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Tan0022015 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0022015
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionRetrotrans_gag domain-containing protein
Genome locationLG02:83917246..83917500
RNA-Seq ExpressionTan0022015
SyntenyTan0022015
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_019172756.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC109168170 [Ipomoea nil]8.2e-2272.94Show/hide
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XP_019180076.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC109175288 [Ipomoea nil]2.4e-2171.76Show/hide
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XP_019188859.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC109183094 [Ipomoea nil]2.0e-2071.43Show/hide
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XP_019198426.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC109192308 [Ipomoea nil]1.8e-2172.94Show/hide
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XP_031127553.1 uncharacterized protein LOC116029647 [Ipomoea triloba]2.0e-2072.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0K9QKB3 Retrotrans_gag domain-containing protein (Fragment)5.4e-1964.29Show/hide
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A0A1U7YY93 uncharacterized protein LOC1045883491.3e-1769.86Show/hide
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        MSLEDIVK+LA  TLQFQ +TRA +Q L NQ+ Q+AT++S+LEAQ+SGKLPSQ  V PKENVSA++LRSGKE+
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A0A1U8BPS3 uncharacterized protein LOC1046132155.9e-1871.23Show/hide
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        MSL+DIVK+LA NTLQFQQ+TRA +Q L NQ+ Q+AT++S LEAQ+ GKLPSQ  VNPKENVSA++LRSGKE+
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A0A6J1DRS5 uncharacterized protein LOC1110232487.0e-1973.08Show/hide
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        MSLE+IVK LAN+TLQFQQ+TR  MQNLGNQITQLATS+S+LEAQ+SG LPSQ EVNPK    E +SAVMLR+ ++IP
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A0A7J0FIA0 Uncharacterized protein7.7e-1868.49Show/hide
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        MSLEDIVK+LA NT+QFQQ+T++ +Q+L NQ+ Q+AT++S+LEAQ SGKLPSQ  VNP+EN SA++LRSGKEI
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTTGGAAGATATTGTTAAGACCCTAGCTAACAATACTCTTCAATTTCAACAGAAGACAAGAGCAGACATGCAGAATTTAGGTAACCAAATTACTCAATTGGCTAC
GTCAGTTAGTAAATTGGAAGCCCAAAATTCTGGAAAGTTGCCTTCACAACCAGAGGTGAATCCAAAGGAGAACGTCAGTGCAGTTATGCTCCGAAGCGGGAAAGAAATTC
CCTCTGAAGTGATTTCACCTGAGGAGGAAAAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GTCAGTTAGTAAATTGGAAGCCCAAAATTCTGGAAAGTTGCCTTCACAACCAGAGGTGAATCCAAAGGAGAACGTCAGTGCAGTTATGCTCCGAAGCGGGAAAGAAATTC
CCTCTGAAGTGATTTCACCTGAGGAGGAAAAATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSLEDIVKTLANNTLQFQQKTRADMQNLGNQITQLATSVSKLEAQNSGKLPSQPEVNPKENVSAVMLRSGKEIPSEVISPEEEK