; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0017593 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0017593
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionLipid transfer protein
Genome locationLG04:65840009..65840302
RNA-Seq ExpressionTan0017593
SyntenyTan0017593
Gene Ontology termsGO:0006869 - lipid transport (biological process)
InterPro domainsIPR016140 - Bifunctional inhibitor/plant lipid transfer protein/seed storage helical domain
IPR033872 - Non-specific lipid-transfer protein type 2
IPR036312 - Bifunctional inhibitor/plant lipid transfer protein/seed storage helical domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0064158.1 non-specific lipid-transfer protein 2-like [Cucumis melo var. makuwa]3.2e-3071.58Show/hide
Query:  KLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        KL   G CLLV VA+   LTG RLGEA +CNPTELSPCVSAITSS APTAACCQKL++Q+PCYCGYLKDP+YKAY  SPRV+ +AS C V +P+C
Subjt:  KLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

KAG6581741.1 hypothetical protein SDJN03_21743, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.7e-3272.45Show/hide
Query:  MKKLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAA-PTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        MK LH +G CLLV   +VA+LTGA +GEAV+CNPTELSPC+SAITS+ A PT ACC+KLK+QQPC+CGYLKDPR+K YV SPR ++VASICH+AVPRC
Subjt:  MKKLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAA-PTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

KGN53813.1 hypothetical protein Csa_015036 [Cucumis sativus]2.5e-3070.1Show/hide
Query:  MKKLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        M K+  TG CLLV VA+   L+  RLGEAV+CNPTELSPCVSAITSS APTAACCQKL++Q+PCYCGYLKDP+YKAY  SPRV+ +AS C V +P+C
Subjt:  MKKLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

XP_022158506.1 non-specific lipid-transfer protein 2-like [Momordica charantia]6.3e-2668.37Show/hide
Query:  MKKLHCTGFCLLVA-VAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        MKK      CLLVA VA VA+L+GAR  EA ACNP ELSPC+ AITSSA P+  CCQKLK+QQPC+C Y KDPR K YV SPR K VASIC +AVPRC
Subjt:  MKKLHCTGFCLLVA-VAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

XP_038904866.1 non-specific lipid-transfer protein 2-like [Benincasa hispida]1.3e-2362.89Show/hide
Query:  MKKLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        MK L  T   LLV VAM A+LTGARL EAV C+  ELSPC+ A TS+A P+AACC KLKEQQPC+CGY+K+P+  AYV SPR K V S C V+ P+C
Subjt:  MKKLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KW80 AAI domain-containing protein1.2e-3070.1Show/hide
Query:  MKKLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        M K+  TG CLLV VA+   L+  RLGEAV+CNPTELSPCVSAITSS APTAACCQKL++Q+PCYCGYLKDP+YKAY  SPRV+ +AS C V +P+C
Subjt:  MKKLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

A0A1R3ICI1 AAI domain-containing protein2.7e-2254.64Show/hide
Query:  MKKLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        MK++ C   C++ A+A+V  L   R  EAV CNP  LSPCV+AITS + P++ACC KLKEQQPC+C YLK+P  + YV SP  K VAS C V  P+C
Subjt:  MKKLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

A0A5D3BT00 Non-specific lipid-transfer protein 2-like1.6e-3071.58Show/hide
Query:  KLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        KL   G CLLV VA+   LTG RLGEA +CNPTELSPCVSAITSS APTAACCQKL++Q+PCYCGYLKDP+YKAY  SPRV+ +AS C V +P+C
Subjt:  KLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

A0A6J1D4R3 non-specific lipid-transfer protein 2-like3.5e-2260.2Show/hide
Query:  MKKLHCTGFCL-LVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        MKKL  TG  L L+ VA+ A+L GAR+ EAV C+PTELSPCV+AI S   P++ACC KL+EQ+PC CGYL++P  K YV SP  K VAS C VA P C
Subjt:  MKKLHCTGFCL-LVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

A0A6J1E135 non-specific lipid-transfer protein 2-like3.1e-2668.37Show/hide
Query:  MKKLHCTGFCLLVA-VAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        MKK      CLLVA VA VA+L+GAR  EA ACNP ELSPC+ AITSSA P+  CCQKLK+QQPC+C Y KDPR K YV SPR K VASIC +AVPRC
Subjt:  MKKLHCTGFCLLVA-VAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XBN5 Non-specific lipid-transfer protein 24.0e-1547.73Show/hide
Query:  LLVAVAMVAVLTGARLGEA-VACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        L++AVAMVA   G  +G A  +CN  +L+ C  AI   A PTAACC  L+ QQ C+C + KDPRY  YV SP  +   S C +A+P C
Subjt:  LLVAVAMVAVLTGARLGEA-VACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

