| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_022143227.1 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa [Momordica charantia] | 1.0e-158 | 88.37 | Show/hide |
Query: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST+GKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTI+GRVVRVNGVK+RGGGRFGRE R++ E
Subjt: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
Query: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHDLNHDQDWEKDHDADWSGGRGI
RDA WE+DRDRGRDYDHDRY HR RNNDWSR+RDRSRE DLDKER YEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNE V DLN DQDWEKDHDADWSGGR I
Subjt: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHDLNHDQDWEKDHDADWSGGRGI
Query: DNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKRSS
DN DDYDKSLDNDRD SRRD+GL I RT R++SSDSS+DYIHE+KEQLEISTERFEELRKEIS+IEERTGEKGK V+ELQKKAKKLE+ALISAKKR+S
Subjt: DNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKRSS
Query: FRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
FRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLK+SEQ+LQ LVESTAIESD G
Subjt: FRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
|
|
| XP_022946346.1 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa [Cucurbita moschata] | 1.1e-157 | 87.57 | Show/hide |
Query: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST+GKCYGFVTFTNPRSA+DAIKDMDGRTIEGRVVRVNGV TRGGGRFGRE+NRFDVE
Subjt: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
Query: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
RD +WERDRDRGRDY+HDRYR R RNNDWSR+RDRSRE DLDKERVYEH QDRDLPKD LLDR+PELEK K NE+ D L+H QDWEKDHDADW+GG
Subjt: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
Query: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
GIDN DDYDKSL +DRD LSRRDNGLAI RT R+LSSDSS+DYIHE+KEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGK V+ELQKKAKKLE+ALISAKKR
Subjt: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
Query: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLK SEQ+LQ LVESTAIESD G
Subjt: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
|
|
| XP_022999196.1 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa [Cucurbita maxima] | 3.2e-157 | 87.28 | Show/hide |
Query: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST+GKCYGFVTFTNPRSA+DAIKDMDGRTIEGRVVRVNGV TRGGGRFGRE+NRFDVE
Subjt: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
Query: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
RD +WERDRDRGRDY+HDRYR R RNNDWSR+RDRSRE DLDKERVYEH QDRDLPKD LLDR+PELEK K NE+ D L+H QDWEKDHD DW+GG
Subjt: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
Query: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
GIDN DDYDKSL +DRD LSRRDNGLAI RT R+LSSDSS+DYIHE+KEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGK V+ELQKKAKKLE+ALISAKKR
Subjt: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
Query: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLK SEQ+LQ LVESTAIESD G
Subjt: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
|
|
| XP_023547216.1 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 3.2e-157 | 87.28 | Show/hide |
Query: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST+GKCYGFVTFTNPRSA+DAIKDMDGRTIEGRVVRVNGV TRGGGRFGRE+NRFDVE
Subjt: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
Query: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
RD +WERDRDRGRDY+HDRYR R RNNDWSR+RDRSRE DLDKER YEH QDRDLPKD LLDR+PELEK K NE+ D L+H QDWEKDHDADW+GG
Subjt: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
Query: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
GIDN DDYDKSL +DRD LSRRDNGLAI RT R+LSSDSS+DYIHE+KEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGK V+ELQKKAKKLE+ALISAKKR
Subjt: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
Query: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLK SEQ+LQ LVESTAIESD G
Subjt: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
|
|
| XP_038889756.1 serine/threonine-protein kinase prpf4B [Benincasa hispida] | 3.8e-158 | 88.15 | Show/hide |
Query: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST+GKCYGFVTFTNPRSA+DAIKDMDGR+IEGRVVRVNGVK+R GGRFGRE NRFDVE
Subjt: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
Query: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
RD SWERDRDRGRDYDHDRYRHR RNNDWSRDRDRSRE DLDKER YEH QD D PKDKLLDRDPELEK+SKDNEKVHD LNHDQD EK+H ADW GG
Subjt: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
Query: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
GIDN DDY+KSLDNDR+ LSRRDNGL RT RDLSSDSS+DYIHE+KEQLEISTER EELRKE+SQIEER+GEK K VIELQKKAKKLE+ALISAKKR
Subjt: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
Query: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQ+LQ LVESTAIESD G
Subjt: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7V7D5 Zinc finger CCCH domain-containing protein 25 | 3.3e-155 | 85.84 | Show/hide |
Query: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
MTVDDDSSIYVGGLPYDATED+LRRIFDLYGAVVAVKIINDRST+GKCYGFVTFTNPRSA+DAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVK+R GGRFG+E NRFD E
Subjt: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
Query: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
RD +WERDRDRGRDYDHDRYRHR RNNDWSRD DRSRE DLDKER Y+H QDRDLPKD+ LDRDPELEKTSKDNEK+HD LNHDQDWEKDH AD SGG
Subjt: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
Query: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
GID DDYDKSLDNDRD + RRDN L I RT RDLSSDSS+DYIHE+KEQLEISTER EELRKE+SQIEER+GEK K V+ELQKKAKKLE+ALISAKKR
Subjt: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
Query: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
SSFRQ QL KLHKSFLLVKDYS+RLKTSEQ+LQ LVESTAIESD G
Subjt: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
|
|
| A0A5D3CHM1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 25 | 2.9e-156 | 86.42 | Show/hide |
Query: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST+GKCYGFVTFTNPRSA+DAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVK+R GGRFG+E NRFD E
Subjt: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
Query: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
RD +WERDRDRGRDYDHDRYRHR RNNDWSRD DRSRE DLDKER Y+H QDRDLPKD+ LDRDPELEKTSKDNEK+HD LNHDQDWEKDH AD SGG
Subjt: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
Query: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
GID DDYDKSLDNDRD + RRDNGL I RT RDLSSDSS+DYIHE+KEQLEISTER EELRKE+SQIEER+GEK K V+ELQKKAKKLE+ALISAKKR
Subjt: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
Query: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
SSFRQ QL KLHKSFLLVKDYS+RLKTSEQ+LQ LVESTAIESD G
Subjt: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
|
|
| A0A6J1CQ67 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa | 4.8e-159 | 88.37 | Show/hide |
Query: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST+GKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTI+GRVVRVNGVK+RGGGRFGRE R++ E
Subjt: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
Query: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHDLNHDQDWEKDHDADWSGGRGI
RDA WE+DRDRGRDYDHDRY HR RNNDWSR+RDRSRE DLDKER YEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNE V DLN DQDWEKDHDADWSGGR I
Subjt: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHDLNHDQDWEKDHDADWSGGRGI
Query: DNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKRSS
DN DDYDKSLDNDRD SRRD+GL I RT R++SSDSS+DYIHE+KEQLEISTERFEELRKEIS+IEERTGEKGK V+ELQKKAKKLE+ALISAKKR+S
Subjt: DNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKRSS
Query: FRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
FRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLK+SEQ+LQ LVESTAIESD G
Subjt: FRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
|
|
| A0A6J1G3E0 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa | 5.4e-158 | 87.57 | Show/hide |
Query: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST+GKCYGFVTFTNPRSA+DAIKDMDGRTIEGRVVRVNGV TRGGGRFGRE+NRFDVE
Subjt: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
Query: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
RD +WERDRDRGRDY+HDRYR R RNNDWSR+RDRSRE DLDKERVYEH QDRDLPKD LLDR+PELEK K NE+ D L+H QDWEKDHDADW+GG
Subjt: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
Query: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
GIDN DDYDKSL +DRD LSRRDNGLAI RT R+LSSDSS+DYIHE+KEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGK V+ELQKKAKKLE+ALISAKKR
Subjt: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
Query: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLK SEQ+LQ LVESTAIESD G
