; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0019033 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0019033
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionras-related protein RABH1b
Genome locationLG07:71029968..71035238
RNA-Seq ExpressionTan0019033
SyntenyTan0019033
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006890 - retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum (biological process)
GO:0006891 - intra-Golgi vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0042147 - retrograde transport, endosome to Golgi (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7036170.1 Ras-related protein RABH1b, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-10698.56Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_004148503.1 ras-related protein RABH1b [Cucumis sativus]1.2e-10699.52Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_022958673.1 ras-related protein RABH1b [Cucurbita moschata]2.0e-10698.56Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_022996115.1 ras-related protein RABH1b [Cucurbita maxima]7.0e-10799.04Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_038889006.1 ras-related protein RABH1b [Benincasa hispida]2.4e-107100Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI95 Uncharacterized protein5.8e-10799.52Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A1S3CQC2 ras-related protein RABH1b5.8e-10799.52Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A5A7TB19 Ras-related protein RABH1b-like isoform X15.8e-10799.52Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A6J1H3Q8 ras-related protein RABH1b9.9e-10798.56Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A6J1K5U1 ras-related protein RABH1b3.4e-10799.04Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80501 Ras-related protein RABH1b2.4e-10292.31Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQ+FLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        +KWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVSIEE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+ + A+ +Q
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         QSGGC+C
Subjt:  PQSGGCAC

P20340 Ras-related protein Rab-6A1.4e-8175.37Show/hide
Query:  LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEE
        L K+KLVFLG+QSVGKTS+ITRFMYD FDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDS+VAV+VYD+ +  +F  T+KWI++
Subjt:  LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEE

Query:  VRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQPQS-GG
        VRTERGSDVII+LVGNKTDL +KRQVSIEEGE KA+ELNVMFIETSAKAG+N+K LFR++AAALPGME+     +EDM+D+ L+       Q QP S GG
Subjt:  VRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQPQS-GG

Query:  CAC
        C+C
Subjt:  CAC

Q9LFT9 Ras-related protein RABH1e2.0e-9688.94Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVA+RQ+FLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEG+ KAR+  V+FIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLK T S +AQ +
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         Q GGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

Q9SID8 Ras-related protein RABH1d1.5e-9184.62Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDVA+R +FLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEG++K RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGME+ S+TK EDMVDVNLK T S ++Q  
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         Q G C+C
Subjt:  PQSGGCAC

Q9SMR4 Ras-related protein RABH1c1.3e-8478.6Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA  S LAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQ TIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA++VYDV++RQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSTGSGAAQ
        SKWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVSI EGE K +E  VMFIETSAK  FNIKALFRKIAAALPG+++ S +TK +DMVDVNLK+T S ++Q
Subjt:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSTGSGAAQ

Query:  SQPQ-----SGGCAC
         + Q      GGC+C
Subjt:  SQPQ-----SGGCAC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22290.1 RAB GTPase homolog H1D1.0e-9284.62Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDVA+R +FLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEG++K RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGME+ S+TK EDMVDVNLK T S ++Q  
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         Q G C+C
Subjt:  PQSGGCAC

AT2G44610.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.7e-10392.31Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQ+FLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        +KWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVSIEE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+ + A+ +Q
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         QSGGC+C
Subjt:  PQSGGCAC

AT4G39890.1 RAB GTPase homolog H1C9.5e-8678.6Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA  S LAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQ TIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA++VYDV++RQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSTGSGAAQ
        SKWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVSI EGE K +E  VMFIETSAK  FNIKALFRKIAAALPG+++ S +TK +DMVDVNLK+T S ++Q
Subjt:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSTGSGAAQ

Query:  SQPQ-----SGGCAC
         + Q      GGC+C
Subjt:  SQPQ-----SGGCAC

AT5G10260.1 RAB GTPase homolog H1E1.4e-9788.94Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVA+RQ+FLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEG+ KAR+  V+FIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLK T S +AQ +
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         Q GGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

AT5G64990.1 RAB GTPase homolog H1A4.3e-7875.88Show/hide
Query:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEEVRT
        YKLVFLGDQ VGKTSIIT FMY KFD +YQATIGIDFLSKT   EDRT RLQLWDTAGQERF+SL+PSYIRDSSVAVIVYDVAS+Q+F+NTSKWIEEVR 
Subjt:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEEVRT

Query:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQPQSGGCAC
        ERGS VIIVLVGNKTDLV KRQVSIEEGE KARE   +F+ETSAKAGFNIK LF KI +AL G E +S TKQED+VDVNLK     +  +  Q   C+C
Subjt:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQPQSGGCAC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCACCGACGTCAGCTCTGGCGAAGTATAAGCTGGTCTTTCTCGGAGACCAGTCTGTTGGAAAAACCAGCATCATTACACGCTTCATGTACGACAAATTTGATAATAC
ATATCAGGCTACAATTGGTATTGATTTTCTCTCAAAAACTATGTATCTTGAAGATCGCACTGTTCGACTGCAGTTGTGGGACACTGCTGGACAGGAAAGATTTAGAAGTC
TAATACCAAGCTATATCAGGGACTCATCTGTCGCTGTCATTGTTTATGATGTTGCAAGCAGGCAGACTTTCCTAAACACTTCAAAATGGATTGAGGAGGTGCGCACTGAG
AGGGGCAGTGATGTTATTATAGTGCTTGTTGGGAACAAAACGGACCTTGTGGAGAAGAGGCAAGTCTCTATAGAGGAAGGAGAAGCCAAAGCCCGTGAACTAAATGTCAT
GTTTATCGAAACCAGTGCAAAAGCTGGATTCAATATCAAGGCACTATTTCGAAAAATTGCTGCAGCATTGCCGGGAATGGAAACTCTCTCTTCAACAAAGCAAGAAGACA
TGGTTGATGTTAACCTGAAGTCCACAGGCAGCGGTGCTGCACAATCCCAGCCGCAGTCCGGTGGATGCGCCTGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCCAGATCAAAGAAGGAAAGACAAACTGGGCCAAAAACCAGAGTTTCCATTGCAACTGACCTCGGCCTCGTCGTCTCATTCAGAAATCTCCATCTTCATCCGATAATTCT
TCTTCTGTCGGGAAGGCAAATCAGAGATCTCTGCAGAAATGGCACCGACGTCAGCTCTGGCGAAGTATAAGCTGGTCTTTCTCGGAGACCAGTCTGTTGGAAAAACCAGC
ATCATTACACGCTTCATGTACGACAAATTTGATAATACATATCAGGCTACAATTGGTATTGATTTTCTCTCAAAAACTATGTATCTTGAAGATCGCACTGTTCGACTGCA
GTTGTGGGACACTGCTGGACAGGAAAGATTTAGAAGTCTAATACCAAGCTATATCAGGGACTCATCTGTCGCTGTCATTGTTTATGATGTTGCAAGCAGGCAGACTTTCC
TAAACACTTCAAAATGGATTGAGGAGGTGCGCACTGAGAGGGGCAGTGATGTTATTATAGTGCTTGTTGGGAACAAAACGGACCTTGTGGAGAAGAGGCAAGTCTCTATA
GAGGAAGGAGAAGCCAAAGCCCGTGAACTAAATGTCATGTTTATCGAAACCAGTGCAAAAGCTGGATTCAATATCAAGGCACTATTTCGAAAAATTGCTGCAGCATTGCC
GGGAATGGAAACTCTCTCTTCAACAAAGCAAGAAGACATGGTTGATGTTAACCTGAAGTCCACAGGCAGCGGTGCTGCACAATCCCAGCCGCAGTCCGGTGGATGCGCCT
GCTAATGAAGCTCGACATGAGGAATCGCTCGCTCTTTCTTGCCTTTTGCTTTCAACACCTCAGCCTTCTAGAACTGTGAGCATTCAGGTACAAGATGTGGTTATATCTAT
CAATGCCTGCTTTTGAGCAAAACTAAATTCGTAAAATGTAATTGGTGGCAAGAGTAGACAACTGTTATTTTATGGAGTAATTTGATGTATTGGTGGAGTCATTATTTGGG
TTTTGGGATTTGGGAGATGGTGTAAAAAATAGAAAATTATCTGTCGGACTCGATTACAGAATTTTGCTTGTCTTGTAAGTTGTAATTCATCTCTAGAAATTCTGCAAATT
TCATCTGTTTTTACAGTGGATTGTTGGGTTGGTTCATATTATGCTTTTGGTTGGTGGTTTATTTGATTATTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEEVRTE
RGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQPQSGGCAC