| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0042597.1 putative RNA-binding protein 18 [Cucumis melo var. makuwa] | 4.1e-72 | 78.46 | Show/hide |
Query: DSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEK
DS+GFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIK+FSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKEK
Subjt: DSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEK
Query: MHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
MHGKLACGRPLVVRLASEKLM+NT N+TS AA ES KSRL GS+YGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKK KQD+ S D+IDKS LKTS
Subjt: MHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
|
|
| XP_008437528.1 PREDICTED: probable RNA-binding protein 18 [Cucumis melo] | 1.1e-72 | 78.57 | Show/hide |
Query: MDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKE
MDS+GFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIK+FSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKE
Subjt: MDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKE
Query: KMHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
KMHGKLACGRPLVVRLASEKLM+NT N+TS AA ES KSRL GS+YGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKK KQD+ S D+IDKS LKTS
Subjt: KMHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
|
|
| XP_011654647.1 probable RNA-binding protein 18 isoform X2 [Cucumis sativus] | 1.6e-71 | 78.06 | Show/hide |
Query: MDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKE
MDS+GFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIK+FSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKE
Subjt: MDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKE
Query: KMHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
KMHGKLACGRPLVVRLASEKLM NTTN+TS A ES KSRL GS+YGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKK KQD+ S D+ DKSSLK S
Subjt: KMHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
|
|
| XP_022157813.1 probable RNA-binding protein 18 isoform X3 [Momordica charantia] | 2.2e-70 | 77 | Show/hide |
Query: MAMDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLA
M MDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEA LIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLA
Subjt: MAMDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLA
Query: KEKMHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSS--VKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
KEKMHGKLACGRPLVVRLASEK MI+TT + S AAGES+KSRL GSNYGQ+TR+DKIAAIKNKLRALEG ESSS VKKQKQD+ SC DNIDK LKTS
Subjt: KEKMHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSS--VKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
|
|
| XP_031741097.1 probable RNA-binding protein 18 isoform X1 [Cucumis sativus] | 2.6e-87 | 88.78 | Show/hide |
Query: MDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKE
MDS+GFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIK+FSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVY +ASVKQ LIFACKVSMQEAKLAKE
Subjt: MDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKE
Query: KMHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
KMHGKLACGRPLVVRLASEKLM NTTN+TS A ES KSRL GS+YGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKK KQD+ S D+ DKSSLK S
Subjt: KMHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KJM9 RRM domain-containing protein | 2.9e-71 | 77.95 | Show/hide |
Query: DSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEK
DS+GFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIK+FSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKEK
Subjt: DSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEK
Query: MHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
MHGKLACGRPLVVRLASEKLM NTTN+TS A ES KSRL GS+YGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKK KQD+ S D+ DKSSLK S
Subjt: MHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
|
|
| A0A1S3ATX2 probable RNA-binding protein 18 | 5.2e-73 | 78.57 | Show/hide |
Query: MDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKE
MDS+GFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIK+FSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKE
Subjt: MDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKE
Query: KMHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
KMHGKLACGRPLVVRLASEKLM+NT N+TS AA ES KSRL GS+YGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKK KQD+ S D+IDKS LKTS
Subjt: KMHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
|
|
| A0A5A7TLJ6 Putative RNA-binding protein 18 | 2.0e-72 | 78.46 | Show/hide |
Query: DSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEK
DS+GFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIK+FSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLAKEK
Subjt: DSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEK
Query: MHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
MHGKLACGRPLVVRLASEKLM+NT N+TS AA ES KSRL GS+YGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKK KQD+ S D+IDKS LKTS
Subjt: MHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
|
|
| A0A6J1DUC5 probable RNA-binding protein 18 isoform X1 | 1.1e-70 | 77 | Show/hide |
Query: MAMDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLA
M MDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEA LIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLA
Subjt: MAMDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLA
Query: KEKMHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSS--VKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
KEKMHGKLACGRPLVVRLASEK MI+TT + S AAGES+KSRL GSNYGQ+TR+DKIAAIKNKLRALEG ESSS VKKQKQD+ SC DNIDK LKTS
Subjt: KEKMHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSS--VKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
|
|
| A0A6J1DUD9 probable RNA-binding protein 18 isoform X3 | 1.1e-70 | 77 | Show/hide |
Query: MAMDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLA
M MDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEA LIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE EAKLA
Subjt: MAMDSSGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLA
Query: KEKMHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSS--VKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
KEKMHGKLACGRPLVVRLASEK MI+TT + S AAGES+KSRL GSNYGQ+TR+DKIAAIKNKLRALEG ESSS VKKQKQD+ SC DNIDK LKTS
Subjt: KEKMHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSS--VKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKTS
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q5R6W3 Probable RNA-binding protein 18 | 2.7e-10 | 31.37 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
+L+IGNLD +ITE L+K+ FGK+ DFL+H G G+PRG+ F+ + +K QEA+ A + ++GKLA + LV
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
Query: VRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTK-SRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRAL
VR A ++ N S + S + L+ + KI AI+ KL+ +
Subjt: VRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTK-SRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRAL
|
|
| Q66J99 Probable RNA-binding protein 18 | 3.0e-09 | 29.1 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
+L+IGN+D +ITE L+K+ FGK+ DFL+H GP G+PRG+ F+ + +K EA+ A ++GK+A + LV
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
Query: VRLASEKL-MINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGG------GESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKT
VR A ++ + N S + L+ S KI AI+ KL+ + G+SS + + C+ KSSLK+
Subjt: VRLASEKL-MINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGG------GESSSVKKQKQDHTSCSDNIDKSSLKT
|
|
| Q6PBM8 Probable RNA-binding protein 18 | 2.5e-11 | 31.37 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
+L+IGN+D +ITE L+K+ FGK+ DFL+H GP G+PRG+ F+ + +KE EA+ A + ++GKLA + LV
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
Query: VRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALE
VR A + + A S + L+ + KI AI+ KL+ +E
Subjt: VRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTKSRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALE
|
|
| Q96H35 Probable RNA-binding protein 18 | 2.7e-10 | 31.37 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
+L+IGNLD +ITE L+K+ FGK+ DFL+H G G+PRG+ F+ + +K QEA+ A + ++GKLA + LV
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
Query: VRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTK-SRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRAL
VR A ++ N S + S + L+ + KI AI+ KL+ +
Subjt: VRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTK-SRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRAL
|
|
| Q9CR83 Probable RNA-binding protein 18 | 4.6e-10 | 31.37 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
+L+IGNLD +ITE L+K+ FGK+ DFL+H G G+PRG+ F+ + +K QEA+ A + ++GKLA + LV
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPLV
Query: VRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTK-SRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRAL
VR A ++ N S + S + L+ + KI AI+ KL+ +
Subjt: VRLASEKLMINTTNNTSTAAGESTK-SRLSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRAL
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT3G16380.1 poly(A) binding protein 6 | 2.7e-05 | 27.78 | Show/hide |
Query: SKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPL
S LY+ NL + E L ++F +G+I+S + H + G +GF F+ C + +E+K AK ++G L G+P+
Subjt: SKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEKMHGKLACGRPL
Query: VVRLASEK
VVR+A K
Subjt: VVRLASEK
|
|
| AT4G10110.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.9e-04 | 33.93 | Show/hide |
Query: LYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVS
+YIGN+D R+++ L + G++I L R + +P+GFAF EY ++E++
Subjt: LYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVS
|
|
| AT5G03580.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.8e-07 | 46.67 | Show/hide |
Query: SKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKII----SEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
+ LYI NLD +++E L MFS FGK+I ++DF RGE RGFAFIE+ S +
Subjt: SKLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKII----SEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| AT5G47620.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.1e-04 | 34.09 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEK
K+++G L +TEA K F+ FG I ++ R + PRGF FI Y S+E V V Q M E KLA K
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKMFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVYYFVASVKQFLIFACKVSMQEAKLAKEK
|
|
| AT5G52545.1 unknown protein | 7.3e-11 | 51.9 | Show/hide |
Query: MHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTS-TAAGESTKSR-LSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQK
MHG+LACGRPLVVRLASEK + +++++ S + E ++R ++GS+ GQ++R +K+ AIKNKL+ALE E KKQK
Subjt: MHGKLACGRPLVVRLASEKLMINTTNNTS-TAAGESTKSR-LSGSNYGQLTRSDKIAAIKNKLRALEGGGESSSVKKQK
|
|