P82353 Non-specific lipid-transfer protein 23.1e-1552.94Show/hide
Query:  VACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        V C+P +LSPC+  I S A     CCQKL+EQ+PC CGYLK+P  + YV SP  + +AS C V VP+C
Subjt:  VACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

P86809 Non-specific lipid-transfer protein 22.3e-1558.73Show/hide
Query:  CNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAV
        C+  +LSPC++AIT +  P+AACC KLKEQ+PC CGYLKDP  K YV SP  +  AS C VA+
Subjt:  CNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAV

Q10ST8 Non-specific lipid-transfer protein 24.0e-1548.86Show/hide
Query:  LLVAVAMVAVLTGARLGEAVA-CNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        L++AVAMVA   G  +G A A CN  +L+ C  AI   A PTAACC  L+ QQ C+C + KDPRY  YV SP  +   S C +A+P C
Subjt:  LLVAVAMVAVLTGARLGEAVA-CNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

Q43681 Probable non-specific lipid-transfer protein AKCS91.9e-1748.42Show/hide
Query:  KLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        K+  +  C +V VA+  +  G  + EAV CNPTELS CV AIT  + P++ CC KLK Q+PC C Y+K+P  K YV SP  K V S C V  P C
Subjt:  KLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G48750.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein1.3e-1641.86Show/hide
Query:  LVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        ++A+A   +L    + E V C+P +L+ C +A+TSS+ P+ ACC KL+EQQPC CGY+++P  + YV+SP  + V++ C +  P C
Subjt:  LVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

AT1G66850.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein7.7e-1442.68Show/hide
Query:  AMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        A+ A  TG      V C+  +L PC++AIT    P+ ACC KL EQQ C CG+ K+P +  Y++SP  + V   C+VA P C
Subjt:  AMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

AT1G73780.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein1.1e-1540.91Show/hide
Query:  CLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        C ++ + +VA     R+     CNP +LSPC+  I   + P+  CC K+KEQQ C C YLK+P +K+++ SP  KI+A+ CH   P+C
Subjt:  CLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

AT3G18280.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein4.7e-1947.67Show/hide
Query:  LVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        L A+A V ++  A   EAV C+P +LSPC +AITSS+ P+A CC KLKEQ+PC CGY+++P  + +V++P  + V+  C + +PRC
Subjt:  LVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC

AT5G38160.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein1.0e-1345.59Show/hide
Query:  VACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC
        V C+ T+LS CV+A+++ A P+  CC KLKE + C C Y+++P Y +YVTSP  +   + C VA P C
Subjt:  VACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGAAACTTCATTGCACAGGCTTTTGCCTTCTGGTGGCGGTGGCGATGGTGGCAGTTCTCACCGGAGCTCGTCTCGGGGAAGCAGTGGCTTGCAACCCCACAGAGCT
GAGCCCATGTGTTAGCGCAATCACGTCATCGGCAGCGCCTACCGCTGCTTGCTGCCAGAAGTTGAAGGAGCAACAGCCATGCTATTGTGGGTACCTAAAAGATCCAAGGT
ATAAGGCTTATGTGACATCTCCCCGCGTCAAAATAGTTGCTTCCATCTGCCATGTTGCTGTCCCTAGGTGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGAAACTTCATTGCACAGGCTTTTGCCTTCTGGTGGCGGTGGCGATGGTGGCAGTTCTCACCGGAGCTCGTCTCGGGGAAGCAGTGGCTTGCAACCCCACAGAGCT
GAGCCCATGTGTTAGCGCAATCACGTCATCGGCAGCGCCTACCGCTGCTTGCTGCCAGAAGTTGAAGGAGCAACAGCCATGCTATTGTGGGTACCTAAAAGATCCAAGGT
ATAAGGCTTATGTGACATCTCCCCGCGTCAAAATAGTTGCTTCCATCTGCCATGTTGCTGTCCCTAGGTGCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKKLHCTGFCLLVAVAMVAVLTGARLGEAVACNPTELSPCVSAITSSAAPTAACCQKLKEQQPCYCGYLKDPRYKAYVTSPRVKIVASICHVAVPRC