +
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        +++++I  LE+  LN   GY+  +  P       +KT+ F   + PAS+    +++ + V  + E+   V L C K       L +  ESL   ++  +N
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Query:  ITAVSG-------RLLKTVFIEVTKLPSLSLFLT
        +++ S         L  T F +   LP+L L++T
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Q2HIV9 Transcription factor bHLH352.8e-5254.62Show/hide
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        D + ++   Y   S F+ +E      SW  +E +SG YDSSSP+G     ASKNIVSERNRR+KLN+RLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI YI+ L  
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Query:  QERRIQAEIYELESGKLNKIT-GYEFDQELPFLLRSKRKKTEQFSYDSPASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIIT
        +E++++AEI ELES   + ++   +FD++L   + SK+ K      DS  S TS IEVL+L VT+MGERTMVVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T
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        +N+T+ SG +  TVFIE  +     L L     +IETG
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Q700E3 Transcription factor bHLH275.6e-4546.81Show/hide
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        M+ +  +Y  Y   +MF  +   E DSW  +E  SG  +SSSP+G A     SKN+VSERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+K+DKAS+IKD+IDY+Q+L 
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Query:  EQERRIQAEIYELESGKL---NKITGYEFD------QELPFLLRSKRKKTEQFSYDSPASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVF
        +QE+ ++AEI ELES      N +  Y+ +      Q+       + KK +Q  Y S   +  PIEVL++ VT+MGE+T+VV +TC K+ ++MV+LC+V 
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Query:  ESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEVTKLPSLSL
        ESL L I+T N ++ + RL  T+F++VT   S SL
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Q9ZVX2 Transcription factor ABORTED MICROSPORES6.7e-1431.41Show/hide
Query:  ADEIDSWGFDEPVSGYYDSSSPEGVASKNIVSERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAIDYIQDLHEQERRIQAEI---YELESG-------
        +D+ID    D+P    Y   S +G  +KN+++ER RR+KLN+RL+ALRS+VP ITK+D+ASI+ DAI+Y+++L  + + +Q E+    E E G       
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Query:  -KLN--KITGYEFDQELPFLLRSKRKKTEQFSYDSPASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANIT
          LN   +TG+         + S ++  +  + +       P     + V  +  R   V + C  +     +L E  +SL L++  AN T
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G29930.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.0e-4646.81Show/hide
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Query:  EQERRIQAEIYELESGKL---NKITGYEFD------QELPFLLRSKRKKTEQFSYDSPASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVF
        +QE+ ++AEI ELES      N +  Y+ +      Q+       + KK +Q  Y S   +  PIEVL++ VT+MGE+T+VV +TC K+ ++MV+LC+V 
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Query:  ESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEVTKLPSLSL
        ESL L I+T N ++ + RL  T+F++VT   S SL
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AT5G57150.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.1e-5455.27Show/hide
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        D + ++   Y   S F+ +   E DSW  +E +SG YDSSSP+G     ASKNIVSERNRR+KLN+RLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI YI+ L  +
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Query:  ERRIQAEIYELESGKLNKIT-GYEFDQELPFLLRSKRKKTEQFSYDSPASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITA
        E++++AEI ELES   + ++   +FD++L   + SK+ K      DS  S TS IEVL+L VT+MGERTMVVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T+
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Query:  NITAVSGRLLKTVFIEVTKLPSLSLFLTRNSKQIETG
        N+T+ SG +  TVFIE  +     L L     +IETG
Subjt:  NITAVSGRLLKTVFIEVTKLPSLSLFLTRNSKQIETG

AT5G57150.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.7e-5557.08Show/hide
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        D + ++   Y   S F+ +E      SW  +E +SG YDSSSP+G     ASKNIVSERNRR+KLN+RLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI YI+ L  
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Query:  QERRIQAEIYELESGKLNKIT-GYEFDQELPFLLRSKRKKTEQFSYDSPASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIIT
        +E++++AEI ELES   + ++   +FD++L   + SK+ K      DS  S TS IEVL+L VT+MGERTMVVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T
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AT5G57150.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein6.8e-5456.88Show/hide
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AT5G57150.4 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.2e-5356.88Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AATAAGATAACAGGGTATGAGTTTGACCAGGAGCTGCCATTCTTGCTCAGATCAAAGAGGAAGAAAACAGAGCAGTTCAGCTATGATTCTCCTGCTTCAAGAACTTCCCC
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GCTTGACATGTTGTAAAAGAGCAGATTCAATGGTTAAACTATGTGAAGTTTTTGAATCACTGAAGCTCAAGATCATCACTGCCAATATTACTGCTGTCTCTGGAAGGCTT
TTGAAAACTGTCTTCATTGAGGTAACTAAACTACCCTCTCTCTCTCTTTTTCTTACAAGAAATTCAAAACAAATTGAAACTGGGGCTTCTCTTTTGGTTTTAGTGCTTGA
AGTGTTTTGTTTGATTCTTCCCCAAACCTGTTCAAATGGATAATAATGCATGTGAGATCTGACTGAGCAGAGTCAATCGATACATATAAATGGGATGTGGAATTGTTTGA
TTACATTTTCTTTGAATGAGACTATAAGAAGAATGAAATGGACAAAATCTTATGAGGAAAAATAAGAAACTTGTGGCCTTGCTAGGAAATTGGGTATGTTTCTTTGATTT
TTCTCAATCATTGAGATAGAAGACATGTCTGCCACGGCATATAATTAATCCTCAAAAAAGAAAGGAGAACGAGAGAGATGCTGATGTGCTTTTGTCTGAATATATGGTGG
TTCAGTATAATGTTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGTCGTTTTCTTTGAGTAGTTAGGTGATGTCTCATATATATTATATGGTAGTTGTTTGAATTC
ACCATGTGCTTCAATGTCATTCTGTCGTTTTTACCGAATTTTCTTTTGAAATATATTTATAAAAAGGTTAAATTAAAAAGGTTAAATTATAAATTTAGTGTCTATGTTTT
CTTTGATTAGACTCAGTTGTTTGATGACGGTGGTAGGGGCTATTTATGAAGATTTTTATCAAAAGACGAATTTTAACCTTTAAAATTATAAGAATTAAATTCTAATTTAT
CCGAAACTTAAAAGACCAAATTTGTAATTTAGCCTTATAAAAATTTTGGATATCAAGATTGTTACCTGGCTTTTTTGGTTGTAATGGGGTGGGTGAGACGACGTTTTGTT
TTGTATTGTTTTTCCTCATAGGGACTGTTTTGTATGGTTTTTAAAAACTGTTTTTTTATTATATATTATATTTTCTAAAAGCATTCATGTTTTCTTTCTCCGCGGTCCAG
TCGTCCAGATAAATAAATTGTGTCCTCAACTTATGTTTTGTTTTGTATTTTTTTCCCCTTAAATAAAGTGCGACATTTTGTTACTCATTTAATAATTCCAAAATTGTATA
ACATATTTTGCCAGCAGGAAAAAAAAATATTTTATAACACCATCCACTTCCCGTTGCTAAATATAGAAACAATCTCTGAATTGCATACAAAATTCAAAAACTGAACTTTT
TGTTTCATAACCTTCTAAACCATCAGTGACACTCGGACTCCATTTCAAAAAAAGAAAAAACGACACTTGACTCAAGAAATACACAGATAGAATCGAAATTAAGGGGGGAA
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TAAAAAGGCAAACTTAGAAAATACAGAACAAAATGGGGTGTAAGCTCAGTCTTGTGTGCTTTCCAAGGGTGGGTCTATCAGGAATCCATTCAACAATGAGCTGTTCCAAC
CAAACAAGGGTAAGATTATAGAGTGAAAAAGTAAAACAAAAGATATATTATGCAAATAAAGAATGAGACCAAAACCAATTTGTGGACTCATAGTCAATAGAGCCACTTTG
TCAAAGTGGAAGATCCACTTGTGAAGCAATTTTGGTGGGGTTGAGAATGACAGCATTTTGCCATTACCTCATCTCATCACCCCATATCTTGGAAATATATATATATATAT
ATATATATATATATAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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TRNSKQIETGASLLVLVLEVFCLILPQTCSNG