Subjt: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
|
|
| A0A6J1KCE4 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa | 1.6e-157 | 87.28 | Show/hide |
Query: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST+GKCYGFVTFTNPRSA+DAIKDMDGRTIEGRVVRVNGV TRGGGRFGRE+NRFDVE
Subjt: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
Query: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
RD +WERDRDRGRDY+HDRYR R RNNDWSR+RDRSRE DLDKERVYEH QDRDLPKD LLDR+PELEK K NE+ D L+H QDWEKDHD DW+GG
Subjt: RDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNEKVHD--LNHDQDWEKDHDADWSGGR
Query: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
GIDN DDYDKSL +DRD LSRRDNGLAI RT R+LSSDSS+DYIHE+KEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGK V+ELQKKAKKLE+ALISAKKR
Subjt: GIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKKR
Query: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLK SEQ+LQ LVESTAIESD G
Subjt: SSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O22703 Glycine-rich RNA-binding protein RZ1B | 1.7e-12 | 36.87 | Show/hide |
Query: DSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST-KGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGR---------------
+S I+VGGL +D TE L FD YG + +I+ R T + + +GF+TFT+ R A DAIK M GR + +V+ VN + + GG
Subjt: DSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST-KGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGR---------------
Query: FGRENNRFDVERDASWERDRDRGRDYDHDRYR----HRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRD
G E+ F R W RD D D +R+R RSR D RDR +RDL++ER E DR + D DRD
Subjt: FGRENNRFDVERDASWERDRDRGRDYDHDRYR----HRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRD
|
|
| P09406 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa | 9.8e-08 | 29.38 | Show/hide |
Query: DDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKG----KCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTR----------GGGR
D +++V + YD TE LRR F++YG + + I+ ++ ++G + Y F+ + + R A K DG+ I+GR V V+ + R GGG
Subjt: DDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKG----KCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTR----------GGGR
Query: FGRENNRFDV------ERDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNE-KVHDLNH
G DV D S +RDR R+ D R R R R + R+R RSR R+ ++ ++R ++K D+D E +K +KD + K +
Subjt: FGRENNRFDV------ERDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPELEKTSKDNE-KVHDLNH
Query: DQDWEKDHDAD
++ E+D D +
Subjt: DQDWEKDHDAD
|
|
| Q18409 Probable splicing factor, arginine/serine-rich 6 | 1.6e-13 | 37.65 | Show/hide |
Query: DSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEG---RVVRVNGVKTRGGGR---------FGRE
D+ +YVGGLP DAT L IFD +G + V + + + + FV + + R A DA++ +DG I G RV G + GGGR GR+
Subjt: DSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEG---RVVRVNGVKTRGGGR---------FGRE
Query: NNRFDVERDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDR
+ + +R S R RDRGRD DR R RSR+ R R+RSRER+ + R PQ+RD K R
Subjt: NNRFDVERDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDR
|
|
| Q54PM6 Uncharacterized protein DDB_G0284459 | 8.6e-04 | 28.32 | Show/hide |
Query: IKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVERDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNN----DWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDK
I+ G+ + R N +T G R+ + + RD +RDRDR RD D DR R R R N + RDRDRS D D++R + +DRD +D+
Subjt: IKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVERDASWERDRDRGRDYDHDRYRHRSRNN----DWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDK
Query: LLDRDPELEKTSKDNEKVHDLNHDQDWEKDHDADWSGGRGIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEE
DRD + ++ +D ++ D D+D ++ D++ + +N ++ + + +N+ + +++DN + + D ++D E T++ E+
Subjt: LLDRDPELEKTSKDNEKVHDLNHDQDWEKDHDADWSGGRGIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEE
Query: L-RKEISQIEERTGEKGKHVIELQKK
L R +I QI+E + K ELQ K
Subjt: L-RKEISQIEERTGEKGKHVIELQKK
|
|
| Q66II8 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa | 2.3e-09 | 27.44 | Show/hide |
Query: DDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKII-NDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTR----------GGGRFGR
D +++V + YD TE LRR F++YG + + ++ N RS K + Y F+ + + R A K DG+ I+GR V V+ + R GGG G
