; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0017964 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0017964
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionRAB GTPase 11C
Genome locationLG01:15688982..15691510
RNA-Seq ExpressionTan0017964
SyntenyTan0017964
Gene Ontology termsGO:0005768 - endosome (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600719.1 Ras-related protein RABA2a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.4e-11096.28Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV
        +NV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALE+TNVEKAFQ+ILSEIYRIISKKSL+SDEPATANIKEGKTIVV
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GEAEANTKKACCSSS
        GE+E N+KKACCSSS
Subjt:  GEAEANTKKACCSSS

XP_004133721.1 ras-related protein RABA2a [Cucumis sativus]7.8e-10996.3Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATA-NIKEGKTIV
        +NVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALE+TNVEKAFQ+ILSEIYRIISKKSL+S+EPA A NIKEGKTIV
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATA-NIKEGKTIV

Query:  VGEAEANTKKACCSSS
        VGE+EANTKKACCSSS
Subjt:  VGEAEANTKKACCSSS

XP_022943001.1 ras-related protein RABA2a-like [Cucurbita moschata]9.2e-11096.28Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV
        +NV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALE+TNVEKAFQ+ILSEIYRIISKKSL+SDEPATANIKEGKTIVV
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GEAEANTKKACCSSS
        GE+E N+KKACCSSS
Subjt:  GEAEANTKKACCSSS

XP_022989944.1 ras-related protein RABA2a-like [Cucurbita maxima]3.5e-10995.35Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV
        +NV+RWLKELRDHAD+NIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSY+EKEGLSFIETSALE+TNVEKAFQ+ILSEIYRIISKKSL+SDEPA ANIKEGKTIVV
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GEAEANTKKACCSSS
        GE+EAN+KKACCSSS
Subjt:  GEAEANTKKACCSSS

XP_038905598.1 ras-related protein RABA2a [Benincasa hispida]4.1e-11096.28Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV
        +NVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALE+TNVEKAFQ+ILSEIYRIISKKSL+S+EPA ANIKEGKTIVV
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GEAEANTKKACCSSS
        GE+EANTKKACCSSS
Subjt:  GEAEANTKKACCSSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6P8 Uncharacterized protein3.8e-10996.3Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATA-NIKEGKTIV
        +NVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALE+TNVEKAFQ+ILSEIYRIISKKSL+S+EPA A NIKEGKTIV
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATA-NIKEGKTIV

Query:  VGEAEANTKKACCSSS
        VGE+EANTKKACCSSS
Subjt:  VGEAEANTKKACCSSS

A0A1S3BTD1 ras-related protein RABA2a8.4e-10995.83Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATA-NIKEGKTIV
        +NVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALE+TNVEKAFQ+ILSEIYRIISKKSL+S+EP+ A NIKEGKTIV
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATA-NIKEGKTIV

Query:  VGEAEANTKKACCSSS
        VGE+EANTKKACCSSS
Subjt:  VGEAEANTKKACCSSS

A0A6J1EU78 ras-related protein RABA2a5.4e-10894.93Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEP--ATANIKEGKTI
        +NVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALE+TNVEKAFQ+ILSEIYRIISKKSL+S+EP  A ANIKEGKTI
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEP--ATANIKEGKTI

Query:  VVGEAEANTKKACCSSS
        VVGE+EAN+KK CCSSS
Subjt:  VVGEAEANTKKACCSSS

A0A6J1FQI3 ras-related protein RABA2a-like4.4e-11096.28Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV
        +NV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALE+TNVEKAFQ+ILSEIYRIISKKSL+SDEPATANIKEGKTIVV
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GEAEANTKKACCSSS
        GE+E N+KKACCSSS
Subjt:  GEAEANTKKACCSSS

A0A6J1JQR7 ras-related protein RABA2a-like1.7e-10995.35Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV
        +NV+RWLKELRDHAD+NIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSY+EKEGLSFIETSALE+TNVEKAFQ+ILSEIYRIISKKSL+SDEPA ANIKEGKTIVV
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GEAEANTKKACCSSS
        GE+EAN+KKACCSSS
Subjt:  GEAEANTKKACCSSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04486 Ras-related protein RABA2a1.0e-10390.32Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPD++YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKP TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDE-PATANIKEGKTI-
        ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALE+ NVEKAFQ+ILSE+YRIISKKS+SSD+  A ANIKEG+TI 
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDE-PATANIKEGKTI-

