; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0021750 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0021750
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionrapid alkalinization factor-like
Genome locationLG06:6856175..6856531
RNA-Seq ExpressionTan0021750
SyntenyTan0021750
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014377.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.9e-4581.36Show/hide
Query:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAK+SFLL FC +AA L V ST VLAT+ +  SWVLD A A CHGSMA CM+DDIEF+M+SEINRRILAD+NYISYDAL+ANKVPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGCSAIARCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

XP_011659776.1 rapid alkalinization factor [Cucumis sativus]5.5e-4075.42Show/hide
Query:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MA  VSFLL   ++ AIL VSSTA      ++ SWVLD A ARCHGSMA+CM++DIEF+M+SEINRRILADLNYISYDALKAN VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

XP_022153599.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]7.9e-4783.9Show/hide
Query:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAKVSFLL FC++ AIL VSSTAV A S ES SWVLD ARARCHGSMA+CM+D+IE+EMNSEINRRILA  NYISY+ALKAN VPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGCSAI RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

XP_022953165.1 rapid alkalinization factor-like [Cucurbita moschata]3.3e-4581.36Show/hide
Query:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAK+SFLL FC +AA L V STAV AT+ +  SWVLD A A CHGSMA CM+DDIEF+M+SEINRRILAD+NYISYDAL+ANKVPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGCSAIARCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

XP_038896330.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]2.1e-4785.59Show/hide
Query:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAKVSFLL F +VAAIL VSSTAVL TS ++ SWVLD ARARCHGSMA+CM+ DIEFEMNS+INRRILADLNYISYDALKAN VPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K607 Uncharacterized protein2.7e-4075.42Show/hide
Query:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MA  VSFLL   ++ AIL VSSTA      ++ SWVLD A ARCHGSMA+CM++DIEF+M+SEINRRILADLNYISYDALKAN VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

A0A1S3BRF1 rapid alkalinization factor-like5.9e-4076.27Show/hide
Query:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAKVSFLL   ++ AIL VSSTA       + SWVL  A ARCHGSMA+CM +DIEFEM+SEINRRILADLNYISYDAL+AN VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

A0A5A7VLB3 Rapid alkalinization factor-like5.9e-4076.27Show/hide
Query:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAKVSFLL   ++ AIL VSSTA       + SWVL  A ARCHGSMA+CM +DIEFEM+SEINRRILADLNYISYDAL+AN VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

A0A6J1DJJ4 protein RALF-like 333.8e-4783.9Show/hide
Query:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAKVSFLL FC++ AIL VSSTAV A S ES SWVLD ARARCHGSMA+CM+D+IE+EMNSEINRRILA  NYISY+ALKAN VPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGCSAI RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

A0A6J1GNW5 rapid alkalinization factor-like1.6e-4581.36Show/hide
Query:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAK+SFLL FC +AA L V STAV AT+ +  SWVLD A A CHGSMA CM+DDIEF+M+SEINRRILAD+NYISYDAL+ANKVPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGCSAIARCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 332.0e-2456.07Show/hide
Query:  VVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMID--DIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGC
        ++ AIL V       TS  S  +V     ++C+G++A+C +   + EFEM+SEINRRILA   YISY AL+ N VPCSRRGASYYNC+ GA+ANPY RGC
Subjt:  VVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMID--DIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGC

Query:  SAIARCR
        SAI RCR
Subjt:  SAIARCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor8.0e-2654.95Show/hide
Query:  LLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDA-ARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYD
        L+ CV+     +S  A  A  + +  WV+ A +   C GS+ +C+ ++ EFE++SE NRRILA   YISY AL+ N VPCSRRGASYYNC+PGA+ANPY 
Subjt:  LLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDA-ARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYD

Query:  RGCSAIARCRS
        RGCSAI RCRS
Subjt:  RGCSAIARCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 233.1e-2250.82Show/hide
Query:  VAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLD--AARARCHGSMAKCMID-------DI---------EFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYY
        +  ILAV + +V A S++ST +  D       C G++A+C +        D+         EFEM+SEINRRILA   YISY AL+ N +PCSRRGASYY
Subjt:  VAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLD--AARARCHGSMAKCMID-------DI---------EFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYY

Query:  NCQPGAEANPYDRGCSAIARCR
        NC+ GA+ANPY RGCSAI RCR
Subjt:  NCQPGAEANPYDRGCSAIARCR

Q9MA62 Protein RALF-like 221.7e-2354.95Show/hide
Query:  VAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARA-------RCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPY
        V AILA+  +AV +T +   S  LD  RA        C GS+A+C+ ++ E E +S+I+RRILA   YISY A++ N VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY
Subjt:  VAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARA-------RCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPY

Query:  DRGCSAIARCR
         RGCS I RCR
Subjt:  DRGCSAIARCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 14.8e-2354.78Show/hide
Query:  LLLFCVVAAILAVSSTAV---LATSNESTSWVLDAAR-ARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEA
        L L   +  +  +SS  V    A      +W       + CHGS+A+C I   E EM+SEINRRILA   YISY +LK N VPCSRRGASYYNCQ GA+A
Subjt:  LLLFCVVAAILAVSSTAV---LATSNESTSWVLDAAR-ARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEA

Query:  NPYDRGCSAIARCRS
        NPY RGCS IARCRS
Subjt:  NPYDRGCSAIARCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 13.4e-2454.78Show/hide
Query:  LLLFCVVAAILAVSSTAV---LATSNESTSWVLDAAR-ARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEA
        L L   +  +  +SS  V    A      +W       + CHGS+A+C I   E EM+SEINRRILA   YISY +LK N VPCSRRGASYYNCQ GA+A
Subjt:  LLLFCVVAAILAVSSTAV---LATSNESTSWVLDAAR-ARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEA

Query:  NPYDRGCSAIARCRS
        NPY RGCS IARCRS
Subjt:  NPYDRGCSAIARCRS

AT2G33775.1 ralf-like 191.5e-1443.27Show/hide
Query:  VAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRR-ILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGCSA
        +  IL + + AV+A S  +T W L  +     G + +    ++++ M+SE NRR + A  +YISY AL+ N VPCSRRG SYY+C+    ANPY RGCS 
Subjt:  VAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRR-ILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGCSA

Query:  IARC
        I  C
Subjt:  IARC

AT3G05490.1 ralf-like 221.2e-2454.95Show/hide
Query:  VAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARA-------RCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPY
        V AILA+  +AV +T +   S  LD  RA        C GS+A+C+ ++ E E +S+I+RRILA   YISY A++ N VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY
Subjt:  VAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARA-------RCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPY

Query:  DRGCSAIARCR
         RGCS I RCR
Subjt:  DRGCSAIARCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 232.2e-2350.82Show/hide
Query:  VAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLD--AARARCHGSMAKCMID-------DI---------EFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYY
        +  ILAV + +V A S++ST +  D       C G++A+C +        D+         EFEM+SEINRRILA   YISY AL+ N +PCSRRGASYY
Subjt:  VAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLD--AARARCHGSMAKCMID-------DI---------EFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYY

Query:  NCQPGAEANPYDRGCSAIARCR
        NC+ GA+ANPY RGCSAI RCR
Subjt:  NCQPGAEANPYDRGCSAIARCR

AT4G15800.1 ralf-like 331.4e-2556.07Show/hide
Query:  VVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMID--DIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGC
        ++ AIL V       TS  S  +V     ++C+G++A+C +   + EFEM+SEINRRILA   YISY AL+ N VPCSRRGASYYNC+ GA+ANPY RGC
Subjt:  VVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMID--DIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGC

Query:  SAIARCR
        SAI RCR
Subjt:  SAIARCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCAAGGTTTCTTTTCTCCTTCTATTTTGCGTAGTTGCTGCAATCCTGGCTGTCTCCTCCACTGCAGTATTGGCCACCAGCAACGAGAGTACGAGCTGGGTCCT
GGATGCAGCTCGAGCACGCTGTCACGGCTCCATGGCAAAGTGCATGATCGACGACATTGAATTTGAGATGAACTCTGAAATCAATAGACGCATATTGGCAGATTTAAACT
ACATAAGCTACGATGCGCTCAAGGCCAACAAGGTGCCATGCTCGCGTAGAGGAGCATCTTACTACAATTGCCAGCCAGGCGCCGAGGCGAATCCCTACGACCGTGGCTGC
AGTGCTATTGCTCGTTGCCGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCCAAGGTTTCTTTTCTCCTTCTATTTTGCGTAGTTGCTGCAATCCTGGCTGTCTCCTCCACTGCAGTATTGGCCACCAGCAACGAGAGTACGAGCTGGGTCCT
GGATGCAGCTCGAGCACGCTGTCACGGCTCCATGGCAAAGTGCATGATCGACGACATTGAATTTGAGATGAACTCTGAAATCAATAGACGCATATTGGCAGATTTAAACT
ACATAAGCTACGATGCGCTCAAGGCCAACAAGGTGCCATGCTCGCGTAGAGGAGCATCTTACTACAATTGCCAGCCAGGCGCCGAGGCGAATCCCTACGACCGTGGCTGC
AGTGCTATTGCTCGTTGCCGAAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAKVSFLLLFCVVAAILAVSSTAVLATSNESTSWVLDAARARCHGSMAKCMIDDIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGC
SAIARCRS