; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0021149 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0021149
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionPSI subunit V
Genome locationLG08:15723956..15725381
RNA-Seq ExpressionTan0021149
SyntenyTan0021149
Gene Ontology termsGO:0015979 - photosynthesis (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0009538 - photosystem I reaction center (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003757 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI
IPR022980 - Photosystem I, reaction centre subunit XI
IPR036592 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
NP_001267647.1 photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic [Cucumis sativus]1.3e-11196.77Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LHJ8 PSI subunit V6.3e-11296.77Show/hide
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A0A1S3B555 PSI subunit V1.6e-11297.7Show/hide
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A0A6J1D7U0 PSI subunit V1.6e-11297.24Show/hide
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A0A6J1HKH3 PSI subunit V6.3e-11296.31Show/hide
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A0A6J1KBZ8 PSI subunit V4.1e-11195.39Show/hide
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P23993 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic5.5e-8170.64Show/hide
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Q39654 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic6.4e-11496.31Show/hide
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Q41385 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic5.3e-9277.63Show/hide
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Q9SUI4 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic3.4e-9176.71Show/hide
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Q9TM17 Photosystem I reaction center subunit XI5.6e-3346.62Show/hide
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        E +              D+LQTA+GW + + GF  G + G  +AY LL
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G12800.1 photosystem I subunit l2.4e-9276.71Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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