; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0016351 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0016351
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionserine/arginine-rich splicing factor RSZ21
Genome locationLG04:11384318..11388855
RNA-Seq ExpressionTan0016351
SyntenyTan0016351
Gene Ontology termsGO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR001878 - Zinc finger, CCHC-type
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily
IPR036875 - Zinc finger, CCHC-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK15593.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]2.5e-9296.79Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR----GGGGGDDLKCYE
        MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR    GGGGGDDLKCYE
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR----GGGGGDDLKCYE

Query:  CGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANG
        CGEPGHFARECRSRGGSR G GGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANG
Subjt:  CGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANG

XP_008446226.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor RSZ21 [Cucumis melo]5.1e-9396.81Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR----GGGGGDDLKCYE
        MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR    GGGGGDDLKCYE
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR----GGGGGDDLKCYE

Query:  CGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
        CGEPGHFARECRSRGGSR G GGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
Subjt:  CGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD

XP_011655636.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21 [Cucumis sativus]6.7e-9396.3Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR-----GGGGGDDLKCY
        MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR     GGGGGDDLKCY
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR-----GGGGGDDLKCY

Query:  ECGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
        ECGEPGHFARECRSRGGSR G GGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
Subjt:  ECGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD

XP_022956661.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21-like [Cucurbita moschata]3.1e-9096.26Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR--GGGGGDDLKCYECG
        MTRVYIGNLDPRVTER+LEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR  GGGGGDDLKCYECG
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR--GGGGGDDLKCYECG

Query:  EPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS-PRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
        EPGHFARECRSRGGSR G GGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS PRRRSITPPKRGRSYSRSPP RHARRASPYANGD
Subjt:  EPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS-PRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD

XP_038892593.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21 [Benincasa hispida]2.8e-9197.28Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGEP
        MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR  GGGDDLKCYECGEP
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGEP

Query:  GHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
        GHFARECRSRGGSRG   GGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
Subjt:  GHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BEJ4 serine/arginine-rich splicing factor RSZ212.5e-9396.81Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR----GGGGGDDLKCYE
        MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR    GGGGGDDLKCYE
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR----GGGGGDDLKCYE

Query:  CGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
        CGEPGHFARECRSRGGSR G GGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
Subjt:  CGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD

A0A5D3CUM7 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ21 isoform X11.2e-9296.79Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR----GGGGGDDLKCYE
        MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR    GGGGGDDLKCYE
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR----GGGGGDDLKCYE

Query:  CGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANG
        CGEPGHFARECRSRGGSR G GGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANG
Subjt:  CGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANG

A0A6J1DBV4 serine/arginine-rich splicing factor RSZ217.4e-9095.11Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGEP
        MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHN+KG GGGGGRRGR  GGGDDLKCYECGEP
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGEP

Query:  GHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
        GHFARECRSRG SR   GGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARR+SPYANGD
Subjt:  GHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD

A0A6J1GX57 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21-like1.5e-9096.26Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR--GGGGGDDLKCYECG
        MTRVYIGNLDPRVTER+LEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR  GGGGGDDLKCYECG
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR--GGGGGDDLKCYECG

Query:  EPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS-PRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
        EPGHFARECRSRGGSR G GGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS PRRRSITPPKRGRSYSRSPP RHARRASPYANGD
Subjt:  EPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS-PRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD

A0A6J1KZV2 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21-like2.6e-9095.24Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR----GGGGGDDLKCYE
        MTRVYIGNLDPRVTER+LEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR    GGGGGDDLKCYE
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGR----GGGGGDDLKCYE

Query:  CGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS-PRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
        CGEPGHFARECRSRGGSR G GGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS PRRRSITPPKRGRSYSRSPP RHARRASPYANGD
Subjt:  CGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS-PRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81126 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ222.5e-5868.56Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHN--SKGGGG-----GGGRRGRGGGGGDDLK
        M+RVY+GNLDPRVTER+LEDEFR FGV+RSVWVARRPPGYAF++F+D RDA DAI+ALDGKNGWRVE SHN   +GGGG     GGG  GRGG GG DLK
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHN--SKGGGG-----GGGRRGRGGGGGDDLK

Query:  CYECGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKR--SPRRRSIT-PPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
        CYECGE GHFARECR+RGG+         R+P PR RRSPS   YGRRS SPR +    PRRRS + PP RGRSYSRSPP   AR   PYANG+
Subjt:  CYECGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKR--SPRRRSIT-PPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD

O81127 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ218.0e-6572.08Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGG-GGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGE
        MTRVY+GNLDPRVTER+LEDEF+ FGVLR+VWVARRPPGYAF+EFDD RDALDAI ALD KNGWRVELSH  KGG GGGGGRR    GG +D KCYECGE
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGG-GGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGE

Query:  PGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS-PRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHAR------------RASPYANG
         GHFARECR       G G   RRSPSPRRRRSP Y  Y RRS SPRG+RS PRRRS+TPP+RGRSYSRSPPYR +R            R SPYANG
Subjt:  PGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS-PRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHAR------------RASPYANG

Q69KL9 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ21A2.8e-5467.38Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGEP
        M RVY+GNLDPRVT R+LEDEFR+FGVLRSVWVAR+PPG+AFI+FDDRRDA DAI+ +DGKNGWRVELS N+  G GG  R      G  + KCYECGE 
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGEP

Query:  GHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYER---YGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASP-YANG
        GHFARECR R GS GG G G RRS S  R RSP Y R   YGRRS SP G RSPRRRS++ P R RSYSRSP Y   R  SP Y NG
Subjt:  GHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYER---YGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASP-YANG

Q6K4N0 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ211.2e-5265.59Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGEP
        M R+Y+GNLDPRVT  +LEDEFR+FGVLRSVWVAR+PPG+AFI+FDD+RDA DA++ LDGKNGWRVELS NS   G      GR   GG ++KCYECGE 
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGEP

Query:  GHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYER---YGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANG
        GHFARECR R G  GG G G RRS S  R RSP Y +   YGRRS SPR  RSPRRRS++ P RGRSYSRSP     R  SPYA+G
Subjt:  GHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYER---YGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANG

Q9SJA6 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ22A9.5e-5866.49Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGRGGG----GGDDLKCYE
        M+RVY+GNLDPRVTER+LEDEFR FGV+RSVWVARRPPGYAF++F+D RDA DAI+ +DGKNGWRVE SHN  GGGG GG RG G G    GG DLKCYE
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGRGGG----GGDDLKCYE

Query:  CGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
        CGE GHFARECRSRGGS G      R    PR R+SP+Y   GRRS SPR +  P  R  +P  RGR+YSRSPP   AR   PYANG+
Subjt:  CGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23860.1 RS-containing zinc finger protein 215.7e-6672.08Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGG-GGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGE
        MTRVY+GNLDPRVTER+LEDEF+ FGVLR+VWVARRPPGYAF+EFDD RDALDAI ALD KNGWRVELSH  KGG GGGGGRR    GG +D KCYECGE
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGG-GGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGE

Query:  PGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS-PRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHAR------------RASPYANG
         GHFARECR       G G   RRSPSPRRRRSP Y  Y RRS SPRG+RS PRRRS+TPP+RGRSYSRSPPYR +R            R SPYANG
Subjt:  PGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS-PRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHAR------------RASPYANG

AT1G23860.2 RS-containing zinc finger protein 215.7e-6672.08Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGG-GGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGE
        MTRVY+GNLDPRVTER+LEDEF+ FGVLR+VWVARRPPGYAF+EFDD RDALDAI ALD KNGWRVELSH  KGG GGGGGRR    GG +D KCYECGE
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGG-GGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGE

Query:  PGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS-PRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHAR------------RASPYANG
         GHFARECR       G G   RRSPSPRRRRSP Y  Y RRS SPRG+RS PRRRS+TPP+RGRSYSRSPPYR +R            R SPYANG
Subjt:  PGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS-PRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHAR------------RASPYANG

