; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0022631 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0022631
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionthaumatin-like protein 1b
Genome locationLG09:58883470..58895347
RNA-Seq ExpressionTan0022631
SyntenyTan0022631
Gene Ontology termsGO:0006952 - defense response (biological process)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001938 - Thaumatin family
IPR037176 - Osmotin/thaumatin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022983086.1 thaumatin-like protein 1b [Cucurbita maxima]2.2e-10679.82Show/hide
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XP_022987542.1 thaumatin-like protein 1b isoform X3 [Cucurbita maxima]3.2e-10567.68Show/hide
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        TTGFELA G S S NVPTPW+GRVWART C+N+    TC TG+C  GL+CNG  GVPP TL EF LA  T   QDF DISLVDGFNIP SI+++ G    
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XP_022987543.1 thaumatin-like protein 1b isoform X4 [Cucurbita maxima]1.3e-10667.91Show/hide
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XP_023526213.1 thaumatin-like protein 1b [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.2e-10578.92Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1J147 thaumatin-like protein 1b1.1e-10679.82Show/hide
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A0A6J1JAN1 thaumatin-like protein 1b isoform X31.5e-10567.68Show/hide
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A0A6J1JEJ4 thaumatin-like protein 1b isoform X25.9e-10566.56Show/hide
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A0A6J1JH58 thaumatin-like protein 1b isoform X17.7e-10566.34Show/hide
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         G      CKS  CR DVN+VCP ELQ KS +EVIGC SAC  FNQPRYCC GEF GP+ CKP++YSQ+ KNQCPDAYSYAYDD +STF+CSN  NYVIT
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        FCG
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A0A6J1JJR2 thaumatin-like protein 1b isoform X46.3e-10767.91Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80327 Thaumatin-like protein 14.0e-7458.08Show/hide
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        H    +AK T  N C  T+WP  LT G G  QL +TGFELA G S S  V  PW+GR W R+ CS ++ G F CSTG+CG G + CNGAG  PP +L E 
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        TL ATN GQDFYD+SLVDGFN+P  ++  GG+G C S++C A++N VCP EL +K  D  VIGCKSAC   NQP+YCC G +  PD C PT++S+VFKNQ
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        CP AYSYAYDD+SSTFTC    NY ITFC
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P83332 Thaumatin-like protein 12.6e-7359.19Show/hide
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        AK+T  N C  T+WP  L TG  + QLS TGFELA G S S + P+PW+GR + RTRCS +  G FTC+T +CG G + CNG G  PP TL E T+ A+N
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         GQDFYD+SLVDGFN+P S++ +GGTG CK+S C AD+N+VCP  LQ K  D  VI CKSAC  FNQP+YCC    D P+ C P +YS++FK QCP AYS
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        YAYDD+SSTFTCS R  Y+ITFC
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P83335 Thaumatin-like protein 21.0e-6956.95Show/hide
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        A M+ KNNC  T+WPA      G  QLSTTGFELA   S+  + P PW+GR WARTRCS +  G F C T +C  G L CNG  G+PP TLAEFT+AA  
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         GQDFYD+SLVDGFN+P S++ +GGTG CK  +C A+VN VCP+ELQ+   D  V+ C SAC  F +P+YCC    +  +KC PTNYSQ+F  QCPDAYS
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        YA+DD    FTCS   NY+ITFC
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Q9FSG7 Thaumatin-like protein 1a3.7e-7258.3Show/hide
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        AK+T  NNC  T+WP  L TG  + QLS TGFELA   S S + P+PW+GR W RTRCS +  G FTC T +CG G + CNGAG VPP TL E T+AA N
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         GQD+YD+SLVDGFN+P S++ +GGTG CK S+C A+VN+VCP  LQ K+ D  VI CKSAC  F   +YCC    + P+ C PT YS++F+ QCP AYS
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        YAYDD++STFTCS   +YVITFC
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Q9SMH2 Thaumatin-like protein 16.3e-7257.4Show/hide
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        +AK+T  NNC RTIWP  LT+   + QL  TGF LA   S +  V  PW GR WARTRC+ N G FTC T +C  G + CNG G +PP +L E  +AA N
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         G DFYD+SLVDG+N+P S+++ GGTG CK+++CRA+VN VCP ELQ K  D  V+ CKSAC  FNQP+YCC G FD    C  T YS++FK QCP AYS
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        YAYDD +STFTCS   +YVITFC
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G19320.1 Pathogenesis-related thaumatin superfamily protein1.5e-6553.85Show/hide
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        T+ N+C  TIWP +LT      QL   GF LA G S +F V   W+GR WART C+ +  G   C TG+CG  L+C GAGG PP TLAEFT+ ++   N 
Subjt:  TVKNNCLRTIWPAVLTTGPGQHQLSTTGFELAPGDSWSFNVPTPWTGRVWARTRCS-NNGGFFTCSTGECGRGLECNGAGGVPPTTLAEFTLAAT---ND

