; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0016977 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0016977
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionmini zinc finger protein 2
Genome locationLG11:4381257..4382124
RNA-Seq ExpressionTan0016977
SyntenyTan0016977
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_016902406.1 PREDICTED: mini zinc finger protein 2 [Cucumis melo]4.2e-4697.92Show/hide
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XP_022939280.1 mini zinc finger protein 2-like [Cucurbita moschata]4.3e-4394.79Show/hide
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XP_022993699.1 mini zinc finger protein 2 [Cucurbita maxima]1.6e-4293.75Show/hide
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XP_038890678.1 mini zinc finger protein 2-like [Benincasa hispida]5.1e-4493.75Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVJ7 Transcription factor1.0e-4295.65Show/hide
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A0A1S4E2E9 mini zinc finger protein 22.0e-4697.92Show/hide
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A0A5D3CUT9 Mini zinc finger protein 22.0e-4697.92Show/hide
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A0A6J1FM92 mini zinc finger protein 2-like2.1e-4394.79Show/hide
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A0A6J1K0U7 mini zinc finger protein 27.9e-4393.75Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 17.9e-2474.29Show/hide
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        VRY ECQ+NHAA +GG+AVDGCREFMASG EGT AAL CAACGCHRSFHRR+V      CDCSS  S+GT
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 37.9e-2461.7Show/hide
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        M+KRQVV+++ +     T +SS    +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMASG +    ALTCAACGCHR+FHRR+V TEVVC+ S   +N
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Q2RB28 Mini zinc finger protein 17.9e-2474.29Show/hide
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 19.4e-2557.73Show/hide
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        M+KRQ+V+++    S          + +SS  + +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMA+G EGT  AL CAACGCHR+FHR++V TEVVC+ S
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 22.8e-3780.81Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18835.1 mini zinc finger5.6e-2561.7Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 16.7e-2657.73Show/hide
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AT2G18350.1 homeobox protein 241.9e-1769.23Show/hide
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AT3G28917.1 mini zinc finger 22.0e-3880.81Show/hide
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AT3G50890.1 homeobox protein 288.7e-1867.27Show/hide
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        +  +Y ECQKNHAA  GG+ VDGC EFMA G+EGT  AL CAAC CHRSFHR++V
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAAGAACCATCAAGAGACACTGTGGCTTCATCTTTCACAGTAAGGAGTGTTAGATATGGGGAGTGCCAAAAGAACCA
CGCCGCCGGAGTCGGAGGGTATGCTGTCGACGGGTGCCGAGAATTCATGGCGAGTGGCGACGAAGGGACGACCGCTGCACTGACTTGCGCCGCCTGCGGTTGCCACCGGA
GCTTCCATAGAAGACAAGTTGGAACTGAGGTAGTCTGTGATTGCTCTTCATCTCCCTCAAATGGAACTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CACAAACCTTACAAATTTCTGATCTTTCATCAGTTTACACACTAAAATATCCCTCCACTATTGATTTTTCTTCAAACCCAATTCCAAAAATTGCAGCTTTTTCTTTGACC
TAGCTAATTACAACAACAAGGAAGAAACTTTTTTAAGGAAAATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAAGAACCATCAAGAGACACTGTGGCTTCATCTTTC
ACAGTAAGGAGTGTTAGATATGGGGAGTGCCAAAAGAACCACGCCGCCGGAGTCGGAGGGTATGCTGTCGACGGGTGCCGAGAATTCATGGCGAGTGGCGACGAAGGGAC
GACCGCTGCACTGACTTGCGCCGCCTGCGGTTGCCACCGGAGCTTCCATAGAAGACAAGTTGGAACTGAGGTAGTCTGTGATTGCTCTTCATCTCCCTCAAATGGAACTT
GAAGATTACACACAATACTATAACTTCAATGTCTTGTAAGGGTTTCTTTTTTTTTTTCTTCTTCTTCTTTTGGGTGCTGGATTAAAAAAAAAAAAAGTCCTCTACAGGGG
ATTGAGAGTTGAGATAGAGCTTGTTGTGTTTGCTTGATTTTTTTTTTTTTTAATTTTATTTTGGGGTGAACTTGACTTGGACTGAAACTATGTGTGTTGAATTACCTGTG
TATTTTGGATTCTTGATGAAAGGGGCAAGAACAAGAGAGAGGAGTGTTTTCTTTTACTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCAGTTCATT
TGAGGATTAAAAGTCATGTAAATTTTTTCCATCATATCTCTTTTGAATTAATCTGTATGGGATTTGAGTGTATCAATCTTTTGGAGATTGAAGTAATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRKRQVVLRRSEEPSRDTVASSFTVRSVRYGECQKNHAAGVGGYAVDGCREFMASGDEGTTAALTCAACGCHRSFHRRQVGTEVVCDCSSSPSNGT