; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0017983 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0017983
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationLG08:66289960..66290928
RNA-Seq ExpressionTan0017983
SyntenyTan0017983
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596606.1 hypothetical protein SDJN03_09786, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.9e-4867.03Show/hide
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         LFTI  EEEEREGIES E D      S  D D    TT F+TPCGSPPFF  SPSPTRDAGD PV+KDSSD +    FLAIEI+
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KAG7028145.1 hypothetical protein SDJN02_09325, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.7e-4867.57Show/hide
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         LFTI  EEEEREGIES E D      S  D D    TT F+TPCGSPPFF  SPSPTRDAGD PV+KDSSD +    FLAIEI+
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XP_022943016.1 uncharacterized protein LOC111447877 [Cucurbita moschata]1.7e-4867.57Show/hide
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         LFTI  EEEEREGIES E D      S  D D    TT FHTPCGSPPFF  SPSPTRDAGD PV+KDSSD +    FLAIEI+
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XP_023005969.1 uncharacterized protein LOC111498829 [Cucurbita maxima]6.4e-5167.03Show/hide
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         LFTI  EEEEREG+ES E DPK       D D    TT F+TPCGSPPFFT  PSPT DA D PV+KDS D +RT  FLAIEI+
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XP_038905411.1 uncharacterized protein LOC120091450 [Benincasa hispida]1.2e-4962.43Show/hide
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        PSR LFTI  EEEEREG IE F YDP  K      + + E+TT FHTPC SPP+FTPS SPTRD+ D P ++  S+DN T PF  I+I+
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TPT7 Uncharacterized protein2.1e-3955.44Show/hide
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        MDGGLNK+AT LI +F   F  LLAQIL+   RRR  +R  G EP +K  YLF WRNQSRI+PKEI   SK+   S   AV +    A+DEL KW+ELCG
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        PSR LFTI EEEEREG IE FEY+   PKLK+         E+TT FHTPC SPP+ TPS SP+R   D P ++   DDN T PF AI+I+ +
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A0A6J1F429 uncharacterized protein LOC1114422043.2e-4056.54Show/hide
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        MDGGLNK+   LIA+F +TFLLL+AQIL+  SRRR H+    +P EK  Y FCWRNQ RIEPKEIA  SK H + E+AA A+        +E+W+EL GP
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        SR LFTI EEEE EGIES                   +T SFHTPCGSP  +FTPSP  SPTRDAG+ PV+ D  D NRT PFLAIEIS +
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A0A6J1FQJ7 uncharacterized protein LOC1114478778.4e-4967.57Show/hide
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         LFTI  EEEEREGIES E D      S  D D    TT FHTPCGSPPFF  SPSPTRDAGD PV+KDSSD +    FLAIEI+
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A0A6J1J6W6 uncharacterized protein LOC1114817749.3e-4055.03Show/hide
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        SR LFTI EEEE EG ES                   +T +FHTPCGSP  +FTPSPSPTR+AG+ PV+ D  D NRT PFLA+EIS +
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A0A6J1L0U5 uncharacterized protein LOC1114988293.1e-5167.03Show/hide
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         LFTI  EEEEREG+ES E DPK       D D    TT F+TPCGSPPFFT  PSPT DA D PV+KDS D +RT  FLAIEI+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G11640.1 unknown protein3.8e-0934.5Show/hide
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        L      L+AV     L+L A++ + F  R         P  K V   +L C +   + SRIEP    ++ ++ +D  +AAV  E  AA D   KWR   
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Query:  GPSRELFTINE-----EEEREGIESFEYDPKLKSSSSSDMDLGENTTSFHTPCGSPPFFTPSPSPTRDAGD
          SR LFTI E     E++ + + S E D   +      ++   + T F TPC SPP+FTPSPSP RD  D
Subjt:  GPSRELFTINE-----EEEREGIESFEYDPKLKSSSSSDMDLGENTTSFHTPCGSPPFFTPSPSPTRDAGD

AT3G52480.1 unknown protein8.4e-0930.14Show/hide
Query:  GLNKLATALIAVFAITFLLLLAQILFFFSRRRHHRRR------------RG------EPMEKSV---YLFCWRNQSRIEPKEIASKVHDDSESAAVAMET
        GL   AT L+AVFA   + + AQ  +    +R  RRR            RG       P  K +   +LFC  N+       I S       +AA  +  
Subjt:  GLNKLATALIAVFAITFLLLLAQILFFFSRRRHHRRR------------RG------EPMEKSV---YLFCWRNQSRIEPKEIASKVHDDSESAAVAMET

Query:  AAADDELEKWRELCGPSRELFTI-----NEEEEREG-------------IESFEYDPKLKSSSSSDMDLG----ENTTSFHTPCGSPPFFTPSPSPTRDA
         A+   +     LCGPS  LFTI     +E + R G             ++  E + ++ ++  SD ++       TT F TPC SPPF+TPSPSP RD 
Subjt:  AAADDELEKWRELCGPSRELFTI-----NEEEEREG-------------IESFEYDPKLKSSSSSDMDLG----ENTTSFHTPCGSPPFFTPSPSPTRDA

Query:  GDSPVEKDS
            V ++S
Subjt:  GDSPVEKDS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACGGCGGCCTCAATAAGCTCGCTACCGCACTCATCGCCGTCTTCGCAATCACTTTCCTACTTCTCCTCGCCCAAATCCTCTTCTTTTTCTCTCGCCGGCGCCACCA
CCGCCGCCGCCGCGGCGAACCCATGGAAAAATCCGTCTACCTTTTCTGTTGGAGGAACCAATCGCGGATCGAACCCAAAGAAATCGCGTCCAAAGTCCACGATGATTCCG
AGTCGGCGGCTGTGGCGATGGAGACGGCGGCGGCCGACGACGAGTTGGAGAAATGGCGGGAACTGTGCGGACCGTCGAGAGAGCTTTTCACTATCAATGAAGAGGAAGAA
AGAGAAGGAATCGAATCTTTCGAGTACGATCCTAAACTGAAATCGTCGTCTTCTTCAGATATGGATTTAGGCGAGAATACGACATCGTTTCATACGCCCTGCGGGTCTCC
TCCGTTCTTCACGCCGTCGCCGTCTCCCACTCGTGACGCCGGCGACTCTCCGGTGGAAAAAGATTCTTCCGACGACAATCGCACGCCACCGTTTTTGGCTATTGAGATTA
GTGACTACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCCGCTCAACTACTTCAAAATTTAAACCCCACACTCCCCAAGTCCACGTCATCATTAATTCGTCACTTTTCCCTCAACCATTTTCCAAGAAAAAGAGAAAAAAAAATTAA
ATCACCATTTCCATTTTCCCCTCACAAATCCATTCTCTTCTTCAGCCATAATTCCCTTACAGACATTAGACATGGACGGCGGCCTCAATAAGCTCGCTACCGCACTCATC
GCCGTCTTCGCAATCACTTTCCTACTTCTCCTCGCCCAAATCCTCTTCTTTTTCTCTCGCCGGCGCCACCACCGCCGCCGCCGCGGCGAACCCATGGAAAAATCCGTCTA
CCTTTTCTGTTGGAGGAACCAATCGCGGATCGAACCCAAAGAAATCGCGTCCAAAGTCCACGATGATTCCGAGTCGGCGGCTGTGGCGATGGAGACGGCGGCGGCCGACG
ACGAGTTGGAGAAATGGCGGGAACTGTGCGGACCGTCGAGAGAGCTTTTCACTATCAATGAAGAGGAAGAAAGAGAAGGAATCGAATCTTTCGAGTACGATCCTAAACTG
AAATCGTCGTCTTCTTCAGATATGGATTTAGGCGAGAATACGACATCGTTTCATACGCCCTGCGGGTCTCCTCCGTTCTTCACGCCGTCGCCGTCTCCCACTCGTGACGC
CGGCGACTCTCCGGTGGAAAAAGATTCTTCCGACGACAATCGCACGCCACCGTTTTTGGCTATTGAGATTAGTGACTACTGAGGAGAATCTGCGACGAGCATTTGATGGT
ATCACTTAGTCTTGACTCTTTCTTGTCCGTTAGTGTTCGACACGTAGTATGAATGATGACTACGGATTTGAAGTTTCAACTCTCTTGGTCGACATGTCGGTCCACGAAGC
TTGCCTTTGCATGACTGTTTTTTGCCACGTCAGCTACGTCTGTTCTAAATAGGAGGGACCCACATGGCCGTTGGATTTGACATCTCGTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDGGLNKLATALIAVFAITFLLLLAQILFFFSRRRHHRRRRGEPMEKSVYLFCWRNQSRIEPKEIASKVHDDSESAAVAMETAAADDELEKWRELCGPSRELFTINEEEE
REGIESFEYDPKLKSSSSSDMDLGENTTSFHTPCGSPPFFTPSPSPTRDAGDSPVEKDSSDDNRTPPFLAIEISDY