; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0017112 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0017112
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionPPPDE domain-containing protein
Genome locationLG06:3368009..3370040
RNA-Seq ExpressionTan0017112
SyntenyTan0017112
Gene Ontology termsGO:0016579 - protein deubiquitination (biological process)
GO:0101005 - ubiquitinyl hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008580 - PPPDE peptidase domain
IPR042266 - PPPDE peptidase domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058719.1 deSI-like protein [Cucumis melo var. makuwa]5.9e-11593.39Show/hide
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XP_022959764.1 deSI-like protein At4g17486 [Cucurbita moschata]6.5e-11492.89Show/hide
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XP_038899104.1 deSI-like protein At4g17486 [Benincasa hispida]6.9e-11694.27Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBP9 PPPDE domain-containing protein8.3e-11592.95Show/hide
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A0A1S3CEJ5 deSI-like protein At4g174862.4e-11492.51Show/hide
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A0A5A7UYX3 DeSI-like protein2.8e-11593.39Show/hide
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A0A6J1H916 deSI-like protein At4g174863.1e-11492.89Show/hide
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A0A6J1KRJ3 deSI-like protein At4g174861.3e-11292Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
H2KZK4 Desumoylating isopeptidase 1 homolog3.9e-2942.45Show/hide
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        V LNVYD+  +N YA  +G+G+FHSG++V GVEYA+G H Y  +G+FE  P+      + F+F+++++VG+T+   +++R L++ L + ++G+ Y+LI++
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Q5PQ09 Deubiquitinase DESI21.5e-2839.15Show/hide
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        P+ LNVYD+  IN Y   LG+GVFHSG+QV+G E+A+G H Y  +G+FE  P       D F+F++ + +G TD    ++  ++EEL + YKGNAY+L+ 
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        KNCNHF +     L G  IP WVNRLA     + FL +C+    L    ++         ++ E + EL  E  +   +++S+STT+ P
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Q5XIT6 Deubiquitinase DESI25.6e-2843.75Show/hide
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        G +  V LNVYD+  +N Y   +G+GVFHSG++V+G E+A+G H Y  +GIFE  P       + F+F++ V++G TD    ++  ++EEL + YKGNAY
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Q93VG8 DeSI-like protein At4g174863.2e-4753.52Show/hide
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        PVYLNVYDLT +N Y YW G+G+FHSG++ H +EY +GAHEY T+G++E  P+ C GF FR++VL+G T M  ++ R+ ME+L++ Y G+ Y+LI KNCN
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        HF  + C++LTG  IP W+NRLAR+G  CNC+LP ++  T +
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Q9D291 Deubiquitinase DESI25.6e-2843.75Show/hide
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        G +  V LNVYD+  +N Y   +G+GVFHSG++V+G E+A+G H Y  +GIFE  P       + F+F++ V++G TD    ++  ++EEL + YKGNAY
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G47740.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein7.3e-5552.11Show/hide
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        G  PVYLNVYDLT INGY YW GLG+FHSGV+VHGVEYAFGAH+Y+T+G+FE  P+QC GF+F+K++ +G T++ PT+VR  ME++A  Y GN Y+LI K
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        NCNHFC D C KLTG  IP WVNRLA+IG +C+C+LP +L  T + H    + ++   E +K     S   L+S S      S  S F   +S  R   P
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Query:  PSSPLFSHSSSSS
        P     S S+SSS
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AT1G80690.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein5.3e-7465.42Show/hide
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        G+VPVYLNVYDLT INGYAYWLGLGV+HSGV+VHG+EYA+GAHEY +TGIFEG PKQC+GF FRK++L+GKTD+ P EVRA ME+LA  YKG++YNLITK
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Query:  NCNHFCNDACVKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVTMET-KKELTSESTKTLNSNSSSSTTSSPCSTFPRGRSRTR--R
        NCNHFC++ C+KLTGN IP+WVNRLARIGF+CNCVLP T+N+TR  ++   +DK    E  KK+LTS S++  ++ ++ S++SS  S   RGRSR R  R
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Query:  APPPSSPLFSHSSS
        A  PSSPL   SSS
Subjt:  APPPSSPLFSHSSS

AT2G25190.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein2.3e-6156.77Show/hide
Query:  MLLFKKPI-GKPTGGSVPVYLNVYDLTAINGYAYWLGLGVFHSGVQVHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTVLVGKTDMKPTEVRALMEEL
        ML FK  +  K   GSVPVYLNVYDLT +N Y YWLGLGVFHSGV+VHGVEYAFGAHE S+TGIFE  PK+C GF FRK++LVGKTD+   EVR  ME+L
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Query:  AQIYKGNAYNLITKNCNHFCNDACVKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVTMETKKELTSESTKTLNSNSSSSTTSSPCS
        A+ Y+GN Y+LIT+NCNHFCN+ C+KL   SIP WVNRLAR+G LCNCVLP  LN  ++R   R+    ++   KK+L +       S S    +SSP S
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Query:  TFP-RGRSRTRRAPPPSSPLFSHSSSSSS
        + P   RS  R     + P  S SSSS S
Subjt:  TFP-RGRSRTRRAPPPSSPLFSHSSSSSS

