; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0021501 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0021501
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionProtein rolling stone-like
Genome locationLG04:81871842..81876463
RNA-Seq ExpressionTan0021501
SyntenyTan0021501
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581320.1 WD repeat-containing protein 6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-16191.29Show/hide
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XP_022934502.1 uncharacterized protein LOC111441659 [Cucurbita moschata]6.1e-16390.76Show/hide
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XP_022983515.1 uncharacterized protein LOC111482095 [Cucurbita maxima]6.1e-16390.13Show/hide
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XP_023528675.1 uncharacterized protein LOC111791525 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-16290.45Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LC98 Uncharacterized protein1.5e-15989.17Show/hide
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A0A1S3BHG4 uncharacterized protein LOC1034898961.4e-16089.81Show/hide
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A0A5A7T9J9 Protein rolling stone-like1.4e-16089.81Show/hide
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A0A6J1F2Y1 uncharacterized protein LOC1114416593.0e-16390.76Show/hide
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A0A6J1J627 uncharacterized protein LOC1114820953.0e-16390.13Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10660.1 unknown protein4.5e-5537.62Show/hide
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        YW+ W+V +C LI+  P V A   I             ++ +   +   + W T +K + PLWLL +R F+FV  + LL   V   G  +F+FYTQWT  
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        LV +YF   +++S YG    +++     E    + + +       +  +  GN    T K  N+ ++    + AG+   + Q+ +   AGA  LTD+VFW
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         ++ PF  G  + +S L   +H+LNAVFLLGDT+LNSL FPL   AYFV +  ++V +QW +HA    WWPY F +LS+P+APLWY+G+AV+HIPC+ ++
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        AL++K K  LL
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AT1G10660.2 unknown protein4.5e-5537.62Show/hide
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        YW+ W+V +C LI+  P V A   I             ++ +   +   + W T +K + PLWLL +R F+FV  + LL   V   G  +F+FYTQWT  
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         ++ PF  G  + +S L   +H+LNAVFLLGDT+LNSL FPL   AYFV +  ++V +QW +HA    WWPY F +LS+P+APLWY+G+AV+HIPC+ ++
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        AL++K K  LL
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AT1G10660.3 unknown protein4.5e-5537.62Show/hide
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        AL++K K  LL
Subjt:  ALIVKTKYSLL

AT1G10660.4 unknown protein4.5e-5537.62Show/hide
Query:  YWVRWQVPVCGLIIGIPCVFAVKFI-------------RKSMVEPVLLSDLWATHWKNLSPLWLLLYRAFAFVCCVQLLYEIVALHGPFVFFFYTQWTMA
        YW+ W+V +C LI+  P V A   I             ++ +   +   + W T +K + PLWLL +R F+FV  + LL   V   G  +F+FYTQWT  
Subjt:  YWVRWQVPVCGLIIGIPCVFAVKFI-------------RKSMVEPVLLSDLWATHWKNLSPLWLLLYRAFAFVCCVQLLYEIVALHGPFVFFFYTQWTMA

Query:  LVAIYFALGTIVSAYGYWYPSRKTQSKNEEAVKLMEKD-------LKKNNGGNVNEDTIKGQNKYAQQDFLEKAGYLGTLMQMAYLAAAGASALTDVVFW
        LV +YF   +++S YG    +++     E    + + +       +  +  GN    T K  N+ ++    + AG+   + Q+ +   AGA  LTD+VFW
Subjt:  LVAIYFALGTIVSAYGYWYPSRKTQSKNEEAVKLMEKD-------LKKNNGGNVNEDTIKGQNKYAQQDFLEKAGYLGTLMQMAYLAAAGASALTDVVFW

Query:  GLLVPFLLGENFHVSLLIGSIHALNAVFLLGDTALNSLSFPLGGFAYFVAFGGLYVVFQWTVHACCVNWWPYPFFELSTPWAPLWYIGLAVIHIPCYGLY
         ++ PF  G  + +S L   +H+LNAVFLLGDT+LNSL FPL   AYFV +  ++V +QW +HA    WWPY F +LS+P+APLWY+G+AV+HIPC+ ++
Subjt:  GLLVPFLLGENFHVSLLIGSIHALNAVFLLGDTALNSLSFPLGGFAYFVAFGGLYVVFQWTVHACCVNWWPYPFFELSTPWAPLWYIGLAVIHIPCYGLY

Query:  ALIVKTKYSLL
        AL++K K  LL
Subjt:  ALIVKTKYSLL

AT5G62960.1 unknown protein5.3e-5636.48Show/hide
Query:  YWVRWQVPVCGLIIGIPCVFAVKFI-------------------RKSMVEPVLLSDLWATHWKNLSPLWLLLYRAFAFVCCVQLLYEIVALHGPFVFFFY
        YW  W+V +C + + I  V     I                    K     V   + W    +N+ P WLL +R  AF   + +L  I  + GP +FF+Y
Subjt:  YWVRWQVPVCGLIIGIPCVFAVKFI-------------------RKSMVEPVLLSDLWATHWKNLSPLWLLLYRAFAFVCCVQLLYEIVALHGPFVFFFY

Query:  TQWTMALVAIYFALGTIVSAYGYWYPSRKTQSKNEEAVKLMEKDLKKNNGGNVNEDTIKGQNKYAQQDFLEKAGYLGTLMQMAYLAAAGASALTDVVFWG
        TQWT  L+ +YF LG+++S +G +  +++      ++++ ++ +  ++ G    ++TI+ Q++Y+       AG+ G + Q+ +   AGA  LTD VFW 
Subjt:  TQWTMALVAIYFALGTIVSAYGYWYPSRKTQSKNEEAVKLMEKDLKKNNGGNVNEDTIKGQNKYAQQDFLEKAGYLGTLMQMAYLAAAGASALTDVVFWG

Query:  LLVPFLLGENFHVSLLIGSIHALNAVFLLGDTALNSLSFPLGGFAYFVAFGGLYVVFQWTVHACCVNWWPYPFFELSTPWAPLWYIGLAVIHIPCYGLYA
        ++VPFL   ++ +++L+ ++H+LNA+FLLGD ALNSLSFP    AYF  +   YV+FQW +H+    WWPYPF +LS+ +APLWY  +AV+H+PCYG +A
Subjt:  LLVPFLLGENFHVSLLIGSIHALNAVFLLGDTALNSLSFPLGGFAYFVAFGGLYVVFQWTVHACCVNWWPYPFFELSTPWAPLWYIGLAVIHIPCYGLYA

Query:  LIVKTKYSLLPRLFPHAF
        L+VK K+ LL R FP ++
Subjt:  LIVKTKYSLLPRLFPHAF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTGAATCGCCTGTAGAAGAAGGATGGCGATATTGGGTCCGATGGCAAGTGCCTGTTTGTGGTCTGATAATCGGTATTCCATGTGTTTTTGCTGTGAAATTCATCAG
AAAGTCAATGGTTGAACCTGTGCTTCTCAGTGATTTGTGGGCTACTCATTGGAAGAACCTCAGTCCTTTATGGCTTTTACTTTACAGGGCTTTTGCTTTTGTTTGCTGTG
TTCAGTTGCTATATGAGATTGTGGCCTTACATGGACCTTTTGTCTTCTTTTTCTACACTCAGTGGACAATGGCATTAGTAGCAATCTATTTTGCGTTGGGAACCATTGTA
TCTGCATATGGATATTGGTATCCTTCAAGGAAAACCCAGTCCAAAAATGAGGAGGCAGTTAAACTCATGGAGAAAGATTTGAAGAAGAATAATGGAGGCAATGTTAATGA
GGATACCATCAAGGGGCAAAACAAATATGCTCAACAGGACTTTCTGGAGAAAGCAGGATATTTAGGAACTCTGATGCAAATGGCATATCTGGCAGCAGCCGGAGCTTCTG
CATTAACCGACGTGGTGTTCTGGGGCCTTCTCGTGCCATTTCTACTTGGTGAAAATTTCCATGTCAGCCTGTTGATAGGTAGCATACATGCTCTGAATGCTGTTTTTCTT
CTTGGGGACACTGCTCTCAATAGCCTTTCGTTTCCTTTGGGCGGTTTCGCATACTTTGTTGCCTTTGGCGGTCTCTACGTCGTTTTCCAATGGACTGTACATGCTTGCTG
TGTAAATTGGTGGCCATATCCTTTCTTTGAGCTAAGTACACCTTGGGCTCCTCTCTGGTACATTGGCTTAGCAGTGATTCACATCCCATGTTATGGACTGTATGCACTAA
TTGTGAAGACAAAATATTCACTTCTGCCAAGATTGTTTCCTCATGCTTTTGTTAAATCATTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCGTTACTGCTGATTGGTAATGGGACTTCCTACATTTATAGCATAGCAGTCTCAGCAGTTTCCAAATTTGTGTGAGCACTTGCCATTAATCATATCATCAACGATCTTC
CTCATTTGCTCATCAAAAACCCCATTTCCTTCTTCAAATTTCCCACTCATTTGATCTCAAACGCTACCTTCTTCATCCATTTCCCCACCCCTTCTGAAAATCCCCACCTC
AAGGGGTCGGACGATTCATCTTTGATTTGTCTTAAAAATGTTTGAATCGCCTGTAGAAGAAGGATGGCGATATTGGGTCCGATGGCAAGTGCCTGTTTGTGGTCTGATAA
TCGGTATTCCATGTGTTTTTGCTGTGAAATTCATCAGAAAGTCAATGGTTGAACCTGTGCTTCTCAGTGATTTGTGGGCTACTCATTGGAAGAACCTCAGTCCTTTATGG
CTTTTACTTTACAGGGCTTTTGCTTTTGTTTGCTGTGTTCAGTTGCTATATGAGATTGTGGCCTTACATGGACCTTTTGTCTTCTTTTTCTACACTCAGTGGACAATGGC
ATTAGTAGCAATCTATTTTGCGTTGGGAACCATTGTATCTGCATATGGATATTGGTATCCTTCAAGGAAAACCCAGTCCAAAAATGAGGAGGCAGTTAAACTCATGGAGA
AAGATTTGAAGAAGAATAATGGAGGCAATGTTAATGAGGATACCATCAAGGGGCAAAACAAATATGCTCAACAGGACTTTCTGGAGAAAGCAGGATATTTAGGAACTCTG
ATGCAAATGGCATATCTGGCAGCAGCCGGAGCTTCTGCATTAACCGACGTGGTGTTCTGGGGCCTTCTCGTGCCATTTCTACTTGGTGAAAATTTCCATGTCAGCCTGTT
GATAGGTAGCATACATGCTCTGAATGCTGTTTTTCTTCTTGGGGACACTGCTCTCAATAGCCTTTCGTTTCCTTTGGGCGGTTTCGCATACTTTGTTGCCTTTGGCGGTC
TCTACGTCGTTTTCCAATGGACTGTACATGCTTGCTGTGTAAATTGGTGGCCATATCCTTTCTTTGAGCTAAGTACACCTTGGGCTCCTCTCTGGTACATTGGCTTAGCA
GTGATTCACATCCCATGTTATGGACTGTATGCACTAATTGTGAAGACAAAATATTCACTTCTGCCAAGATTGTTTCCTCATGCTTTTGTTAAATCATTTTAACTCTCTCT
ATAATAATTCAAAATGGCTGGTTTATAAGTGTTATATTTATAAACCATTGGAAATGTAATATTTTTCCATTCAAAAACTAGGTTTAATTAATAATAATTTGAAAAAATAG
CTAAATTGTACTTCAGATATGTGTTGTTATTTATGTAGTGTATGATGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFESPVEEGWRYWVRWQVPVCGLIIGIPCVFAVKFIRKSMVEPVLLSDLWATHWKNLSPLWLLLYRAFAFVCCVQLLYEIVALHGPFVFFFYTQWTMALVAIYFALGTIV
SAYGYWYPSRKTQSKNEEAVKLMEKDLKKNNGGNVNEDTIKGQNKYAQQDFLEKAGYLGTLMQMAYLAAAGASALTDVVFWGLLVPFLLGENFHVSLLIGSIHALNAVFL
LGDTALNSLSFPLGGFAYFVAFGGLYVVFQWTVHACCVNWWPYPFFELSTPWAPLWYIGLAVIHIPCYGLYALIVKTKYSLLPRLFPHAFVKSF