; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0022570 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0022570
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptiondof zinc finger protein DOF1.4-like
Genome locationLG03:78319311..78321281
RNA-Seq ExpressionTan0022570
SyntenyTan0022570
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003851 - Zinc finger, Dof-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6594595.1 Dof zinc finger protein PBF, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-10079.47Show/hide
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KAG7026566.1 Dof zinc finger protein PBF, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-9571.72Show/hide
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XP_022926924.1 dof zinc finger protein DOF1.4-like [Cucurbita moschata]2.2e-9979.01Show/hide
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XP_023004046.1 dof zinc finger protein DOF1.4-like [Cucurbita maxima]5.6e-10381.32Show/hide
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        QNP  LNSIN  +TT  ISSSA STHINN MFFG DAIG  LGFS SG LSHI DLR+GFNSAKQIQDIS  NSNHFHHP ISFDRNS L GNFE SL M
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XP_023518732.1 dof zinc finger protein DOF1.4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.8e-10279.92Show/hide
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        T+TSTPSQNP  LNSIN  +TT  ISSSA STHINN MFFG DAIGG LGFS SG LSHI DLR+GFNSAKQIQDIS  NSNHFHHP ISFDRNS   GN
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        FE +L MP KEVKMEGLNRL QN TEQ+DLSNFSDPSH+WNST   TGNWHDPTNNGSSIASLF
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KI37 Dof-type domain-containing protein7.4e-8569.96Show/hide
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        PRLL  N IN+T+  NI+SSSA   H N++MFFGLD+IG   G LG S SGLLSH  D  Q            P +SNHFHHP ISFDRNS L GN +P+
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        LM   KE+K+E LNRLCQNQTEQIDLSNFSDPS  YWNS     TGNWHDPTN NGSS+ASLF
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A0A1S3B0B7 dof zinc finger protein DOF1.7-like6.1e-8771.32Show/hide
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        QNPRLL   SIN+T+  NI+SSSA   H N++MFFGLD+I   GG LGFS SGLLSH       FN+  Q     P NSNHFHHP ISFDRNS L GN +
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        P+LM   KE+K+E LNRLCQNQTEQIDLSNFSDPS  YWNS     TGNWHDPTN NGSS+ASLF
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A0A5A7UBU9 Dof zinc finger protein DOF1.7-like6.1e-8771.32Show/hide
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        P+LM   KE+K+E LNRLCQNQTEQIDLSNFSDPS  YWNS     TGNWHDPTN NGSS+ASLF
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A0A6J1EGJ0 dof zinc finger protein DOF1.4-like1.1e-9979.01Show/hide
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        SL M P KE KMEGLNRL QN TEQ+DLSNFSDPSH+WNST   TGNWHDPTNNGSSIASLF
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A0A6J1KR08 dof zinc finger protein DOF1.4-like2.7e-10381.32Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80928 Dof zinc finger protein DOF2.42.8e-2858.04Show/hide
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        A  ++D+ RQ     P A L CPRC+S+NTKFCY+NNYSL+QPRHFCK C+RYWTRGG LRNVPVGGGCR+N+R KS+S++ N  TATS    N    +S
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         N ++ + I+SS
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Q9FZA4 Dof zinc finger protein DOF1.41.3e-3037.13Show/hide
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        + ++S    + +Q Q P   L CPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGG  RKNKR+K  S++++    T ++T S +P  
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         + I++ S+ N       +S   +S + NN           +   S SGL S    L  GF+S   +    P+  +H H    SF  NS          L
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        FG+   S    L  P K +   G                                L+++  N    +  S+  DPS+Y   WN+ +   G W DPTNN  
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Query:  GSSIASL
        GSS+ SL
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Q9LZ56 Dof zinc finger protein DOF5.14.0e-2761.39Show/hide
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Query:  S
        S
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Q9M2U1 Dof zinc finger protein DOF3.61.2e-2670.24Show/hide
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        P A LNCPRCDS+NTKFCY+NNYSL+QPRHFCK C+RYWTRGG+LRNVPVGGG R+NKR KS S S   V+    TST S   R
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Q9ZV33 Dof zinc finger protein DOF2.25.6e-2938.63Show/hide
Query:  RQQQSPPAPLNCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKSSSSSVNGGTATSTPSQNPRLLNSINNTSTTNI-
        +  Q P   L CPRCDS+NTKFCY+NNY+L+QPRHFCKAC+RYWTRGG LRNVPVGGGCR+NK+ KS      G + +S+ SQN +  + +N TS TN  
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Query:  -ISSSANS------THINNTMFFG-------LDAIGGALGFSPSGLLSHIADLRQGFNSAKQIQDISPNN-------SNHFHHPPISFDRNSPLFGNFEP
         +    NS      T  N T   G       ++   G  G + S  L+ +     G  S   + + + NN       S+HF      FDR   L+ NF  
Subjt:  -ISSSANS------THINNTMFFG-------LDAIGGALGFSPSGLLSHIADLRQGFNSAKQIQDISPNN-------SNHFHHPPISFDRNSPLFGNFEP

