; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0017577 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0017577
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionATP-dependent Clp protease proteolytic subunit
Genome locationLG04:81195836..81201038
RNA-Seq ExpressionTan0017577
SyntenyTan0017577
Gene Ontology termsGO:0006515 - protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins (biological process)
GO:0009368 - endopeptidase Clp complex (cellular component)
GO:0009526 - plastid envelope (cellular component)
GO:0009570 - chloroplast stroma (cellular component)
GO:0004176 - ATP-dependent peptidase activity (molecular function)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0051117 - ATPase binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001907 - ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit
IPR018215 - ClpP, Ser active site
IPR023562 - Clp protease proteolytic subunit /Translocation-enhancing protein TepA
IPR029045 - ClpP/crotonase-like domain superfamily
IPR033135 - ClpP, histidine active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7036637.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.6e-16294.77Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
        MAHTF YTSASSFRLNSLVSVPNSS SSE QKLFLPLE FHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLD+SSRQG+WSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKANLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA+EYGLIDGVIMNPLKA QPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDESGA
        E+E GA
Subjt:  EDESGA

XP_008454281.1 PREDICTED: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Cucumis melo]1.2e-16395.75Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
        MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSS SS+ QK FLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKA+YSGEFSS+DR+SRQGIWSIRDDVQ+PSSPYFP YAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAK+YGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDESGA
        ED+  A
Subjt:  EDESGA

XP_022155316.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Momordica charantia]2.7e-16396.41Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
        MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSS SSE QKLFLPL+PF SRKLGKLVGGGRNLKN+PVKAIYS EFSSLDRSSRQG+WSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERF SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAA+T
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDESGA
        E E GA
Subjt:  EDESGA

XP_022948813.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Cucurbita moschata]1.2e-16093.79Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
        MAHTF YTSASSFRLNSLVSVPNSS SSE QKLFLPLE FHSRKLGK VGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLD+SSR+G+WSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKANLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA+EYGLIDGVIMNPLKA QPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDESGA
        E+E G+
Subjt:  EDESGA

XP_038906134.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Benincasa hispida]4.6e-16397.02Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
        MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSS SSE  KLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVK++YSGE SSLDR+SRQGIWSIRDDVQIPSSPYFP YAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAA T
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  ED
        ED
Subjt:  ED

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BY88 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit5.8e-16495.75Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
        MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSS SS+ QK FLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKA+YSGEFSS+DR+SRQGIWSIRDDVQ+PSSPYFP YAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAK+YGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDESGA
        ED+  A
Subjt:  EDESGA

A0A5A7TNH0 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit5.8e-16495.75Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
        MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSS SS+ QK FLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKA+YSGEFSS+DR+SRQGIWSIRDDVQ+PSSPYFP YAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAK+YGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDESGA
        ED+  A
Subjt:  EDESGA

A0A6J1DRD0 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit1.3e-16396.41Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
        MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSS SSE QKLFLPL+PF SRKLGKLVGGGRNLKN+PVKAIYS EFSSLDRSSRQG+WSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERF SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAA+T
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDESGA
        E E GA
Subjt:  EDESGA

A0A6J1GAD0 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit6.0e-16193.79Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
        MAHTF YTSASSFRLNSLVSVPNSS SSE QKLFLPLE FHSRKLGK VGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLD+SSR+G+WSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKANLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA+EYGLIDGVIMNPLKA QPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDESGA
        E+E G+
Subjt:  EDESGA

A0A6J1K7I3 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit1.3e-16093.79Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
        MAHTF YTSASSFRLNSLVSVPNSS SS+ QKLFLPLE FHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLD+SSRQG+WSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKANLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA+EYGLIDGVIMNPLKA QPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDESGA
        E++  A
Subjt:  EDESGA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2JIP1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 26.6e-6465.45Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RII  G  VDDD+AN+IVAQ+LYL++ DP KDI +Y+NSPGGSV AGMAI+DTM+HI+PDVST+C+GLAASMGAFLL+ GTKGKR +
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAS
        LP++RIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L  K +LN  L+YHTGQ LE+I +DTDRD FM+ ++AKEYGLID VI    K  QP  AA S
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAS

Q2JV68 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 27.3e-6364.4Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RII  G  VDDD+AN+IVAQ+LYL++ DP KDI +Y+NSPGGSV AGMAI+DTM+HI+PDVST+C+GLAASMGAFLL+ G KGKR +
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAS
        LP++RIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L  K +LN  L+YHTGQ LE+I +DTDRD FM+ ++AKEYGLID VI    +  QP  AA S
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAS

Q3MFR5 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 11.9e-6667.38Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RII  G  VD ++AN+IVAQLL+LDA DP KDI +Y+NSPGGSVTAGM IFDTM+HIRPDV T+C GLAASMGAFLLSAGTKGKR S
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLA
        LP+SRIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L+HK  LN YL+ HTGQ +E+I +DT+RDFFMS  EA++YGLID VI       +P+A
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLA

