; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0021805 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0021805
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionTLC domain-containing protein
Genome locationLG05:80002928..80013924
RNA-Seq ExpressionTan0021805
SyntenyTan0021805
Gene Ontology termsGO:0055088 - lipid homeostasis (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR006634 - TRAM/LAG1/CLN8 homology domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573446.1 TLC domain-containing protein 4-B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.6e-14595.64Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M188 TLC domain-containing protein1.0e-14395.26Show/hide
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A0A1S4E2B6 transmembrane protein 56-like3.2e-14595.99Show/hide
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A0A5D3E1H6 Transmembrane protein 56-like3.2e-14595.99Show/hide
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A0A6J1GTT4 transmembrane protein 564.6e-14494.91Show/hide
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A0A6J1K6A0 transmembrane protein 56-like3.5e-14495.64Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5XIY2 TLC domain-containing protein 4-B9.0e-1224.17Show/hide
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        V G  +  +L +  ++ ++S+ + + Y  L   +  +WN+R +ST+HA+ + +  LY +++ D  ++    G        L    + I+ GY   DL L+
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           + ++G V +V HH  +  A  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ +     R+   ++ NGI +   + + RI +    +  V+ + Y  
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          +   +   + + +  V L ++N++W  KI +G  K I+
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Q6GLX2 TLC domain-containing protein 4-A2.6e-1124.4Show/hide
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        D  I Y  V G  L  +L++  ++  +   Y  +Y  L+  ++ EW++R +ST HA+ +    LY + + D  +     G   +    ++     I+ GY
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Query:  FLADLGLIVWLYPSLGGVEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSC-AYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYH
         + DL L+   +  +     V HH     +  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ D  G  RS    L+NG+ +   + + RI +    +  
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Query:  VYLHY--DQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNVMWFGKIVKGLMKTISKR
        V+  +  +  I++ +   +       VL ++NV W  KI +G  K +  +
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Q6PGS5 TLC domain-containing protein 4-B4.3e-1428.37Show/hide
Query:  LTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGVEYVVHHSLSGLAVAYSVFS
        L+  Q++EWN+R +S+ HA+ +    LY + + D  +     G        +    + ++ GY ++DL LI++ +  +G   +V HH L+ L   Y V  
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        GEG L  +    LI+E +TP +N RW+ +  G  K S   ++NG+++  ++ + RI +    +  V+  +  +      +G    + + +V L +MNVMW
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Query:  FGKIVKGLMKTISKR
          KI KG  K +  R
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Q8CGF5 TLC domain-containing protein 41.5e-1427.44Show/hide
Query:  YLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGVEYVVHHSLSGLAVAYS
        Y  L+  +++EWN+R +ST H++ + I  LY  F+ +        G  T+ +  ++T     + GY ++DL +I++ +  +G   +++HH  +GL   Y 
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Query:  VFSGEGQLY-TYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHY--DQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNV
        V +     Y     L++E+++P +N RW+ +     K S A +INGI++   + + RI+     ++ +Y  Y  +  I+   +   +      +L +MN+
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Query:  MWFGKIVKGLMKTIS
        MW  KI KG +K IS
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Q96MV1 TLC domain-containing protein 41.1e-1429.61Show/hide
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        FYF SY    K+          +++EWN+R +ST H++ + I  LY F+F     +D    G       +L+   + I+ GY ++DL +I+  +  +G  
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Query:  EYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KRSCAYLINGIVIFFAWLVARI--LLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGY
         +++HH  S  A    + +G         L++E+++P +N RW+ +     K S A +INGI++   + + RI  +L  Y F +     +  I++ V+  
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Query:  LLVFGVPTVLGMMNVMWFGKIVKGLMKTISKRR
        L       VL +MNVMW  KI KG +K IS  R
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31300.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein2.0e-11573.26Show/hide
Query:  TTSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRFIPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFS
        TTSL+T+ AIKSY  QA  L+KNYLLAD FIPYTSVL G+  CK+VYDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFS
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Query:  DQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGVEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAY
        D+ H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY
Subjt:  DQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGVEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAY

Query:  LINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNVMWFGKIVKGLMKTISKR
        ++NG+ IF AWLVARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MN++WFGKIV+G+ KT++KR
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AT1G31300.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein2.0e-11573.26Show/hide
Query:  TTSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRFIPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFS
        TTSL+T+ AIKSY  QA  L+KNYLLAD FIPYTSVL G+  CK+VYDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFS
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Query:  DQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGVEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAY
        D+ H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY
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Query:  LINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNVMWFGKIVKGLMKTISKR
        ++NG+ IF AWLVARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MN++WFGKIV+G+ KT++KR
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AT4G10360.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein3.2e-6549.58Show/hide
Query:  SVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI
        S+  G L CK+VYDLT+ +S   F  Y  L    R+EWNNRG ST HA++ S+ S+YF+  SD F +  H   V   ++ LS  ++GIS+GYFLADL +I
Subjt:  SVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI

Query:  VWLYPSLGGVEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVI
         W +P+LGG+EYV HH LS  A+  SV SG+ Q Y ++VL+SE TTP +N+RWYLD +G K S AY +NGI +F  WLVAR+LLF + F H+YLH+ QV 
Subjt:  VWLYPSLGGVEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVI

Query:  KMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNVMWFGKIVKGLMKTISKRR
        ++  +G+  +  +P  L +MN++WF KI KGL+KT+SK +
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AT4G19645.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein3.4e-10771.27Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALIKNYLLADRFIPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL
        M IKSYQ+QA+  +++YLLAD F+PYTSVL G+  CKLVYDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
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Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGVEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
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Query:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNVMWFGKIVKGLMKTISKRR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MN++WFGKIVKGL KT+ KR+
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AT4G19645.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein3.4e-10771.27Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALIKNYLLADRFIPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL
        M IKSYQ+QA+  +++YLLAD F+PYTSVL G+  CKLVYDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALIKNYLLADRFIPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL

Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGVEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGVEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNVMWFGKIVKGLMKTISKRR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MN++WFGKIVKGL KT+ KR+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAACGTCTTTGAAGACTGTAATGGCTATTAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTAATAAAGAACTACTTATTAGCAGACCGTTTTATCCCATACACCTCTGT
CCTTGGAGGCATGCTTGCTTGTAAATTGGTCTATGATCTTACTCAATTAGTTAGCAATTTTTACTTCAAGAGTTATCTGGGTCTTACAAAAATCCAACGAGTCGAGTGGA
ATAACCGCGGCATGTCCACTATTCATGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATGCTGGCCTTGTTACC
TTTCAAAGTTCAACGTTGTCTACTTTCATACTGGGGATTTCAGTTGGATACTTCTTGGCAGATCTTGGATTGATTGTTTGGCTGTATCCTTCTTTAGGTGGGGTGGAGTA
TGTTGTCCACCACTCTCTTTCCGGACTAGCGGTAGCATATTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACATATATGGTCCTCATTTCGGAGATCACAACTCCTGAGA
TTAATATGAGATGGTATCTTGATACAGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATCTGATTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGGTTGCTCGCATATTGCTGTTT
GGTTACACATTCTATCATGTTTACCTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATACCTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTATGATGAACGT
GATGTGGTTCGGGAAGATCGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCGAAGAGGCGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GATTTTTATATATAAATTCACAAAGCGTATCGAAGTAATAAATAAAGGGCGCTAAAAAAACAAGGAAAAAATCATCGGCTAAGGCGCGAAGTTATCATTTTCCTTCTGTT
AGTACTTCAAGGATTGGATAGAATGCAATTCAATCCACAAGAACACGACGATCCCATCTCTGGACACTCAAATCCATTGCTGATTAGCAATACCCACTTGCAATTCGCAT
TACCCAATTCACAATTTGCTCTTATTATTATTTGTAATTTCTCTTCATCTTGTCGGGATTACCCCTTTTAGATTGTTGCGGTTGGAGATTCCTAACGCTTCACATTGATT
GAACCTCACGGTTCTTTTATTACCGGTCGGTTGTTGCATTTCCCTTTACAGATTATCTTATTTTGTTTGTTACCATTTTGTTATCTTTGAAAAAGGAAAAACCCCTTCTT
CTGCATCTCCTCGTGATCTGGGGTTTTCATTTATGAGGGATAATAACATGGAACGAGGGAGCAATAGATAATTCAGTCTAAGGTAGCGCGATCTGCCAAATGTTATGTAG
TCAAACACAACAATGACAACGTCTTTGAAGACTGTAATGGCTATTAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTAATAAAGAACTACTTATTAGCAGACCGTTTTATCCC
ATACACCTCTGTCCTTGGAGGCATGCTTGCTTGTAAATTGGTCTATGATCTTACTCAATTAGTTAGCAATTTTTACTTCAAGAGTTATCTGGGTCTTACAAAAATCCAAC
GAGTCGAGTGGAATAACCGCGGCATGTCCACTATTCATGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATGCT
GGCCTTGTTACCTTTCAAAGTTCAACGTTGTCTACTTTCATACTGGGGATTTCAGTTGGATACTTCTTGGCAGATCTTGGATTGATTGTTTGGCTGTATCCTTCTTTAGG
TGGGGTGGAGTATGTTGTCCACCACTCTCTTTCCGGACTAGCGGTAGCATATTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACATATATGGTCCTCATTTCGGAGATCA
CAACTCCTGAGATTAATATGAGATGGTATCTTGATACAGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATCTGATTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGGTTGCTCGC
ATATTGCTGTTTGGTTACACATTCTATCATGTTTACCTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATACCTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGG
TATGATGAACGTGATGTGGTTCGGGAAGATCGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCGAAGAGGCGATGAGAAACGTATTCTTCTGGTTCATATCTCTTCCTCTTCACTC
TCTTGGTCTATTTCTTAACATCTCCACATGGGTTTAGGAGGAAAAGGAATTTGATGCTATGTAGTGTGGTTGTAAATGGTTCAAAATAACTTAAAACTTCTTGACATTTA
GTGTCTTCTTCCTCGTCAGATTTATGTACCAATTCATTTTTTCTGTATAGTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTCTTTCAAGAATGCATACAGACAAATGCATGGAAGAAATG
TGATGATACTACAGCAATTTTTTTTTGTATTCAGTTATATTATGATTTCAGTTCTCGTCTTTGTTCTCCCTTCACGATCTATGGTTTATGGTTAATGAGATCTCCCAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTTSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRFIPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVT
FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGVEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLF
GYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNVMWFGKIVKGLMKTISKRR