CuGenDBv2

Gene ID	Tan0021245
Organism	Trichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description	30S ribosomal protein S3, chloroplastic
Genome location	Contig00034:107179..107835
RNA-Seq Expression	Tan0021245
Synteny	Tan0021245
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0005840 - ribosome (cellular component) GO:0009507 - chloroplast (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR001351 - Ribosomal protein S3, C-terminal IPR004044 - K Homology domain, type 2 IPR005704 - Ribosomal protein S3, bacterial-type IPR009019 - K homology domain superfamily, prokaryotic type IPR015946 - K homology domain-like, alpha/beta IPR018280 - Ribosomal protein S3, conserved site IPR036419 - Ribosomal protein S3, C-terminal domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

QJD26682.1 ribosomal protein S3 [Trichosanthes rosthornii]

2.2e-119

99.54

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEI+KRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

YP_009560874.1 ribosomal protein S3 [Trichosanthes kirilowii]

7.6e-120

100

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

YP_009752113.1 ribosomal protein S3 [Dendrosicyos socotranus]

1.7e-119

99.08

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHS+WFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQ+QIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

YP_009752281.1 ribosomal protein S3 [Trichosanthes baviensis]

9.9e-120

99.54

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNY+QKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

YP_009752534.1 ribosomal protein S3 [Trichosanthes tubiflora]

1.7e-119

99.54

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        K+LNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A410HFC8 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

3.7e-120

100

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A0A6H0ESE2 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

3.7e-120

100

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A0A6H0ETZ7 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

3.7e-120

100

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A0A6H0EV08 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

3.7e-120

100

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A0A6M3RWJ0 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

3.7e-120

100

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A0ZZ73 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

8.2e-109

88.53

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQ HHS+WFA PKKYSEGLQED+KIRDCI+NYVQKN R+ SGVEGIARIEIQKR+DLIQVII+MGFPKLLIE   RK+EELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELN +NRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQA TKGIQ+QIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTI AKI+YC Y V
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIF+DE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A6MM75 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

2.4e-108

89.45

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQGHHS+WFA PK YSEGLQEDQKIRDCI+NYVQKNMRI SG EGIARIEIQKRIDLIQVII+MGFPKLLIEG  R +EELQ+NVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KE NSVNRKLNIAITRI  PYG PNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQA TKGIQ+QIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKI YC Y V
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

Q0ZIY0 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

1.6e-109

89.91

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQGHHS+WFA PK YS+GLQEDQKIRDCI+NYVQKN+RI SGVEGIARIEIQKRIDLIQVII+MGFPKLL+EG  R+IEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELN VNRKLNIAITRI  PYGHPNILAEFIAGQL+NRVSFRKA+KKAIELTEQA TKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYC Y V
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

Q2L946 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

8.2e-109

88.53

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQ HHS+WFA PKKYSEGLQED+KIRDCI+NYVQKN R+ SGVEGIARIEIQKR+DLIQVII+MGFPKLLIE   RK+EELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELN +NRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQA TKGIQ+QIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTI AKI+YC Y V
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIF+DE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

Q4VZN0 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

1.1e-118

95.87

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHS+WFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCI+NYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKL+I+ GSRKIEELQ+NVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KE NS NRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYG+LGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG00800.1 structural constituent of ribosome

2.2e-109

88.53

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQ HHS+WFA PKKYSEGL+ED+KIRDCI+NYVQKN+RI SG+EGIARIEIQKRIDLIQ+II+MGFPKLLIE   R++EELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELN VNRKLNIAITRI NPYG PNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQA TKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTI AKIDYC Y V
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

ATMG00090.1 structural constituent of ribosome;protein binding

2.4e-07

32.14

Show/hide

Query:  NSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKN-RVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRI-DGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPVR
        N  N K  I   +I + Y   + +A+ I+ QLKN R SF     K ++   + G +GI++  +GR+ D  E A+ +  +  +        KIDY    V 
Subjt:  NSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKN-RVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRI-DGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPVR

Query:  TIYGVLGIKIWI
        T YG+ G+K+WI
Subjt:  TIYGVLGIKIWI

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGACAAAAAATAAATCCACTCGGTTTTAGACTTGGTGCAACCCAAGGGCATCATTCTATTTGGTTTGCACACCCCAAAAAATATTCCGAAGGTTTACAAGAAGATCA
AAAAATACGAGATTGTATCCGGAATTATGTACAAAAAAATATGAGAATATTCTCTGGTGTTGAGGGAATTGCACGTATCGAGATTCAAAAAAGAATTGATCTTATTCAAG
TGATAATCTTTATGGGATTCCCAAAGTTATTAATAGAAGGTGGGTCTCGAAAAATCGAAGAATTACAGATGAATGTACAAAAAGAATTAAATTCTGTGAACCGAAAACTC
AACATTGCTATTACAAGAATAGGAAACCCTTATGGACACCCTAATATTCTCGCAGAATTTATAGCCGGACAATTAAAGAATAGAGTTTCATTTCGAAAAGCAATGAAAAA
AGCTATTGAATTAACTGAACAGGCGGGTACAAAGGGAATTCAAGTACAAATTGCCGGACGTATAGACGGAAAAGAAATTGCACGTGTCGAATGGATCAGAGAAGGAAGGG
TTCCTCTACAAACCATTCGAGCTAAAATTGATTATTGTTGCTATCCAGTTCGAACTATCTATGGGGTATTAGGCATAAAAATTTGGATATTTGTAGACGAGCAATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQKELNSVNRKL
NIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPVRTIYGVLGIKIWIFVDEQ

Tan0021245 (gene) of Snake gourd v1 genome