| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0044978.1 retrotransposon gag protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.2e-27 | 54.86 | Show/hide |
Query: ISRCESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRLKVRSDQHKRKIKPL
I + ++ ++ EE +N+ E+KQRTSVFD IKPLTTR SVFQ++SM T EE+NQ PT RTS+F RLS+ SKK RP TS F RLK+ +DQ +R++K L
Subjt: ISRCESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRLKVRSDQHKRKIKPL
Query: KEELLDEVN-HNKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
K + E N +KIH VPSRMKRK SV INT+GSL I+
Subjt: KEELLDEVN-HNKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
|
|
| KAA0055462.1 retrotransposon gag protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.4e-28 | 51.27 | Show/hide |
Query: SRQIIRISRC--------ESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRL
S +++ ++ C ++ ++ EE +N+ E+KQRTSVFD IKPLTTR SVFQ++SM T EEKNQ PT RTS+F RLS+ SKK RP TS F RL
Subjt: SRQIIRISRC--------ESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRL
Query: KVRSDQHKRKIKPLKEELLDEVN-HNKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
K+ +DQ +R++K LK + E N +KIH VPSRMKRK SV INT+GSL I+
Subjt: KVRSDQHKRKIKPLKEELLDEVN-HNKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
|
|
| KAA0061331.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.1e-28 | 57.89 | Show/hide |
Query: EEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRLKVRSDQHKRKIKPLKEELLDEVN-H
EE +N+ E+KQ+TSVFD IKPLTTR S+FQ++SM T +E+NQ PTP RTS+F RLS+ ISKKDRP TS F RLK+ + Q +R++K LK + E N
Subjt: EEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRLKVRSDQHKRKIKPLKEELLDEVN-H
Query: NKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
+KIH VPSRMKRK SV INT+GSL I+
Subjt: NKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
|
|
| KAA0063431.1 Retrotransposon gag protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.8e-28 | 53.29 | Show/hide |
Query: TSRQIIRISRCESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRLKVRSDQH
T+ + I ++ + +E +N+ E+KQRTSVFDHIKP TTR SVF+++SM T EE+NQ PT S RTS+F RLS+F SKKDRP TS+F RLK+++DQ
Subjt: TSRQIIRISRCESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRLKVRSDQH
Query: KRKIKPLKEELLDEVNHN--KIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
+R++K LK ++ E N+N KIH VPSRMKRK SV I+T+ SL LI+
Subjt: KRKIKPLKEELLDEVNHN--KIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
|
|
| TYK08944.1 retrotransposon gag protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.4e-28 | 51.27 | Show/hide |
Query: SRQIIRISRC--------ESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRL
S +++ ++ C ++ ++ EE +N+ E+KQRTSVFD IKPLTTR SVFQ++SM T EEKNQ PT RTS+F RLS+ SKK RP TS F RL
Subjt: SRQIIRISRC--------ESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRL
Query: KVRSDQHKRKIKPLKEELLDEVN-HNKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
K+ +DQ +R++K LK + E N +KIH VPSRMKRK SV INT+GSL I+
Subjt: KVRSDQHKRKIKPLKEELLDEVN-HNKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TQ06 Retrotransposon gag protein | 5.7e-28 | 54.86 | Show/hide |
Query: ISRCESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRLKVRSDQHKRKIKPL
I + ++ ++ EE +N+ E+KQRTSVFD IKPLTTR SVFQ++SM T EE+NQ PT RTS+F RLS+ SKK RP TS F RLK+ +DQ +R++K L
Subjt: ISRCESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRLKVRSDQHKRKIKPL
Query: KEELLDEVN-HNKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
K + E N +KIH VPSRMKRK SV INT+GSL I+
Subjt: KEELLDEVN-HNKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
|
|
| A0A5A7UI09 Retrotransposon gag protein | 1.1e-28 | 51.27 | Show/hide |
Query: SRQIIRISRC--------ESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRL
S +++ ++ C ++ ++ EE +N+ E+KQRTSVFD IKPLTTR SVFQ++SM T EEKNQ PT RTS+F RLS+ SKK RP TS F RL
Subjt: SRQIIRISRC--------ESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRL
Query: KVRSDQHKRKIKPLKEELLDEVN-HNKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
K+ +DQ +R++K LK + E N +KIH VPSRMKRK SV INT+GSL I+
Subjt: KVRSDQHKRKIKPLKEELLDEVN-HNKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
|
|
| A0A5A7V6H5 Ty3-gypsy retrotransposon protein | 1.5e-28 | 57.89 | Show/hide |
Query: EEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRLKVRSDQHKRKIKPLKEELLDEVN-H
EE +N+ E+KQ+TSVFD IKPLTTR S+FQ++SM T +E+NQ PTP RTS+F RLS+ ISKKDRP TS F RLK+ + Q +R++K LK + E N
Subjt: EEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRLKVRSDQHKRKIKPLKEELLDEVN-H
Query: NKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
+KIH VPSRMKRK SV INT+GSL I+
Subjt: NKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
|
|
| A0A5D3CCI8 Retrotransposon gag protein | 1.1e-28 | 51.27 | Show/hide |
Query: SRQIIRISRC--------ESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRL
S +++ ++ C ++ ++ EE +N+ E+KQRTSVFD IKPLTTR SVFQ++SM T EEKNQ PT RTS+F RLS+ SKK RP TS F RL
Subjt: SRQIIRISRC--------ESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRL
Query: KVRSDQHKRKIKPLKEELLDEVN-HNKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
K+ +DQ +R++K LK + E N +KIH VPSRMKRK SV INT+GSL I+
Subjt: KVRSDQHKRKIKPLKEELLDEVN-HNKIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
|
|
| A0A5D3CK61 Retrotransposon gag protein | 8.8e-29 | 53.29 | Show/hide |
Query: TSRQIIRISRCESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRLKVRSDQH
T+ + I ++ + +E +N+ E+KQRTSVFDHIKP TTR SVF+++SM T EE+NQ PT S RTS+F RLS+F SKKDRP TS+F RLK+++DQ
Subjt: TSRQIIRISRCESKEETVEEANNTEEVKQRTSVFDHIKPLTTRPSVFQKMSMVTTEEKNQGPTPISPRTSSFTRLSVFISKKDRPLTSIFYRLKVRSDQH
Query: KRKIKPLKEELLDEVNHN--KIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
+R++K LK ++ E N+N KIH VPSRMKRK SV I+T+ SL LI+
Subjt: KRKIKPLKEELLDEVNHN--KIHRVVPSRMKRKFSVLINTKGSLKFSSSLIL
|
|
