| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7028683.1 spp27 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 1.9e-56 | 81.82 | Show/hide |
Query: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
MSS FSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAA KSKEKAPP SD SAAAP+PK+KR TTR TGILKV +VSPALSNFLGVSEVSRTNA
Subjt: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
Query: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
VKQIWSYIKL+NLQNPANKREIFCDDKLKAIFEG+EKVGFLEIAKLL HFVK+
Subjt: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
|
|
| XP_022146901.1 upstream activation factor subunit spp27-like [Momordica charantia] | 9.9e-58 | 83.54 | Show/hide |
Query: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTT----SKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVS
MSSG SNGIRVFRGCRALLAPSKSSA+VPAA AAAKSK T S+SKEK P SDTAA AAAP+PK+KRE TRP GILKVAQVSPAL NFLGV E S
Subjt: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTT----SKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVS
Query: RTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
RT+AVKQIWSYIKLHNLQNPANKREI+CDDKLKAIFEG+EKVGFLEI KLLARHFVKN
Subjt: RTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
|
|
| XP_022950651.1 upstream activation factor subunit UAF30-like [Cucurbita moschata] | 1.7e-57 | 82.47 | Show/hide |
Query: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAA KSKEKAPP SD SAAAP+PK+KR TTR TGILKV +VSPALSNFLGVSEVSRTNA
Subjt: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
Query: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
VKQIWSYIKL+NLQNPANKREIFCDDKLKAIFEG+EKVGFLEIAKLL HFVK+
Subjt: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
|
|
| XP_022974194.1 protein TRI1-like [Cucurbita maxima] | 4.5e-58 | 83.12 | Show/hide |
Query: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
MSSGFSNGIRVFRGC ALLAPSKSSAAVP A+ KSK TSKSKEKAPP SD SAAAP+P +KR TTR TGILKV +VSPALSNFLGVSEVSRTNA
Subjt: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
Query: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
VKQIWSYIKL+NLQNPANKREIFCDDKLKAIFEG+EKVGFLEIAK L+ HFVK+
Subjt: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
|
|
| XP_022980440.1 protein TRI1-like [Cucurbita maxima] | 2.9e-57 | 81.82 | Show/hide |
Query: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSA VP AA + SK+ ++ KEK PPRSD AA AAAP+PKVKRE TR TG LKV QVSPAL NFLGVSE SRT+A
Subjt: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
Query: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
VKQIWSYIKLHNLQNPANKREI+CDDKLKAIFEG+EKVGFLEI KLL RHFVKN
Subjt: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1D0R8 upstream activation factor subunit spp27-like | 4.8e-58 | 83.54 | Show/hide |
Query: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTT----SKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVS
MSSG SNGIRVFRGCRALLAPSKSSA+VPAA AAAKSK T S+SKEK P SDTAA AAAP+PK+KRE TRP GILKVAQVSPAL NFLGV E S
Subjt: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTT----SKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVS
Query: RTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
RT+AVKQIWSYIKLHNLQNPANKREI+CDDKLKAIFEG+EKVGFLEI KLLARHFVKN
Subjt: RTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
|
|
| A0A6J1EDA2 upstream activation factor subunit spp27-like | 8.5e-55 | 77.92 | Show/hide |
Query: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
MSSGFSNGIRVFRGC +LLAP KSSA VP A + SK+ ++ KEK PPRSD AA AAAP+PK +RE TRPTG+LKV QVSPAL NFLGVSE SRT+A
Subjt: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
Query: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
VKQIWSYIKLHNLQNP+NKREI+CDDKLKAIFEG+EKVGFLEI KLL RHFVKN
Subjt: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
|
|
| A0A6J1GFF6 upstream activation factor subunit UAF30-like | 8.2e-58 | 82.47 | Show/hide |
Query: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAA KSKEKAPP SD SAAAP+PK+KR TTR TGILKV +VSPALSNFLGVSEVSRTNA
Subjt: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
Query: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
VKQIWSYIKL+NLQNPANKREIFCDDKLKAIFEG+EKVGFLEIAKLL HFVK+
Subjt: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
|
|
| A0A6J1IKQ4 protein TRI1-like | 2.2e-58 | 83.12 | Show/hide |
Query: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
MSSGFSNGIRVFRGC ALLAPSKSSAAVP A+ KSK TSKSKEKAPP SD SAAAP+P +KR TTR TGILKV +VSPALSNFLGVSEVSRTNA
Subjt: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
Query: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
VKQIWSYIKL+NLQNPANKREIFCDDKLKAIFEG+EKVGFLEIAK L+ HFVK+
Subjt: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
|
|
| A0A6J1IWB1 protein TRI1-like | 1.4e-57 | 81.82 | Show/hide |
Query: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSA VP AA + SK+ ++ KEK PPRSD AA AAAP+PKVKRE TR TG LKV QVSPAL NFLGVSE SRT+A
Subjt: MSSGFSNGIRVFRGCRALLAPSKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNA
Query: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
VKQIWSYIKLHNLQNPANKREI+CDDKLKAIFEG+EKVGFLEI KLL RHFVKN
Subjt: VKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O74503 Upstream activation factor subunit spp27 | 2.0e-08 | 37.29 | Show/hide |
Query: APS-KSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTG---ILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQN
APS K S A A K T + ++E P T KR+ + + K ++SP L+ FLG+ ++SR VK++W YIK H+LQ+
Subjt: APS-KSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTG---ILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQN
Query: PANKREIFCDDKLKAIFE
P +KR I CDDKLK++FE
Subjt: PANKREIFCDDKLKAIFE
|
|
| Q05024 Protein TRI1 | 4.0e-09 | 37.61 | Show/hide |
Query: TAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFE
T K K+ SKSK K +++ + R + +S L FLG E+ RT VK IW YIK H+LQNP ++REI CD+K++ IF
Subjt: TAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFE
Query: GKEKVGFLEIAKLLARH
GK K+ + KLL +H
Subjt: GKEKVGFLEIAKLLARH
|
|
| Q08747 Upstream activation factor subunit UAF30 | 1.4e-09 | 37.07 | Show/hide |
Query: KSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEK
K T SK + ++D+ K + P KV +S +L++ LG E++RT V+++W+YIK HNLQNP NK+EI CD+KL+ I GK
Subjt: KSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEK
Query: VGFLEIAKLLARHFVK
E+ K+LA H +
Subjt: VGFLEIAKLLARHFVK
|
|
| Q2TBN1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 | 4.6e-05 | 34.33 | Show/hide |
Query: QVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLL
++ P L+ LG+ +R ++ +W YIK H LQ+P + + CD L+ IFE +++ F EI + L
Subjt: QVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLL
|
|
| Q9P7S3 SWI/SNF and RSC complexes subunit ssr3 | 2.4e-06 | 39.13 | Show/hide |
Query: QVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLAR
++S A +N LG+ E +R + V +W YIK H LQ+ KR I CD L+ +FE +++ F I +L+ R
Subjt: QVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLAR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G31760.1 SWIB/MDM2 domain superfamily protein | 5.0e-23 | 60 | Show/hide |
Query: GILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
GI K VS L++F G E++R +A+K++W Y+KLHNLQNPANK+EI CDDKLK IF+GK+KVG EI KLL+ HF K+
Subjt: GILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
|
|
| AT2G14880.1 SWIB/MDM2 domain superfamily protein | 6.1e-21 | 44.88 | Show/hide |
Query: KTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTR--------------PTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCD
KTTS P S AS A + ++ R T P GI+K VSP + + + + E++RT A+K+IW+YIK H+LQ+P NKREI CD
Subjt: KTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTR--------------PTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCD
Query: DKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFV
+KLK IFEG+++VGFLEIAKL+ HF+
Subjt: DKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFV
|
|
| AT2G35605.1 SWIB/MDM2 domain superfamily protein | 5.7e-27 | 69.14 | Show/hide |
Query: TGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
TGILKV VS L+NF+G +EVSRT AVK+IW YIKL+NLQNP NKREI CD++LK IF GK+ VGFLEI+KLL++HF K+
Subjt: TGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVKN
|
|
| AT3G03590.1 SWIB/MDM2 domain superfamily protein | 1.2e-32 | 54.17 | Show/hide |
Query: VFRGCRALLAP-SKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIK
VFRG R+LLAP S++++++ +A T +K +K+K K +SD+ A ++T R TGI KV VSP L+ FLG E SRT+A+K IW+YIK
Subjt: VFRGCRALLAP-SKSSAAVPAAAGTAAAKSKTTSKSKEKAPPRSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIK
Query: LHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVK
H+LQNPA+KREIFCD+ LK IFEGK+KVGFLEI+KLL+ HFVK
Subjt: LHNLQNPANKREIFCDDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFVK
|
|
| AT4G34290.1 SWIB/MDM2 domain superfamily protein | 3.4e-24 | 48.44 | Show/hide |
Query: TAAAKSKTTSKSKEKAPP---------RSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFC
TA +S S S + P R+ T+A+AA+ P +T P GI+K VS A+ + +GV E+ RT A+K+IW+YIK H+LQ+P NKR+I C
Subjt: TAAAKSKTTSKSKEKAPP---------RSDTAASAAAPRPKVKRETTRPTGILKVAQVSPALSNFLGVSEVSRTNAVKQIWSYIKLHNLQNPANKREIFC
Query: DDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFV
D+KLK IFEGKE+VGFLEIAKL+ HF+
Subjt: DDKLKAIFEGKEKVGFLEIAKLLARHFV
|
|
