; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0017439 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0017439
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionHybrid signal transduction histidine kinase M-like protein
Genome locationLG01:100045603..100048392
RNA-Seq ExpressionTan0017439
SyntenyTan0017439
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7037686.1 hypothetical protein SDJN02_01316, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.5e-12293.58Show/hide
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XP_023524341.1 uncharacterized protein LOC111788264 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-12293.21Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7VFR8 Vitellogenin-27.4e-11588.76Show/hide
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A0A6J1FCW4 uncharacterized protein LOC1114429641.8e-12192.08Show/hide
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A0A6J1FT55 uncharacterized protein LOC1114466292.5e-12393.96Show/hide
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A0A6J1IQH5 uncharacterized protein LOC1114772638.4e-11990.94Show/hide
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A0A6J1J4F7 uncharacterized protein LOC1114812361.3e-12293.21Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G24550.1 unknown protein1.2e-0838.66Show/hide
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        +N     S+ SSSSIG        SS+ E+  E D+  S  +G LD    SLE+ LP+++G+S  Y GKSKSF +L +A+  S  K++ K EN ++K+RR
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Query:  NLMAYNLVWEKNRSFPLKN
         ++A N +  + RS    N
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AT3G43850.1 unknown protein2.5e-2244.94Show/hide
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        V++   C S+ST SS SIG NSD        +D G  +E++SSY GPLDMM+SLEE LP+++ ISKFY GKSKSF SL++ SS+  +K++ KPEN YS++
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        RRNL+++ +            + GGISK+P  S        +AMS  E +SS   + S
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AT5G21940.1 unknown protein2.3e-3649.15Show/hide
Query:  FEKEVEESNTCSSASTSSSSSIGRNSDQSVRSSD--AEDSGENDEVQSSYKGPLDMMDSLEEVLPVRKGISKFYNGKSKSFTSL-ADASSV----SSMKE
        F      S++ SS S+S+SSSIGRNSD   +SS+   +D+GEN EV+S YKGPL+MM+SLE+VLPVRKGISK+Y+GKSKSFT+L A+A+S     SSMK+
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Query:  IAKPENAYSKKRRNLMAYNLVWEKNRSFPLKNNGGGISKRPI-SSSISSLALAVA-----MSSSESNSSEDSN--SSSYSSSPPPR------------PP
        +AKPEN YS++RRNL+ +  +WE N++ P     GGISK+ + SSS S+L LA+A     M+   S+S  DS+  SS  +S  PPR            PP
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Query:  LHPQSRASNCNLASMVPPQRNFSTWRSYSLADLQEC
        L+P+S+ S  NL S       F  WRS+S+AD   C
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AT5G24890.1 unknown protein1.6e-0837.5Show/hide
Query:  EKEVEESNTC------SSASTSSSSSIGRNSDQSVRSSDAEDSGENDEVQSSYKG--PLDMMDSLEEVLPVRKGISKFYNGKSKSFTSLADASSVSSMKE
        E+ VEES         ++  +S SSSIG   D      + E   END+V S   G   L  M SLE+ LP ++G+S  Y GKSKSF +L +   + S+KE
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Query:  IAKPENAYSKKRRNLMAYNLV------WEKNRSFPL
        +AK EN  +K+RR  +   L       W+  +S PL
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AT5G56550.1 oxidative stress 31.9e-0633.33Show/hide
Query:  EKEVEESNTCSSASTSSSSSIGRNSDQSVRSSDAEDSGENDEVQSSYKGPLDMMDSLEEVLPVRKGISKFYNGKSKSFTSLADASSVSSMKEIAKPENAY
        E  V+E +T  S    +SSS   +S  S+ S   ED  ++D   SS  GPL+ +  L   LP+++G+SKFY GKS+SFTSL +  S+  + +       Y
