| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0048153.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 1.2e-28 | 65.81 | Show/hide |
Query: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
GDDV+ + LHVP+G IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+GVKM REKL +L+DGT ++KR SKFDLRVIH
Subjt: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
Query: PLTKLLVGINSLTSLVD
PLTKLLVGI S+ D
Subjt: PLTKLLVGINSLTSLVD
|
|
| KAA0063387.1 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 8.9e-29 | 69.44 | Show/hide |
Query: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
GDDV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFT+H+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+GVKMAREKL +L+D TE++KR SKFDLRVIH
Subjt: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
Query: PLTKLLVG
PLTKLLVG
Subjt: PLTKLLVG
|
|
| TYK02449.1 F15O4.13 [Cucumis melo var. makuwa] | 3.1e-21 | 69.88 | Show/hide |
Query: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKK
GDDV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+GVKMAREKL +L+DGT ++K
Subjt: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKK
|
|
| TYK08102.1 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.1e-29 | 67.52 | Show/hide |
Query: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
GDDV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+GVKMAREKL +L+DGT ++KR SKFDLRVIH
Subjt: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
Query: PLTKLLVGINSLTSLVD
PLTKLLVGI S+ D
Subjt: PLTKLLVGINSLTSLVD
|
|
| TYK11649.1 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.0e-21 | 69.05 | Show/hide |
Query: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKR
GDDV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+GVKMAREKL +L+DGT ++K+
Subjt: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TX19 Reverse transcriptase | 5.7e-29 | 65.81 | Show/hide |
Query: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
GDDV+ + LHVP+G IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+GVKM REKL +L+DGT ++KR SKFDLRVIH
Subjt: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
Query: PLTKLLVGINSLTSLVD
PLTKLLVGI S+ D
Subjt: PLTKLLVGINSLTSLVD
|
|
| A0A5A7V8R2 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 4.3e-29 | 69.44 | Show/hide |
Query: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
GDDV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFT+H+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+GVKMAREKL +L+D TE++KR SKFDLRVIH
Subjt: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
Query: PLTKLLVG
PLTKLLVG
Subjt: PLTKLLVG
|
|
| A0A5D3BWE8 F15O4.13 | 1.5e-21 | 69.88 | Show/hide |
Query: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKK
GDDV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+GVKMAREKL +L+DGT ++K
Subjt: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKK
|
|
| A0A5D3C9X5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 5.1e-30 | 67.52 | Show/hide |
Query: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
GDDV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+GVKMAREKL +L+DGT ++KR SKFDLRVIH
Subjt: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
Query: PLTKLLVGINSLTSLVD
PLTKLLVGI S+ D
Subjt: PLTKLLVGINSLTSLVD
|
|
| A0A5D3CN32 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 1.9e-21 | 69.05 | Show/hide |
Query: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKR
GDDV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+GVKMAREKL +L+DGT ++K+
Subjt: GDDVNQTVDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSSLKDGTEDKKR
|
|
