; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0019747 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0019747
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptiondehydration-responsive element-binding protein 3-like
Genome locationLG01:104234861..104235710
RNA-Seq ExpressionTan0019747
SyntenyTan0019747
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001471 - AP2/ERF domain
IPR016177 - DNA-binding domain superfamily
IPR036955 - AP2/ERF domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7024616.1 Dehydration-responsive element-binding protein 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.2e-7767.22Show/hide
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XP_022936152.1 dehydration-responsive element-binding protein 3-like [Cucurbita moschata]1.7e-7767.5Show/hide
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        RPVSFAPRDVQAAAAKAAHMDPF YS                                       DD DEL+EIVKLPSL TNY     NNEFVLMDST+
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XP_022976323.1 dehydration-responsive element-binding protein 3-like [Cucurbita maxima]4.3e-7869.3Show/hide
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        AAKAAHMDPF YS                                       DD DEL+EIVKLPSL TNY     NNEFVLMDST+GWVYPPPWLRTM+
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        DC      NNN+I DE+GIGDSNFLW Y
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XP_023535238.1 dehydration-responsive element-binding protein 3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.5e-7868.35Show/hide
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        RPVSFAPRDVQAAAAKAAHMDPF YS                                       DD DEL+EIVKLPSL TNY     NNEFVLMDST+
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        GWVYPPPWLRTM+DC  N+ND  DE+GIGDSNFLW Y
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XP_038899086.1 ethylene-responsive transcription factor TINY-like [Benincasa hispida]2.1e-8073.25Show/hide
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        SA  +     PNKRVR DS+KHP+YRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFP+LAHSLPRPVSFAPRDVQA
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        AAAKAA+MD   FH+SPS                 P+  SLSPS SSAA    DDDD DELTEIVKLP+L +NYDH     EFVLMDS EGWVYPPPWLR
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Query:  TMEDCG-CNNNDITDELGIGDSNFLWGY
        TMEDCG  N+N+I D  GIGDSN LW Y
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CQC6 dehydration-responsive element-binding protein 3-like5.2e-6969.47Show/hide
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        +  S   +KRVR S    +YRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVS APRD+QAAAAKA
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        AH        S+  S+SSSSSS+SL    +  SLSPSS S  ++   DDDD ELTEIVKLP+L  +NYD    ++EFVLMDSTEGWVYPPPWLRT+ED  
Subjt:  AHMDPFHYSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSL-GTNYDHVIANNEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTMED--

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         G + N+I DELGIGD   SN  W Y
Subjt:  CGCNNNDITDELGIGD---SNFLWGY

A0A6J1F7M6 dehydration-responsive element-binding protein 3-like8.0e-7867.5Show/hide
Query:  MSATEDDQSIKP------------NKRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLP
        MSAT+  Q  +P            NKRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLP
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        RPVSFAPRDVQAAAAKAAHMDPF YS                                       DD DEL+EIVKLPSL TNY     NNEFVLMDST+
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Query:  GWVYPPPWLRTMEDCGC---NNNDITDELGIGDSNFLWGY
        GWVYPPPWLRTM+D      NNN+I DE+GIGDSNFLW Y
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A0A6J1FNI3 dehydration-responsive element-binding protein 3-like5.7e-6865.62Show/hide
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        MS TE+   QSI P        +KRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKG NSAILNFPELAHSLPR
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Query:  PVSFAPRDVQAAAAKAAHMDPFHYSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEG
        P SFAPRD+QAAAAKAAHMDP  YS SS+                                   DD D+L EI+KLP+LGTNYDH I NNEFVLMDS+E 
Subjt:  PVSFAPRDVQAAAAKAAHMDPFHYSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEG

Query:  -WVYPPPWLRTMEDCGCNNNDITD
         W YPPPW+RTMED   + N + D
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A0A6J1ILS4 dehydration-responsive element-binding protein 3-like2.1e-7869.3Show/hide
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        +++ + QS   NKRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSA LNFPELAHSLPRPVSFAPRDVQAA
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Query:  AAKAAHMDPFHYSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTME
        AAKAAHMDPF YS                                       DD DEL+EIVKLPSL TNY     NNEFVLMDST+GWVYPPPWLRTM+
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Query:  DCGC----NNNDITDELGIGDSNFLWGY
        DC      NNN+I DE+GIGDSNFLW Y
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A0A6J1J127 dehydration-responsive element-binding protein 3-like3.0e-6967.43Show/hide
Query:  MSATED--DQSIKP--NKRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKG-NSAILNFPELAHSLPRPVSFAP
        MS TE+   QSI P  +KRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKG NSAILNFPELAHSLPRP SFAP
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Query:  RDVQAAAAKAAHMDPFHYSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEG-WVYPP
        RD+QAAAAKAAHMDP  YS S++                                  DDD D+L EI+KLP+LGTNYDH I NNEFVLMDS+E  W YPP
Subjt:  RDVQAAAAKAAHMDPFHYSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEG-WVYPP

