; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0016286 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0016286
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionDomain of unknown function (DUF303)
Genome locationLG02:81293297..81294163
RNA-Seq ExpressionTan0016286
SyntenyTan0016286
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR005181 - Sialate O-acetylesterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022973316.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita maxima]3.8e-13581.72Show/hide
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XP_023002177.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita maxima]1.5e-13683.68Show/hide
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XP_023536885.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.6e-13682.99Show/hide
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XP_023536887.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.6e-13682.99Show/hide
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XP_038886442.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Benincasa hispida]2.6e-13681.6Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BQ38 probable carbohydrate esterase At4g342155.2e-13079.17Show/hide
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A0A6J1GIT2 probable carbohydrate esterase At4g342154.5e-13481.25Show/hide
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A0A6J1GJF6 probable carbohydrate esterase At4g342153.1e-13582.29Show/hide
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A0A6J1I774 probable carbohydrate esterase At4g342151.8e-13581.72Show/hide
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A0A6J1KIR8 probable carbohydrate esterase At4g342157.5e-13783.68Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342155.8e-4637.45Show/hide
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        + S   P  IFIL+GQSNMAGRGGV +++   + +WD  +PPEC PN SI+RL+ + +WE A EPLH  ID GK  G+GPG+ FA  ++ +    + V+G
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Query:  LVPCARGGTLIEQWIKNPSNPNATFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTASRYKENLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKIALYDFFMQH
        LVPCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y  N+ + I ++R+D+    LP+I V IA    ++  
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Query:  DTHDLPTVRAAEDAVQQELPDIVTIDSLKLPINLTTHEGFNLDHGHFNTTTEIVLGKWLADTYLSHY
                +  E  +  +L ++V +D+  LP+          D+ H  T  ++ LG  LA  YLS++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)3.5e-4640.15Show/hide
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        T   +IFILAGQSNMAGRGGV  +      +WDG +PPEC+ NPSI+RL  + +W+ A+EPLH  IDI K  G+GPG+PFA     +   + G VGLVPC
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Query:  ARGGTLIEQWIKNPSNPNATFYQNFIERIKA--SDKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTASRYKENLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKIALYDFFMQHDT
        + GGT + QW K         Y+  ++R KA  +   GG  RA+ WYQGESD      AS YK+ L KF +D+RND++   LP+I V +A         T
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Query:  HDLPTVRAAEDA-VQQELPDIVTIDSLKLPINLTTHEGFNLDHGHFNTTTEIVLGKWLADTYLS
           P + A   A ++ +L ++  +D+  LP+          D  H  T++++ LG  +A+++L+
Subjt:  HDLPTVRAAEDA-VQQELPDIVTIDSLKLPINLTTHEGFNLDHGHFNTTTEIVLGKWLADTYLS

AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)4.1e-4737.45Show/hide
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        + S   P  IFIL+GQSNMAGRGGV +++   + +WD  +PPEC PN SI+RL+ + +WE A EPLH  ID GK  G+GPG+ FA  ++ +    + V+G
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Query:  LVPCARGGTLIEQWIKNPSNPNATFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTASRYKENLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKIALYDFFMQH
        LVPCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y  N+ + I ++R+D+    LP+I V IA    ++  
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Query:  DTHDLPTVRAAEDAVQQELPDIVTIDSLKLPINLTTHEGFNLDHGHFNTTTEIVLGKWLADTYLSHY
                +  E  +  +L ++V +D+  LP+          D+ H  T  ++ LG  LA  YLS++
Subjt:  DTHDLPTVRAAEDAVQQELPDIVTIDSLKLPINLTTHEGFNLDHGHFNTTTEIVLGKWLADTYLSHY

AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)4.1e-4737.45Show/hide
Query:  LSSATSPTNIFILAGQSNMAGRGGV-EENQMGKLMWDGYVPPECQPNPSIVRLNPERQWEIAREPLHEGIDIGKATGIGPGIPFARQLQAKAAQKAGVVG
        + S   P  IFIL+GQSNMAGRGGV +++   + +WD  +PPEC PN SI+RL+ + +WE A EPLH  ID GK  G+GPG+ FA  ++ +    + V+G
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Query:  LVPCARGGTLIEQWIKNPSNPNATFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTASRYKENLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKIALYDFFMQH
        LVPCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y  N+ + I ++R+D+    LP+I V IA    ++  
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Query:  DTHDLPTVRAAEDAVQQELPDIVTIDSLKLPINLTTHEGFNLDHGHFNTTTEIVLGKWLADTYLSHY
                +  E  +  +L ++V +D+  LP+          D+ H  T  ++ LG  LA  YLS++
Subjt:  DTHDLPTVRAAEDAVQQELPDIVTIDSLKLPINLTTHEGFNLDHGHFNTTTEIVLGKWLADTYLSHY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTTTCTTGAAACTATCAATCTTCCTATGTACAGTGTTATTTGGCTCTTCCCTTTCAAGTGCTACTTCTCCTACAAACATATTCATTCTCGCCGGTCAGAGCAACAT
GGCTGGTCGAGGTGGTGTTGAGGAAAATCAAATGGGGAAGCTTATGTGGGATGGGTATGTGCCACCAGAGTGTCAACCCAACCCATCTATCGTACGATTGAACCCTGAGC
GCCAATGGGAGATAGCACGAGAGCCTCTCCACGAGGGAATTGATATCGGCAAGGCCACTGGGATTGGTCCGGGAATACCATTTGCTCGCCAACTGCAAGCGAAAGCCGCA
CAAAAGGCAGGCGTCGTGGGTTTAGTTCCTTGTGCTAGAGGTGGCACTTTAATCGAACAATGGATTAAAAACCCTAGCAATCCTAATGCAACTTTCTACCAAAATTTTAT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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