Q8YXH5 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 14.1e-6666.84Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RI+  G  VD ++AN+IVAQLL+LDA DP KDI +Y+NSPGGSVTAGM IFDTM+HIRPDV T+C GLAASMGAFLLSAG KGKR S
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLA
        LP+SRIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L+HK  LN YL+ HTGQ +E+I +DT+RDFFMS  EAK+YGLID VI       +P+A
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLA

Q9S834 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic1.3e-13683.22Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNS-LVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQ
        MAH    TSASS R  +  VS   +  S +  KL LP EP  SRK  KLV   +N KNS  KA+YSG   + +  S QG+WSIRDD+Q+PSSPYFP YAQ
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNS-LVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQ

Query:  GQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLS
        GQGPPPMVQERFQS+ISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDP KDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLS
Subjt:  GQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLS

Query:  AGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        AGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYL+YHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
Subjt:  AGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02560.1 nuclear encoded CLP protease 59.2e-13883.22Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNS-LVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQ
        MAH    TSASS R  +  VS   +  S +  KL LP EP  SRK  KLV   +N KNS  KA+YSG   + +  S QG+WSIRDD+Q+PSSPYFP YAQ
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNS-LVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQ

Query:  GQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLS
        GQGPPPMVQERFQS+ISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDP KDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLS
Subjt:  GQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLS

Query:  AGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        AGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYL+YHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
Subjt:  AGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

AT1G11750.1 CLP protease proteolytic subunit 63.4e-3938.4Show/hide
Query:  KNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIP---SSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFQ-----SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDA
        + +P++ I S   S    S + G+ S      I     +P F      +G PP++           + S LF+ RII  G  ++  +A  +++QL+ L +
Subjt:  KNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIP---SSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFQ-----SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDA

Query:  VDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGY
        +D   DI+MY+N PGGS  + +AI+D M  I+P V TV  G+AAS GA LL+ G KG RY++PN+R+MIHQP  G  G   D+  Q NE +  +  ++  
Subjt:  VDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGY

Query:  LSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVI
         +  TGQ LEK+ Q T+RD F+SA EA E+GLIDG++
Subjt:  LSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVI

AT1G66670.1 CLP protease proteolytic subunit 31.9e-5049.3Show/hide
Query:  SLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGM
        SL +  RQ + S  D     SS    + AQ     P  +E      + L + RI+  G  VDD  A+++++QLL LDA D  +DI +++NSPGGS+TAGM
Subjt:  SLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGM

Query:  AIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFM
         I+D M+  + DVSTVC+GLAASMGAFLL++G+KGKRY +PNS++MIHQPLG A G  T++ I+  EM++HK  LN   S  TG+   +I  DTDRD F+
Subjt:  AIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFM

Query:  SAKEAKEYGLIDGVI
        +  EAKEYGLID VI
Subjt:  SAKEAKEYGLIDGVI

AT5G23140.1 nuclear-encoded CLP protease P73.2e-4546.7Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RII   G ++DD ++++VAQLLYL++ +P+K I MY+NSPGG VTAG+AI+DTM++IR  +ST+C+G AASM + LL+AG KG+R S
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVI-MNPLKALQPLAAAASTEDES
        LPN+ +MIHQP GG  G   DI I   +++     LN     HTGQ L+ +  + DRD FM+ +EAK +G+ID VI   PL+ ++      S +  S
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVI-MNPLKALQPLAAAASTEDES

AT5G45390.1 CLP protease P45.2e-4852.63Show/hide
Query:  VISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSR
        V+  L + RI+  G ++DD +A+ I++QLL LDA DP KDI +++NSPGGS++A MAI+D ++ +R DVST+ +G+AAS  + +L AGTKGKR+++PN+R
Subjt:  VISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSR

Query:  IMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVI
        IMIHQPLGGA G   D++IQA E++H+K N+   ++  T +S E++ +D DRD +MS  EA EYGLIDGVI
Subjt:  IMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCATACTTTCGCCTACACATCCGCCTCGTCTTTTAGATTAAACTCCCTCGTTTCTGTTCCAAATTCGAGCCCTTCTTCCGAGCCCCAGAAGCTCTTTCTCCCCCT
GGAGCCTTTTCATTCGAGGAAACTAGGAAAATTAGTTGGAGGTGGAAGAAACCTCAAGAATTCTCCAGTCAAAGCCATCTACTCAGGCGAGTTTTCATCATTGGATAGGA
GTTCTCGCCAAGGCATTTGGTCTATAAGGGATGACGTGCAAATTCCATCTTCACCATACTTTCCAACTTATGCACAAGGGCAAGGTCCTCCTCCAATGGTGCAGGAACGC
TTCCAAAGTGTTATAAGCCAGCTTTTTCAATATAGAATTATTCGTTGTGGTGGAGCGGTTGATGATGATATGGCTAATATCATTGTTGCTCAACTTCTATACCTTGATGC
TGTTGATCCCAATAAGGATATTGTCATGTATGTAAATTCCCCTGGTGGATCAGTTACAGCTGGTATGGCCATTTTTGACACTATGAGGCATATTCGACCAGATGTCTCCA
CTGTCTGCGTAGGACTAGCAGCCAGTATGGGAGCCTTCCTGCTTAGTGCTGGAACTAAAGGAAAAAGATACAGCTTGCCAAATTCGAGGATAATGATCCATCAGCCTCTT
GGTGGGGCTCAGGGTGGACAGACTGACATTGATATTCAGGCAAATGAAATGTTGCATCATAAGGCTAATCTTAATGGGTATCTTTCCTACCACACCGGTCAAAGTCTCGA
GAAGATTAACCAGGACACCGATCGCGATTTCTTCATGAGCGCTAAAGAAGCCAAAGAGTATGGACTCATAGATGGAGTTATCATGAATCCTCTCAAAGCTCTCCAACCTT
TAGCAGCAGCAGCTTCCACTGAAGACGAGTCGGGTGCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTGCCATCAAATTACTTGCTCGACCCATCTTCTTCTTCTTCTCTATCTTTGCCGTCGTTCGCTTCTTCCAGCGGATAAGGCCTCTCGGACTTTGCTCCGAACTCCCACTG
GCTGCCAATTCTCGGCAGTTTCTTCTTCACCCTTTTGCTTTGTGCCGAGTATTTTCGGAACATTTAGCTGCGAAAATGGCCCATACTTTCGCCTACACATCCGCCTCGTC
TTTTAGATTAAACTCCCTCGTTTCTGTTCCAAATTCGAGCCCTTCTTCCGAGCCCCAGAAGCTCTTTCTCCCCCTGGAGCCTTTTCATTCGAGGAAACTAGGAAAATTAG
TTGGAGGTGGAAGAAACCTCAAGAATTCTCCAGTCAAAGCCATCTACTCAGGCGAGTTTTCATCATTGGATAGGAGTTCTCGCCAAGGCATTTGGTCTATAAGGGATGAC
GTGCAAATTCCATCTTCACCATACTTTCCAACTTATGCACAAGGGCAAGGTCCTCCTCCAATGGTGCAGGAACGCTTCCAAAGTGTTATAAGCCAGCTTTTTCAATATAG
AATTATTCGTTGTGGTGGAGCGGTTGATGATGATATGGCTAATATCATTGTTGCTCAACTTCTATACCTTGATGCTGTTGATCCCAATAAGGATATTGTCATGTATGTAA
ATTCCCCTGGTGGATCAGTTACAGCTGGTATGGCCATTTTTGACACTATGAGGCATATTCGACCAGATGTCTCCACTGTCTGCGTAGGACTAGCAGCCAGTATGGGAGCC
TTCCTGCTTAGTGCTGGAACTAAAGGAAAAAGATACAGCTTGCCAAATTCGAGGATAATGATCCATCAGCCTCTTGGTGGGGCTCAGGGTGGACAGACTGACATTGATAT
TCAGGCAAATGAAATGTTGCATCATAAGGCTAATCTTAATGGGTATCTTTCCTACCACACCGGTCAAAGTCTCGAGAAGATTAACCAGGACACCGATCGCGATTTCTTCA
TGAGCGCTAAAGAAGCCAAAGAGTATGGACTCATAGATGGAGTTATCATGAATCCTCTCAAAGCTCTCCAACCTTTAGCAGCAGCAGCTTCCACTGAAGACGAGTCGGGT
GCGTAAATTTCATCCTGCTGTGCATCAACCAGTTAGATATTCTTCTTGTAGATTTAAAAGCAAAAACCATCTTAGTGTAAGCAGATTTTGACTATTAACAACATGGCTTC
CATGCTTCCATCTTAGCTTAAGCTTGAGAAAATCCTGAAATGCCCATTGAATTACTGTTGTTTCCTTACACCACCAGGATATTTTATTCAAGTGTCCATTAAAATACCTG
TCCTAATTAAAAGAAATCTCCTCTTTGGTTGGTTGGGATGACAAGGATGATGTTGGCCTAACACTTGGCAATGTCTGGTTGGTTGTTGTGAAAAGATGCCGCCGACCCTA
TAAAAGACGGCATTATTATGAAGTCACTTTCTTGATTGTGGATTAATATGCGTTAGGTTTCAATGAGAATTTCTAATGCATTCAGTAGCTTTCCATATACGTTGCAGGAA
AGGGTTTATTATATGCGAACTTGGTTGTTTCTGATATTTTAGTGTTTTTTTTTTTCGATGGAGTTGTTGCATTATGGATATGTTTCTTGAAAAATTTGGGGCTGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSPSSEPQKLFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAIYSGEFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQER
FQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPL
GGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAASTEDESGA