; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0022649 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0022649
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptiondehydrin DHN1-like
Genome locationLG01:12197513..12198894
RNA-Seq ExpressionTan0022649
SyntenyTan0022649
Gene Ontology termsGO:0009414 - response to water deprivation (biological process)
GO:0009631 - cold acclimation (biological process)
GO:0009737 - response to abscisic acid (biological process)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
InterPro domainsIPR000167 - Dehydrin
IPR030513 - Dehydrin, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600589.1 Dehydrin Xero 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-6374.86Show/hide
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        M+H+QSGTDQYGNPVRQTDEYGNVI G GQH DP  RTGEF ETDQYGNPV+R G       TGGTYE+G                GYGGG QQQHKEH 
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Query:  GILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH
        G+L RSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEK+KEKLPGHHDT QQP ATSTTTPGGYSS EHGG HEKKG+M+KIKEKLPGH+
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XP_022942609.1 dehydrin Rab16B-like [Cucurbita moschata]6.8e-6579.65Show/hide
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        M+H+QSGTDQYGNPVRQTDEYGNVI G GQ  DP  RTGEF ETDQYGNPV+R G       TGGTYE+G     GYGGG QQQHKEH G+L RSGSSSS
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        SSSSEDDGHGGRRKKGLKEK+KEKLPGHHDT QQPHATSTTTPGGYSS EHGG HEKKG+M+KIKEKLPGH+
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XP_022983036.1 dehydrin DHN1-like [Cucurbita maxima]5.7e-6479.07Show/hide
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        M+H+QSGTDQYGNPVRQTDEYGNVI G GQH DP  RTGEF +TDQYGNPV+R G       TGGTYE+G     GYGGG QQQHKEH GIL RSGSSSS
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Query:  SSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH
        SSSSEDDGHGGRRKKGLKEK+KEKLPGHHDT QQP ATSTTTPGGYSS EHGG +EKKG+M+KIKEKLPGH+
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XP_023550338.1 dehydrin Rab18-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-6377.71Show/hide
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        M+H+QSGTDQYGNPVRQTDEYGNVI G GQH DP  R   TGEF ETDQYGNP++R G       TGGTYE+G     GYGGG  QQHKEH G+L RSGS
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Query:  SSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH
        SSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEK+KEKLPGHHDT QQPHATSTTTPGGYSS EHGG HEKKG+M+KIKEKLPGH+
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XP_038902571.1 dehydrin Xero 1-like [Benincasa hispida]2.9e-6077.27Show/hide
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        MAHYQSGTDQYGNP+RQTDEYGNVIS   Q+GDPLRRTGEF ETDQYGNPV RT        TG TGGTYE+GGYGG        QQHKEH GILHRSG 
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Query:  SSSSSSSEDDGHGG-RRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH
        SSSSSSSEDDGHGG RRKKGLKEKVKEK+PGHH  PQ   A STTTPGGYSS ++GG HEKKG+MEKIKEKLPGHH
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWM9 Uncharacterized protein2.7e-5975.56Show/hide
Query:  MAHYQSG-TDQYGNPVRQTDEYGNVISGIGQHGDPLRRTGEFGETDQYGNPVQRT--------GTGP---TGGTYESGGY------GGGQQQHKEHAGIL
        MAHYQSG TDQYGNP+RQTDEYGNVIS  GQ+GDPLRRTGEF ETDQYGNP +RT        GTG    TGGTYE+ GY      GG  QQHKEH GIL
Subjt:  MAHYQSG-TDQYGNPVRQTDEYGNVISGIGQHGDPLRRTGEFGETDQYGNPVQRT--------GTGP---TGGTYESGGY------GGGQQQHKEHAGIL

Query:  HRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH
        HRSG SSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHH   +Q  A STTTPGGY+S E+GG HEKKG+MEKIKEKLPGHH
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A0A1S3BTX2 dehydrin DHN17.1e-6075.56Show/hide
Query:  MAHYQS-GTDQYGNPVRQTDEYGNVISGIGQHGDPLRRTGEFGETDQYGNPVQRT--------GTGP---TGGTYESGGYGGG------QQQHKEHAGIL
        MAHYQS GTDQYGNP+RQTDEYGNVIS  GQ+GDPLRRTGEF ETDQYGNPV+RT        GTG    TGGTYE+ GYGG        QQHKEH GIL
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Query:  HRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH
        HRSG SSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPG H    +  A STTTPGGY+S EHGG HEKKG+MEKIKEKLPGHH
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A0A5D3CYN8 Dehydrin DHN17.1e-6075.56Show/hide
Query:  MAHYQS-GTDQYGNPVRQTDEYGNVISGIGQHGDPLRRTGEFGETDQYGNPVQRT--------GTGP---TGGTYESGGYGGG------QQQHKEHAGIL
        MAHYQS GTDQYGNP+RQTDEYGNVIS  GQ+GDPLRRTGEF ETDQYGNPV+RT        GTG    TGGTYE+ GYGG        QQHKEH GIL
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Query:  HRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH
        HRSG SSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPG H    +  A STTTPGGY+S EHGG HEKKG+MEKIKEKLPGHH
Subjt:  HRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH

A0A6J1FRT8 dehydrin Rab16B-like3.3e-6579.65Show/hide
Query:  MAHYQSGTDQYGNPVRQTDEYGNVISGIGQHGDPLRRTGEFGETDQYGNPVQRTGTG----PTGGTYESG-----GYGGG-QQQHKEHAGILHRSGSSSS
        M+H+QSGTDQYGNPVRQTDEYGNVI G GQ  DP  RTGEF ETDQYGNPV+R G       TGGTYE+G     GYGGG QQQHKEH G+L RSGSSSS
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Query:  SSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH
        SSSSEDDGHGGRRKKGLKEK+KEKLPGHHDT QQPHATSTTTPGGYSS EHGG HEKKG+M+KIKEKLPGH+
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A0A6J1J0Z6 dehydrin DHN1-like2.8e-6479.07Show/hide
Query:  MAHYQSGTDQYGNPVRQTDEYGNVISGIGQHGDPLRRTGEFGETDQYGNPVQRTGTG----PTGGTYESG-----GYGGG-QQQHKEHAGILHRSGSSSS
        M+H+QSGTDQYGNPVRQTDEYGNVI G GQH DP  RTGEF +TDQYGNPV+R G       TGGTYE+G     GYGGG QQQHKEH GIL RSGSSSS
Subjt:  MAHYQSGTDQYGNPVRQTDEYGNVISGIGQHGDPLRRTGEFGETDQYGNPVQRTGTG----PTGGTYESG-----GYGGG-QQQHKEHAGILHRSGSSSS

Query:  SSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH
        SSSSEDDGHGGRRKKGLKEK+KEKLPGHHDT QQP ATSTTTPGGYSS EHGG +EKKG+M+KIKEKLPGH+
Subjt:  SSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A8CVF3 Dehydrin DHN16.7e-2347.09Show/hide
Query:  YQSGTDQYGNPVRQTDE------------YGNVISGIGQHGDPLRRTGEFG--ETDQYGNP--VQRTGT---GPTGGTYESGGYGGGQQQHKEHAGIL--
        Y   TD+YGNP+RQT E            YG   + +G   D    T   G  +TDQYG P      GT   G TG T E G +GGG       AG+   
Subjt:  YQSGTDQYGNPVRQTDE------------YGNVISGIGQHGDPLRRTGEFG--ETDQYGNP--VQRTGT---GPTGGTYESGGYGGGQQQHKEHAGIL--

Query:  ---HRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGG------HHEKKGMMEKIKEKLPGHH
           HR   SS SSSSEDDG GGRRKKG+KEK+KEKLPG      Q H T   + GGY   EHGG      H EKKG+M+KIKEKLPG H
Subjt:  ---HRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGG------HHEKKGMMEKIKEKLPGHH

P12950 Dehydrin DHN11.5e-2251.76Show/hide
Query:  GQHGDPLRRTGEFGETDQYGNPV---------QRTGTGPTGGTYESG-----GYGGGQQQ--HKEH--AGILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEK
        GQ G   R  G  G  DQYGNPV          R GTG TGG  + G     G GGGQ Q   +EH   GILHRSG SSSSSSSEDDG GGRRKKG+KEK
Subjt:  GQHGDPLRRTGEFGETDQYGNPV---------QRTGTGPTGGTYESG-----GYGGGQQQ--HKEH--AGILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEK

Query:  VKEKLPGHHDTPQQPHATSTT------------------TPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH
        +KEKLPG H   Q  HAT+TT                    GG  +T   G  EKKG+M+KIKEKLPG H
Subjt:  VKEKLPGHHDTPQQPHATSTT------------------TPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH

P21298 Late embryogenesis abundant protein1.4e-2042.05Show/hide
Query:  DQYGNPVRQTDEYGNVISGIGQHGDPLRRTGEFGETDQY-----GNPVQRTGTGPTGGTYESGGYGG-------------GQQQHKEHAGILHRSGSSSS
        D+ GNP+  TD YGN +    + G+P+  TG      QY     GN  +     P  G     G                GQ+ H      L RSG SSS
Subjt:  DQYGNPVRQTDEYGNVISGIGQHGDPLRRTGEFGETDQY-----GNPVQRTGTGPTGGTYESGGYGG-------------GQQQHKEHAGILHRSGSSSS

