; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0019599 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0019599
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionRetrotrans_gag domain-containing protein
Genome locationLG10:32911106..32911426
RNA-Seq ExpressionTan0019599
SyntenyTan0019599
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_019172756.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC109168170 [Ipomoea nil]6.5e-2464.81Show/hide
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        Q+Q SNSGM L++IVK LANNT QFQQETR  +Q LGNQ++QLATSVSKLEAQ  GKLPSQ EVNP+ENV+AI LRSGK++    P  V   KE K +E 
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        S ST   K
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XP_019180076.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC109175288 [Ipomoea nil]1.4e-2363.89Show/hide
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        Q+Q SN GM L++IVK LANNT QFQ+ETR  +Q LGNQ++QLATSVSKLEAQ  GKLPSQ EVNP+ENV+AI LRSGK++    P  V   KEEK +E 
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        S ST   K
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XP_031112037.1 uncharacterized protein LOC116016008 [Ipomoea triloba]6.5e-2466.02Show/hide
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        Q Q SNSGM L++IVK LANNT QF QETR  +Q LGNQI+QLATSVSKLEAQ   KLPSQ EVNP+ENVSAI LRSGK++ P   +P +EEKEE+S   
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         ++
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XP_031127553.1 uncharacterized protein LOC116029647 [Ipomoea triloba]1.4e-2372.04Show/hide
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XP_031131791.1 uncharacterized protein LOC116033171 [Ipomoea triloba]1.1e-2370.1Show/hide
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        Q Q SNSGM L++IVK LANNT QFQQETR   Q LGNQI+QLAT VSKLEAQ   KLPSQ EVNP+ENVSAI LRSGK++ P   +P +EEKEE+S
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1U7YY93 uncharacterized protein LOC1045883492.7e-2061.05Show/hide
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        QNS+SGM LEDIVK+LA  TLQFQ ETR  +Q L NQ+ Q+AT++S+LEAQ+ GKLPSQ+ V P+ENVSAI+LRSGKE+  P+   P    +E+E
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A0A1U8ARH5 uncharacterized protein LOC1046057631.8e-1961.05Show/hide
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        QNS+S M LEDIVK+LA NTLQFQQETR  +Q L NQ+ Q+A  +S+LEAQ+ GKLPSQ  VNP+ENVSAI+LRSGK++  P+   P    +E+E
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A0A1U8QA90 uncharacterized protein LOC1046118134.7e-2058.65Show/hide
Query:  QNSNSGMCLEDIVKTLANNTL-------QFQQETRVDMQNLGNQITQLATSVSKLEAQNYGKLPSQLEVNPRENVSAIMLRSGK--EIPSGVIPPKEEKE
        Q SNSGM LEDIVK+LA NTL       QFQQE R  +Q+L NQ+ Q+AT++S+LEAQ+ GKLPSQ  VNPR+N SAI+LRSGK  EIP+G  P   ++E
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Query:  EESS
        +E +
Subjt:  EESS

A0A6J1DRS5 uncharacterized protein LOC1110232489.1e-2463.81Show/hide
Query:  MQAQNSNSGMCLEDIVKTLANNTLQFQQETRVDMQNLGNQITQLATSVSKLEAQNYGKLPSQLEVNPR----ENVSAIMLRSGKEIPSGVIPPKEEKEEE
        MQ Q SNSGM LE+IVK LAN+TLQFQQETRV MQNLGNQITQLATS+S+LEAQ+ G LPSQ+EVNP+    E +SA+MLR+ ++IP   IP K+ +  E
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Query:  SSSST
            T
Subjt:  SSSST

A0A7J0FIA0 Uncharacterized protein3.6e-2058.49Show/hide
Query:  AQNSNSGMCLEDIVKTLANNTLQFQQETRVDMQNLGNQITQLATSVSKLEAQNYGKLPSQLEVNPRENVSAIMLRSGKEIPSGV----IPPKEEKEEESS
        +Q SNSGM LEDIVK+LA NT+QFQQET+  +Q+L NQ+ Q+AT++S+LEAQ  GKLPSQ  VNPREN SAI+LRSGKEI   V       ++EKE+   
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Query:  SSTKAP
          T  P
Subjt:  SSTKAP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAGCCCAGAATTCCAACTCAGGTATGTGTTTGGAAGATATTGTTAAGACCCTAGCTAACAATACTCTTCAATTTCAACAGGAGACAAGAGTAGACATGCAAAATTT
AGGTAACCAAATTACTCAATTGGCTACGTCAGTCAGTAAGCTGGAAGCCCAAAATTATGGAAAGTTGCCTTCACAACTAGAGGTGAATCCAAGGGAGAACGTCAGTGCAA
TAATGCTCAGAAGCGGGAAAGAAATTCCCTCTGGAGTGATTCCACCTAAGGAGGAAAAAGAAGAAGAATCTTCTTCTTCCACCAAAGCACCAAAAGGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAGCCCAGAATTCCAACTCAGGTATGTGTTTGGAAGATATTGTTAAGACCCTAGCTAACAATACTCTTCAATTTCAACAGGAGACAAGAGTAGACATGCAAAATTT
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TAATGCTCAGAAGCGGGAAAGAAATTCCCTCTGGAGTGATTCCACCTAAGGAGGAAAAAGAAGAAGAATCTTCTTCTTCCACCAAAGCACCAAAAGGGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQAQNSNSGMCLEDIVKTLANNTLQFQQETRVDMQNLGNQITQLATSVSKLEAQNYGKLPSQLEVNPRENVSAIMLRSGKEIPSGVIPPKEEKEEESSSSTKAPKG