Subjt: DDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKII-NDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTR----------GGGRFGR
Query: ENNRFDV--------------ERDASWERDRD---RGRDYDHDRYRHRSRNNDWSR--------DRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPEL
DV ERD ER+RD R R+ D +R R RSR+ + R +R RSRER DK++ +D+D K+K D+D +
Subjt: ENNRFDV--------------ERDASWERDRD---RGRDYDHDRYRHRSRNNDWSR--------DRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRDPEL
Query: EKTSKDNEKVHDLNHDQDWEKD-------------HDADWSGGRGID------NPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKE
++ S+ E+ + + D++ ++D D +G GID P++ ++ D +RD RD DR R D D E
Subjt: EKTSKDNEKVHDLNHDQDWEKD-------------HDADWSGGRGID------NPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKE
Query: QLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGK
+R + ++ + +R G++G+
Subjt: QLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGK
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G60650.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain | 1.2e-13 | 36.87 | Show/hide |
Query: DSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST-KGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGR---------------
+S I+VGGL +D TE L FD YG + +I+ R T + + +GF+TFT+ R A DAIK M GR + +V+ VN + + GG
Subjt: DSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST-KGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGR---------------
Query: FGRENNRFDVERDASWERDRDRGRDYDHDRYR----HRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRD
G E+ F R W RD D D +R+R RSR D RDR +RDL++ER E DR + D DRD
Subjt: FGRENNRFDVERDASWERDRDRGRDYDHDRYR----HRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRD
|
|
| AT1G60650.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain | 1.2e-13 | 36.87 | Show/hide |
Query: DSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST-KGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGR---------------
+S I+VGGL +D TE L FD YG + +I+ R T + + +GF+TFT+ R A DAIK M GR + +V+ VN + + GG
Subjt: DSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST-KGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGR---------------
Query: FGRENNRFDVERDASWERDRDRGRDYDHDRYR----HRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRD
G E+ F R W RD D D +R+R RSR D RDR +RDL++ER E DR + D DRD
Subjt: FGRENNRFDVERDASWERDRDRGRDYDHDRYR----HRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKDKLLDRD
|
|
| AT4G39260.1 cold, circadian rhythm, and RNA binding 1 | 4.7e-13 | 42.17 | Show/hide |
Query: YVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDR-STKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFG
+VGGL + ++ L+R F +G V+ KIINDR S + + +GFVTF + ++ DAI++M+G+ ++GRV+ VN ++RG G G
Subjt: YVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDR-STKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFG
|
|
| AT5G19960.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-54 | 44.67 | Show/hide |
Query: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
MT+DD +S+YVGGLPYD TE+++RR+F +YG+V+ VKI+NDRS +GKCYGFVTF+N RSA DAI+DMDG++I GR VRVN V TR GGR R ++
Subjt: MTVDDDSSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRSTKGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTRGGGRFGRENNRFDVE
Query: RDASWERDRDRGRD--YDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKD-KLLDRDPELEKTSKDNEKVHDLNHDQDWEKDHDADWSGG
W+R DR D Y+ DRY RSR D S+DR R R ++KER YEH D + D ++DR+ E+ +E DW D + G
Subjt: RDASWERDRDRGRD--YDHDRYRHRSRNNDWSRDRDRSRERDLDKERVYEHPQDRDLPKD-KLLDRDPELEKTSKDNEKVHDLNHDQDWEKDHDADWSGG
Query: RGIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKK
RGI+ S R ++R++ + RD S+SS D H++KE LE + E LR E+ +EER K ELQKK+K+LE+ LI+ KK
Subjt: RGIDNPDDYDKSLDNDRDTLSRRDNGLAIGDRTVRDLSSDSSEDYIHEMKEQLEISTERFEELRKEISQIEERTGEKGKHVIELQKKAKKLEEALISAKK
Query: RSSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
S R+ +L KLHKS+ V++ ++ LK EQ+LQ+LV S A E AG
Subjt: RSSFRQMQLTKLHKSFLLVKDYSERLKTSEQDLQVLVESTAIESDAG
|
|
| AT5G61030.1 glycine-rich RNA-binding protein 3 | 8.5e-15 | 47.13 | Show/hide |
Query: SSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST-KGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTR-GGGRFG
S +++GG+ Y EDSLR F YG VV ++I DR T + + +GFVTFT+ +A AI+ +DGR + GRVV+VN R GG FG
Subjt: SSIYVGGLPYDATEDSLRRIFDLYGAVVAVKIINDRST-KGKCYGFVTFTNPRSAVDAIKDMDGRTIEGRVVRVNGVKTR-GGGRFG
|
|
