; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0016684 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0016684
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionGlucan endo-1,3-beta-D-glucosidase
Genome locationLG09:2008552..2010997
RNA-Seq ExpressionTan0016684
SyntenyTan0016684
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
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InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044788 - Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein, plant


Homology Show/hide homology
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A0A1S3BQE9 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 41.7e-15786.41Show/hide
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A0A5A7U6N8 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 41.7e-15786.41Show/hide
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Q93V72 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 41.1e-2043.41Show/hide
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Q9FNQ2 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 13.0e-1839.36Show/hide
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Q9FZ86 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 37.0e-2048.36Show/hide
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Q9FZD0 Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein4.3e-1739.8Show/hide
Query:  CVARSGASEMALQSALDYACGIGGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSP-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSSSSSTPASMSPSV
        CV +  A+E+ LQ  +D+ACG GGADC+QIQ  G+CY PNTL+NH   A NSY+QK  S   +CDF G+A+++ S PST S     SSS+ TP +  PS 
Subjt:  CVARSGASEMALQSALDYACGIGGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSP-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSSSSSTPASMSPSV

Query:  PMVTPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGSPPTVFNTGNPASSIGSTTGFGTEIPPSSSTSISMAVG--LRPFTCCIILMMSLSLVTRRI
             TT +P T      TNP+T +   + +P N  P +   T   ++++G          PSSSTS     G  L   T  IIL+ +++ V  R+
Subjt:  PMVTPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGSPPTVFNTGNPASSIGSTTGFGTEIPPSSSTSISMAVG--LRPFTCCIILMMSLSLVTRRI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.9e-5249.5Show/hide
Query:  TTMHDMTNSPTTIFPTTPDTSTPTIITVPATNPVTVTPSSPIATPVSIPLTTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP--APSGGPPVVT
        TT HD+ N P T+FPT P T+TPT  T P   PVT+TP++P  T   +P  T I  P  +P P+     P +T P   P+TNPVT YP   PSG  PV  
Subjt:  TTMHDMTNSPTTIFPTTPDTSTPTIITVPATNPVTVTPSSPIATPVSIPLTTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP--APSGGPPVVT

Query:  PVTNPVPVSPPAMTNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNP
        PV     V+PP ++N+P + GQSWCVA+ GAS+++LQ ALDYACGI  ADCSQ+QQGG+CY+P +L++HASFAFNSY+QKNPSP SCDFGG+A + N+NP
Subjt:  PVTNPVPVSPPAMTNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNP

Query:  STGSCIYPLSSSSSTPASMSPSVPMVTPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGSPPTVFNTGNPA-------SSIGSTTGFGTEIPPSSSTSIS
        STGSCIY   SS+STP +   + P  TP+T   +  PP T    T   P G G+   G+PP +FN  NP        SS G   G+G +  P+ +   S
Subjt:  STGSCIYPLSSSSSTPASMSPSVPMVTPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGSPPTVFNTGNPA-------SSIGSTTGFGTEIPPSSSTSIS

AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein4.5e-2236.5Show/hide
Query:  IPLTTPITVPANSPVP-LTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP-----APSGGPPVVTPVTNP--VPVSPPAMTNAPVIPG--------------------
        IP+  P     ++  P +T P  P +T PG    T P   YP      P+GG P +   T P    V           PG                    
Subjt:  IPLTTPITVPANSPVP-LTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP-----APSGGPPVVTPVTNP--VPVSPPAMTNAPVIPG--------------------

Query:  ------------QSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPL
                      WC+A++ AS  +LQ ALDYACG GGADC QIQQG +CY PNT+ +HASFAFNSY+QK+P   SC+FGG+A +T+++PS GSC +  
Subjt:  ------------QSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPL

Query:  SS---SSSTPASMSPSVPMVTPTTT--APITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGSPPTVFNTGNPASSIGSTTG
        SS   S+S P+ MSP      P++T   PIT P T +T   +  P G   P  G P +  +  +   SI +  G
Subjt:  SS---SSSTPASMSPSVPMVTPTTT--APITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGSPPTVFNTGNPASSIGSTTG

AT1G69295.1 plasmodesmata callose-binding protein 47.7e-2243.41Show/hide
Query:  SWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSP-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSSSSSTPASMSP
        ++C+ + G +E  LQ A+DYACG  GADC+QIQ  G+CY PNT++NH   A NSY+QK  S   +CDF G+A  + + PST S     SSSS TP + +P
Subjt:  SWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSP-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSSSSSTPASMSP

Query:  SVPMVTPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPLG----TGMPENGSPPTVFNTGNPASSIGSTTGFGTEIPPSSSTSISMAVGLRP
        +    TPT+  P T  PTT T PTT +P      +G P  G+P T  NTG P S+          +P SSS+S+     L P
Subjt:  SVPMVTPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPLG----TGMPENGSPPTVFNTGNPASSIGSTTGFGTEIPPSSSTSISMAVGLRP

AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein4.1e-3148.78Show/hide
Query:  TTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYPAPSGGPPVVTPVTNPVPVSPPAMTNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGADC
        T  IT P      +T P+A         P T P T  P        V      +P SP    +    PG QSWCVAR   ++MALQ+ALDYACGIGGADC
Subjt:  TTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYPAPSGGPPVVTPVTNPVPVSPPAMTNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGADC

Query:  SQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSSSSST
        S+IQ+GG+CYNPN+L  HASFAFNSY+QKNP P+SC+F G+A+  +++PS GSC +P +S+S +
Subjt:  SQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSSSSST

AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein3.2e-2849.33Show/hide
Query:  TTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYPAPSGGPPVVTPVTNPVPVSPPAMTNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGADC
        T  IT P      +T P+A         P T P T  P        V      +P SP    +    PG QSWCVAR   ++MALQ+ALDYACGIGGADC
Subjt:  TTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYPAPSGGPPVVTPVTNPVPVSPPAMTNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGADC

Query:  SQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPS
        S+IQ+GG+CYNPN+L  HASFAFNSY+QKNP P+SC+F G+A+  +++PS
Subjt:  SQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCTAACAGCTTCCAAATGTTGCTTCTTTTGCGTTCTATCTCTCCTCGCCATCTGCTCTTCTGGTAGTAGATTTGGTGGGTCGCATTTGAAAGTGGAAGAAAATGC
TTCCATGGAGTTGAAATGGAAGTTCAGTGAGCTTGATCGGACAACAATGCACGACATGACCAACTCGCCGACAACAATTTTTCCGACAACCCCGGACACCTCCACGCCGA
CAATCATCACCGTTCCGGCGACCAACCCTGTCACTGTCACTCCGTCCAGCCCTATTGCCACGCCGGTGTCCATTCCTCTAACGACACCCATCACAGTTCCGGCTAACTCT
CCGGTACCGCTCACAAATCCGGTTGCGCCGCCGGTTACAGTCCCCGGAGCACAGCCAATAACGAACCCGGTGACCACTTATCCAGCTCCGTCAGGTGGTCCTCCGGTTGT
AACACCCGTCACAAACCCAGTTCCAGTGTCTCCTCCGGCGATGACAAATGCACCGGTAATTCCAGGACAGAGCTGGTGCGTGGCCAGGTCTGGCGCATCAGAGATGGCTC
TTCAGTCGGCGTTGGACTACGCTTGTGGCATTGGAGGAGCTGACTGTTCTCAAATCCAACAAGGTGGAAGCTGTTACAACCCAAATACACTTGAAAACCACGCTTCTTTT
GCGTTCAATAGCTATTTTCAGAAGAATCCTTCTCCTACAAGCTGCGACTTTGGAGGATCTGCCATGGTTACCAACTCCAATCCAAGCACTGGCTCCTGCATTTACCCATT
ATCATCTTCCTCTTCGACACCAGCATCCATGTCGCCGTCAGTTCCAATGGTGACACCGACAACAACAGCTCCGATCACCGTCCCACCAACTACAGTTACAAACCCAACAA
CGTCTTCACCTTTAGGGACTGGCATGCCAGAAAATGGAAGTCCTCCTACAGTCTTTAACACAGGCAATCCAGCTTCGAGTATAGGCAGCACAACAGGCTTTGGAACCGAG
ATACCACCAAGCTCGAGCACCTCAATATCCATGGCGGTTGGATTGAGACCCTTTACTTGTTGCATCATTCTGATGATGTCCTTGTCCTTGGTCACTCGCAGAATCACTCT
GGACTGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAAGCATTGCAACTTGGTCACCTCTCTACTTTTTTCACCTTTATCTTCTTCCTTTTCCCCTCCCTCTTTCTCTTTCTCTTTCACTTTGCATGTTTCACTCTTATGTCCTT
TTACACCATTTCTTCTGTCTGGTTTCGTTGTTTTTAAAAGCAATGCCTAAATTAAACTGATCCCATTAAGAATCCAGTTGGGTCTCTTCAGTTGTCCCCAGAACTATAAC
CTCCCACCTTCCCCCATTAAAATGGCCCTAACAGCTTCCAAATGTTGCTTCTTTTGCGTTCTATCTCTCCTCGCCATCTGCTCTTCTGGTAGTAGATTTGGTGGGTCGCA
TTTGAAAGTGGAAGAAAATGCTTCCATGGAGTTGAAATGGAAGTTCAGTGAGCTTGATCGGACAACAATGCACGACATGACCAACTCGCCGACAACAATTTTTCCGACAA
CCCCGGACACCTCCACGCCGACAATCATCACCGTTCCGGCGACCAACCCTGTCACTGTCACTCCGTCCAGCCCTATTGCCACGCCGGTGTCCATTCCTCTAACGACACCC
ATCACAGTTCCGGCTAACTCTCCGGTACCGCTCACAAATCCGGTTGCGCCGCCGGTTACAGTCCCCGGAGCACAGCCAATAACGAACCCGGTGACCACTTATCCAGCTCC
GTCAGGTGGTCCTCCGGTTGTAACACCCGTCACAAACCCAGTTCCAGTGTCTCCTCCGGCGATGACAAATGCACCGGTAATTCCAGGACAGAGCTGGTGCGTGGCCAGGT
CTGGCGCATCAGAGATGGCTCTTCAGTCGGCGTTGGACTACGCTTGTGGCATTGGAGGAGCTGACTGTTCTCAAATCCAACAAGGTGGAAGCTGTTACAACCCAAATACA
CTTGAAAACCACGCTTCTTTTGCGTTCAATAGCTATTTTCAGAAGAATCCTTCTCCTACAAGCTGCGACTTTGGAGGATCTGCCATGGTTACCAACTCCAATCCAAGCAC
TGGCTCCTGCATTTACCCATTATCATCTTCCTCTTCGACACCAGCATCCATGTCGCCGTCAGTTCCAATGGTGACACCGACAACAACAGCTCCGATCACCGTCCCACCAA
CTACAGTTACAAACCCAACAACGTCTTCACCTTTAGGGACTGGCATGCCAGAAAATGGAAGTCCTCCTACAGTCTTTAACACAGGCAATCCAGCTTCGAGTATAGGCAGC
ACAACAGGCTTTGGAACCGAGATACCACCAAGCTCGAGCACCTCAATATCCATGGCGGTTGGATTGAGACCCTTTACTTGTTGCATCATTCTGATGATGTCCTTGTCCTT
GGTCACTCGCAGAATCACTCTGGACTGGTAAAATCATACACTTCTTCTCCTTGAACTGTACATGAAAGGCCCTTGTAATTCATAGCTTCAGAAGCGCCACCCAGTTCTTC
CACCACGAGTGCAATTTTTGGAGGAGAAAAGGAACCAGAGGTGAGTTTTGAGGGATAAACAAGAAGGTTTAGAGAATGCATTGCCCTGCTTGAGCTTTTGTTTGTGTAAA
GATGAAGATATGTTAGTGATAGATAAGGGTGTATTAGCTACTTGGAACTTTGAGACTGTAATATATGTATGTTAGATTTTGGGAGTATTGTTGGGATTTGTATTGATGTT
TATTTACTTTAATGACGTTCATCATAGTGCATTAGAATTAGAATTTTGGTAGAGATAGCTGGATTGGAAATATTTATGTTCCTTTGTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALTASKCCFFCVLSLLAICSSGSRFGGSHLKVEENASMELKWKFSELDRTTMHDMTNSPTTIFPTTPDTSTPTIITVPATNPVTVTPSSPIATPVSIPLTTPITVPANS
PVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYPAPSGGPPVVTPVTNPVPVSPPAMTNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGADCSQIQQGGSCYNPNTLENHASF
AFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSSSSSTPASMSPSVPMVTPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGSPPTVFNTGNPASSIGSTTGFGTE
IPPSSSTSISMAVGLRPFTCCIILMMSLSLVTRRITLDW