AT1G23860.4 RS-containing zinc finger protein 216.9e-6470.56Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGG-GGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGE
        MTRVY+GNLDPRVTER+LEDEF+ FGVLR+VWVARRPPGYAF+EFDD RDALDAI ALD KNGWRVELSH  KGG GGGGGRR    GG +D KCYECGE
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGG-GGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGE

Query:  PGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS-PRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHAR------------RASPYANG
         GHFARECR       G G   RRSPSPRRRRSP Y      S SPRG+RS PRRRS+TPP+RGRSYSRSPPYR +R            R SPYANG
Subjt:  PGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRS-PRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHAR------------RASPYANG

AT4G31580.1 serine/arginine-rich 221.8e-5968.56Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHN--SKGGGG-----GGGRRGRGGGGGDDLK
        M+RVY+GNLDPRVTER+LEDEFR FGV+RSVWVARRPPGYAF++F+D RDA DAI+ALDGKNGWRVE SHN   +GGGG     GGG  GRGG GG DLK
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHN--SKGGGG-----GGGRRGRGGGGGDDLK

Query:  CYECGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKR--SPRRRSIT-PPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
        CYECGE GHFARECR+RGG+         R+P PR RRSPS   YGRRS SPR +    PRRRS + PP RGRSYSRSPP   AR   PYANG+
Subjt:  CYECGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKR--SPRRRSIT-PPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD

AT4G31580.2 serine/arginine-rich 221.8e-5968.56Show/hide
Query:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHN--SKGGGG-----GGGRRGRGGGGGDDLK
        M+RVY+GNLDPRVTER+LEDEFR FGV+RSVWVARRPPGYAF++F+D RDA DAI+ALDGKNGWRVE SHN   +GGGG     GGG  GRGG GG DLK
Subjt:  MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHN--SKGGGG-----GGGRRGRGGGGGDDLK

