; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0018511 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0018511
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptiont-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein
Genome locationLG04:9079210..9080936
RNA-Seq ExpressionTan0018511
SyntenyTan0018511
Gene Ontology termsGO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0061025 - membrane fusion (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0031201 - SNARE complex (cellular component)
GO:0005484 - SNAP receptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000727 - Target SNARE coiled-coil homology domain
IPR044766 - NPSN/SNAP25-like, N-terminal SNARE domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6574050.1 SNAP25-likeous protein SNAP33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-13986.83Show/hide
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XP_022945438.1 putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Cucurbita moschata]1.8e-14087.7Show/hide
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XP_022968314.1 putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Cucurbita maxima]1.6e-13987.07Show/hide
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XP_023542548.1 putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.4e-14087.42Show/hide
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        ELNSRVKGANQRARRL+G
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XP_038891847.1 putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Benincasa hispida]4.0e-14388.78Show/hide
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        GR +NNKE+REKLGVSTGKKQSA++TPPSE SGAMQKVE EKEKQDDALSDLSNILGDLK+MAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRAR+
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        L+G
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KQT5 t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein8.4e-13987.17Show/hide
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        SG+ +NNKE+REKLG+STGKKQSA++TPPSE SGA+QKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLK+MAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRAR
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A0A1S3BF13 putative SNAP25 homologous protein SNAP305.4e-13887.13Show/hide
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        G+ +NNK++REKLG+STGKKQSA++TPPSE SGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLK+MAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRAR 
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        L+G
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A0A6J1G0W1 putative SNAP25 homologous protein SNAP308.9e-14187.7Show/hide
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A0A6J1HWW0 putative SNAP25 homologous protein SNAP307.6e-14087.07Show/hide
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A0A6J1J9F6 putative SNAP25 homologous protein SNAP304.6e-13787.17Show/hide
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        SGR +NNKE+REKLGVSTGKKQSA++TPPSE +GA+QKVE +KE QDDALSDLSNILGDLK+MAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRAR
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Query:  RLVG
         LVG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P36977 Synaptosomal-associated protein 25-A3.9e-1629.05Show/hide
Query:  VQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLG---GMFSKPWKPKKTREITGPLITADNS
        + +++  A   A+E+ +S    L++ E+ +    RTL ML +QGEQ+ER       ++KD+   EK LN+LG   G+ S P    K+    G     +N 
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Query:  SGRADNNK----EEREKLGVSTGKKQSASRTPPSESSGAMQKV--EVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKG
         G   +      +ERE++ +               S G +++V  +  + + D+ L  +  I+G+L++MA+DMG+E+D QN+ +D + +  D   +R+  
Subjt:  SGRADNNK----EEREKLGVSTGKKQSASRTPPSESSGAMQKV--EVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKG

Query:  ANQRARRLVG
        ANQRA +++G
Subjt:  ANQRARRLVG

Q17QQ3 Synaptosomal-associated protein 253.3e-1528.37Show/hide
Query:  VQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLG---GMFSKPWKPKKTREITGPLITADNS
        ++E++  A   A+E+ +S    L++ E+ +    RTL ML +QGEQ+ER       ++KD+ + EK L +LG   G+   P    K+ +        +N 
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Query:  SGRADNNK----EEREKLGVSTGKKQSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGAN
         G   +      +ERE++ +S G  +  +              +  + + D+ L  +S I+G+L++MA+DMG+E+D QN+ +D + +  D   +R+  AN
Subjt:  SGRADNNK----EEREKLGVSTGKKQSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGAN

Query:  QRARRLVG
        QRA +++G
Subjt:  QRARRLVG

Q9LMG8 Putative SNAP25 homologous protein SNAP304.2e-8760.26Show/hide
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        MF F KSP                 G N   +++      T    RRTSSEP L+ P       FDDD                 D+YKN F DSGGL++
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        Q+ +ELE YAVYKAEETTK VNNCLKIAEDIR D  RTL+MLHQQGEQI RTH MA DMDKDLS+GEKLLNNLGGMFSKPWKPKKT+ ITGP+IT D  S
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Query:  GRADNNKEEREKLGVSTGKKQSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARR
         +++N+KEEREKLG+   K +S+S+    + + A+QKVE EK KQDD LSDLS+ILGDLK+MAVDMGSE+D+QNKALDHL DDVDELNSRV+GANQRAR 
Subjt:  GRADNNKEEREKLGVSTGKKQSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARR

Query:  LV
        L+
Subjt:  LV

Q9S7P9 SNAP25 homologous protein SNAP337.2e-8760.19Show/hide
Query:  MFSFMKSPAKVSKPNSEDPGLSAGSGTNPFDSDTGLETNQTPNPARRTSSEPALVIPKSNSPNPFDDDDDGFVGRRGTATSKP-----SKDRYKNDFRDS
        MF   KSPA + K NS D      S  NPFDSD   +   T NP++RT+SEP+L    ++  NPF  +    V +  +++SK      SK +YKN+FRDS
Subjt:  MFSFMKSPAKVSKPNSEDPGLSAGSGTNPFDSDTGLETNQTPNPARRTSSEPALVIPKSNSPNPFDDDDDGFVGRRGTATSKP-----SKDRYKNDFRDS

Query:  GGLENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTREITGPLIT
        GG+ENQSVQELE YAVYKAEETTKSV  CLK+AEDIR DATRTL MLH QGEQI RTH  A ++D DLS+GEKLL +LGGMFSK WKPKKTR I GP++T
Subjt:  GGLENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTREITGPLIT

Query:  ADNSSGRADNNKEEREKLGVSTGKK-QSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGA
         D+S  R  N+ E+REKLG+++  + QS +R P  ES+ A Q+VE+EK KQDD LSDLS+ILG+LKNMAVDMGSE+++QNK LDHL DDVDELN RV+ +
Subjt:  ADNSSGRADNNKEEREKLGVSTGKK-QSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGA

Query:  NQRARRLVG
        NQR RRL+G
Subjt:  NQRARRLVG

Q9SD96 SNAP25 homologous protein SNAP299.8e-6053.47Show/hide
Query:  KSNSPNPFDDDDDGFVGRRGTATSKPSKDRYKNDFRDSGGLENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAA
        KS S NPFDDDDD           K  + R+ +  + SGG ENQ+VQELE+YAVY +EETTK+V  CLK+AE+IR DA++TL ML++QG+QI RTH+   
Subjt:  KSNSPNPFDDDDDGFVGRRGTATSKPSKDRYKNDFRDSGGLENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAA

Query:  DMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTREITGPLITADNSSGRADNNKEEREKLGVSTGKKQSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILG
        D+D  LS+GEK+L  LGG+FS+ WKPKK+R ITGP+IT  +S  R   + + REKLG++   K  +   P  E+  A QK ++   KQD+AL+DLS +LG
Subjt:  DMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTREITGPLITADNSSGRADNNKEEREKLGVSTGKKQSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILG

Query:  DLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLV
        +LKNMAVDMG+ ++RQ   LDHL D+ DELN RVK +NQRAR L+
Subjt:  DLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G13890.1 soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor adaptor protein 303.0e-8860.26Show/hide
Query:  MFSFMKSPAKVSKPNSEDPGLSAGSGTNPFDSDTGLETNQTPNPARRTSSEPALVIPKSNSPNPFDDDDDGFVGRRGTATSKPSKDRYKNDFRDSGGLEN
        MF F KSP                 G N   +++      T    RRTSSEP L+ P       FDDD                 D+YKN F DSGGL++
Subjt:  MFSFMKSPAKVSKPNSEDPGLSAGSGTNPFDSDTGLETNQTPNPARRTSSEPALVIPKSNSPNPFDDDDDGFVGRRGTATSKPSKDRYKNDFRDSGGLEN

Query:  QSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTREITGPLITADNSS
        Q+ +ELE YAVYKAEETTK VNNCLKIAEDIR D  RTL+MLHQQGEQI RTH MA DMDKDLS+GEKLLNNLGGMFSKPWKPKKT+ ITGP+IT D  S
Subjt:  QSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTREITGPLITADNSS

Query:  GRADNNKEEREKLGVSTGKKQSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARR
         +++N+KEEREKLG+   K +S+S+    + + A+QKVE EK KQDD LSDLS+ILGDLK+MAVDMGSE+D+QNKALDHL DDVDELNSRV+GANQRAR 
Subjt:  GRADNNKEEREKLGVSTGKKQSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARR

Query:  LV
        L+
Subjt:  LV

AT3G09740.1 syntaxin of plants 716.4e-0629.38Show/hide
Query:  AVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNN-----------------LGGMFS-KPWKPKKTREITG
        A+ KAE  TK  N    +A  +  +  RT   L    E++ +  R+A    K L+  E    N                  GG  S   W P  T   + 
Subjt:  AVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNN-----------------LGGMFS-KPWKPKKTREITG

Query:  PLITADNSSGRADNNKEEREKLGVSTGKKQSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRV
        P I  D S GR D++  +                   +ESS   Q+ E+ K KQ+  L  +S  L  LKNMA DM  ELDRQ   +D +   VD   S +
Subjt:  PLITADNSSGRADNNKEEREKLGVSTGKKQSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRV

Query:  KGANQRARRLV
        K  N R +  V
Subjt:  KGANQRARRLV

AT3G45280.1 syntaxin of plants 725.4e-0538.03Show/hide
Query:  ESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARR
        ESS   Q+ E+ ++KQD+ L  +S  L  LKN+A DM  ELD+Q   ++ +   VD   S +K  N R ++
Subjt:  ESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARR

AT5G07880.1 synaptosomal-associated protein SNAP25-like 296.9e-6153.47Show/hide
Query:  KSNSPNPFDDDDDGFVGRRGTATSKPSKDRYKNDFRDSGGLENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAA
        KS S NPFDDDDD           K  + R+ +  + SGG ENQ+VQELE+YAVY +EETTK+V  CLK+AE+IR DA++TL ML++QG+QI RTH+   
Subjt:  KSNSPNPFDDDDDGFVGRRGTATSKPSKDRYKNDFRDSGGLENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAA

Query:  DMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTREITGPLITADNSSGRADNNKEEREKLGVSTGKKQSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILG
        D+D  LS+GEK+L  LGG+FS+ WKPKK+R ITGP+IT  +S  R   + + REKLG++   K  +   P  E+  A QK ++   KQD+AL+DLS +LG
Subjt:  DMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTREITGPLITADNSSGRADNNKEEREKLGVSTGKKQSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILG

Query:  DLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLV
        +LKNMAVDMG+ ++RQ   LDHL D+ DELN RVK +NQRAR L+
Subjt:  DLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLV

AT5G61210.1 soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor adaptor protein 335.1e-8860.19Show/hide
Query:  MFSFMKSPAKVSKPNSEDPGLSAGSGTNPFDSDTGLETNQTPNPARRTSSEPALVIPKSNSPNPFDDDDDGFVGRRGTATSKP-----SKDRYKNDFRDS
        MF   KSPA + K NS D      S  NPFDSD   +   T NP++RT+SEP+L    ++  NPF  +    V +  +++SK      SK +YKN+FRDS
Subjt:  MFSFMKSPAKVSKPNSEDPGLSAGSGTNPFDSDTGLETNQTPNPARRTSSEPALVIPKSNSPNPFDDDDDGFVGRRGTATSKP-----SKDRYKNDFRDS

Query:  GGLENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTREITGPLIT
        GG+ENQSVQELE YAVYKAEETTKSV  CLK+AEDIR DATRTL MLH QGEQI RTH  A ++D DLS+GEKLL +LGGMFSK WKPKKTR I GP++T
Subjt:  GGLENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTREITGPLIT

Query:  ADNSSGRADNNKEEREKLGVSTGKK-QSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGA
         D+S  R  N+ E+REKLG+++  + QS +R P  ES+ A Q+VE+EK KQDD LSDLS+ILG+LKNMAVDMGSE+++QNK LDHL DDVDELN RV+ +
Subjt:  ADNSSGRADNNKEEREKLGVSTGKK-QSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGA

Query:  NQRARRLVG
        NQR RRL+G
Subjt:  NQRARRLVG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTAGTTTCATGAAATCCCCCGCGAAAGTTTCTAAGCCGAATTCTGAAGATCCTGGATTATCAGCCGGATCTGGCACTAATCCTTTTGATTCAGATACTGGACTTGA
AACCAACCAAACTCCTAATCCTGCAAGAAGAACTTCTTCCGAGCCTGCACTCGTCATACCGAAATCCAATTCCCCCAATCCTTTTGATGATGATGATGATGGTTTTGTTG
GAAGAAGAGGTACTGCAACTTCTAAACCCTCTAAAGACAGGTACAAAAATGATTTTCGCGACTCGGGAGGGCTTGAGAACCAGAGTGTGCAGGAATTGGAGAACTACGCC
GTGTATAAAGCTGAGGAGACCACAAAATCTGTGAATAACTGCCTGAAGATCGCTGAGGACATAAGGGGAGATGCTACCAGGACCCTTGACATGTTGCATCAGCAGGGTGA
GCAAATTGAGAGGACCCACAGGATGGCTGCTGATATGGATAAAGATCTAAGTAAGGGAGAGAAACTTCTGAATAATCTTGGAGGCATGTTTTCTAAGCCATGGAAGCCAA
AGAAGACCAGAGAAATTACAGGCCCTCTTATAACAGCAGACAATTCCTCCGGGAGAGCTGATAACAACAAGGAGGAACGGGAAAAACTGGGTGTATCTACGGGCAAAAAG
CAGTCGGCTTCTCGAACACCACCTTCTGAATCATCAGGCGCAATGCAAAAAGTTGAGGTTGAGAAGGAAAAGCAAGATGATGCACTCTCAGATTTAAGTAATATCTTAGG
TGATCTGAAGAACATGGCTGTGGACATGGGAAGCGAGCTTGACAGGCAAAACAAAGCTCTGGATCATCTAAGTGACGATGTCGACGAGCTGAATTCTAGAGTGAAAGGCG
CGAATCAACGAGCTCGCCGTTTGGTTGGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTTAGTTTCATGAAATCCCCCGCGAAAGTTTCTAAGCCGAATTCTGAAGATCCTGGATTATCAGCCGGATCTGGCACTAATCCTTTTGATTCAGATACTGGACTTGA
AACCAACCAAACTCCTAATCCTGCAAGAAGAACTTCTTCCGAGCCTGCACTCGTCATACCGAAATCCAATTCCCCCAATCCTTTTGATGATGATGATGATGGTTTTGTTG
GAAGAAGAGGTACTGCAACTTCTAAACCCTCTAAAGACAGGTACAAAAATGATTTTCGCGACTCGGGAGGGCTTGAGAACCAGAGTGTGCAGGAATTGGAGAACTACGCC
GTGTATAAAGCTGAGGAGACCACAAAATCTGTGAATAACTGCCTGAAGATCGCTGAGGACATAAGGGGAGATGCTACCAGGACCCTTGACATGTTGCATCAGCAGGGTGA
GCAAATTGAGAGGACCCACAGGATGGCTGCTGATATGGATAAAGATCTAAGTAAGGGAGAGAAACTTCTGAATAATCTTGGAGGCATGTTTTCTAAGCCATGGAAGCCAA
AGAAGACCAGAGAAATTACAGGCCCTCTTATAACAGCAGACAATTCCTCCGGGAGAGCTGATAACAACAAGGAGGAACGGGAAAAACTGGGTGTATCTACGGGCAAAAAG
CAGTCGGCTTCTCGAACACCACCTTCTGAATCATCAGGCGCAATGCAAAAAGTTGAGGTTGAGAAGGAAAAGCAAGATGATGCACTCTCAGATTTAAGTAATATCTTAGG
TGATCTGAAGAACATGGCTGTGGACATGGGAAGCGAGCTTGACAGGCAAAACAAAGCTCTGGATCATCTAAGTGACGATGTCGACGAGCTGAATTCTAGAGTGAAAGGCG
CGAATCAACGAGCTCGCCGTTTGGTTGGGTAGTAAAATCAGACACTTTTATTCTTTTTCCCACCTCTCACTCCCTTCTGTTTGTTTCTAGCTGGAAGCATTTCGTTTAAA
CATTCTTTAATTGTTGGTGTACTTCTATTCTTTTCTCTTGTGGTTTTAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFSFMKSPAKVSKPNSEDPGLSAGSGTNPFDSDTGLETNQTPNPARRTSSEPALVIPKSNSPNPFDDDDDGFVGRRGTATSKPSKDRYKNDFRDSGGLENQSVQELENYA
VYKAEETTKSVNNCLKIAEDIRGDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTREITGPLITADNSSGRADNNKEEREKLGVSTGKK
QSASRTPPSESSGAMQKVEVEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLVG