; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0021405 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0021405
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionMitochondrial substrate carrier family protein
Genome locationLG04:5699015..5703409
RNA-Seq ExpressionTan0021405
SyntenyTan0021405
Gene Ontology termsGO:0001682 - tRNA 5'-leader removal (biological process)
GO:0090502 - RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic (biological process)
GO:1901962 - S-adenosyl-L-methionine transmembrane transport (biological process)
GO:0005743 - mitochondrial inner membrane (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0000095 - S-adenosyl-L-methionine transmembrane transporter activity (molecular function)
GO:0004526 - ribonuclease P activity (molecular function)
InterPro domainsIPR018108 - Mitochondrial substrate/solute carrier
IPR023395 - Mitochondrial carrier domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601202.1 Mitochondrial substrate carrier family protein S, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.9e-19791.41Show/hide
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XP_022138930.1 uncharacterized protein LOC111009990 isoform X1 [Momordica charantia]2.1e-19791.15Show/hide
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XP_022957565.1 mitochondrial arginine transporter BAC2 isoform X1 [Cucurbita moschata]1.6e-19791.67Show/hide
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XP_022993312.1 uncharacterized protein LOC111489353 isoform X1 [Cucurbita maxima]6.7e-19691.41Show/hide
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XP_023522692.1 mitochondrial arginine transporter BAC2 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.0e-19691.41Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SXT4 Mitochondrial arginine transporter BAC2-like6.8e-18687.14Show/hide
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A0A6J1CAV8 uncharacterized protein LOC111009990 isoform X11.0e-19791.15Show/hide
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A0A6J1CCL2 uncharacterized protein LOC111009990 isoform X22.3e-19490.36Show/hide
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A0A6J1H0X1 mitochondrial arginine transporter BAC2 isoform X17.7e-19891.67Show/hide
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A0A6J1JSG1 uncharacterized protein LOC111489353 isoform X13.2e-19691.41Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q7XA87 Folate transporter 1, chloroplastic2.3e-0532.37Show/hide
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        A A AG  T++ +  + LD ++T  QV +D  GS  P    TA A+  I    G  GLY+GF     G     G  F  Y      Y  GR+D+ +  + 
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         L +   AGA+  L ++P  LVK R Q+ + +    P S
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Q9GMZ1 Mitochondrial brown fat uncoupling protein 13.3e-0428.79Show/hide
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        AAAG+  L+ ++T+PLDT K  +Q+  +  G G+P    +    L  + + +   GL   +  L  G    +G    R GLY+ V  +   G +     +
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Query:  SEALLTGLMAGAVESLISSPFELVKLRAQVTS
           +  G+M G     I  P E+VK+R Q  S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37890.1 Mitochondrial substrate carrier family protein4.4e-0428.46Show/hide
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        H V+   +   +   TYPLD ++T +    + +       T + + R +   G  GLY G G    G    +   F  YE +  F+   R +D   +  +
Subjt:  HAVAAAGSVTLSTVLTYPLDTIKTLIQVGSDPLGSGKPLTTAQALQRIQSFSGNSGLYSGFGWLAFGRLFGIGARFGLYEIVTAFYKDGREDDYVHVSEA

Query:  LLTGLMAGAVESLISSPFELVKLRAQVTSA
        L++G +AGAV S  + P +LV+ R QV  A
Subjt:  LLTGLMAGAVESLISSPFELVKLRAQVTSA

AT4G15010.1 Mitochondrial substrate carrier family protein1.4e-13059.89Show/hide
Query:  MDEFFKNQIFATHAVAAAGSVTLSTVLTYPLDTIKTLIQVGSDPLGSGKPLTTAQALQRIQSFSGNSGLYSGFGWLAFGRLFGIGARFGLYEIVTAFYKD
        MD+  +N  FATHA+AA+ SV+L T L YPLDTIKT+IQVGS P    K L++ Q   R+  FSG SGLYSG G L  GR+ G GARFG+YEI+TAFYKD
Subjt:  MDEFFKNQIFATHAVAAAGSVTLSTVLTYPLDTIKTLIQVGSDPLGSGKPLTTAQALQRIQSFSGNSGLYSGFGWLAFGRLFGIGARFGLYEIVTAFYKD

Query:  GREDDYVHVSEALLTGLMAGAVESLISSPFELVKLRAQVTSAVRIPSPVSVVGQGALAPSTSRFLLGYTLDQKALNHSVGLLSTLTTKHQNIKGALQEYP
        GR D+YV V EA L GL+ GA E++++SPFEL+K+R QVT+A R P+  +V     ++P  ++ L  YTLD K+L  +V LLS L  KH N+  ALQEYP
Subjt:  GREDDYVHVSEALLTGLMAGAVESLISSPFELVKLRAQVTSAVRIPSPVSVVGQGALAPSTSRFLLGYTLDQKALNHSVGLLSTLTTKHQNIKGALQEYP

Query:  WMMTGSGRPPAVSNVYRPSDIMSLEGWGAFWRGLRSGIVRDSIFSGVFFSTWQFMHRSMLIWKSIEMDPPPRSDDEVGPLSPFSVSLAAGFSGAVAAAAS
        WMMTG+G PP+  +V RP D+ SLEG+ A WR LRSG++RD I+ GVFFSTWQF+H +M+ WK++ M+P P S++EVGPLSP ++SLAAG SGAVAAAAS
Subjt:  WMMTGSGRPPAVSNVYRPSDIMSLEGWGAFWRGLRSGIVRDSIFSGVFFSTWQFMHRSMLIWKSIEMDPPPRSDDEVGPLSPFSVSLAAGFSGAVAAAAS

Query:  HGFDTARSRSQCTVLPKYVAMERKFLKWRRPGNRFERTTGIHPADRSLLFRGIGLRMARCGLGSFFMVGGYYLIIDHLL
        H FDTAR+R+QC +LPKY A ERKFLKW +PG R ER TGIHP DR+LLFRGIG+RMAR  + S  +VG YYL +D L+
Subjt:  HGFDTARSRSQCTVLPKYVAMERKFLKWRRPGNRFERTTGIHPADRSLLFRGIGLRMARCGLGSFFMVGGYYLIIDHLL

AT4G15010.2 Mitochondrial substrate carrier family protein1.4e-13059.89Show/hide
Query:  MDEFFKNQIFATHAVAAAGSVTLSTVLTYPLDTIKTLIQVGSDPLGSGKPLTTAQALQRIQSFSGNSGLYSGFGWLAFGRLFGIGARFGLYEIVTAFYKD
        MD+  +N  FATHA+AA+ SV+L T L YPLDTIKT+IQVGS P    K L++ Q   R+  FSG SGLYSG G L  GR+ G GARFG+YEI+TAFYKD
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Query:  GREDDYVHVSEALLTGLMAGAVESLISSPFELVKLRAQVTSAVRIPSPVSVVGQGALAPSTSRFLLGYTLDQKALNHSVGLLSTLTTKHQNIKGALQEYP
        GR D+YV V EA L GL+ GA E++++SPFEL+K+R QVT+A R P+  +V     ++P  ++ L  YTLD K+L  +V LLS L  KH N+  ALQEYP
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Query:  WMMTGSGRPPAVSNVYRPSDIMSLEGWGAFWRGLRSGIVRDSIFSGVFFSTWQFMHRSMLIWKSIEMDPPPRSDDEVGPLSPFSVSLAAGFSGAVAAAAS
        WMMTG+G PP+  +V RP D+ SLEG+ A WR LRSG++RD I+ GVFFSTWQF+H +M+ WK++ M+P P S++EVGPLSP ++SLAAG SGAVAAAAS
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Query:  HGFDTARSRSQCTVLPKYVAMERKFLKWRRPGNRFERTTGIHPADRSLLFRGIGLRMARCGLGSFFMVGGYYLIIDHLL
        H FDTAR+R+QC +LPKY A ERKFLKW +PG R ER TGIHP DR+LLFRGIG+RMAR  + S  +VG YYL +D L+
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AT4G15010.3 Mitochondrial substrate carrier family protein1.4e-13059.89Show/hide
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        MD+  +N  FATHA+AA+ SV+L T L YPLDTIKT+IQVGS P    K L++ Q   R+  FSG SGLYSG G L  GR+ G GARFG+YEI+TAFYKD
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        GR D+YV V EA L GL+ GA E++++SPFEL+K+R QVT+A R P+  +V     ++P  ++ L  YTLD K+L  +V LLS L  KH N+  ALQEYP
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Query:  WMMTGSGRPPAVSNVYRPSDIMSLEGWGAFWRGLRSGIVRDSIFSGVFFSTWQFMHRSMLIWKSIEMDPPPRSDDEVGPLSPFSVSLAAGFSGAVAAAAS
        WMMTG+G PP+  +V RP D+ SLEG+ A WR LRSG++RD I+ GVFFSTWQF+H +M+ WK++ M+P P S++EVGPLSP ++SLAAG SGAVAAAAS
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Query:  HGFDTARSRSQCTVLPKYVAMERKFLKWRRPGNRFERTTGIHPADRSLLFRGIGLRMARCGLGSFFMVGGYYLIIDHLL
        H FDTAR+R+QC +LPKY A ERKFLKW +PG R ER TGIHP DR+LLFRGIG+RMAR  + S  +VG YYL +D L+
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AT5G66380.1 folate transporter 11.6e-0632.37Show/hide
Query:  AVAAAGSVTLSTVLTYPLDTIKTLIQVGSDPLGSGKPL--TTAQALQRIQSFSGNSGLYSGFGWLAFGRLFGIGARFGLYEIVTAFYKDGREDDYVHVSE
        A A AG  T++ +  + LD ++T  QV +D  GS  P    TA A+  I    G  GLY+GF     G     G  F  Y      Y  GR+D+ +  + 
Subjt:  AVAAAGSVTLSTVLTYPLDTIKTLIQVGSDPLGSGKPL--TTAQALQRIQSFSGNSGLYSGFGWLAFGRLFGIGARFGLYEIVTAFYKDGREDDYVHVSE

Query:  ALLTGLMAGAVESLISSPFELVKLRAQVTSAVRIPSPVS
         L +   AGA+  L ++P  LVK R Q+ + +    P S
Subjt:  ALLTGLMAGAVESLISSPFELVKLRAQVTSAVRIPSPVS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTAAAATGGATGAATTTTTTAAGAACCAAATCTTCGCCACCCATGCAGTTGCTGCTGCAGGCTCAGTGACGCTAAGCACAGTTCTTACTTACCCTCTTGACACTAT
CAAAACTCTTATCCAGGTTGGTTCTGATCCTTTAGGATCTGGTAAACCGTTGACTACTGCTCAGGCTTTACAGAGAATTCAATCTTTCTCAGGAAATTCAGGTCTGTATA
GTGGATTTGGATGGTTGGCATTTGGGAGGCTATTTGGTATAGGAGCTCGATTTGGGTTATACGAAATTGTGACAGCATTTTATAAAGATGGTCGTGAAGATGATTACGTG
CACGTATCCGAGGCTCTTCTGACTGGACTTATGGCTGGTGCTGTGGAATCATTGATAAGCTCTCCATTTGAGCTTGTTAAACTTCGTGCTCAGGTGACCTCTGCTGTTCG
TATACCTAGCCCAGTCTCTGTTGTTGGACAAGGAGCTCTTGCACCTTCTACGTCAAGATTTCTGCTTGGCTATACACTAGATCAAAAAGCCTTAAACCATTCAGTTGGTC
TTTTATCCACCCTAACAACTAAGCACCAAAATATAAAAGGTGCCTTACAAGAGTATCCATGGATGATGACGGGGTCCGGGAGGCCACCTGCAGTCAGCAATGTCTATAGG
CCATCAGATATCATGTCACTAGAAGGATGGGGTGCATTTTGGAGAGGTCTACGATCCGGGATTGTAAGGGATTCCATCTTCAGCGGCGTATTCTTCTCAACTTGGCAATT
TATGCACCGATCTATGCTTATTTGGAAGAGCATCGAGATGGATCCACCACCCAGGTCAGATGACGAAGTAGGACCGCTGTCCCCGTTTTCAGTTAGTCTTGCAGCTGGAT
TTTCAGGTGCAGTTGCTGCTGCTGCTTCTCATGGTTTTGATACTGCTAGGAGTCGATCACAATGCACCGTGCTGCCAAAGTATGTTGCCATGGAGAGGAAGTTTCTCAAA
TGGCGAAGACCGGGTAATAGATTTGAGAGAACTACAGGGATTCATCCCGCAGATCGGAGTCTTCTGTTTCGTGGCATAGGATTGCGAATGGCTCGCTGTGGTTTAGGGTC
ATTTTTTATGGTTGGAGGTTACTATTTGATTATTGATCATTTGTTGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCGGCGTCTCTCTTTCTTCTTTCAGTTTCCCACTTCGCCGGAGACCTTCTTCCACAGACAGAGCCACTTTCACTGCACTGGAAATTTCAGCAATCTGTCCATTAAAATCC
CTGCAAAAGAATGCTTAAAATGGATGAATTTTTTAAGAACCAAATCTTCGCCACCCATGCAGTTGCTGCTGCAGGCTCAGTGACGCTAAGCACAGTTCTTACTTACCCTC
TTGACACTATCAAAACTCTTATCCAGGTTGGTTCTGATCCTTTAGGATCTGGTAAACCGTTGACTACTGCTCAGGCTTTACAGAGAATTCAATCTTTCTCAGGAAATTCA
GGTCTGTATAGTGGATTTGGATGGTTGGCATTTGGGAGGCTATTTGGTATAGGAGCTCGATTTGGGTTATACGAAATTGTGACAGCATTTTATAAAGATGGTCGTGAAGA
TGATTACGTGCACGTATCCGAGGCTCTTCTGACTGGACTTATGGCTGGTGCTGTGGAATCATTGATAAGCTCTCCATTTGAGCTTGTTAAACTTCGTGCTCAGGTGACCT
CTGCTGTTCGTATACCTAGCCCAGTCTCTGTTGTTGGACAAGGAGCTCTTGCACCTTCTACGTCAAGATTTCTGCTTGGCTATACACTAGATCAAAAAGCCTTAAACCAT
TCAGTTGGTCTTTTATCCACCCTAACAACTAAGCACCAAAATATAAAAGGTGCCTTACAAGAGTATCCATGGATGATGACGGGGTCCGGGAGGCCACCTGCAGTCAGCAA
TGTCTATAGGCCATCAGATATCATGTCACTAGAAGGATGGGGTGCATTTTGGAGAGGTCTACGATCCGGGATTGTAAGGGATTCCATCTTCAGCGGCGTATTCTTCTCAA
CTTGGCAATTTATGCACCGATCTATGCTTATTTGGAAGAGCATCGAGATGGATCCACCACCCAGGTCAGATGACGAAGTAGGACCGCTGTCCCCGTTTTCAGTTAGTCTT
GCAGCTGGATTTTCAGGTGCAGTTGCTGCTGCTGCTTCTCATGGTTTTGATACTGCTAGGAGTCGATCACAATGCACCGTGCTGCCAAAGTATGTTGCCATGGAGAGGAA
GTTTCTCAAATGGCGAAGACCGGGTAATAGATTTGAGAGAACTACAGGGATTCATCCCGCAGATCGGAGTCTTCTGTTTCGTGGCATAGGATTGCGAATGGCTCGCTGTG
GTTTAGGGTCATTTTTTATGGTTGGAGGTTACTATTTGATTATTGATCATTTGTTGAAATGATGAATTATTTACATGGAGTACTTATAATGAGTAACAAGGAGAGTATAG
GAAGGCCATGGAGAATCAATTCTTGTTCTATATACATATAGATTTTGTTTGGCTAATTTGTTATTTTTCTCGTTCCTGAAGTTTGTGTAACATAATTGTATTTTAGTTCT
CGGTCATCGACAAATTTGGTATTTTTTGAATCCTATTTTGATTTTCCCTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLKMDEFFKNQIFATHAVAAAGSVTLSTVLTYPLDTIKTLIQVGSDPLGSGKPLTTAQALQRIQSFSGNSGLYSGFGWLAFGRLFGIGARFGLYEIVTAFYKDGREDDYV
HVSEALLTGLMAGAVESLISSPFELVKLRAQVTSAVRIPSPVSVVGQGALAPSTSRFLLGYTLDQKALNHSVGLLSTLTTKHQNIKGALQEYPWMMTGSGRPPAVSNVYR
PSDIMSLEGWGAFWRGLRSGIVRDSIFSGVFFSTWQFMHRSMLIWKSIEMDPPPRSDDEVGPLSPFSVSLAAGFSGAVAAAASHGFDTARSRSQCTVLPKYVAMERKFLK
WRRPGNRFERTTGIHPADRSLLFRGIGLRMARCGLGSFFMVGGYYLIIDHLLK