Query:  VVGEAEANTKKACCSSS
        V   +E+N KK CCSSS
Subjt:  VVGEAEANTKKACCSSS

Q39434 Ras-related protein Rab2BV1.4e-8976.17Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV
        +NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DLKHLRAV+ ED Q+ AEKEGLSF+ETSALE+ N+EKAFQ+IL+EIY IISKK+L++ E ++    +G TI V
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GEAEANTKKACCSS
         +A AN +++CCS+
Subjt:  GEAEANTKKACCSS

Q40193 Ras-related protein Rab11C1.0e-8775.12Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIK---EGKT
        +NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLRAV+ +D  + +EKEGLSF+ETSALE+TN+EKAFQ+IL+EIY I+SKK+L++ E ATA      +G T
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIK---EGKT

Query:  IVVGEAEANTKKACCSS
        I V +   NTKK CCS+
Subjt:  IVVGEAEANTKKACCSS

Q96283 Ras-related protein RABA2c1.2e-8876.04Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        M  R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT QVEG+T+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIK---EGKT
        +NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED QS AEKEGLSF+ETSALE+TNVEKAFQ+IL EIY IISKK+L++ E A AN     +G T
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIK---EGKT

Query:  IVVGEAEANTKKACCSS
        I V +     K+ACCSS
Subjt:  IVVGEAEANTKKACCSS

Q9LNW1 Ras-related protein RABA2b2.1e-8876.17Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV
        ENV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED +S AEKEGLSF+ETSALE+TN+EKAFQ+ILSEIY IISKK+L++ E A     +G  I +
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GEAEANTKKACCSS
         ++ A  +K CCS+
Subjt:  GEAEANTKKACCSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07410.1 RAB GTPase homolog A2B1.5e-8976.17Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV
        ENV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED +S AEKEGLSF+ETSALE+TN+EKAFQ+ILSEIY IISKK+L++ E A     +G  I +
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GEAEANTKKACCSS
         ++ A  +K CCS+
Subjt:  GEAEANTKKACCSS

AT1G09630.1 RAB GTPase 11C7.2e-10590.32Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPD++YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKP TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDE-PATANIKEGKTI-
        ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALE+ NVEKAFQ+ILSE+YRIISKKS+SSD+  A ANIKEG+TI 
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDE-PATANIKEGKTI-

Query:  VVGEAEANTKKACCSSS
        V   +E+N KK CCSSS
Subjt:  VVGEAEANTKKACCSSS

AT3G46830.1 RAB GTPase homolog A2C8.6e-9076.04Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        M  R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT QVEG+T+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIK---EGKT
        +NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED QS AEKEGLSF+ETSALE+TNVEKAFQ+IL EIY IISKK+L++ E A AN     +G T
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIK---EGKT

Query:  IVVGEAEANTKKACCSS
        I V +     K+ACCSS
Subjt:  IVVGEAEANTKKACCSS

AT5G59150.1 RAB GTPase homolog A2D4.7e-8874.65Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R + DYDYLFK+VLIGDSGVGK+N+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIK---EGKT
        +NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK DL HLR+VA ED Q+ AE EGLSF+ETSALE+TNVEKAFQ++L+EIY IISKK+L++ E A AN     +G T
Subjt:  ENVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIK---EGKT

Query:  IVVGEAEANTKKACCSS
        I V +     K+ CCS+
Subjt:  IVVGEAEANTKKACCSS

AT5G60860.1 RAB GTPase homolog A1F4.3e-8170.51Show/hide
Query:  ARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFE
        A R DD+YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEF LESKSTIGVEFATR++ V+ + VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVT+ +TFE
Subjt:  ARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFE

Query:  NVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLS-SDEPATANIKEGKTIVV
        NV RWLKELRDH D+NIVIM +GNK DL+HLRAV+TEDA+++AE+E   F+ETSALES NVE AF  +LS+IYR++S+K+L   D+PA   + +G+TI V
Subjt:  NVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLS-SDEPATANIKEGKTIVV