Query:  GQDFYDISLVDGFNIPASISSEGGTGPCKSSNCRADVNRVCPTELQEKSGDEVIGCKSACFVFNQPRYCCIGEFDGPDKCKPTNYSQVFKNQCPDAYSYA
         QDFYD+SLVDG+N+   I+ +GG+G CK++ C +DVN +CP ELQ      V  CKSAC  FN+P YCC G +  P  C PTNYS++FK  CP AYSYA
Subjt:  GQDFYDISLVDGFNIPASISSEGGTGPCKSSNCRADVNRVCPTELQEKSGDEVIGCKSACFVFNQPRYCCIGEFDGPDKCKPTNYSQVFKNQCPDAYSYA

Query:  YDDRSSTFTCSNRANYVITFC
        YDD SSTFTC+N ANY I+FC
Subjt:  YDDRSSTFTCSNRANYVITFC

AT1G20030.1 Pathogenesis-related thaumatin superfamily protein6.5e-6452.23Show/hide
Query:  TVKNNCLRTIWPAVLTTGPGQHQLSTTGFELAPGDSWSFNVPTPWTGRVWARTRCS-NNGGFFTCSTGECGRG-LECNGAGGVPPTTLAEFTLAATNDGQ
        T  N C  T+WP +L+   G   L TTGF L  G++ + N P+ W GR W RT CS ++ G F+C+TG+CG G +EC+GAG  PP TLAEFTL  +  G 
Subjt:  TVKNNCLRTIWPAVLTTGPGQHQLSTTGFELAPGDSWSFNVPTPWTGRVWARTRCS-NNGGFFTCSTGECGRG-LECNGAGGVPPTTLAEFTLAATNDGQ

Query:  DFYDISLVDGFNIPASISSEGGTGP-CKSSNCRADVNRVCPTELQEKSGD----EVIGCKSACFVFNQPRYCCIGEFDGPDKCKPTNYSQVFKNQCPDAY
        DFYD+SLVDG+N+   +  +GG+G  C S+ C  D+N  CP+EL+  S D      + CKSAC  F QP YCC G F  PD CKP+ YS++FK+ CP AY
Subjt:  DFYDISLVDGFNIPASISSEGGTGP-CKSSNCRADVNRVCPTELQEKSGD----EVIGCKSACFVFNQPRYCCIGEFDGPDKCKPTNYSQVFKNQCPDAY

Query:  SYAYDDRSSTFTCSNRANYVITFC
        SYAYDD+SSTFTC+   NYVITFC
Subjt:  SYAYDDRSSTFTCSNRANYVITFC

AT1G20030.2 Pathogenesis-related thaumatin superfamily protein6.5e-6452.23Show/hide
Query:  TVKNNCLRTIWPAVLTTGPGQHQLSTTGFELAPGDSWSFNVPTPWTGRVWARTRCS-NNGGFFTCSTGECGRG-LECNGAGGVPPTTLAEFTLAATNDGQ
        T  N C  T+WP +L+   G   L TTGF L  G++ + N P+ W GR W RT CS ++ G F+C+TG+CG G +EC+GAG  PP TLAEFTL  +  G 
Subjt:  TVKNNCLRTIWPAVLTTGPGQHQLSTTGFELAPGDSWSFNVPTPWTGRVWARTRCS-NNGGFFTCSTGECGRG-LECNGAGGVPPTTLAEFTLAATNDGQ

Query:  DFYDISLVDGFNIPASISSEGGTGP-CKSSNCRADVNRVCPTELQEKSGD----EVIGCKSACFVFNQPRYCCIGEFDGPDKCKPTNYSQVFKNQCPDAY
        DFYD+SLVDG+N+   +  +GG+G  C S+ C  D+N  CP+EL+  S D      + CKSAC  F QP YCC G F  PD CKP+ YS++FK+ CP AY
Subjt:  DFYDISLVDGFNIPASISSEGGTGP-CKSSNCRADVNRVCPTELQEKSGD----EVIGCKSACFVFNQPRYCCIGEFDGPDKCKPTNYSQVFKNQCPDAY

Query:  SYAYDDRSSTFTCSNRANYVITFC
        SYAYDD+SSTFTC+   NYVITFC
Subjt:  SYAYDDRSSTFTCSNRANYVITFC

AT1G75030.1 thaumatin-like protein 31.6e-6250Show/hide
Query:  DKTAKMTVKNNCLRTIWPAVLTTGPGQHQLSTTGFELAPGDSWSFNVPTPWTGRVWARTRCS-NNGGFFTCSTGECGRGLECNGAGGVPPTTLAEFTLAA
        D     T++N+C  T+WP  L+       L   GF L PG S     PT W+GR WART C+ +  G  TC TG+CG  L+C G GGVPP TLAEFT+ +
Subjt:  DKTAKMTVKNNCLRTIWPAVLTTGPGQHQLSTTGFELAPGDSWSFNVPTPWTGRVWARTRCS-NNGGFFTCSTGECGRGLECNGAGGVPPTTLAEFTLAA

Query:  TNDGQDFYDISLVDGFNIPASISSEGGTGPCKSSNCRADVNRVCPTELQ--EKSGDEVIGCKSACFVFNQPRYCCIGEFDGPDKCKPTNYSQVFKNQCPD
        +N G DFYD+SLVDG+N+   I  +GG G CK + C +D+N +CP+EL+  + +   V  CKSAC  F+ P +CC G    P  C PT YS +FKN CP 
Subjt:  TNDGQDFYDISLVDGFNIPASISSEGGTGPCKSSNCRADVNRVCPTELQ--EKSGDEVIGCKSACFVFNQPRYCCIGEFDGPDKCKPTNYSQVFKNQCPD

Query:  AYSYAYDDRSSTFTCSNRANYVITFC
        AYSYAYDD SSTFTC+  +NY+ITFC
Subjt:  AYSYAYDDRSSTFTCSNRANYVITFC

AT1G75800.1 Pathogenesis-related thaumatin superfamily protein6.5e-6451.53Show/hide
Query:  KTAKMTVKNNCLRTIWPAVLTTGPGQHQLSTTGFELAPGDSWSFNVPTPWTGRVWARTRCS-NNGGFFTCSTGECGRG-LECNGAGGVPPTTLAEFTLAA
        ++    + N C  T+WP +L+   G   L TTGF L  G+  + + PT W GR W RT+CS +  G FTC TG+CG G LEC+G+G  PP TLAEFTL  
Subjt:  KTAKMTVKNNCLRTIWPAVLTTGPGQHQLSTTGFELAPGDSWSFNVPTPWTGRVWARTRCS-NNGGFFTCSTGECGRG-LECNGAGGVPPTTLAEFTLAA

Query:  TNDGQDFYDISLVDGFNIPASISSEGGTG-PCKSSNCRADVNRVCPTELQEKS----GDEVIGCKSACFVFNQPRYCCIGEFDGPDKCKPTNYSQVFKNQ
        +N G DFYD+SLVDG+N+P  ++ +GG+G  C S+ C  D+N  CP+EL+  S    G + +GCKSAC  F  P YCC G    PD CKP++YS +FK  
Subjt:  TNDGQDFYDISLVDGFNIPASISSEGGTG-PCKSSNCRADVNRVCPTELQEKS----GDEVIGCKSACFVFNQPRYCCIGEFDGPDKCKPTNYSQVFKNQ