Query:  SSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGG----HHEKKGMMEKIKEKLPGHH
        SSSSEDDG GGRRKK +K+K+K+KL G     +Q   T+TTT    ++T  G     HHEKKG++EKIKEKLPGHH
Subjt:  SSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGG----HHEKKGMMEKIKEKLPGHH

P30185 Dehydrin Rab181.9e-2550.81Show/hide
Query:  MAHYQS-----GTDQYGNPVRQT-DEYGNVI--SGIGQHGDPLRRTGE-FGETDQ-YGNPVQRTGTG----PTGGTYESGGYGGG------QQQHKEH--
        MA YQ+      TD+YGNP++Q  DEYGN +   G G  G      G+ +G   Q YG+  Q  GTG     TG   E  G GGG      +Q HKE   
Subjt:  MAHYQS-----GTDQYGNPVRQT-DEYGNVI--SGIGQHGDPLRRTGE-FGETDQ-YGNPVQRTGTG----PTGGTYESGGYGGG------QQQHKEH--

Query:  --AGILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGG-HHEKKGMMEKIKEKLPG
           G+LHRSG S SSSSSEDDG GGRRKKG+ +K+KEKLPGHHD   Q  A       GY +  +GG HHEKKGMM+KIKEKLPG
Subjt:  --AGILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGG-HHEKKGMMEKIKEKLPG

Q00742 Dehydrin Rab151.5e-1948.34Show/hide
Query:  GQHGDPLRRTGEFGETDQYGNPVQRTGTGPTGGTYESGGYGGGQQQHKEHAGILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHAT
        GQH +P  R       D+YGNP    G               G Q   +   ILHRSGSSSSSSSSEDDG GGRRKKG+KEK+KEKLPG H   QQ  AT
Subjt:  GQHGDPLRRTGEFGETDQYGNPVQRTGTGPTGGTYESGGYGGGQQQHKEHAGILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHAT

Query:  STTTPGGYS-STEHGGHH----------------EKKGMMEKIKEKLPGHH
         T T G Y   T  GG +                EKKG+M+KIKEKLPG H
Subjt:  STTTPGGYS-STEHGGHH----------------EKKGMMEKIKEKLPGHH

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G20440.1 cold-regulated 473.2e-1251.58Show/hide
Query:  LHRSGSSSSSSSSEDDG----------HGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQ---PHATSTTTPGGYSSTEHG-GHHEKKGMMEKIKEKLPGHH
        LHRS SSSSSSS E+             G   KKGL EK+KEKLPGHHD   +   P +T+   P   S  EH     EKKG++EKIKEKLPGHH
Subjt:  LHRSGSSSSSSSSEDDG----------HGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQ---PHATSTTTPGGYSSTEHG-GHHEKKGMMEKIKEKLPGHH

AT2G21490.1 dehydrin LEA9.2e-2041.53Show/hide
Query:  DQYGNPVRQTDEYGN-VISGIGQHGDPLRRTGEFGETDQY----------------------------GNPVQRTGTGPTGGTYESGGYGGGQQQHKEHA
        D+ GNP+  TD  GN ++    +HG+P+  TG    T Q+                            G     T TG + GT   G    GQQ H    
Subjt:  DQYGNPVRQTDEYGN-VISGIGQHGDPLRRTGEFGETDQY----------------------------GNPVQRTGTGPTGGTYESGGYGGGQQQHKEHA

Query:  GILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH
          L RSG SSSSSSSEDDG GGRRKK +KEK+KEK        +Q  AT+TTT  G ++T+    HEKKG++EKIK+KLPGHH
Subjt:  GILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH

AT3G50980.1 dehydrin xero 14.1e-2056.1Show/hide
Query:  ETDQYGNPV-QRTGTGPTGGTYESGGYGGGQQQHKEHAGILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRR--KKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSST
        + DQ+GNP    TG   T G   +   GGG       +G+LHRSG SSSSSSSEDDG GGRR  KKG+ EK+KEKLPGHHD+ +     STTT     + 
Subjt:  ETDQYGNPV-QRTGTGPTGGTYESGGYGGGQQQHKEHAGILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRR--KKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSST

Query:  EHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH
            HHEKKGMMEKIKEKLPG H
Subjt:  EHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH

AT5G66400.1 Dehydrin family protein1.3e-2650.81Show/hide
Query:  MAHYQS-----GTDQYGNPVRQT-DEYGNVI--SGIGQHGDPLRRTGE-FGETDQ-YGNPVQRTGTG----PTGGTYESGGYGGG------QQQHKEH--
        MA YQ+      TD+YGNP++Q  DEYGN +   G G  G      G+ +G   Q YG+  Q  GTG     TG   E  G GGG      +Q HKE   
Subjt:  MAHYQS-----GTDQYGNPVRQT-DEYGNVI--SGIGQHGDPLRRTGE-FGETDQ-YGNPVQRTGTG----PTGGTYESGGYGGG------QQQHKEH--

Query:  --AGILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGG-HHEKKGMMEKIKEKLPG
           G+LHRSG S SSSSSEDDG GGRRKKG+ +K+KEKLPGHHD   Q  A       GY +  +GG HHEKKGMM+KIKEKLPG
Subjt:  --AGILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGG-HHEKKGMMEKIKEKLPG

AT5G66400.2 Dehydrin family protein5.1e-2650.27Show/hide
Query:  MAHYQS-----GTDQYGNPVRQT-DEYGNVI--SGIGQHGDPLRRTGE-FGETDQ-YGNPVQRTGTG----PTGGTYESGGYGGG------QQQHKEH--
        MA YQ+      TD+YGNP++Q  DEYGN +   G G  G      G+ +G   Q YG+  Q  GTG     TG   E  G GGG      +Q HKE   
Subjt:  MAHYQS-----GTDQYGNPVRQT-DEYGNVI--SGIGQHGDPLRRTGE-FGETDQ-YGNPVQRTGTG----PTGGTYESGGYGGG------QQQHKEH--

Query:  --AGILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGG-HHEKKGMMEKIKEKLPG
           G+LHRSGS SSSSS  DDG GGRRKKG+ +K+KEKLPGHHD   Q  A       GY +  +GG HHEKKGMM+KIKEKLPG
Subjt:  --AGILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEKVKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGG-HHEKKGMMEKIKEKLPG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCATTACCAATCTGGAACCGATCAGTACGGCAACCCGGTTCGGCAGACTGATGAATATGGCAACGTGATCTCCGGGATCGGTCAGCATGGTGATCCGCTTCGCCG
GACCGGTGAGTTCGGTGAGACGGACCAATATGGAAACCCGGTGCAGCGGACTGGTACCGGACCTACCGGTGGGACGTATGAGAGTGGTGGCTACGGGGGAGGACAGCAGC
AGCATAAGGAGCATGCTGGAATACTTCACCGCTCTGGAAGCTCCAGCAGTTCCAGCTCGTCGGAAGATGATGGACATGGAGGGAGGAGGAAGAAGGGGCTGAAAGAGAAG
GTAAAGGAGAAGCTGCCGGGACATCATGATACGCCGCAGCAGCCGCACGCAACATCAACCACCACACCCGGCGGCTACTCCTCCACGGAGCACGGCGGCCACCATGAGAA
GAAGGGAATGATGGAGAAGATCAAGGAGAAACTGCCGGGACATCACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCATCCGCATTCTGAAACTCACTTCATTCACTATCTGTTTTCTTTTTCTTATCTTGATTGATCATTTTAGTTTGAGAAAATATAATGGCCCATTACCAATCTGGAACCGA
TCAGTACGGCAACCCGGTTCGGCAGACTGATGAATATGGCAACGTGATCTCCGGGATCGGTCAGCATGGTGATCCGCTTCGCCGGACCGGTGAGTTCGGTGAGACGGACC
AATATGGAAACCCGGTGCAGCGGACTGGTACCGGACCTACCGGTGGGACGTATGAGAGTGGTGGCTACGGGGGAGGACAGCAGCAGCATAAGGAGCATGCTGGAATACTT
CACCGCTCTGGAAGCTCCAGCAGTTCCAGCTCGTCGGAAGATGATGGACATGGAGGGAGGAGGAAGAAGGGGCTGAAAGAGAAGGTAAAGGAGAAGCTGCCGGGACATCA
TGATACGCCGCAGCAGCCGCACGCAACATCAACCACCACACCCGGCGGCTACTCCTCCACGGAGCACGGCGGCCACCATGAGAAGAAGGGAATGATGGAGAAGATCAAGG
AGAAACTGCCGGGACATCACTGAGAGGCTTTGGCCATGTCCATACATACATATATATATATATATAATGATATTGTAATAATGGTTGGTCTATGGCACAGCTTGTTGGCT
AAACCTAAATAAATTGAGGGACAGTGGTCAGTTTGTGGTTGTGGGTATTATGTAATTTATGGATTTCGTGGTTTGATGTATGCAAGTGTTTGTGTTGTTTATGTTGTGGA
ATTTTATAGCAACTGTGTTTATC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAHYQSGTDQYGNPVRQTDEYGNVISGIGQHGDPLRRTGEFGETDQYGNPVQRTGTGPTGGTYESGGYGGGQQQHKEHAGILHRSGSSSSSSSSEDDGHGGRRKKGLKEK
VKEKLPGHHDTPQQPHATSTTTPGGYSSTEHGGHHEKKGMMEKIKEKLPGHH