; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0020169 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0020169
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionVQ domain-containing protein
Genome locationLG03:72894179..72895049
RNA-Seq ExpressionTan0020169
SyntenyTan0020169
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039610 - VQ motif-containing protein 29


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604115.1 VQ motif-containing protein 29, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.7e-6884.85Show/hide
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XP_022950153.1 uncharacterized protein LOC111453330 [Cucurbita moschata]5.6e-6784.24Show/hide
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XP_038883814.1 uncharacterized protein LOC120074676 [Benincasa hispida]3.5e-6984.21Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KJR2 VQ domain-containing protein2.2e-6479.17Show/hide
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A0A1S3B142 uncharacterized protein LOC1034848691.8e-6378.82Show/hide
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A0A6J1GE45 uncharacterized protein LOC1114533302.7e-6784.24Show/hide
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A0A6J1HHA9 uncharacterized protein LOC1114634799.4e-6078.79Show/hide
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A0A6J1IPH4 uncharacterized protein LOC1114776401.9e-6079.39Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22880.1 VQ motif-containing protein4.7e-1136Show/hide
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        N++LH  RK  AKPWKKP         P+VY+V+PVNF++LVQ+LTG  ++     Q                  VEA       PVK+ DD      + 
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AT4G37710.1 VQ motif-containing protein8.3e-0840.79Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGCATTTTGTGCTTATACTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCGTCCAGCTTTTTGGCTCAAAATAGTGAGCAATCTGAGCACGTGAGGAGAGAATTTTCGAGTTATTC
GAATAATAATCTTCACTGTGTTCGAAAGCCGATGGCGAAGCCGTGGAAGAAGCCGGCGATTGCGCCACTGCCACCGACTCGGCCGAGGGTTTACAAAGTGGACCCAGTTA
ACTTCAGGGATTTGGTTCAGAAACTCACCGGCTTGGCTGAGCTCCGATCTCCACGGCTACAAAAAATGGCCCCGCCGCCTCTTGATATTGCCCGCCGCCCAGCTGGCTCC
GGCGCCGTGGAAGCCACCCCATTTCTTCTGCCTTCGCCGGTGAAGTTGGATGATCAGGCCTTGGACGTTAGCAGCTTTCTTGAGCTGAATTTGTCGCCCTTCAACAAAAA
TTGGTGCTCTTTCCCTGCTTTGAGCCCCGAAAGTCTTGCCATTTTGGATGCAATTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTTAATAAACTGATCTGTTATCTAAAAAAGATAAAAAAACTGATTGGTAATAGTTTCCAAATTGATATGGAGGCATTTTGTGCTTATACTTCTTCTTCTTCTTCTTCC
TCGTCCAGCTTTTTGGCTCAAAATAGTGAGCAATCTGAGCACGTGAGGAGAGAATTTTCGAGTTATTCGAATAATAATCTTCACTGTGTTCGAAAGCCGATGGCGAAGCC
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AAGTTGGATGATCAGGCCTTGGACGTTAGCAGCTTTCTTGAGCTGAATTTGTCGCCCTTCAACAAAAATTGGTGCTCTTTCCCTGCTTTGAGCCCCGAAAGTCTTGCCAT
TTTGGATGCAATTTAGATCTAGATTATAATTTTTAAGCTTGTTTTGTTTATAGCTCAGATTATATGGAAAATTAAAGACCAATAGAACTTGTACTTGGTAATGTAATCAA
GATAATAAACATGTGGAGATCATTCGGTAGATTCTGCAGGATTATATTTAATTCTCTCAAATACTATATCCTCATTAATAAAATGCAATTAAAAAGTATATTGTAATATT
TTTTCTTTTTTTTTTTTTTAAAGTATATTGTAATCTATAGGCTACCACCCTCTTCCCTGCAGAACTTGTACTTGGTAATGTAAGATTATTGTAATTCGAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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