Query:  SLMMPTKEVKMEGLNRLCQNQTEQIDLSNFSDP
         + M    +    +++  Q + E   L N S P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28310.1 Dof-type zinc finger DNA-binding family protein9.4e-3237.13Show/hide
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        + ++S    + +Q Q P   L CPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGG  RKNKR+K  S++++    T ++T S +P  
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Query:  LNSINNTSTTNI------ISSSANSTHINNTMFFGLDAIGGALGFSPSGLLSHIADLRQGFNSAKQIQDISPNNSNHFHHPPISFDRNSP---------L
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Query:  FGNFEPS----LMMPTKEVKMEG--------------------------------LNRLCQNQTEQIDLSNFSDPSHY---WNSTT---GNWHDPTNN--
        FG+   S    L  P K +   G                                L+++  N    +  S+  DPS+Y   WN+ +   G W DPTNN  
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Query:  GSSIASL
        GSS+ SL
Subjt:  GSSIASL

AT1G28310.2 Dof-type zinc finger DNA-binding family protein9.4e-3237.13Show/hide
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Query:  FGNFEPS----LMMPTKEVKMEG--------------------------------LNRLCQNQTEQIDLSNFSDPSHY---WNSTT---GNWHDPTNN--
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Query:  GSSIASL
        GSS+ SL
Subjt:  GSSIASL

AT2G28810.1 Dof-type zinc finger DNA-binding family protein3.9e-3038.63Show/hide
Query:  RQQQSPPAPLNCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKSSSSSVNGGTATSTPSQNPRLLNSINNTSTTNI-
        +  Q P   L CPRCDS+NTKFCY+NNY+L+QPRHFCKAC+RYWTRGG LRNVPVGGGCR+NK+ KS      G + +S+ SQN +  + +N TS TN  
Subjt:  RQQQSPPAPLNCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKSSSSSVNGGTATSTPSQNPRLLNSINNTSTTNI-

Query:  -ISSSANS------THINNTMFFG-------LDAIGGALGFSPSGLLSHIADLRQGFNSAKQIQDISPNN-------SNHFHHPPISFDRNSPLFGNFEP
         +    NS      T  N T   G       ++   G  G + S  L+ +     G  S   + + + NN       S+HF      FDR   L+ NF  
Subjt:  -ISSSANS------THINNTMFFG-------LDAIGGALGFSPSGLLSHIADLRQGFNSAKQIQDISPNN-------SNHFHHPPISFDRNSPLFGNFEP

Query:  SLMMPTKEVKMEGLNRLCQNQTEQIDLSNFSDP
         + M    +    +++  Q + E   L N S P
Subjt:  SLMMPTKEVKMEGLNRLCQNQTEQIDLSNFSDP

