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Tan0021904 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0021904
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionCalcineurin B-like protein 3
Genome locationLG08:43007154..43013784
RNA-Seq ExpressionTan0021904
SyntenyTan0021904
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000166 - nucleotide binding (molecular function)
GO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0025588.1 Calcineurin B-like protein 3 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-3689.13Show/hide
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TYK12463.1 Calcineurin B-like protein 3 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-3689.13Show/hide
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XP_008440962.1 PREDICTED: calcineurin B-like protein 3 [Cucumis melo]1.1e-3689.13Show/hide
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XP_023003379.1 calcineurin B-like protein 3 [Cucurbita maxima]1.5e-3689.13Show/hide
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XP_038880898.1 calcineurin B-like protein 3 isoform X1 [Benincasa hispida]6.5e-3789.13Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KMV4 Uncharacterized protein1.2e-3688.04Show/hide
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A0A1S3B337 calcineurin B-like protein 35.4e-3789.13Show/hide
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A0A5A7SHG0 Calcineurin B-like protein 35.4e-3789.13Show/hide
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A0A5D3CKP7 Calcineurin B-like protein 35.4e-3789.13Show/hide
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A0A6J1KRL6 calcineurin B-like protein 37.1e-3789.13Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q3HRP1 Calcineurin B-like protein 62.2e-2765.22Show/hide
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Q3HRP5 Calcineurin B-like protein 24.7e-3072.83Show/hide
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        MVQCL+G++    VV  CCD +  +QPRGL+DP+ LARETVFSVSE+E LYEL KKISSAVIDD LINKEEFQLALFKT+KKESL  DRV D
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Q75LU8 Calcineurin B-like protein 36.6e-3276.09Show/hide
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        M+QCLEG+K  C V+  CCD D  +QP+GL+DPE LARETVFSVSE+E LYEL KKISSAVIDD LINKEEFQLALFKTNKKESL  DRV D
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Q8LAS7 Calcineurin B-like protein 23.1e-2972.83Show/hide
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Q8LEM7 Calcineurin B-like protein 33.4e-2871.74Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G16350.1 calcineurin B-like protein 65.5e-1851.09Show/hide
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        M+QCL+G+K+  +++  CCDAD    P+  Q+P+ +AR TVF+V+EIE LYEL K IS     + LI+KE+FQL LFK N   SL  DRV D
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AT4G17615.1 calcineurin B-like protein 11.2e-1756Show/hide
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        C  +  +++ RG +DP  LA ET FSVSE+E L+EL K ISS+V+DD LINKEEFQLALFK+ K+E++  +R+ D
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AT4G26570.1 calcineurin B-like 32.4e-2971.74Show/hide
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AT4G26570.2 calcineurin B-like 31.1e-2964.42Show/hide
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         K+N
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AT5G55990.1 calcineurin B-like protein 22.2e-3072.83Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AAGGGAGACAGTATTCAGTGTAAGTGAGATAGAGACATTGTATGAGTTGCTTAAAAAGATCAGTAGTGCTGTGATTGATGATTGGTTGATCAATAAGGAAGAATTTCAAC
TGGCATTGTTCAAAACAAATAAAAAAGAGAGCTTAGTTGAAGATAGGGTTGATGACAAAATATCATGGGAGGTTTTTGGCCACAAAAACAACTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAAAACTTAAATATTTTAAGTGTGGCTCCCAACTTTTTCTCTCAAAAAAGCAGGGGAAAATTTTGCGCCCAATTTTTTCCAACCCTCGTTGTTCTCTCGCAAACAACACC
ACGTCTTCATCATCGATCGATCTTCTTCAACCTAACAGACCCAAACTCCTCTTAGTCGACGGTCGAACATCACAAATCTACCCGAACAGACCCAAACTCCTCTTACTTCA
CAGCAGTTTTCATCCTCGATCGATCTTCTTCAACCTAAGCTCACACCCACATCCCTTCATGTCGACAAAAAAGGAGCAACAATCACCATTTGGCTCTTCGACTTACAAAT
CCACACCGGCAACGATCACATTTTGTGGCGGTAGTGTACCAGAGCATCAATCAGCGACTGTACCGGTAGTGTTCCCCTTATTCTCACCTTTTCCAATCGTTCCATTCATT
TTTAGTAATTCCACCGTAGAATTGCCCATTTCATCATTTGCATTTCTATGTCGAAAGCCAATGAATTAGAAGAGAATCCGGCGGCTTGTCCACATTTCTCAAAGCTCTCT
GATTTCAGATCCTCTTTCGTTTAAGCTCCAAGGCTAAGGTGTGGTGGGTCTCAGGAGTAAGGCTATTCTCTCAGAATTTTGGCTTGAGCGGATTCAGACACTGTTTGAAG
ATGAGAGGATGGAGTGGCTAAGAAGATGGGATTCGACCATTTTGAAGGCCTTCTCTTGGAGCACTCTTTCTAAAGAGTTTGCAGAATATTCTATCTCAGATTTGTGTTTT
TCTTGGCGACCTTTTTTGATTTCTGCTTAACATTAGTCTCTTTAGTTGTTGATGCTGTTAGGACTACTTAAGTTTTATTTTTGTGTTATTCCCTTATGTCGTATTATTTT
CTCTTATTACTATGTACTTTCATTATATCAATTAAATTATACTTTATTGCCTTGTCAAAAAAAAAAGTTTGCAAAACTAGCAAGGTATATTGTAATGGAGTTCTGAGTTC
AATTGAAAACTAGGAGTAGAAGCTTGTACACATCATATAAATGGAACAAATGGATTGAGTTCAACTTGTTGTGATTTTTTTTTTAACTTTTTTGGAACACTAACTTATTT
TCAACTTTTTAAGCAAACTTCTTTTGTTGTCCGGCTTTTGGTATCCAAAATTTGCTTCCTTTAAATTCTCTCCAAATAATTCTCTCATATTAGCTACCAAAACAGCTCAT
TTGCTGAAGCTTAAGTCTTATATTTTTAAACTCTTTCTTAAAAGTTTTTTAGTCAAAACAAGAATGGAAGTTGAGTTGAAAGAATAAAATTATAGTTGCAGTTTTTATGC
TTTTGATGGACATGTATTGTTGATTTTCTTGTGTGAAGCATGATATGTCTAGCTGTGTAGTATTGTTTGTCCGTGAGGCGTGAGTTGAGTTTTTGGTTCTTGGAGGATTG
AGATTGTTGTTTGAGAGGGAGTAATTTAAAGCTTCACAATTAGATGCTAGAAAAAATTATAATGATATTAAATTGTATTTTCATTGACATACTGAATGATCATCTTTGGA
GATATATGATTTTCTATGAATATAAATTTCCCTTTTCACATTGTTGGGTTTCTGTTCAATTTATCCTTTCCAAGACCAAATAGATATAGAATTGTTGAATTTGTCAAAGA
CCAATTAGACACAAAATTACAAGTTCATGGGGCTAGGCCTATTTAAGATTTTAAAAGTCACGGACTTATTATACATGAATTTGAAACTTGACCATGTTAGGAATTTCTAA
TATATAGTTGATGGAATGGGATGTTGAAGTTTGACCTTCTACTCGGGTTGTGGACTATATAGATTTACAGTATTTGAAAGTTGTTGAGCATGGCATACTCAGATGCTCAT
GGTGTGAGACCCCATATGGATTCTATTTCATATCACGTTTAAGGTAATAGTCCAAATTTCTTCTCTTGTTTATTTGTGGAAGGATGAATTCAAGTTATAAATATTGACTT
TGTCATTTTAAGAGATCAGTTCTGGCTTCTTTTTAGTGTCGAGGTACTGGTGATTGATTGCCATGTTCATTAGCCCGTCAGCTTGTTTCAAGATAATTGTTGAAACGTTT
TTTTACTAATTCATGGTGCATGTATGGAGTGTTTTGACATCTGTAAAAGATCATGGTTCAATGCCTAGAGGGAATAAAGTATTTCTGTGTTGTTGTAGCAAACTGTTGTG
ATGCAGATACGTCTAGGCAACCCAGGGGCCTTCAAGATCCTGAGGCTCTTGCAAGGGAGACAGTATTCAGTGTAAGTGAGATAGAGACATTGTATGAGTTGCTTAAAAAG
ATCAGTAGTGCTGTGATTGATGATTGGTTGATCAATAAGGAAGAATTTCAACTGGCATTGTTCAAAACAAATAAAAAAGAGAGCTTAGTTGAAGATAGGGTTGATGACAA
AATATCATGGGAGGTTTTTGGCCACAAAAACAACTAGCTCTAAAATTATATATTTTGATATTGAATAGTGAAATATTTTATAATTTAATGAATAGTATTTGACAAATTTG
TATTTAGTGTCATCCCAAAGTTGATGTTAATTATTATATCTATTTTGTGAACAATAGATTGTTATGTTTTGTATCAATTTAAGTGGGATAATGTAAACCTTGAATGAAAT
GTAATTTGCTTGGATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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