; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0020933 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0020933
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionNEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like
Genome locationLG02:8879355..8883169
RNA-Seq ExpressionTan0020933
SyntenyTan0020933
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0019788 - NEDD8 transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
IPR023313 - Ubiquitin-conjugating enzyme, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022419.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.0e-10197.27Show/hide
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XP_022931623.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita moschata]3.0e-10197.27Show/hide
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XP_023530137.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.6e-10196.72Show/hide
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XP_038888942.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Benincasa hispida]2.7e-10298.36Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BHD5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like4.2e-10197.27Show/hide
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A0A5D3CPZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like4.2e-10197.27Show/hide
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A0A6J1C2V1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like2.0e-10399.45Show/hide
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A0A6J1EZ82 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.4e-10197.27Show/hide
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A0A6J1JMG9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.4e-10197.27Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3KN22 NEDD8-conjugating enzyme Ubc124.7e-6563.39Show/hide
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Q6DCZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.7e-6563.39Show/hide
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Q6P8D9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.7e-6563.39Show/hide
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Q9SDY5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc123.5e-8985.33Show/hide
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Q9ZU75 Probable NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.4e-8582.16Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18600.1 Ubiquitin-conjugating enzyme family protein9.9e-8782.16Show/hide
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AT3G08690.1 ubiquitin-conjugating enzyme 112.4e-2438.52Show/hide
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         +  L T PN +DPL  + A + + +   +ES  R
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AT3G08690.2 ubiquitin-conjugating enzyme 112.4e-2438.52Show/hide
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AT4G36800.1 RUB1 conjugating enzyme 12.5e-9085.33Show/hide
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AT4G36800.2 RUB1 conjugating enzyme 12.5e-9085.33Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAGAGAATGCCAATGGAAAACCTCCTGTTAAGAAACAAACTGCAGGAGAATTGCGTCTTCAAAAAGA
TATCAGTGAATTGAACCTACCGAAAACGTGTAGTATATCCTTTCCTAATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTATCTAG
GTGGTACGTTCCTCTTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTATCCACACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACAAAGGTGTATCATCCTAATATTGACTTGGAAGGAAAT
GTTTGCCTCAATATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCCGTTCTGAATATCAACACTATAATTTACGGATTATTTCATCTTTTCACGCAACCAAATCATGAAGACCCCCTCAA
CCATGATGCCGCTGCTGTTTTGAGGGACAACCCGAAGTTGTTCGAATCGAATGTGAGAAGAGCCATGGCTGGGGGCTACGTGGGGCAGACTTTCTTCACACGTTGCATGT
AG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCGAAAGCGAAGGGATCCGAATTTGGCCCTGCAGAGCGTACGACGATAATTTCACAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTCTGAATCAAACCCAC
CCACCTCCCTCCTTCTTTCTCTCTCACTTTCTACACGCTTTGGCTCCGCTCTGCTTCACCTTTGTCCTTTCAAGAATTGGTTTGTACTCCTTCAAATCCAGTACTGTGCA
GGAACGATGATCAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAGAGAATGCCAATGGAAAACCTCCTGTTAAGAAACAAACTGCAGGAGAATTGCGTCTTCA
AAAAGATATCAGTGAATTGAACCTACCGAAAACGTGTAGTATATCCTTTCCTAATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATT
ATCTAGGTGGTACGTTCCTCTTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTATCCACACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACAAAGGTGTATCATCCTAATATTGACTTGGAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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