AT2G28810.2 Dof-type zinc finger DNA-binding family protein3.9e-3038.63Show/hide
Query:  RQQQSPPAPLNCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKSSSSSVNGGTATSTPSQNPRLLNSINNTSTTNI-
        +  Q P   L CPRCDS+NTKFCY+NNY+L+QPRHFCKAC+RYWTRGG LRNVPVGGGCR+NK+ KS      G + +S+ SQN +  + +N TS TN  
Subjt:  RQQQSPPAPLNCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKSSSSSVNGGTATSTPSQNPRLLNSINNTSTTNI-

Query:  -ISSSANS------THINNTMFFG-------LDAIGGALGFSPSGLLSHIADLRQGFNSAKQIQDISPNN-------SNHFHHPPISFDRNSPLFGNFEP
         +    NS      T  N T   G       ++   G  G + S  L+ +     G  S   + + + NN       S+HF      FDR   L+ NF  
Subjt:  -ISSSANS------THINNTMFFG-------LDAIGGALGFSPSGLLSHIADLRQGFNSAKQIQDISPNN-------SNHFHHPPISFDRNSPLFGNFEP

Query:  SLMMPTKEVKMEGLNRLCQNQTEQIDLSNFSDP
         + M    +    +++  Q + E   L N S P
Subjt:  SLMMPTKEVKMEGLNRLCQNQTEQIDLSNFSDP

AT2G37590.1 DNA binding with one finger 2.42.0e-2958.04Show/hide
Query:  ASRIMDKPRQQQ--SPPAPLNCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKSSSSSVNGGTATSTPSQNPRLLNS
        A  ++D+ RQ     P A L CPRC+S+NTKFCY+NNYSL+QPRHFCK C+RYWTRGG LRNVPVGGGCR+N+R KS+S++ N  TATS    N    +S
Subjt:  ASRIMDKPRQQQ--SPPAPLNCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKSSSSSVNGGTATSTPSQNPRLLNS

Query:  INNTSTTNIISS
         N ++ + I+SS
Subjt:  INNTSTTNIISS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCAGCTTCTAGGATTATGGACAAACCCCGTCAACAACAATCACCACCTGCTCCTTTAAACTGCCCTCGTTGTGATTCTTCAAACACCAAATTTTGTTATTACAA
CAATTACAGCCTCTCTCAGCCAAGGCACTTCTGCAAGGCCTGCAAACGCTACTGGACTCGCGGCGGAACCCTAAGAAATGTCCCCGTTGGCGGCGGCTGCCGGAAGAACA
AGCGCCTCAAGTCTTCCTCCTCCTCAGTCAACGGTGGTACTGCCACGTCAACTCCAAGTCAAAACCCTCGCCTTCTCAACTCCATCAATAATACTTCTACTACTAATATT
ATTTCTTCTTCCGCTAATTCAACTCACATCAACAATACAATGTTTTTTGGGTTGGATGCCATTGGTGGCGCTTTAGGGTTTTCTCCTTCTGGCCTTCTCTCCCACATCGC
TGATCTCCGCCAAGGATTCAATTCCGCTAAGCAAATTCAAGATATTTCACCCAATAATTCAAATCACTTCCATCACCCCCCGATCTCCTTCGACCGGAATTCACCGCTTT
TCGGTAATTTCGAACCTAGTTTGATGATGCCGACCAAGGAAGTTAAGATGGAGGGTTTGAACAGGTTATGTCAAAATCAAACGGAGCAAATCGATCTGTCGAATTTCTCC
GACCCTTCTCATTATTGGAACTCGACGACCGGGAATTGGCATGATCCGACGAATAACGGGTCCTCCATTGCTTCTCTATTCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCTGTTTCTGTTCTCTTATTTTACCCTAATTAATACAACATCTTAACCTCTCTTCTCTCTCTTCTCTCCTTCTTGTTTTTCAAAACACTCCTTCTCTCTATCTCTCTTT
TCTTTAGAATCTGTGTTAAATGATAAAAAGGGTTGATCCCTAATGGCTTCAGCTTCTAGGATTATGGACAAACCCCGTCAACAACAATCACCACCTGCTCCTTTAAACTG
CCCTCGTTGTGATTCTTCAAACACCAAATTTTGTTATTACAACAATTACAGCCTCTCTCAGCCAAGGCACTTCTGCAAGGCCTGCAAACGCTACTGGACTCGCGGCGGAA
CCCTAAGAAATGTCCCCGTTGGCGGCGGCTGCCGGAAGAACAAGCGCCTCAAGTCTTCCTCCTCCTCAGTCAACGGTGGTACTGCCACGTCAACTCCAAGTCAAAACCCT
CGCCTTCTCAACTCCATCAATAATACTTCTACTACTAATATTATTTCTTCTTCCGCTAATTCAACTCACATCAACAATACAATGTTTTTTGGGTTGGATGCCATTGGTGG
CGCTTTAGGGTTTTCTCCTTCTGGCCTTCTCTCCCACATCGCTGATCTCCGCCAAGGATTCAATTCCGCTAAGCAAATTCAAGATATTTCACCCAATAATTCAAATCACT
TCCATCACCCCCCGATCTCCTTCGACCGGAATTCACCGCTTTTCGGTAATTTCGAACCTAGTTTGATGATGCCGACCAAGGAAGTTAAGATGGAGGGTTTGAACAGGTTA
TGTCAAAATCAAACGGAGCAAATCGATCTGTCGAATTTCTCCGACCCTTCTCATTATTGGAACTCGACGACCGGGAATTGGCATGATCCGACGAATAACGGGTCCTCCAT
TGCTTCTCTATTCTAGGAGATGATGGTATTAATTATAGAGTGTATTTGTATTTGTATTTGTATCTCCCTCTCTATTTAAGCAGATTCAAAAGGGAAAAAGAAAAGACAAA
GAATAAAGACGAGAAGAGGTGGGATCGGAGCGATCATGTCAGCAGCAAAAAAAAGCTAAACTCAAAACCCTTCAAACTTTATCGATGTGGGTTTGAGAATTTTATAGGTA
ATTGCGCTGAGAGGAACCTCGGATCCTCTTTCATTTCGTCAGTTAGTAGAATTCTATTAATTACAAGTTAGAGTTTATTATCATTTTTACTTTGAAGAACTTTCATATCC
TTTGATTGATGAGTCCAGTTTCAACCTAGAAAGATGAGCAATAGTTTCGCATGCGTACTCACATGCATGCATCAAAAACGATCGGATACGTTTTTTTTTTTTTTTTTCCT
TTTTGGGTATATAGTTAAGGGTATAGGAGATCAGATCAGAGGGAGATTTGTTATTGTAATGGTGATTAGAATTAGATCGTTAAATTTAAGGTTATCTATGTTTTTTCTTT
TGTCCCTTTGTTATCTACAACTTATTAACAAGGAAATTTGGTTTGGGAAAACAGGTATATTTATGTTCATTTTCAATTTCTTTTGATATGGTAAATTTGGTTTGCTCAAT
CTCTCTCTTTTTTTTTAGTTTAACAATATTTTGAGTTATGTTTAAATTGGTGTCGATCTCCCTTACACTAAATTAATCATGCATATTCTTTTTTCTAAAAATTCAAAATT
TTCAAATGTTCAATAAAGTAATTTGTATGTGTGTAATACAGATCCTCTAGACATATATTCTATAGTTGCATAAGTAAAATCATACACACAAATCTATTGGAGCGATGAAA
AAGAGAGTAGAGAAAGGGAAGTTGAAAAGCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASASRIMDKPRQQQSPPAPLNCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRLKSSSSSVNGGTATSTPSQNPRLLNSINNTSTTNI
ISSSANSTHINNTMFFGLDAIGGALGFSPSGLLSHIADLRQGFNSAKQIQDISPNNSNHFHHPPISFDRNSPLFGNFEPSLMMPTKEVKMEGLNRLCQNQTEQIDLSNFS
DPSHYWNSTTGNWHDPTNNGSSIASLF