; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0021982 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0021982
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionPinin-like
Genome locationLG05:84361112..84362653
RNA-Seq ExpressionTan0021982
SyntenyTan0021982
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573241.1 hypothetical protein SDJN03_27128, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.6e-12184.73Show/hide
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KAG7012412.1 hypothetical protein SDJN02_25164, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.6e-12084.36Show/hide
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XP_022954756.1 uncharacterized protein LOC111456914 [Cucurbita moschata]1.5e-12084.73Show/hide
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XP_022994446.1 uncharacterized protein LOC111490165 [Cucurbita maxima]8.7e-12185.09Show/hide
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XP_023542734.1 uncharacterized protein LOC111802557 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.6e-12285.45Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3DT19 Pinin-like3.6e-11279.72Show/hide
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A0A6J1EN02 uncharacterized protein LOC1114340649.4e-11381.43Show/hide
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A0A6J1GRS3 uncharacterized protein LOC1114569147.1e-12184.73Show/hide
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A0A6J1JZ58 uncharacterized protein LOC1114901654.2e-12185.09Show/hide
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A0A6J1KR40 uncharacterized protein LOC1114957151.0e-11482.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G11125.1 unknown protein2.5e-0928.66Show/hide
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        MGCC+S++ +     P     SG +  +P  + D      EE  VKEVLSET            E++   K+        GI +   +E           
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Query:  ---SEVSDVCSFSETLSTATLTEKMDDYDEIRQRIC--RSPAKLPKNRSLSDDWVPRRDRPLGKSPTRKSDQSPGRIN----GGTVKLVQSRDMGQGFAR
           SEVS+ CS SE+L +       ++  +++  +   RSPAK              R+R +   P R++D SP + N     G+V+LV S         
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Query:  RSLRPEPHLQNRTENSYRRSRSPATTRT---DGVASRTAAGRSPSVRRSGMSPGREATAGRDYNRKEAGQTQAAQNETIEGKW----RTTNESLDNPLVS
                 ++ TE S RRSRSPA  R+       S+ +     ++RR   SPGR        N    G  Q   +    G         N+S +NPLVS
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Query:  LECFIFL
        LECFIFL
Subjt:  LECFIFL

AT1G61170.1 unknown protein6.6e-1032.74Show/hide
Query:  SGYSHPKPNGIGDRAPPPLEEES-VKEVLSETP--KPKPLFGERKTEESCSVKV--------------NGGIPIHP----TEEISEVSDVCSFSETLSTA
        SG +  +   + D+    +EEE+ VKEVLSET    P   F     ++    K+              +  + I P     EE SEVS++CS S + S +
Subjt:  SGYSHPKPNGIGDRAPPPLEEES-VKEVLSETP--KPKPLFGERKTEESCSVKV--------------NGGIPIHP----TEEISEVSDVCSFSETLSTA

Query:  TLTEKMDDYDE----IRQRIC-RSPAKLPKNRSLSDDWVPRRDRPLGKS-PTRKSDQSPGRINGGTVKLVQSRDMGQGFARRSLRPEPHLQNRTENSYRR
        + T  M+ YDE    ++QR   RSPAK              R +  G + PTR++DQSP + N GT         G G           +++  E S RR
Subjt:  TLTEKMDDYDE----IRQRIC-RSPAKLPKNRSLSDDWVPRRDRPLGKS-PTRKSDQSPGRINGGTVKLVQSRDMGQGFARRSLRPEPHLQNRTENSYRR

Query:  SRSPATTRTDGVASRTAAGRSPSVRRSGMSPGREATAGRDYNRKEAGQTQAAQNETIEGKWRTTNESLDNPLVSLECFIFL
        SRSPAT R+   +++++       R++  SPGR     R    K     Q  QN        TT E L+NPLVSLECFIFL
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AT4G28180.1 unknown protein3.7e-0529.29Show/hide
Query:  MGCCVSTSRSSNSSSPPHHSGSGYSHPKPNGIGDRAPPPLEEESVKEVLSET-----------PKPKP-LFGERKTEESCSVKVNGGIPIH-PTEEIS-E
        MGCC S  +    ++PP  +              + PPPLEEESVKEV+ ++           P P P L     T      +V   +P+  P  EIS  
Subjt:  MGCCVSTSRSSNSSSPPHHSGSGYSHPKPNGIGDRAPPPLEEESVKEVLSET-----------PKPKP-LFGERKTEESCSVKVNGGIPIH-PTEEIS-E

Query:  VSDVCSFS-----ETLSTATLTEKMDDYDEIRQRICRSPAKLPKNRSLSDDWVPRRDRP--LGKSPTRKSDQSPGRINGGTVKLVQSRDMGQGFARRSLR
         SD+CS S      T +TAT    ++  D+   +  R P   P + S S     RR+RP  + +SP  +      ++    V+  QSR       RR++ 
Subjt:  VSDVCSFS-----ETLSTATLTEKMDDYDEIRQRICRSPAKLPKNRSLSDDWVPRRDRP--LGKSPTRKSDQSPGRINGGTVKLVQSRDMGQGFARRSLR