AT4G31980.1 unknown protein4.5e-5753.24Show/hide
Query:  KPTGGSVPVYLNVYDLTAINGYAYWLGLGVFHSGVQVHGVEYAFGAHEYSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTVLVGKTDMKPTEVRALMEELAQIYKGNAYN
        K   G+VPVYLNVYDLT +N Y YWLG+G++HSG++VHGVEY +GAHE S++GIFE  PK+C GF FRK++LVG+T+MK  EVR+ ME+L++ Y+GN Y+
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Query:  LITKNCNHFCNDACVKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVTME-TKKELTSESTKTLNSN--SSSSTTSSPCSTFPRGRS
        LIT+NCNHFCN   +KLT  SIP+WVNRLAR+GFLCNCVLP  LN T+++   +    ++  E TKK+   +  +   S   SSSS+ +   +T    RS
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Query:  RTRRAPP----PSSPL
         +   PP    PS PL
Subjt:  RTRRAPP----PSSPL

AT5G25170.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein2.7e-6561.17Show/hide
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        K   GSVPVYLNVYDLT INGYAYWLGLG++HSGV+VHGVEY FGAH++STTGIFE  PKQC GF FRK++L+G+TD+ P  VR  ME+LA+ Y GN+Y+
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Query:  LITKNCNHFCNDACVKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTLNSTRIRHHHRIEDKVVTMETKKELTSESTKTLNSNSSSSTTSSPCSTFPRGRSRTR
        LITKNCNHFCND CV+LT  SIP+WVNRLAR G  CNCVLP  LN T++R     E+K+  +E KK+L S S++     S SS+ S   S   R   R R
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Query:  RAPPPS
        +  PPS
Subjt:  RAPPPS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGTTGTTTAAGAAGCCAATCGGAAAACCCACCGGAGGATCCGTGCCGGTGTACCTGAATGTGTACGATCTGACCGCGATCAATGGCTACGCTTACTGGCTTGGCCT
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TTAGATTTAGGAAGACAGTTTTGGTTGGCAAAACAGATATGAAACCAACAGAGGTGAGAGCTTTAATGGAGGAACTTGCCCAAATCTACAAGGGAAATGCTTACAATTTA
ATCACCAAAAATTGCAATCATTTTTGCAATGATGCTTGTGTTAAACTCACGGGGAATTCCATCCCAAATTGGGTTAATCGCCTTGCTAGAATTGGCTTTCTTTGCAATTG
TGTTCTACCAGTGACCTTAAATTCCACCAGAATCAGGCACCACCACAGAATTGAAGACAAGGTTGTAACCATGGAAACAAAGAAGGAATTGACAAGTGAATCAACCAAAA
CTCTCAATTCTAATTCCTCTTCATCTACAACTTCTTCTCCTTGCTCGACGTTTCCCCGAGGAAGAAGTCGGACGAGACGAGCTCCTCCTCCATCTTCTCCATTGTTTTCT
CATTCTTCATCCTCGTCTTCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAAAAAGCCGTCAGTGGCATCAATGTAATTTAAGCTCGAAACCAAGGCTGATGATATACCCTCACCAAACTAGAATCATCCAGGGTCCAGATCAAATGTACGGTGTTCAA
CAACGAGTCGCCGCCGGTAACGCCCGTTAGAATTAGAACTAAGAAACAATAGTTTCCATTCTTCTCCACAAATTTTGAATTTCAAATTTTCCTCCATTTCTCGAGGGCAT
CACTCTGCGTTTTTCCTTCTCCATTTTTTCCGAGTTTTTGGCAATGAATTGAAGACTGAAGAATGTTGTTGTTTAAGAAGCCAATCGGAAAACCCACCGGAGGATCCGTG
CCGGTGTACCTGAATGTGTACGATCTGACCGCGATCAATGGCTACGCTTACTGGCTTGGCCTCGGCGTTTTCCATTCCGGAGTTCAAGTTCATGGTGTGGAATACGCATT
TGGAGCTCACGAGTACTCAACAACAGGAATTTTTGAAGGAGTGCCGAAGCAATGCGATGGATTTAGATTTAGGAAGACAGTTTTGGTTGGCAAAACAGATATGAAACCAA
CAGAGGTGAGAGCTTTAATGGAGGAACTTGCCCAAATCTACAAGGGAAATGCTTACAATTTAATCACCAAAAATTGCAATCATTTTTGCAATGATGCTTGTGTTAAACTC
ACGGGGAATTCCATCCCAAATTGGGTTAATCGCCTTGCTAGAATTGGCTTTCTTTGCAATTGTGTTCTACCAGTGACCTTAAATTCCACCAGAATCAGGCACCACCACAG
AATTGAAGACAAGGTTGTAACCATGGAAACAAAGAAGGAATTGACAAGTGAATCAACCAAAACTCTCAATTCTAATTCCTCTTCATCTACAACTTCTTCTCCTTGCTCGA
CGTTTCCCCGAGGAAGAAGTCGGACGAGACGAGCTCCTCCTCCATCTTCTCCATTGTTTTCTCATTCTTCATCCTCGTCTTCATGAGGGACGGACATGATTGAAAACCTC
AGCTCCTTGGAATTTTTTGCCATTTCCATTGGAAGTGCTCAAAGAAAGCTTAAACAGTCACAATTCTTATCTTTTCCTCTATTATTGTCTTCTTCTTTGTGATCTTGGAA
GATCATTCTCAATTAAAAGCATTCACTTGTATGCTTTTGATTCCCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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HSSSSSS