| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0051909.1 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.7e-20 | 66.67 | Show/hide |
Query: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKM
DDV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE + LYNVS+ SQ+E+GVKMAREKL +DGT ++KSVQ +
Subjt: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKM
|
|
| KAA0065364.1 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.0e-20 | 63.54 | Show/hide |
Query: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKMFDVLIKKMS
DDV+ + LHVPEG+IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE + LYNVS+ SQ+E+ VKMAREKL L+DGT ++KSVQ +V I+ S
Subjt: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKMFDVLIKKMS
|
|
| KAA0067206.1 hypothetical protein E6C27_scaffold418G00080 [Cucumis melo var. makuwa] | 5.0e-20 | 65.52 | Show/hide |
Query: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKM
DDV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ E K FEP+ LYNVS+ SQ+E+ +KMA EKL L+DGT D+KSVQ +
Subjt: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKM
|
|
| TYK02449.1 F15O4.13 [Cucumis melo var. makuwa] | 3.5e-21 | 67.82 | Show/hide |
Query: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKM
DDV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE + LYNVS+ SQ+E+GVKMAREKL L+DGT ++KSVQ +
Subjt: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKM
|
|
| TYK20861.1 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.0e-20 | 63.54 | Show/hide |
Query: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKMFDVLIKKMS
DDV+ + LHVPEG+IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE + LYNVS+ SQ+E+ VKMAREKL L+DGT ++KSVQ +V I+ S
Subjt: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKMFDVLIKKMS
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7UEI2 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 8.3e-21 | 66.67 | Show/hide |
Query: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKM
DDV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE + LYNVS+ SQ+E+GVKMAREKL +DGT ++KSVQ +
Subjt: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKM
|
|
| A0A5A7VDK8 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 4.9e-21 | 63.54 | Show/hide |
Query: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKMFDVLIKKMS
DDV+ + LHVPEG+IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE + LYNVS+ SQ+E+ VKMAREKL L+DGT ++KSVQ +V I+ S
Subjt: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKMFDVLIKKMS
|
|
| A0A5A7VL78 RT_RNaseH_2 domain-containing protein | 2.4e-20 | 65.52 | Show/hide |
Query: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKM
DDV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ E K FEP+ LYNVS+ SQ+E+ +KMA EKL L+DGT D+KSVQ +
Subjt: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKM
|
|
| A0A5D3BWE8 F15O4.13 | 1.7e-21 | 67.82 | Show/hide |
Query: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKM
DDV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE + LYNVS+ SQ+E+GVKMAREKL L+DGT ++KSVQ +
Subjt: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKM
|
|
| A0A5D3DB73 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 4.9e-21 | 63.54 | Show/hide |
Query: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKMFDVLIKKMS
DDV+ + LHVPEG+IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE + LYNVS+ SQ+E+ VKMAREKL L+DGT ++KSVQ +V I+ S
Subjt: DDVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPQILYNVSTTSQDENGVKMAREKLSCLKDGTEDKKSVQKMFDVLIKKMS
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 1.7e-07 | 40.74 | Show/hide |
Query: NGVQVDEEKVKAIREWPTPTNANEVRSFHGLASFYRRFIKNFSSIASPLNELVK
+G++ + EK++AI+++P PT E+++F GL +YR+FI NF+ IA P+ + +K
Subjt: NGVQVDEEKVKAIREWPTPTNANEVRSFHGLASFYRRFIKNFSSIASPLNELVK
|
|
| P10401 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon gypsy | 7.0e-09 | 53.7 | Show/hide |
Query: NGVQVDEEKVKAIREWPTPTNANEVRSFHGLASFYRRFIKNFSSIASPLNELVK
+G + D EKVKAI+E+P P +VRSF GLAS+YR FIK+F++IA P+ +++K
Subjt: NGVQVDEEKVKAIREWPTPTNANEVRSFHGLASFYRRFIKNFSSIASPLNELVK
|
|
| P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 | 2.5e-06 | 42.59 | Show/hide |
Query: NGVQVDEEKVKAIREWPTPTNANEVRSFHGLASFYRRFIKNFSSIASPLNELVK
+G++ + KVKAI +P PT E+R+F GL +YR+FI N++ IA P+ +K
Subjt: NGVQVDEEKVKAIREWPTPTNANEVRSFHGLASFYRRFIKNFSSIASPLNELVK
|
|
| P92523 Uncharacterized mitochondrial protein AtMg00860 | 2.0e-08 | 49.06 | Show/hide |
Query: GVQVDEEKVKAIREWPTPTNANEVRSFHGLASFYRRFIKNFSSIASPLNELVK
GV D K++A+ WP P N E+R F GL +YRRF+KN+ I PL EL+K
Subjt: GVQVDEEKVKAIREWPTPTNANEVRSFHGLASFYRRFIKNFSSIASPLNELVK
|
|
| Q8I7P9 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon opus | 1.3e-07 | 39.29 | Show/hide |
Query: NGVQVDEEKVKAIREWPTPTNANEVRSFHGLASFYRRFIKNFSSIASPLNELVKSM
+G++ D +KV+AI E P PT+ E++ F G+ S+YR+FI++++ +A PL L + +
Subjt: NGVQVDEEKVKAIREWPTPTNANEVRSFHGLASFYRRFIKNFSSIASPLNELVKSM
|
|
