; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0017089 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0017089
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionexpansin-like A2
Genome locationLG02:5511925..5513981
RNA-Seq ExpressionTan0017089
SyntenyTan0017089
Gene Ontology termsGO:0019953 - sexual reproduction (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR007112 - Expansin/pollen allergen, DPBB domain
IPR007117 - Expansin, cellulose-binding-like domain
IPR007118 - Expansin/Lol pI
IPR009009 - RlpA-like protein, double-psi beta-barrel domain
IPR036749 - Expansin, cellulose-binding-like domain superfamily
IPR036908 - RlpA-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BHX1 expansin-like A24.4e-10681.78Show/hide
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A0A5A7TAM6 Expansin-like A22.0e-10681.78Show/hide
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A0A6J1C745 expansin-like A21.7e-11084.89Show/hide
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A0A6J1GMD1 expansin-like A31.0e-11081.78Show/hide
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A0A6J1I1Z2 expansin-like A31.4e-10981.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10S70 Expansin-like A15.4e-5344.89Show/hide
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Q7XCL0 Expansin-like A26.4e-5446.9Show/hide
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Q9LZT4 Expansin-like A15.9e-6050.92Show/hide
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        G+IYD  +QI DIA+E C
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Q9LZT5 Expansin-like A34.0e-6453.78Show/hide
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Q9SVE5 Expansin-like A21.2e-6050.22Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G45960.1 expansin-like A36.1e-6054.07Show/hide
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        G++A  +PS+YK GAGCGACFQVRCKN + C S GT V+VTD N  N+ D VLS +A+ AMA  +    K LL  G +DVEY+R+PC+Y  +NL +RVEE
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Query:  WSQKPYYLAIKFLYQGGQTEIKAVEIAEAGSSDWEPMKRNYGAIWDTNKQLEGALQLKITVALGYNDENTYWTNYDLPEDWKNGEIYDTRIQIDDIAKET
         S+KP YLAIK LYQGGQTE+  ++IA  GSS W  M R++GA+W T+K   GALQ K TV  GY D  T W+   LP +W +G IYD  +QI DIA+E 
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Query:  CPRNQCGDL
        C  + CG +
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AT3G45960.2 expansin-like A32.8e-6553.78Show/hide
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AT3G45970.1 expansin-like A14.2e-6150.92Show/hide
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        S+GAC YG +A     G++A  +PS+YK GAGCGACFQVRCKN + C++ GT V++TD N  N+ D VLS +A+ AMA  +    K+LL  G +D+EY+R
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        +PC Y NKN+ +RVEE S+KP YL IK LYQGGQTE+ +++IA+ GSS +W  M R++GA+W T+K   GA+Q +  V  GY D    W+   LP +W+ 
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        Y   NL+ ++ E S  P+YLAI  LY GG  +I AVE+ +    +W  M+R +GA+ D      G L L+  V   Y      W      +P DW  G  
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