Query:  G---EAEANTKKACCSS
        G   +  A  K  CCS+
Subjt:  G---EAEANTKKACCSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCGGAGACCCGACGACGACTATGATTACCTCTTCAAAGTTGTGCTAATCGGCGATTCCGGCGTTGGAAAATCCAACCTCCTTTCCCGATTCACTCGGAATGAGTT
TTGTTTGGAGTCTAAGTCCACCATTGGCGTCGAATTCGCCACTCGTACTCTTCAGGTAGAGGGAAGAACTGTGAAAGCTCAGATATGGGACACGGCCGGTCAAGAGCGTT
ACAGAGCAATAACCAGTGCTTACTATAGGGGTGCCCTCGGAGCCCTTCTAGTGTATGATGTAACAAAACCGATGACATTCGAAAATGTAAGCCGTTGGTTGAAGGAACTT
AGGGACCATGCTGATTCCAACATAGTCATCATGCTAATCGGAAACAAGACTGATCTGAAACACCTTCGAGCAGTGGCGACAGAGGACGCACAGAGTTACGCCGAGAAAGA
AGGGCTATCATTCATTGAAACTTCTGCTCTTGAATCAACAAACGTGGAGAAGGCCTTCCAAAGTATTCTCTCAGAGATATATCGGATAATCAGTAAGAAGTCCCTCAGTT
CGGATGAGCCTGCTACTGCTAACATCAAGGAAGGAAAAACCATTGTGGTTGGTGAAGCGGAGGCCAATACAAAGAAGGCTTGTTGCTCCTCTTCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAGCGTTTGAAGTCGGCAGAGTCTCCATTTCGTCTTCATTTTCAAAGTGGAGCACAGCCGATTCGTGAGGAACAAGTTCTTCAATTTTGCTTTCCAGATTTCGGAAAGCT
AAATCTTTAGACCAAAGAACCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACGCCGGCGAGATAATATGGCCCGGAGACCCGACGACGACTATGATTACCTCTTCAAAGTTGTGCTA
ATCGGCGATTCCGGCGTTGGAAAATCCAACCTCCTTTCCCGATTCACTCGGAATGAGTTTTGTTTGGAGTCTAAGTCCACCATTGGCGTCGAATTCGCCACTCGTACTCT
TCAGGTAGAGGGAAGAACTGTGAAAGCTCAGATATGGGACACGGCCGGTCAAGAGCGTTACAGAGCAATAACCAGTGCTTACTATAGGGGTGCCCTCGGAGCCCTTCTAG
TGTATGATGTAACAAAACCGATGACATTCGAAAATGTAAGCCGTTGGTTGAAGGAACTTAGGGACCATGCTGATTCCAACATAGTCATCATGCTAATCGGAAACAAGACT
GATCTGAAACACCTTCGAGCAGTGGCGACAGAGGACGCACAGAGTTACGCCGAGAAAGAAGGGCTATCATTCATTGAAACTTCTGCTCTTGAATCAACAAACGTGGAGAA
GGCCTTCCAAAGTATTCTCTCAGAGATATATCGGATAATCAGTAAGAAGTCCCTCAGTTCGGATGAGCCTGCTACTGCTAACATCAAGGAAGGAAAAACCATTGTGGTTG
GTGAAGCGGAGGCCAATACAAAGAAGGCTTGTTGCTCCTCTTCTTAAGTTCAGAAAAATATTTCAACATTTTTGTAACTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTTCTTTGTCATCTGCTTGTTCATTTCTTTCTAGTTACCAACTCTATTCTGTTATTTGTTTGCTTGGATTATTTGGTGTATAATTTAC
ATATAATTTATATTTTACTTAGGTTTAATTTTTTTCTCATTATGTAGCCAAGGGATCATTGAAATCTCTTGTCAGACACTAATGAGCGGTTCATTTCAGTGGGTGTCTGT
TTCTATGGAATCTCTATGTTGGAGAATCAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFENVSRWLKEL
RDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALESTNVEKAFQSILSEIYRIISKKSLSSDEPATANIKEGKTIVVGEAEANTKKACCSSS