; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0020089 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0020089
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionRibosomal protein S14
Genome locationLG11:7728257..7730427
RNA-Seq ExpressionTan0020089
SyntenyTan0020089
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001209 - Ribosomal protein S14
IPR018271 - Ribosomal protein S14, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032953.1 Ribosomal protein S14, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.5e-4694.06Show/hide
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XP_022134507.1 uncharacterized protein LOC111006733 [Momordica charantia]1.2e-4899.01Show/hide
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XP_022938933.1 uncharacterized protein LOC111444996 [Cucurbita moschata]2.6e-4695.05Show/hide
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XP_023550870.1 uncharacterized protein LOC111808878 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.4e-4694.06Show/hide
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XP_038884392.1 ribosomal protein S14, mitochondrial [Benincasa hispida]2.6e-4694.06Show/hide
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A0A0A0LSR8 Uncharacterized protein2.4e-4285.15Show/hide
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A0A1S4E169 ribosomal protein S14, mitochondrial3.7e-4386.14Show/hide
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A0A5D3CKB3 Ribosomal protein S143.7e-4386.14Show/hide
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A0A6J1C264 uncharacterized protein LOC1110067336.0e-4999.01Show/hide
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A0A6J1FKA4 uncharacterized protein LOC1114449961.2e-4695.05Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P05716 Ribosomal protein S14, mitochondrial7.3e-3672.45Show/hide
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P14875 Ribosomal protein S14, mitochondrial8.6e-3772.45Show/hide
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P26873 Ribosomal protein S14, mitochondrial1.1e-3168.04Show/hide
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        N+ I DH RR L AK+ELKR  YKA+C D +LPN +R E  +KLSKLPRNSS TR+RNRCIFTGRPR+VY+LFR+SRIVFR+LASKG ++G+ KS W
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P46752 Ribosomal protein S14, mitochondrial4.3e-2056.52Show/hide
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P49387 Ribosomal protein S14, mitochondrial5.2e-3469.39Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34520.1 mitochondrial ribosomal protein S149.8e-3669.7Show/hide
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ATCG00330.1 chloroplast ribosomal protein S143.0e-0838.89Show/hide
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        R++L  K+ L +R   K +   PSL    + +   KL   PRNS+ TRL  RC  TGRPRA Y+ F +S  + R++    L+ G  +SSW
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGGGGACAACAGGAACATTCTTGACCATTATCGCCGTCAGCTTGCTGCGAAGTTTGAGTTGAAGCGGAAGCTTTACAAAGCCGTTTGCAATGATCCGAGTCTTCC
TAACGATGTGCGTGAAGAGCAGCGTTATAAGCTGTCGAAGTTGCCTAGAAATAGTTCGTTCACTCGACTGAGGAATCGCTGCATTTTCACCGGCCGACCTAGGGCCGTTT
ACCAGCTTTTCCGTGTTTCTCGTATCGTTTTCCGTGATCTGGCGTCCAAAGGTCTTATAATGGGTGTGAAGAAATCTTCTTGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTCGTCTCCTTCAGCCGATTTCGATTTCTCTCCATCTCTCACTTTCCTGGTCTGCTCGAAGGTAGCCACTGTAGAGGATTTGATAGCTTGAAGGTCAAACGAAATGTCGG
GGGACAACAGGAACATTCTTGACCATTATCGCCGTCAGCTTGCTGCGAAGTTTGAGTTGAAGCGGAAGCTTTACAAAGCCGTTTGCAATGATCCGAGTCTTCCTAACGAT
GTGCGTGAAGAGCAGCGTTATAAGCTGTCGAAGTTGCCTAGAAATAGTTCGTTCACTCGACTGAGGAATCGCTGCATTTTCACCGGCCGACCTAGGGCCGTTTACCAGCT
TTTCCGTGTTTCTCGTATCGTTTTCCGTGATCTGGCGTCCAAAGGTCTTATAATGGGTGTGAAGAAATCTTCTTGGTAGATATTGGTTGATGGTAGAGGCTTTTGTCGTC
GGGGATCAATTATCATTGTTGAATTATATTTCTGCGAGATTCTCTCTTTAATATCAGCGGGAATTAGTTATAGACACTGAAAAGGGTGATATTAACTGTAAGTTCCTTGG
ACACGTGCATTCATGCTCTTTACGTGTATGACTGAAGAAGAGTAAAGGTTTATTTGTTATTCAATAAGCGTTTTCTGGTAGACTGTTACCAATGCTGTTGTTTTACACTA
TCTTTGGTTATCAGCTACTTCCTCTTTTACTGCATTTTCATTTGAGTTTTAGCCAGATGGCCTAGCAAATGGTCAATGTAAACAGTAAAGAGTTTATTATTTTTAAGTTT
CCTTGACAACCAAATGTGGTAGGATGAGACAATTGTCTCATGAGAATAGTTGGGGTGCATGTAACCTGATCTAGACACGCATGGATATTACAAAAACAATAATAATAAAC
ACTGCATCTCCCTGCACTCTTGTCAATTATTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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