; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0020842 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0020842
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptiontRNA-processing ribonuclease BN
Genome locationLG01:114747852..114749370
RNA-Seq ExpressionTan0020842
SyntenyTan0020842
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6591340.1 hypothetical protein SDJN03_13686, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-15682.12Show/hide
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XP_008466634.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503989 [Cucumis melo]1.1e-16084.46Show/hide
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XP_022138611.1 uncharacterized protein LOC111009450 [Momordica charantia]3.7e-16485.59Show/hide
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XP_022974903.1 uncharacterized protein LOC111473667 [Cucurbita maxima]2.1e-15682.12Show/hide
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XP_038905249.1 uncharacterized protein LOC120091332 [Benincasa hispida]4.2e-16887.85Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CRR4 uncharacterized protein LOC1035039895.3e-16184.46Show/hide
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A0A5D3E8K1 tRNA-processing ribonuclease BN1.2e-14783.69Show/hide
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A0A6J1CA74 uncharacterized protein LOC1110094501.8e-16485.59Show/hide
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A0A6J1FDA5 uncharacterized protein LOC1114429661.4e-15681.84Show/hide
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A0A6J1IHP8 uncharacterized protein LOC1114736671.0e-15682.12Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G48460.1 unknown protein3.1e-9762.41Show/hide
Query:  SNRKPKLESSGEENHVLYVSRLNGVEPFRGKSGSISFHGLTHQLVEEGKLMSAPFSEDKGSLLWVLAPVAFISSLILPQVFLGGLIEAFFKNEILVEVVT
        S+ +P+ + S + N+          E FRGKSGS+SF+GLTHQLVEE KL+SAPF E+KGS LWVLAPV  ISSLILPQ FL G+IEA FKN+ + E+VT
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Query:  SLVLEVLFYVGVATFLLVTDRVQRPYLQFSSKRWSLITGLRGYLTTAFFIAGFKVIAPLFAVYVTWPMIGLPALVAVIPFLVGCIVQLAFENHLDRRGSS
        S   E +FY G+A FL VTDRVQRPYL FSSKRW LITGLRGYLT+AF   G KV+ P+FAVY+TWP +G+ AL+AV+PFLVGC VQ  FE  L+RRGSS
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Query:  SWPLVPIIFEVYRLYQLTKAAHFMERLMFQMRGLPTTPDLLEKSGALFAMMITFQVLGVVCLWSLMTFLLRLFPSRPVAEKY
         WP+VPI+FEVYRLYQ+T+AA F++RLMF M+   TT ++ E+  AL  +++T Q L V+CLWS +TFL+RLFPSRPV E Y
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AT5G63040.1 unknown protein1.9e-3033.74Show/hide
Query:  GKSGSISFHGLTHQLVEEGKLMSAPFSEDKGSLLWVLAPVAFISSLILPQVFLGGLIEAFFKNEILVEVVTSLVLEVLFYVGVATFLLVTDRVQRPYLQF
        GK G ISF+   ++   E  ++        G LLW++ P   +SS ILP V+L  ++ A F++ +L + +     E LFY GVA FLL+ DR ++   + 
Subjt:  GKSGSISFHGLTHQLVEEGKLMSAPFSEDKGSLLWVLAPVAFISSLILPQVFLGGLIEAFFKNEILVEVVTSLVLEVLFYVGVATFLLVTDRVQRPYLQF

Query:  SSKRWSLITGLRGYLTTAFFIAGFKVIAPLFAVYVTWPMIGLPALVAVIPFLVGCIVQLAFENHLDRRGSSSWPLVPIIFEVYRLYQLTKAAHFMERLMF
           R  +     G   ++       ++ P+  +   WP  G  A   + P+LVG +VQ AFE +   R S S P++PIIF+VYRL+QL +AA  +  L F
Subjt:  SSKRWSLITGLRGYLTTAFFIAGFKVIAPLFAVYVTWPMIGLPALVAVIPFLVGCIVQLAFENHLDRRGSSSWPLVPIIFEVYRLYQLTKAAHFMERLMF

Query:  QMRGLPTTPDLLEKSGALFAMMITFQVLGVVCLWSLMTFLLRL
         ++G   T + L    +L  ++   QVLGV+ +WS+ +FL+ L
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AT5G63040.2 unknown protein1.9e-3033.74Show/hide
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        GK G ISF+   ++   E  ++        G LLW++ P   +SS ILP V+L  ++ A F++ +L + +     E LFY GVA FLL+ DR ++   + 
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           R  +     G   ++       ++ P+  +   WP  G  A   + P+LVG +VQ AFE +   R S S P++PIIF+VYRL+QL +AA  +  L F
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         ++G   T + L    +L  ++   QVLGV+ +WS+ +FL+ L
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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