Query:  PWLRTMEDCGCNNNDITD
        PW+RTMED   + N + D
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80654 Ethylene-responsive transcription factor ERF0373.9e-4557.35Show/hide
Query:  EDDQSIKPNKRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSFAPRDVQAAAAK
        +D       KRVR     P YRGVRMR WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTF TPEMAARAHD AAL+IKG SA+LNFPELA  LPRP S +PRDVQAAAA 
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Query:  AAHMDPFHYSPSSS----------VSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEGWVYPP
        AA MD   +SPSSS          ++ + +  S+S  +T    SLSPSS  AA+ A      +EL+EIV+LPSL T+YD  +  +EFV +DS     YPP
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Query:  --PW
          PW
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Q39127 Ethylene-responsive transcription factor TINY1.2e-5159.9Show/hide
Query:  SATEDDQSIKPNKRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSFAPRDVQAA
        SA   +   +  K V+DS KHP+YRGVR R WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFP+PEMAARAHDVAALSIKG SAILNFP+LA S PRP S +PRD+Q A
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Query:  AAKAAHMDPFH-YSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVI-ANNEFVLMDSTEGWVYPPPW
        A KAAHM+    +S SSS++ SSS SS+SL         S  SSSA  +       +EL EIV+LPSLG++YD +    NEF+  DS + W YPP W
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Q52QU1 Ethylene-responsive transcription factor ERF0428.9e-4248.66Show/hide
Query:  DQSIKPNKRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSFAPRDVQAAAAKAA
        D      K+   + +  +YRG RMR+WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPT EMAARAHDVAALSIKG+SAILNFPELA  LPRPVS + +D+QAAAA+AA
Subjt:  DQSIKPNKRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSFAPRDVQAAAAKAA

Query:  HMD----PFHYSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEGWVYPPPWL-RTME
         MD    PFH     S    +   +  +       S + SSSS+++++       EL +IV+LPSL  N  +     +  L DS EG V  PPWL  T  
Subjt:  HMD----PFHYSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEGWVYPPPWL-RTME

Query:  DCGCNNNDITDELGIGDSNFLWGY
        D    ++ +  +  + +S FLW Y
Subjt:  DCGCNNNDITDELGIGDSNFLWGY

Q9LYD3 Dehydration-responsive element-binding protein 38.9e-5864.68Show/hide
Query:  DQSIKPNKRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSFAPRDVQAAAAKAA
        +QS K  KR RDS KHP+YRGVRMR WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKG +AILNFPELA S PRPVS +PRD+Q AA KAA
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Query:  HMDP---FHYSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIAN--NEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTME
        HM+P   F  S SSS S SS+SS  SL+   MDLS + S              +EL EIV+LPSLG +YD   AN  NEFV  DS +  +YPPPW ++ E
Subjt:  HMDP---FHYSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIAN--NEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTME

Query:  D
        D
Subjt:  D

Q9M080 Ethylene-responsive transcription factor ERF0439.8e-4956.44Show/hide
Query:  NKRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSFAPRDVQAAAAKAAHMDPFH
        +K  ++++K P+YRGVRMR+WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPT EMA RAHDVAA+SIKG SAILNFPEL+  LPRPVS +PRDV+AAA KAA MD   
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Query:  YSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMD---LSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTMED--CGCNN
         +  S   TS +++SN +  +      +S S SS S+  +  +    D+L EIVKLPSLGT+ +    +NEFV+ DS E  VY P WL   E+     NN
Subjt:  YSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMD---LSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTMED--CGCNN

Query:  ND
        ND
Subjt:  ND

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G77200.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein2.7e-4657.35Show/hide
Query:  EDDQSIKPNKRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSFAPRDVQAAAAK
        +D       KRVR     P YRGVRMR WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTF TPEMAARAHD AAL+IKG SA+LNFPELA  LPRP S +PRDVQAAAA 
Subjt:  EDDQSIKPNKRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSFAPRDVQAAAAK

Query:  AAHMDPFHYSPSSS----------VSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEGWVYPP
        AA MD   +SPSSS          ++ + +  S+S  +T    SLSPSS  AA+ A      +EL+EIV+LPSL T+YD  +  +EFV +DS     YPP
Subjt:  AAHMDPFHYSPSSS----------VSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEGWVYPP

Query:  --PW
          PW
Subjt:  --PW

AT2G25820.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein6.3e-4348.66Show/hide
Query:  DQSIKPNKRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSFAPRDVQAAAAKAA
        D      K+   + +  +YRG RMR+WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPT EMAARAHDVAALSIKG+SAILNFPELA  LPRPVS + +D+QAAAA+AA
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Query:  HMD----PFHYSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEGWVYPPPWL-RTME
         MD    PFH     S    +   +  +       S + SSSS+++++       EL +IV+LPSL  N  +     +  L DS EG V  PPWL  T  
Subjt:  HMD----PFHYSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEGWVYPPPWL-RTME