Query:  CYECGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKR--SPRRRSIT-PPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD
        CYECGE GHFARECR+RGG+         R+P PR RRSPS   YGRRS SPR +    PRRRS + PP RGRSYSRSPP   AR   PYANG+
Subjt:  CYECGEPGHFARECRSRGGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKR--SPRRRSIT-PPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTCGAGTTTACATTGGTAATTTGGATCCACGCGTTACAGAGAGGGATCTTGAAGATGAATTTCGAATGTTCGGTGTTCTTAGGAGTGTTTGGGTTGCTAGAAGGCC
TCCAGGATATGCATTTATCGAGTTTGATGATCGCAGGGATGCTTTAGATGCAATACAAGCATTGGATGGGAAAAATGGTTGGCGTGTGGAGCTTTCTCATAACTCTAAAG
GTGGTGGAGGTGGTGGCGGTCGTCGCGGCCGTGGTGGTGGTGGTGGTGACGATTTGAAATGTTATGAATGTGGTGAACCTGGTCATTTTGCTCGAGAGTGTCGTTCCCGT
GGGGGCTCACGAGGCGGCACAGGAGGTGGTTTACGTCGTAGTCCTTCTCCTCGGCGCCGCAGGAGTCCAAGTTATGAAAGATATGGTCGCAGGAGTAACAGTCCCCGTGG
TAAAAGATCTCCACGACGTCGCAGCATTACACCTCCCAAGCGTGGTCGGAGCTACAGCAGATCTCCTCCATATCGCCATGCCCGTCGCGCTTCACCTTATGCTAATGGAG
ATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGACAACCAAAAAATTGAACTCACTCGTCACTTGACTGATACCTTCTGCAGACTTCCGAGCATCAGAGCTCTGCGACTACGGGCAGCGCCGTTTTCCTATCCTATCAACG
GCTGATCTGTTCGTATTCTTCGACGATTCCGAGATATCTTTTTCTTGGTGGGTTTTGGCTTCTTCGCTACGATGACTCGAGTTTACATTGGTAATTTGGATCCACGCGTT
ACAGAGAGGGATCTTGAAGATGAATTTCGAATGTTCGGTGTTCTTAGGAGTGTTTGGGTTGCTAGAAGGCCTCCAGGATATGCATTTATCGAGTTTGATGATCGCAGGGA
TGCTTTAGATGCAATACAAGCATTGGATGGGAAAAATGGTTGGCGTGTGGAGCTTTCTCATAACTCTAAAGGTGGTGGAGGTGGTGGCGGTCGTCGCGGCCGTGGTGGTG
GTGGTGGTGACGATTTGAAATGTTATGAATGTGGTGAACCTGGTCATTTTGCTCGAGAGTGTCGTTCCCGTGGGGGCTCACGAGGCGGCACAGGAGGTGGTTTACGTCGT
AGTCCTTCTCCTCGGCGCCGCAGGAGTCCAAGTTATGAAAGATATGGTCGCAGGAGTAACAGTCCCCGTGGTAAAAGATCTCCACGACGTCGCAGCATTACACCTCCCAA
GCGTGGTCGGAGCTACAGCAGATCTCCTCCATATCGCCATGCCCGTCGCGCTTCACCTTATGCTAATGGAGATTGATGCTGGAATCAAGGCTGATGCTGTGCTGGTAGAA
CTTAGATGATGGTGTTTCTGCTATACTGTAGTTCTAATAGGAATTGTGGAGTGAACCGGAATCATGTAGTTAAGTTCGTCTCTGACAATTGGTTCTCTTTGAAAACTGGA
TTTGGATGGTGTCTACCAAGTGTTTTAAGCCACCAAATGGGGTTCTGTCTGGCACCATTTTGTGTTGGCTCTCTTCCGCCCGCCGGAACTCGGAGGTCTCTTTCTTGCTT
TCAAAATTCTATCTATTACCTAGAGTTTTATATGTACCTTTCTGTCTATTTATTAAAATTTCTTTTTCATTGGATGTCCCTAAAGATTTATCTGTTGGCTGTTGTTTTTT
TTGAGGTGTGATTTTCGGCTATAAATGGCATCGTTACTCAGCTAACTGCATGTTAGTGCATCACGGTTCTCAATATCTGCTCTGCTCCTCAATCTTCTTGTTACTACAAC
TGGTTGCATGCTGTTTGTATTGCACTCTTCTGCAAGAAGGCTGCGTATATATTTTATCCTTTTTAGCTGGTTGAAGAAGATGGAGCTGTTTTCTTGTGATTTTCTGCTCA
TCATCTTCTCGTCTACCAGCATTTTATGAGCTTCTTCTATTACATGCGCGAAACTATCGTGAGAGATTCTACTTGTTTTATAACATCGGCATCTTGTGAGCTTCGACTTG
TTTGTTGCTCTCCCCAACTTCTGCCTTGCTCCACCAACCTTCCTTCCATTGTTATGCTTCCTTCAATTGCACCACTTCTTCTTAAGTTAGAGACCACCAGTGATTTTGCT
TTTAGATGATGAGGCAGCTATCTTCTTGGTCAGGGCTCTGTTGGTCTACCCTCATTAGTTTGTGGTTAGAAAAACGTCAAAGGATGTTGGAAATTTGAATGCTTATTTAT
TTTCTGTCTGTTTTTTGTTACTTGCATAGAGAACTACATTACATTATGACCATCCCATTTTTCAGTTAAAGAATCCTCATGAATTGATTTTATTGTGAAGTCATGAAACT
GATGATTCTCACAATAATATACAGAGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTRVYIGNLDPRVTERDLEDEFRMFGVLRSVWVARRPPGYAFIEFDDRRDALDAIQALDGKNGWRVELSHNSKGGGGGGGRRGRGGGGGDDLKCYECGEPGHFARECRSR
GGSRGGTGGGLRRSPSPRRRRSPSYERYGRRSNSPRGKRSPRRRSITPPKRGRSYSRSPPYRHARRASPYANGD