| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6588073.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.8e-107 | 87.22 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
+APTQVAFG+GGTSS++R++G SKAGN+ RNEDGTLPS SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNE EFGEASE TYDENTTTPA+DLGL+E
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
Query: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
DNPET+IFFLQLPPMVPV +QSST EGMEAANSLEQ KGSQP QKTCSLNE PSGS+GKLLVYRSGAVKLKLG+IVYDVSSGMDCGFAQ++AAINVEGK
Subjt: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
CCIVGELSKRA+LTPDVDSMLKNIEDL
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
|
|
| XP_004144123.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 [Cucumis sativus] | 3.9e-109 | 86.78 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
AAPTQVAFGSGG+SST+RS+G+SKAGNRPRNEDGTLP+S SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASE +TYDENTTT A++LGL+E
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
Query: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
+NPE D+ FLQLPPMVP+IKQSS++E M + NS EQ K SQPRQKTCS+NELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDI+YDVSSGMDCGFAQ+VAAINVEGK
Subjt: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
|
|
| XP_008450913.1 PREDICTED: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 [Cucumis melo] | 1.9e-108 | 85.9 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
AAPTQVAFGSGG+SST+RS+G+SKAGNRPRNEDGTLP+S SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASE TYDENTTT A++LGL+E
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
Query: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
+NPETD+FFLQLPPMVP+IKQSST+E M + N EQ SQ RQKTCS+NELPSGS+GKLLVYRSGAVKLKLGDI+YDVSSGMDCGFAQ+VAAIN+EGKH
Subjt: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
CCIVGELSKRAILTPDVDSML+NIEDL
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
|
|
| XP_022147557.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc4 [Momordica charantia] | 1.1e-108 | 87.67 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
AAPTQVAFGSGGTS+TIRS+G+ KAGNRPRNEDGTLPSS SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSG+PDSLNEEEFGEASE TYDE+ TTPA+DLGL+E
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
Query: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
+NPET++FFLQ+PPMVPV KQSST+EGM AA+S EQ KGS+ RQ CSLNELPSGS+GKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Subjt: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
CCIVGELSKRAILTPDVDSMLK+IEDL
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
|
|
| XP_038878504.1 uncharacterized protein LOC120070724 [Benincasa hispida] | 1.1e-111 | 88.55 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
AAPTQVAFGSGGTSST+RS+G+SKAGNRPRNEDGTLPSS SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASE YDENTTTPA+DLGL+E
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
Query: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
+NPE D+FFLQLPPMVP++KQSST+EG AANSLEQ KGSQPRQK C +NELPSGS+GKLLVYRSGAVKLKLGDI+YDVSSGMDCGFAQDVAA+NVEGK
Subjt: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
CCIVGELSKRAILTPDVDS+LKNIEDL
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LWX7 Uncharacterized protein | 1.9e-109 | 86.78 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
AAPTQVAFGSGG+SST+RS+G+SKAGNRPRNEDGTLP+S SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASE +TYDENTTT A++LGL+E
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
Query: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
+NPE D+ FLQLPPMVP+IKQSS++E M + NS EQ K SQPRQKTCS+NELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDI+YDVSSGMDCGFAQ+VAAINVEGK
Subjt: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
|
|
| A0A1S3BPR1 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 | 9.3e-109 | 85.9 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
AAPTQVAFGSGG+SST+RS+G+SKAGNRPRNEDGTLP+S SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASE TYDENTTT A++LGL+E
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
Query: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
+NPETD+FFLQLPPMVP+IKQSST+E M + N EQ SQ RQKTCS+NELPSGS+GKLLVYRSGAVKLKLGDI+YDVSSGMDCGFAQ+VAAIN+EGKH
Subjt: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
CCIVGELSKRAILTPDVDSML+NIEDL
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
|
|
| A0A6J1D2P1 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc4 | 5.5e-109 | 87.67 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
AAPTQVAFGSGGTS+TIRS+G+ KAGNRPRNEDGTLPSS SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSG+PDSLNEEEFGEASE TYDE+ TTPA+DLGL+E
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
Query: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
+NPET++FFLQ+PPMVPV KQSST+EGM AA+S EQ KGS+ RQ CSLNELPSGS+GKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Subjt: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
CCIVGELSKRAILTPDVDSMLK+IEDL
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
|
|
| A0A6J1HBC9 uncharacterized protein LOC111461827 | 6.7e-107 | 86.34 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFG+SKAGNR NEDG+LPS+ SKEYVEPWDYYSYYPVTLP+R PYSGNPDSLNEEEFGE SET++YDE TTTPA+DLGL+E
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
Query: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
+NPETDIFFLQLPPMVPVIKQSST+EG+ AANS E SQPRQKTCS+NELPSGS+GKLLVYRSGAVKLKLGDI+YDVSSGM CGFAQDVAAINVEGK+
Subjt: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
CC +GELSKRAILTPDV+SMLKNIEDL
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
|
|
| A0A6J1HTZ8 uncharacterized protein LOC111467450 | 3.0e-107 | 87.22 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
AAPTQVAFG+GGTSS++R+FG SKAGN+ RNEDGTLP S+EYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNE EFGEASE+ TYDENTTTPA+DLGL+E
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGLSKAGNRPRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLME
Query: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
DNPET+IFFLQLPPMVPV +QSST EGMEAANSLEQ K SQP QKTCSLNE PSGS+GKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQ++AAINVEGK
Subjt: DNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
CCIVGELSKRA+LTPDVDSMLKNIEDL
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKNIEDL
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O74857 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc4 | 2.9e-06 | 26.01 | Show/hide |
Query: LNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGL-----MEDNPETDIFFLQLPPMVP---------VIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQP---RQKTCSLNEL-
+N+E+ E E + D + A LGL MED+ + + +Q P +P + SS ++ EA + + P ++ ++++L
Subjt: LNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGL-----MEDNPETDIFFLQLPPMVP---------VIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQP---RQKTCSLNEL-
Query: ---------PSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKHCCIVGELSKRAILTPD
P+G IG L V++SG L++G + + V SG DC F Q++A ++ + K +G +R I++PD
Subjt: ---------PSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKHCCIVGELSKRAILTPD
|
|
| P05423 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 | 1.1e-08 | 25.95 | Show/hide |
Query: ETDIFFLQLPPMV----------PVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAA
E ++ FLQLP + P+ + +G E+ + ++ + C+L +L G +GKLL+ +SG V+L LG + DV+ G C F Q++ +
Subjt: ETDIFFLQLPPMV----------PVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAA
Query: INVEGK---HCCIVGELSKRAILTPDVDSML
+ + ++G + + + +PD +S+L
Subjt: INVEGK---HCCIVGELSKRAILTPDVDSML
|
|
| P25441 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 | 3.8e-06 | 27.34 | Show/hide |
Query: MEDNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSST---LEGMEAANSLEQRKGSQPRQK----TCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDV
M + PE + F QLP +P ++ + E ME S +K ++K S EL +G +G + V++SG + +K+G++V D+ G + F QDV
Subjt: MEDNPETDIFFLQLPPMVPVIKQSST---LEGMEAANSLEQRKGSQPRQK----TCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDV
Query: AAINV--EGKHCCIVGELSKRAILTPDV
A+++ + ++G + + ++TP +
Subjt: AAINV--EGKHCCIVGELSKRAILTPDV
|
|
| Q5E9Z7 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 | 9.6e-10 | 24.52 | Show/hide |
Query: PRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLR--RPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLMEDNPETDIFFLQLPPMV----------
P+ ED + A K EP D + PLR R G P ++ E +L L + E ++ FLQLP +
Subjt: PRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLR--RPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLMEDNPETDIFFLQLPPMV----------
Query: PVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH---CCIVGELSKRAIL
P+ + + +G E+ + ++ + TC+L +L G +GKLL+ +SG V+L LG + DV+ G C F Q++ ++ + ++G + + +
Subjt: PVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH---CCIVGELSKRAIL
Query: TPDVDSML
+P+ +S+L
Subjt: TPDVDSML
|
|
| Q91WD1 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 | 1.3e-09 | 25.48 | Show/hide |
Query: PRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLR--RPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLMEDNPETDIFFLQLPPMV----------
P+ ED + A K EP D V P R R G P ++ E +L LM+D ++ FLQLP +
Subjt: PRNEDGTLPSSASKEYVEPWDYYSYYPVTLPLR--RPYSGNPDSLNEEEFGEASETITYDENTTTPALDLGLMEDNPETDIFFLQLPPMV----------
Query: PVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGK---HCCIVGELSKRAIL
PV + +G E+ + ++ + C+L +L G +GKLL+ +SG V+L LG + DV+ G C F Q++ ++ + ++G + + +
Subjt: PVIKQSSTLEGMEAANSLEQRKGSQPRQKTCSLNELPSGSIGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGK---HCCIVGELSKRAIL
Query: TPDVDSML
+PD +S+L
Subjt: TPDVDSML
|
|