Query:  CPDAYSYAYDDRSSTFTCSNRANYVITFC
        CP AYSYAYDD+SSTFTC+   NYVITFC
Subjt:  CPDAYSYAYDDRSSTFTCSNRANYVITFC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCATCATCAATCTTCTCCACCTTCTGCTCTGTTTCTGTACTCCTTCTCCTTGGAGCTCTGATTTCTCCAGGATCAAAATGGGGAAATATGGTGATGGCGATTGA
AGATGAAGATTTTGCTCTTTTACCCTTTGGATCTGACTCTGCCATTGACAACTTCATTCGTCTTCCTCAATGCGGTGGCCCTCCCCAGACTCACACAAGGGATAAAACTG
CGAAAATGACCGTGAAAAACAATTGTCTAAGAACCATATGGCCAGCAGTATTAACAACCGGTCCAGGGCAACACCAGCTATCAACAACTGGGTTCGAGTTAGCTCCCGGA
GATTCATGGTCGTTCAACGTCCCGACGCCATGGACTGGCCGAGTATGGGCACGAACCCGATGCTCCAATAATGGCGGATTCTTCACCTGTTCGACCGGAGAATGCGGTCG
AGGTCTCGAATGCAACGGCGCCGGAGGAGTTCCACCAACCACGCTGGCTGAATTCACCCTCGCCGCCACAAACGACGGCCAAGATTTCTACGACATCAGCCTTGTGGATG
GCTTCAACATCCCAGCCTCCATCAGCAGCGAGGGCGGCACAGGGCCATGCAAATCCTCAAACTGTCGTGCCGACGTGAACAGGGTTTGCCCGACAGAGCTGCAGGAGAAA
TCTGGCGACGAAGTGATTGGCTGCAAGAGTGCTTGTTTTGTATTCAACCAACCTCGCTACTGCTGCATTGGAGAGTTCGATGGCCCTGACAAATGCAAGCCAACGAACTA
TTCGCAGGTTTTCAAAAACCAATGCCCGGATGCTTACAGCTACGCGTATGATGATCGGAGTAGTACTTTTACTTGCAGTAATAGGGCAAATTATGTCATCACATTCTGCG
GTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTAAGATTCAAATAGGGTGGAGGATGGGATGGCGCCCCTGAACATCTCTAGTCTTCAACCAGTCAACCTGTTGTACAAATTTAAGCATCACAGAAGTCAATATGCGTCGA
CAGATGTAGAAGATAAAGATGTATTATTTCGATCAGTAAGATTCAAAGAAATGGCCATAAATTAGTTGGGATTTCTGTACAACTTTATGTTATGGCTTCATCATCAATCT
TCTCCACCTTCTGCTCTGTTTCTGTACTCCTTCTCCTTGGAGCTCTGATTTCTCCAGGATCAAAATGGGGAAATATGGTGATGGCGATTGAAGATGAAGATTTTGCTCTT
TTACCCTTTGGATCTGACTCTGCCATTGACAACTTCATTCGTCTTCCTCAATGCGGTGGCCCTCCCCAGACTCACACAAGGGATAAAACTGCGAAAATGACCGTGAAAAA
CAATTGTCTAAGAACCATATGGCCAGCAGTATTAACAACCGGTCCAGGGCAACACCAGCTATCAACAACTGGGTTCGAGTTAGCTCCCGGAGATTCATGGTCGTTCAACG
TCCCGACGCCATGGACTGGCCGAGTATGGGCACGAACCCGATGCTCCAATAATGGCGGATTCTTCACCTGTTCGACCGGAGAATGCGGTCGAGGTCTCGAATGCAACGGC
GCCGGAGGAGTTCCACCAACCACGCTGGCTGAATTCACCCTCGCCGCCACAAACGACGGCCAAGATTTCTACGACATCAGCCTTGTGGATGGCTTCAACATCCCAGCCTC
CATCAGCAGCGAGGGCGGCACAGGGCCATGCAAATCCTCAAACTGTCGTGCCGACGTGAACAGGGTTTGCCCGACAGAGCTGCAGGAGAAATCTGGCGACGAAGTGATTG
GCTGCAAGAGTGCTTGTTTTGTATTCAACCAACCTCGCTACTGCTGCATTGGAGAGTTCGATGGCCCTGACAAATGCAAGCCAACGAACTATTCGCAGGTTTTCAAAAAC
CAATGCCCGGATGCTTACAGCTACGCGTATGATGATCGGAGTAGTACTTTTACTTGCAGTAATAGGGCAAATTATGTCATCACATTCTGCGGTTGAAGATGAAGACAATG
GGTACGTTGGAGCCATGAGATAAGTATTTAAGAATAATTTACCAAATTGGTTTTAATAAGCTTCCATGAGATTGATTGATTTGAGTATATGATAAGAAAACCTTAGCGAA
TTGGAATTAGTAACCCTTGGTTATGTGAATCCCTAATGCTCAAACACTAAGACTCCCAAATCGATTCGATTCAATTCTAAGGAAAAAGGACTAGATATGGATTATCAAAG
ACCAAGAGGTAAGGAAACTAGTTCCTCACTCAAGGATGGAACAGTCCACAAGCAAAGGATGGAACACTCCACAAGCAAAGGAAAGAACACTCCACAACAAGTTGATCAAA
CCTACCAGAATGTTCATGGCTTGCAACCCTATACTCAAGAATTGCAAAGGGTGATGATGTGACTCTGCAACAAATCACATGAAATTGTATTCATCCAAAAACTGTCTTGT
ACAACCTAATGGCCAAGCTTTAAATAGCTTCCCAAAATCCTAAATGTCATATCATGACAAATGACAAAAATACCCCTACTTAAAATGTCATAAAAATGATAAAATTGAAA
AAATAATAAAATTATATAAAAATTAGAAATTAACAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASSSIFSTFCSVSVLLLLGALISPGSKWGNMVMAIEDEDFALLPFGSDSAIDNFIRLPQCGGPPQTHTRDKTAKMTVKNNCLRTIWPAVLTTGPGQHQLSTTGFELAPG
DSWSFNVPTPWTGRVWARTRCSNNGGFFTCSTGECGRGLECNGAGGVPPTTLAEFTLAATNDGQDFYDISLVDGFNIPASISSEGGTGPCKSSNCRADVNRVCPTELQEK
SGDEVIGCKSACFVFNQPRYCCIGEFDGPDKCKPTNYSQVFKNQCPDAYSYAYDDRSSTFTCSNRANYVITFCG