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Query:  SKKRRNLMAYNLVWEKN--RSFPLKNNGGGISKRPISSSISSLA
          KR++  +   + +++  R F  K        R  SS +S LA
Subjt:  SKKRRNLMAYNLVWEKN--RSFPLKNNGGGISKRPISSSISSLA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGATTACTTTGGATAGGGTTCGGCGGGTTGAGGATAAAGGCTCTGGATTCTCGCCGGAGGATTTGGGTTATAGATCGGTGTTTGAGAGGTTGGATACTGGGGATGT
GGATCGCGGTGTTGAAGGGTTTGAAAAGGAGGTTGAGGAATCTAACACTTGCAGCTCGGCTTCCACTTCTTCGTCTTCTTCGATCGGGAGGAATAGTGATCAGTCTGTGA
GATCGTCGGACGCTGAGGATAGCGGCGAGAATGATGAGGTTCAGAGCTCGTATAAAGGGCCGCTTGATATGATGGACTCTTTGGAGGAGGTCTTGCCCGTCAGAAAAGGT
ATCTCAAAGTTCTACAACGGAAAATCAAAGTCTTTCACGAGTCTGGCCGATGCCTCCTCTGTTTCCTCCATGAAGGAGATTGCAAAGCCAGAGAATGCCTATTCCAAGAA
ACGTAGGAATCTTATGGCGTATAATCTTGTGTGGGAGAAGAACCGGAGTTTCCCCCTCAAGAATAACGGTGGTGGGATATCAAAGAGACCCATCAGCTCAAGCATAAGCT
CCCTGGCTTTGGCTGTTGCTATGAGCAGCTCCGAAAGTAACAGCAGTGAGGATTCAAATTCTAGCTCATATTCAAGCTCTCCACCGCCTCGCCCACCTCTGCATCCACAA
TCCAGGGCATCCAACTGCAATCTGGCTTCCATGGTGCCACCTCAACGAAATTTCTCCACTTGGCGTTCATATTCCTTGGCCGATTTACAAGAGTGTGCCACCTCTGCTAA
TAAGGCCAATTTAACAAATCTCAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAATATCTTTCATTCATTTCTCATCTACGCCGGTTCTCCACGTGCTTCCAATCTCGACCGTCCATTTTTTTAATCCAAAATCCCTCAATTTTTCATTTATAAAACCCCAT
TTCCTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCGTCTCCGTTCTTTCTTCTCTCTCCTTGTTGTCACTGTTCAAATTCGAAGTCGTCATGTCGATTACTTTGGATAGGGTT
CGGCGGGTTGAGGATAAAGGCTCTGGATTCTCGCCGGAGGATTTGGGTTATAGATCGGTGTTTGAGAGGTTGGATACTGGGGATGTGGATCGCGGTGTTGAAGGGTTTGA
AAAGGAGGTTGAGGAATCTAACACTTGCAGCTCGGCTTCCACTTCTTCGTCTTCTTCGATCGGGAGGAATAGTGATCAGTCTGTGAGATCGTCGGACGCTGAGGATAGCG
GCGAGAATGATGAGGTTCAGAGCTCGTATAAAGGGCCGCTTGATATGATGGACTCTTTGGAGGAGGTCTTGCCCGTCAGAAAAGGTATCTCAAAGTTCTACAACGGAAAA
TCAAAGTCTTTCACGAGTCTGGCCGATGCCTCCTCTGTTTCCTCCATGAAGGAGATTGCAAAGCCAGAGAATGCCTATTCCAAGAAACGTAGGAATCTTATGGCGTATAA
TCTTGTGTGGGAGAAGAACCGGAGTTTCCCCCTCAAGAATAACGGTGGTGGGATATCAAAGAGACCCATCAGCTCAAGCATAAGCTCCCTGGCTTTGGCTGTTGCTATGA
GCAGCTCCGAAAGTAACAGCAGTGAGGATTCAAATTCTAGCTCATATTCAAGCTCTCCACCGCCTCGCCCACCTCTGCATCCACAATCCAGGGCATCCAACTGCAATCTG
GCTTCCATGGTGCCACCTCAACGAAATTTCTCCACTTGGCGTTCATATTCCTTGGCCGATTTACAAGAGTGTGCCACCTCTGCTAATAAGGCCAATTTAACAAATCTCAA
CTGACCAGAAAGATTTCCCTTCTCTTGCTTAGGTACGCAAGAGACTTTTAACTATTCTAGGGACCCTGAAACAGAAGGTTTTTCTAGTATGATTTTAGCTCTTATGGTCG
TTACTGTACTCCCTTATATGTTAAAAACCAAAACTTCCATGTCTCGTTGTTTATAATGAAATGGGGATATGAAGTTAGAGTAAAGCTGAGGTAGCAGCAGACTTTTGAGT
CCGCATTTGTCAACACCTGTCTGTACTGGCCTAAGCTAAGACACAACCAACCCAACTACTCACCCACACATAAAACTGCCACCTTGAAGTTTAGTTTGACTGATGAACCA
CAACTTTCAAATCCTTTTTGGTTCACCAAGATTGATAACCTGGTTGGTTGATAAACTGCTAATATCGTTCTTATGCTTACAGGAATTATGCCTGAAAAGATGGATAGGGT
GACCTTCCCCAGTCCATTTAATTGACTTAAGAACTTTTAGTTAACATGTTAAACTGCTCTTATAGTCTTAACATTTGGTTCCTCAAACACTCTCTGCACGTTTTGACACA
TGTAATTCACAGGATCTGGGTTCCTGATATTGATATTTTCCCATGAGCTTCATTTATGGTTGAATTTAACTGCGGCTTCTTTCTTCTAGATCTTGAGAATGTACAATGCT
GCAAATTTGCTCGTTGCTTAAGCACTTTGTAAGCATTCCCAATGACTTTAATGAGTTTCTTTTGCTGATTGTCGTTCAATATAGATTGATTTTTCCTTTGTTTGATAGAT
TGTGGTGTTATTTTTTTTATTTCATTCACATGGTTGAGAGTCTTGATGTTATAGTTGTAGTCAAATAGTTATCGTTCTGCGACTTTAAAGAATATACTGCAAAAAATTCA
ATGTCGGTTGACGTGTTCGTACAGTATTAGATAAGGTTTGATGAAGTGATGGGACCTATCTACTAGTCAATTAGACTAAGTCTAGAGATTAACAATTATATTAAGCCCTA
GTTTACAACCTGTCCAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSITLDRVRRVEDKGSGFSPEDLGYRSVFERLDTGDVDRGVEGFEKEVEESNTCSSASTSSSSSIGRNSDQSVRSSDAEDSGENDEVQSSYKGPLDMMDSLEEVLPVRKG
ISKFYNGKSKSFTSLADASSVSSMKEIAKPENAYSKKRRNLMAYNLVWEKNRSFPLKNNGGGISKRPISSSISSLALAVAMSSSESNSSEDSNSSSYSSSPPPRPPLHPQ
SRASNCNLASMVPPQRNFSTWRSYSLADLQECATSANKANLTNLN