Query:  DCGCNNNDITDELGIGDSNFLWGY
        D    ++ +  +  + +S FLW Y
Subjt:  DCGCNNNDITDELGIGDSNFLWGY

AT4G32800.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein7.0e-5056.44Show/hide
Query:  NKRVRDSSKHPLYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSFAPRDVQAAAAKAAHMDPFH
        +K  ++++K P+YRGVRMR+WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPT EMA RAHDVAA+SIKG SAILNFPEL+  LPRPVS +PRDV+AAA KAA MD   
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Query:  YSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMD---LSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIANNEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTMED--CGCNN
         +  S   TS +++SN +  +      +S S SS S+  +  +    D+L EIVKLPSLGT+ +    +NEFV+ DS E  VY P WL   E+     NN
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Query:  ND
        ND
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AT5G11590.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein6.3e-5964.68Show/hide
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        +QS K  KR RDS KHP+YRGVRMR WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKG +AILNFPELA S PRPVS +PRD+Q AA KAA
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Query:  HMDP---FHYSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVIAN--NEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTME
        HM+P   F  S SSS S SS+SS  SL+   MDLS + S              +EL EIV+LPSLG +YD   AN  NEFV  DS +  +YPPPW ++ E
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Query:  D
        D
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AT5G25810.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein8.8e-5359.9Show/hide
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        SA   +   +  K V+DS KHP+YRGVR R WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFP+PEMAARAHDVAALSIKG SAILNFP+LA S PRP S +PRD+Q A
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Query:  AAKAAHMDPFH-YSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVI-ANNEFVLMDSTEGWVYPPPW
        A KAAHM+    +S SSS++ SSS SS+SL         S  SSSA  +       +EL EIV+LPSLG++YD +    NEF+  DS + W YPP W
Subjt:  AAKAAHMDPFH-YSPSSSVSTSSSSSSNSLLTTPMDLSLSPSSSSAAAAAHDDDDDDELTEIVKLPSLGTNYDHVI-ANNEFVLMDSTEGWVYPPPW


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTCCGAAATCCGCGAGCCCCGCAAGAAATCCCGCATTTGGCTCGGCACCTTCCCCACGCCCGAGATGGCCGCTCGTGCCCACGACGTCGCCGCCTTGTCCATCAAAGGTA
ATTCCGCCATTCTCAATTTCCCTGAACTCGCCCACTCCCTTCCCCGCCCTGTCTCCTTCGCCCCTCGCGATGTCCAAGCCGCCGCCGCTAAGGCTGCTCACATGGACCCT
TTCCACTACTCTCCCTCCTCCTCTGTTTCCACTTCCTCCTCTTCTTCCTCTAATTCGTTATTGACCACGCCCATGGACTTATCTTTATCCCCCTCCTCCTCCTCCGCCGC
CGCCGCCGCCCACGACGACGACGACGACGACGAGCTCACCGAAATCGTCAAGCTACCCAGCCTCGGCACCAACTACGATCACGTCATCGCCAATAACGAGTTCGTGCTGA
TGGATTCCACCGAGGGTTGGGTTTATCCGCCGCCCTGGTTACGAACCATGGAGGATTGCGGCTGCAATAACAACGACATTACTGACGAGTTGGGAATTGGGGATAGTAAT
TTCTTGTGGGGTTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCAATTCATCCTCCAAAAAAATAGTTCCCAAATTTTGTGTTCTTCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCAATCTCTCAATTTCTCTCCCTATGATCACCATGTTTAATAACTC
CTCCTAATTCTAATTATTCACTCCTCCCTTCCAATTTAATACCCACCAAATTATAAATAAAAATGTCAGCAACCGAAGACGACCAATCCATCAAGCCCAACAAGCGCGTT
CGAGATTCCAGCAAGCACCCACTCTACCGCGGCGTTCGAATGCGCGCTTGGGGCAAATGGGTCTCCGAAATCCGCGAGCCCCGCAAGAAATCCCGCATTTGGCTCGGCAC
CTTCCCCACGCCCGAGATGGCCGCTCGTGCCCACGACGTCGCCGCCTTGTCCATCAAAGGTAATTCCGCCATTCTCAATTTCCCTGAACTCGCCCACTCCCTTCCCCGCC
CTGTCTCCTTCGCCCCTCGCGATGTCCAAGCCGCCGCCGCTAAGGCTGCTCACATGGACCCTTTCCACTACTCTCCCTCCTCCTCTGTTTCCACTTCCTCCTCTTCTTCC
TCTAATTCGTTATTGACCACGCCCATGGACTTATCTTTATCCCCCTCCTCCTCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCCACGACGACGACGACGACGACGAGCTCACCGAAATCGT
CAAGCTACCCAGCCTCGGCACCAACTACGATCACGTCATCGCCAATAACGAGTTCGTGCTGATGGATTCCACCGAGGGTTGGGTTTATCCGCCGCCCTGGTTACGAACCA
TGGAGGATTGCGGCTGCAATAACAACGACATTACTGACGAGTTGGGAATTGGGGATAGTAATTTCTTGTGGGGTTATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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FLWGY