Query:  PEP-HLQNRTENSYRRSRSPATTRTDGVASRTAAGRSPSVRRSGMSPGREATAGRDYNRKEAGQTQAAQNETIEGKWRTTNESLDNPLVSLECFIFL
          P      ++N  RRS+SPAT       + ++A RSP  +R G     E     +  +KE    +  +  T E K      ++ +P VS+ECFIFL
Subjt:  PEP-HLQNRTENSYRRSRSPATTRTDGVASRTAAGRSPSVRRSGMSPGREATAGRDYNRKEAGQTQAAQNETIEGKWRTTNESLDNPLVSLECFIFL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTGCTGTGTCAGTACTTCTAGGTCTTCTAATTCATCCTCTCCGCCCCACCATTCTGGATCTGGCTATTCACATCCCAAACCCAATGGCATTGGAGACAGAGCTCC
CCCTCCACTGGAAGAAGAGTCTGTCAAAGAAGTTCTCTCTGAAACCCCCAAGCCCAAACCGCTGTTTGGTGAGAGGAAAACCGAGGAATCGTGCTCTGTGAAGGTCAATG
GGGGAATCCCCATTCACCCAACTGAAGAAATTTCTGAGGTTTCTGATGTATGCAGCTTTAGCGAAACCCTATCTACTGCGACCCTAACAGAGAAGATGGACGATTACGAT
GAGATACGTCAGAGGATTTGCAGATCTCCGGCGAAATTGCCCAAGAACCGGTCGCTCTCTGACGATTGGGTTCCGAGGAGGGATAGACCGCTGGGTAAATCGCCAACGCG
AAAATCCGATCAGTCGCCCGGCCGGATTAACGGCGGAACGGTGAAGTTGGTGCAGAGCAGAGACATGGGGCAAGGATTCGCCAGGCGGAGTTTGAGGCCAGAGCCACACC
TGCAGAACCGAACTGAGAATTCATACCGAAGGTCCAGATCCCCTGCTACCACCCGGACTGATGGCGTAGCCTCCAGAACCGCCGCCGGGCGGAGCCCATCTGTCCGGAGG
TCCGGAATGTCGCCGGGACGGGAAGCAACCGCCGGAAGAGACTATAACCGGAAAGAAGCAGGTCAGACTCAGGCTGCACAGAACGAGACGATTGAGGGAAAATGGCGGAC
AACAAACGAGTCCCTCGATAACCCACTTGTTTCATTGGAATGCTTCATCTTCCTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CATGATAATAAAAAGCAATTTTGGGTTGGGAAGGAAGATGGAGATCCGTTTATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTCTCTGTGTGTGAGTGTGTGTGAACGTGATT
CCCAGAATCAGAGCAGAGCTGCACTTAAATGCAATTCACTCTCTTCCAACCAATCTCTCTCCCATTTTTAACTTCTCTCTTCTCTCTCACTTTCTACTCTTCTTCTTCCT
CAAACCCTGCAATGATCCTCAACCTTCTCAGACCCTGAATGTGAGTCCACATCTCTGTAACCTCCAAACCCATCTTCTTCAAAATGGGTTGCTGTGTCAGTACTTCTAGG
TCTTCTAATTCATCCTCTCCGCCCCACCATTCTGGATCTGGCTATTCACATCCCAAACCCAATGGCATTGGAGACAGAGCTCCCCCTCCACTGGAAGAAGAGTCTGTCAA
AGAAGTTCTCTCTGAAACCCCCAAGCCCAAACCGCTGTTTGGTGAGAGGAAAACCGAGGAATCGTGCTCTGTGAAGGTCAATGGGGGAATCCCCATTCACCCAACTGAAG
AAATTTCTGAGGTTTCTGATGTATGCAGCTTTAGCGAAACCCTATCTACTGCGACCCTAACAGAGAAGATGGACGATTACGATGAGATACGTCAGAGGATTTGCAGATCT
CCGGCGAAATTGCCCAAGAACCGGTCGCTCTCTGACGATTGGGTTCCGAGGAGGGATAGACCGCTGGGTAAATCGCCAACGCGAAAATCCGATCAGTCGCCCGGCCGGAT
TAACGGCGGAACGGTGAAGTTGGTGCAGAGCAGAGACATGGGGCAAGGATTCGCCAGGCGGAGTTTGAGGCCAGAGCCACACCTGCAGAACCGAACTGAGAATTCATACC
GAAGGTCCAGATCCCCTGCTACCACCCGGACTGATGGCGTAGCCTCCAGAACCGCCGCCGGGCGGAGCCCATCTGTCCGGAGGTCCGGAATGTCGCCGGGACGGGAAGCA
ACCGCCGGAAGAGACTATAACCGGAAAGAAGCAGGTCAGACTCAGGCTGCACAGAACGAGACGATTGAGGGAAAATGGCGGACAACAAACGAGTCCCTCGATAACCCACT
TGTTTCATTGGAATGCTTCATCTTCCTCTGAAAGAAGAGGGAAATTCCGGGCGCACATTACGGCAAAATTCACCGAACCGGCAAGTGCCATTCAATTTCTTGTACTATGT
TTTTGTGCGTCTTCAACGGTGGGCTTCCTATTTTTGGTCTGGAAATTGTAGTAAGCTGTAAATAATGAATGTCTGGAAGGTCAATTTAGGGAACAGGACTTATTGGTAGG
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AG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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